Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi

SİNDEL, Şükrü; BALİ, Musa; DERİCİ, Ülver; BAŞAY, Turgay; BOZDAYI, Gülendam; VERDİ, Hasibe; ROTA, Seyyal

Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi

Gülendam BOZDAYI, (Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Seyyal ROTA, (Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Hasibe VERDİ, (Ankara Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Hepatoloji Enstitüsü, Ankara, Türkiye)

Ülver DERİCİ, (Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Nefroloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Şükrü SİNDEL, (Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Nefroloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Musa BALİ, (Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Nefroloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Turgay BAŞAY (SSK Etlik Hastanesi, Hemodiyaliz Ünitesi, Ankara, Türkiye)

Mikrobiyoloji Bülteni

3 0

Yıl: 2002 Cilt: 36 Sayı: 3-4 Sayfa Aralığı: 291 - 299 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi

Öz:

Bu çalışmada, hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının belirlenmesinde, HCV-RNA'sının reverse transkriptaz-polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PZR) ile araştırılması ve HCV-RNA pozitifliği saptanan hastalarda HCV genotipinin saptanması amaçlanmıştır. Çalışmaya, Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi ile Sosyal Sigortalar Kurumu Etlik Ankara Hastanesi hemodiyaliz ünitelerinde 1987-1999 yılları arasında (0-13 yıl süre ile) hemodiyalize giren 44 kadın 50 erkek (yaş ortalaması: 49±17 yıl) olmak üzere toplam 94 hasta dahil edilmiş ve hastaların 41 'inde (%43.6) anti-HCV, 36'sında (%38.3) HCV-RNA pozitif olarak saptanmıştır. Anti-HCV ve HCV-RNA'nın birlikte pozitif bulunduğu hasta sayısı 33, anti-HCV pozitif HCV-RNA negatif hasta sayısı 8 ve anti-HCV negatif HCV-RNA pozitif hasta sayısı 3 olarak belirlenmiştir. HCV-RNA'sı pozitif bulunan 36 hastada "Restriction Fragment Length Polymorphism" (RFLP) yöntemi ile HCV genotipleri tayin edilmiş ve 28 hastanın tip 1 b, 8'inin ise tip 1a ile enfekte olduğu belirlenmiştir. Elde edilen genotip sonuçları, örnek olarak seçilmiş iki hastaya DNA dizi analizi yapılarak doğrulanmıştır. Anti-HCV ve HCV-RNA pozitifliğinin, 24 aydan uzun süre hemodiyalize giren hastalarda diğerlerine göre ve kan transfüzyonu yapılan hemodiyaliz hastalarında yapılmayanlara göre istatistiksel olarak anlamlı artış gösterdiği saptanmıştır. Sonuç olarak bulgularımız, hemodiyaliz hastalarında anti-HCV ile birlikte HCV-RNA takibinin de belirli periodlarla yapılmasının uygun olacağını ve genotiplendirmenin epidemiyolojik açıdan önem taşıdığını düşündürmektedir.

Anahtar Kelime: Hepacivirus Böbrek yetmezliği, kronik Genotip Polimorfizm, kesim parçacığı uzunluk Renal diyaliz RNA, viral Hepatit C Ters transkriptaz polimeraz zincir reaksiyonu

Konular: Mikrobiyoloji Hematoloji Viroloji Enfeksiyon Hastalıkları

Investigation of the presence of hepatitis C virus (HCV) infection in hemodialysis patients and determination of HCV genotypes

Öz:

The aim of this study was the investigation of hepatitis C virus (HCV) RNA by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR), in hemodialysis patients in order to detect HCV infection, and the determination of virus genotypes in HCV positive patients. A total of 94 patients, 44 female and 50 male (mean age: 49± 17 years old), who were included in hemodialysis program between 1987-1999 (0-13 years) in the Hemodialysis Units of Gazi University, School of Medicine and Ankara Etlik Hospital of Social Insurance Society, were enrolled in the study. Anti-HCV was found positive in 41 patients (43.6%), while HCV-RNA was positive in 36 patients (38.3%). Thirty three of the patients were positive for both anti-HCV and HCV-RNA, 8 were anti-HCV positive HCV-RNA negative, and 3 were anti-HCV negative HCV-RNA positive. HCV was genotyped by Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) method in 36 HCV-RNA positive patients, and 28 yielded genotype 1b, and 8 showed genotype 1a pattern. PCR products from 5'UTR of HCV-RNA isolated from two patients were also sequenced to confirm the results of RFLP study. The rate of anti-HCV and HCV-RNA positivity was detected statistically higher in patients who exposed hemodialysis longer than 24 months, and in hemodialysis patients who had blood transfusion than the other groups. As a result, our findings supported that the periodic follow-up of HCV-RNA, in addition to anti-HCV would be useful for hemodialysis patients, and genotyping of HCV for the epidemiologic data.

Anahtar Kelime: RNA, Viral Hepatitis C Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction Hepacivirus Kidney Failure, Chronic Genotype Polymorphism, Restriction Fragment Length Renal Dialysis

Konular: Mikrobiyoloji Hematoloji Viroloji Enfeksiyon Hastalıkları

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1.Houghton M, Weiner A, Han J, Kuo G, Choo QL: Molecular hepatology of the hepatitis C viruses: Implications for diagnosis, development and control of viral disease. Hepatology 1991,14: 381-388.
2.Koonin EV: The phyiogeny of RNA-dependent RNA polymerases of positive-strand RNA viruses. J Gen Virol 1991, 72: 2197-2206.
3.Mc Ornish F, Yap PL, Dow BC, et al: Geographical distribution of hepatitis C virus genotypes in blood donors: An international colloborative survey. J Clin Microbiol 1994, 32: 884-892.
4.Chan SW, Mc Ornish F, Holmes EC, et al: Analysis of a new hepatitis C virus type and its phylogenetic relationship to existing variants. J Gen Virol 1998, 73: 1131-1141.
5.Abacioğlu YH, Davidson F, Simmonds P: Sequence analysis of the 5' non coding region of Turkish HCV isolates: Implications for PCR diagnosis. Clin Diag Virol 1996, 5: 211-214.
6.Bozdayi AM, Uzunalimoğlu Ö, Aslan N, et al: Influence of viral load and alanine aminotransferase on viral genetic heterogenity in patients with chronic hepatitis C virus infection. Intervirol 2000, 43: 61-66.
7.Türkoğlu S: HCV enfeksiyonu (Viroloji ve Seroloji), s: 182-192. Kılıçturgay K, Badur S (Ed), Viral Hepatit 2001. 2001, Deniz Ofset, İstanbul.
8.Yakinci G, Rota S, Aylı D, Çırak M, Sultan N: Hemodiyaliz hastalarında anti-HCV pozitiflik nedenlerinin araştırılması. Viral Hepatit Derg 1998, 2: 131-133.
9.Özgür G, Çolakoğlu S, Seyrek N ve ark: Hemodiyaliz hastalarında anti-HCV sıklığı.Gastroenteroloji 1996, 7: 17-21.
10.Mistik R, Dilek K, Güllülü M ve ark: Hemodiyaliz olgularında, bunların eş, çocuk ve yakınları ile hemodiyalizde çalışan personelde anti-HCV seroprevalansı. II.Ulusal Viral Hepatit Sempozyumu Kongre Kitabı, s: 134. 1994, Ankara.
11.Arısoy AS, Kürşat S, Gazi H, Kurutepe S, Özbakkaloğlu B: Hemodiyaliz hastalarında HCV antikor prevalansı. IX.Türk Klinik Mikrobiyoloji ve infeksiyon Hastalıkları Kongresi Kongre Kitabı, s: 230. 1999, Antalya.
12.Chomazynkski R Sacchi N: Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. Anal Biochem 1987,162: 156-159.
13.Garson JA, Ring C, Tuke R et al: Enhanced detection by PCR of hepatitis C virus RNA. Lancet 1990, 336: 878-879.
14.Okamoto H, Okada S, Sugiyama Y, et al: Detection of hepatitis C virus RNA by a two-stage polymerase chain reaction with two pairs of primers deduced from the 5'-noncoding region. Japan J Exp Med 1990, 60: 215-222.
15.Saiki RK, Gelfand DH, Stoffel S, et al: Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase. Science 1998, 239: 487-492.
16.Kwok S, Higuchi R: Avoiding false positivities with PCR. Nature 1989, 339: 237-238.
17.Simmonds P, Mc Ornish F, Yap PL, et al: Sequence variability in the 5' noncoding region of hepatitis C virus: Identification of a new virus type and restrictions on sequence diversity. J Gen Virol 1993, 74: 661-668.
18.Şengül AZ, Karabayraktar A, Koşar A, Baysal A: Hemodiyaliz hastalarında anti-HCV seropozitifliği ve T-lenfosit alt grupları ile ilişkisi. XXVI. Türk Mikrobiyoloji Kongresi, Kongre Kitabı, s: 265.1994, Antalya.
19.Durmaz R, Tecimer C, Durmaz B ve ark: Malatya'da farklı risk gruplarında anti-HCV pozitifliği. İnfeks Derg 1992, 6: 247-249.
20.Le Pogam S, Le Chapois D, Christen R, et al: Hepatitis C in a hemodialysis unit: Molecular evidence for nosocomial transmission. Clin Microbiol 1998, 36: 3040-3043.
21.Schneeberger PM, Keur I, Van Der Vliet W, et al: Hepatitis C virus infections in dialysis centers in The Netherlands: A national survey by serological and molecular methods. J Clin Microbiol 1998, 36: 1711-1715.
22.Lombardi M, Cerrai T, Geatti S, et al: Results of a national epidemiological investigation among dialysis patients. Survey by the Italian Branch of EDTNA/ERCA. J Nephrol 1999, 12: 322-327.
23.Sandhu J, Preiksitis JK, Campbell PM, Carriere KC, Hessel PA: Hepatitis C prevalence and risk factors in the Northern Alberta dialysis population. Am J Epidemiol 1999, 150: 58-66.
24.Grethe S, Gemsa F, Monazahian M, et al: Molecular epidemiology of an outbreak of HCV in a hemodialysis unit: direct sequencing of HCV-HVR1 as an appropriate tool for phylogenetic analysis. J Med Virol 2000, 60: 152-158.
25.Frusyo N, Hayashi J, Ariyama I, et al: Maintenance hemodialysis decreases serum Hepatitis C virus (HCV) RNA levels in hemodialysis patients with chronic HCV infection. Am J Gastroenterol 2000, 95: 490-496.
26.Natov SN, Lau JY, Bouthot BA, et al: Serologic and virologic profiles of hepatitis C infection in renal transplant candidates. New England Organ Bank Hepatitis C Study Group. Am J Kidney Dis 1998, 31: 920-927.
27.Cerrai T Michelassi S, lerpi C, Toti G, Zignego AL, Lombardi M: Universal precautions and dedicated machines as cheap and effective measures to control HCV spread. EDTNA ERCA J 1998, 24: 43-45, 48.
28.Hino K: Diagnosis of hepatitis C. Intervirology 1994, 37: 77-86.
29.Lok ASF, Gunaratnam NT: Diagnosis of hepatitis C. Hepatology 1997, 26: 494-556.
30.Bozdayi AM, Uzunalimoğlu Ö, Bozkaya H: Türkiye'de kan donörlerinde HCV genotipleri. Gastroenteroloji 1996, 7: 10.
31.Tuncer S, Özkuyumcu C, Arıkan S: PZR ve hepatitis C virus genotipi ile serolojik reaktivite arasındaki ilişkinin değerlendirilmesi. Viral Hepatit Derg 1996, 1: 10-18.
32.Uzunalimoğlu Ö, Çetinkaya H, Bozdayi AM: C hepatitli hastaların genotipleri, interferona cevapları. III. Viral Hepatit Sempozyumu Kitapçığı, s: 18,1996. Viral Hepatitle Savaşım Derneği Yayını, İstanbul.
33.Abacıoğlu YH, Davidson F, Tuncer S, et al: The distribution of hepatitis C virus genotypes in Turkish patients. J Viral Hepatitis 1995, 2: 297-301.
34.Falasca E, Raphenon G, Pipan C, et al: HCV RNA and viral types in dialysis patients in Dakar, Senegal. Clin Microbiol Infect 1999, 5: 230-237.
35.Fabrizi F, Lunghi G, Guarnori I, et al: Hepatitis C virus genotypes in chronic dialysis patients. Nephrol Dial Transplant 1996, 11: 679-683.
36.Abdulkarim AS, Zein NN, Germer JJ, et al: Hepatit C virus genotypes and hepatitis G virus in hemodialysis patients from Syria: Identification of two novel hepatitis C virus subtypes. Am J Trop Med Hyg 1998, 59: 571-576.

APA	BOZDAYI G, ROTA S, VERDİ H, DERİCİ Ü, SİNDEL Ş, BALİ M, BAŞAY T (2002). Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi. , 291 - 299.
Chicago	BOZDAYI Gülendam,ROTA Seyyal,VERDİ Hasibe,DERİCİ Ülver,SİNDEL Şükrü,BALİ Musa,BAŞAY Turgay Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi. (2002): 291 - 299.
MLA	BOZDAYI Gülendam,ROTA Seyyal,VERDİ Hasibe,DERİCİ Ülver,SİNDEL Şükrü,BALİ Musa,BAŞAY Turgay Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi. , 2002, ss.291 - 299.
AMA	BOZDAYI G,ROTA S,VERDİ H,DERİCİ Ü,SİNDEL Ş,BALİ M,BAŞAY T Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi. . 2002; 291 - 299.
Vancouver	BOZDAYI G,ROTA S,VERDİ H,DERİCİ Ü,SİNDEL Ş,BALİ M,BAŞAY T Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi. . 2002; 291 - 299.
IEEE	BOZDAYI G,ROTA S,VERDİ H,DERİCİ Ü,SİNDEL Ş,BALİ M,BAŞAY T "Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi." , ss.291 - 299, 2002.
ISNAD	BOZDAYI, Gülendam vd. "Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi". (2002), 291-299.

APA	BOZDAYI G, ROTA S, VERDİ H, DERİCİ Ü, SİNDEL Ş, BALİ M, BAŞAY T (2002). Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni, 36(3-4), 291 - 299.
Chicago	BOZDAYI Gülendam,ROTA Seyyal,VERDİ Hasibe,DERİCİ Ülver,SİNDEL Şükrü,BALİ Musa,BAŞAY Turgay Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni 36, no.3-4 (2002): 291 - 299.
MLA	BOZDAYI Gülendam,ROTA Seyyal,VERDİ Hasibe,DERİCİ Ülver,SİNDEL Şükrü,BALİ Musa,BAŞAY Turgay Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.36, no.3-4, 2002, ss.291 - 299.
AMA	BOZDAYI G,ROTA S,VERDİ H,DERİCİ Ü,SİNDEL Ş,BALİ M,BAŞAY T Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2002; 36(3-4): 291 - 299.
Vancouver	BOZDAYI G,ROTA S,VERDİ H,DERİCİ Ü,SİNDEL Ş,BALİ M,BAŞAY T Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2002; 36(3-4): 291 - 299.
IEEE	BOZDAYI G,ROTA S,VERDİ H,DERİCİ Ü,SİNDEL Ş,BALİ M,BAŞAY T "Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi." Mikrobiyoloji Bülteni, 36, ss.291 - 299, 2002.
ISNAD	BOZDAYI, Gülendam vd. "Hemodiyaliz hastalarında hepatit C virus (HCV) enfeksiyon varlığının araştırılması ve HCV genotip dağılımının belirlenmesi". Mikrobiyoloji Bülteni 36/3-4 (2002), 291-299.