Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi

Gulay, Zeynep; ERGON, Cem; BİÇMEN, Meral

Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi

Cem ERGON, (Dokuz Eylül Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İzmir, Türkiye)

Meral BİÇMEN, (Dokuz Eylül Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İzmir, Türkiye)

Zeynep GÜLAY (Dokuz Eylül Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İzmir, Türkiye)

ANKEM Dergisi

9 0

Yıl: 2010 Cilt: 24 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 65 - 70 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi

Öz:

Dokuz Eylül Üniversitesi (DEÜ) Tıp Fakültesi Hastanesi’nde hakim olan metisilin dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) klon/klonlarının dünyada iyi bilinen klonların bazıları ile ilişkisinin DNA Sma I makrorestriksiyon analizi (PFGE), ribozomal-spacer (RS) PZR, SCCmec tipi belirlenmesi, multiloküs sekans tiplendirme (MLST) ve spa tiplendirme yöntemleri ile araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya 2002-2003 yıllarında DEÜ hastanesinde yatan farklı hastalardan gönderilen kan kültürlerinden izole edilen ve S.aureus izolatları arasında en sık görülen antibiyogram profilini taşıyan dokuz MRSA suşu alınmıştır. PFGE ile bu MRSA izolatlarının aynı veya çok benzer klonal özellikler taşıdığı gözlenmiştir. SCCmec analizi ve MLST ile de bu klonun, ülkemizde daha önce de bildirilmiş olan ST239-MRSA-III klonunun (Brezilya klonu) bir üyesi olduğu saptanmıştır. SCCmec tipi Tip III olmakla beraber kontrollerden farklı bir patern taşımaktaydı (Tip III varyantı). İzolatların spa paterni WGKAQQ (t030) olarak saptanmıştır. Çalışmada ayrıca pvl geni de araştırılmış ve bu gen MRSA izolatlarının hiçbirinde bulunmamıştır.

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Aires-de-Sousa M, Boye K, de Lencastre H et al: High interlaboratory reproducibility of DNA sequence-based typing of bacteria in a multicenter study, J Clin Microbiol 2006;44(2):619-21.
2. Alp E, Klaassen CH, Doganay M ve ark: MRSA genotypes in Turkey: persistence over 10 years of a single clone of ST239, J Infect 2009;58(6):433-8.
3. Bannerman TL, Hancock GA, Tenover FC, Miller JM: Pulsed-field gel electrophoresis as a replacement for bacteriophage typing of Staphylococcus aureus, J Clin Microbiol 1995;33(3):551-5.
4. Bignardi GE, Woodford N, Chapman A, Johnson AP, Speller DC: Detection of the mec-A gene and phenotypic detection of resistance in Staphylococcus aureus isolates with borderline or lowlevel methicillin resistance, J Antimicrob Chemother 1996;37(1):53-63.
5. Brakstad OG, Aasbakk K, Maeland JA: Detection of Staphylococcus aureus by polymerase chain reaction amplification of the nuc gene, J Clin Microbiol 1992;30(7):1654-60.
6. Cookson BD, Robinson DA, Monk AB et al: Evaluation of molecular typing methods in characterizing a European collection of epidemic methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains: the HARMONY collection, J Clin Microbiol 2007;45(6):1830-7.
7. Deurenberg RH, Vink C, Kalenic S, Friedrich AW, Bruggeman CA, Stobberingh EE: The molecular evolution of methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Clin Microbiol Infect 2007;13(3):222-35.
8. Enright MC, Day NP, Davies CE, Peacock SJ, Spratt BG: Multilocus sequence typing for characterization of methicillin-resistant and methicillinsusceptible clones of Staphylococcus aureus, J Clin Microbiol 2000;38(3):1008-15.
9. Enright MC, Robinson DA, Randle G, Feil EJ, Grundmann H, Spratt BG: The evolutionary history of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), Proc Natl Acad Sci USA 2002;99(11): 7687-92.
10. Faria NA, Oliveira DC, Westh H et al: Epidemiology of emerging methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in Denmark: a nationwide study in a country with low prevalence of MRSA infection, J Clin Microbiol 2005;43(4):1836-42.
11. Frénay HM, Bunschoten AE, Schouls LM et al: Molecular typing of methicillin-resistant Staphylococcus aureus on the basis of protein A gene polymorphism, Eur J Clin Microbiol Infect Dis 1996;15(1): 60-4.
12. Hiramatsu K, Cui L, Kuroda M, Ito T: The emergence and evolution of methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Trends Microbiol 2001;9(10):486-93.
13. International Working Group on the Classification of Staphylococcal Cassette Chromosome Elements (IWG-SCC): Classification of staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec): guidelines for reporting novel SCCmec elements, Antimicrob Agents Chemother 2009;53(12):4961-7.
14. Ito T, Katayama Y, Asada K et al: Structural comparison of three types of staphylococcal cassette chromosome mec integrated in the chromosome in methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Antimicrob Agents Chemother 2001;45(5):1323-36.
15. Katayama Y, Ito T, Hiramatsu K: A new class of genetic element, Staphylococcus cassette chromosome mec, encodes methicillin resistance in Staphylococcus aureus, Antimicrob Agents Chemother 2000;44(6):1549-55.
16. Katayama Y, Ito T, Hiramatsu K: Genetic organization of the chromosome region surrounding mecA in clinical staphylococcal strains: role of IS431-mediated mecI deletion in expression of resistance in mecA-carrying, low-level methicillinresistant Staphylococcus haemolyticus, Antimicrob Agents Chemother 2001;45(7):1955-63.
17. Kobayashi N, Wu H, Kojima K et al: Detection of mecA, femA, and femB genes in clinical strains of staphylococci using polymerase chain reaction, Epidemiol Infect 1994;113(2):259-66.
18. Kumari DN, Keer V, Hawkey PM et al: Comparison and application of ribosome spacer DNA amplicon polymorphisms and pulsed-field gel electrophoresis for differentiation of methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains, J Clin Microbiol 1997;35(4):881-5.
19. Lim TT, Chong FN, O’Brien FG, Grubb WB: Are all community methicillin-resistant Staphylococcus aureus related? A comparison of their mec regions, Pathology 2003;35(4):336-43.
20. Lina G, Piémont Y, Godail-Gamot F et al: Involvement of Panton-Valentine leukocidinproducing Staphylococcus aureus in primary skin infections and pneumonia, Clin Infect Dis 1999;29(5):1128-32.
21. Liu C, Graber CJ, Karr M et al: A population-based study of the incidence and molecular epidemiology of methicillin-resistant Staphylococcus aureus disease in San Francisco, 2004-2005, Clin Infect Dis 2008;46(11):1637-46.
22. Maiden MC, Bygraves JA, Feil E et al: Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms, Proc Natl Acad Sci USA 1998;95(6):3140-5.
23. O’Brien FG, Lim TT, Chong FN et al: Diversity among community isolates of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Australia, J Clin Microbiol 2004;42(7):3185-90.
24. Oliveira DC, de Lencastre H: Multiplex PCR strategy for rapid identification of structural types and variants of the mec element in methicillinresistant Staphylococcus aureus, Antimicrob Agents Chemother 2002;46(7):2155-61.
25. Shopsin B, Gomez M, Montgomery SO et al: Evaluation of protein A gene polymorphic region DNA sequencing for typing of Staphylococcus aureus strains, J Clin Microbiol 1999;37(11):3556-63.
26. Tristan A, Bes M, Meugnier H et al: Global distribution of Panton-Valentine leukocidin-positive methicillin-resistant Staphylococcus aureus, 2006, Emerg Infect Dis 2007;13(4):594-600.
27. Urwin R, Maiden MC: Multi-locus sequence typing: a tool for global epidemiology, Trends Microbiol 2003;11(10):479-87.

APA	ERGON C, BİÇMEN M, Gulay Z (2010). Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi. , 65 - 70.
Chicago	ERGON Cem,BİÇMEN Meral,Gulay Zeynep Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi. (2010): 65 - 70.
MLA	ERGON Cem,BİÇMEN Meral,Gulay Zeynep Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi. , 2010, ss.65 - 70.
AMA	ERGON C,BİÇMEN M,Gulay Z Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi. . 2010; 65 - 70.
Vancouver	ERGON C,BİÇMEN M,Gulay Z Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi. . 2010; 65 - 70.
IEEE	ERGON C,BİÇMEN M,Gulay Z "Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi." , ss.65 - 70, 2010.
ISNAD	ERGON, Cem vd. "Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi". (2010), 65-70.

APA	ERGON C, BİÇMEN M, Gulay Z (2010). Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi. ANKEM Dergisi, 24(2), 65 - 70.
Chicago	ERGON Cem,BİÇMEN Meral,Gulay Zeynep Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi. ANKEM Dergisi 24, no.2 (2010): 65 - 70.
MLA	ERGON Cem,BİÇMEN Meral,Gulay Zeynep Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi. ANKEM Dergisi, vol.24, no.2, 2010, ss.65 - 70.
AMA	ERGON C,BİÇMEN M,Gulay Z Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi. ANKEM Dergisi. 2010; 24(2): 65 - 70.
Vancouver	ERGON C,BİÇMEN M,Gulay Z Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi. ANKEM Dergisi. 2010; 24(2): 65 - 70.
IEEE	ERGON C,BİÇMEN M,Gulay Z "Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi." ANKEM Dergisi, 24, ss.65 - 70, 2010.
ISNAD	ERGON, Cem vd. "Dokuz Eylül Üniversitesi Hastanesi’ndeki dominant metisiline dirençli staphylococcus aureus suşunun moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi". ANKEM Dergisi 24/2 (2010), 65-70.