Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar
Yıl: 2022 Cilt: 27 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 241 - 248 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/flora.20229807 İndeks Tarihi: 10-08-2022
Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar
Öz: Giriş: Hastane kaynaklı Candida infeksiyonları tanısı ve tedavisi zor, yüksek maliyetli infeksiyon hastalıklarıdır. Mortalite oranı diğer infeksiyon hastalıklarına göre çok yüksektir. Uygun antifungal tedavinin zamanında başlanması gerekir. Bu nedenle tanı amaçlı kullandığımız kan kültürlerinde Candida cinsi maya mantarlarının üreme sürelerini hızlandırabilecek ya da daha hızlı tanımlanmalarını sağlayabilecek yaklaşımların geliştirilmesi önemlidir. Bu çalışmada amacımız, kan kültürlerinde saptanan mayaların üreme sürelerini belirlemek, bu etkenlerin tanımlanmasını sağlayan rutinde kullandığımız karbonhidrat asimilasyon yöntemi ile MALDI-TOF MS yönteminin tanımlama sürelerini karşılaştırmak ve bu etkenlerin kan kültürü şişelerinde üremesini hızlandırabilecek yeni yaklaşımlar geliştirmektir. Materyal ve Metod: Çalışmada mayaların üremesini hızlandıracağını düşündüğümüz özel mantar besiyeri hazırlanmıştır. C. albicans ATCC 10231, C. parapsilosis ATCC 22019, C. glabrata ATCC 90030 kökenlerinin seri dilüsyonları hazırlanarak, özel mantar besiyerine ve standart kan kültür şişelerine ekilmiştir. Bulgular: Özel mantar besiyeri eklenmiş şişelerdeki ortalama üreme süresi, eklenmemiş şişelerdeki ortalama üreme süresi ile karşılaştırılmıştır. Aerobik şişelere özel mantar besiyeri eklenmesinin özellikle C. albicans kökeninde üreme süresini iki saat kısalttığı gözlenmiştir. Fakat kökene bakılmaksızın özel mantar besiyeri eklenmiş şişeler ile eklenmemiş şişelerdeki ortalama üreme süreleri istatiksel olarak kıyaslandığında anlamlı bir fark saptanamamıştır (p> 0.05). Bu kan kültürlerinden elde edilen kolonilerin MALDI-TOF MS ile tanımlanması, klasik yöntemlere göre tanımlama süresini 21.5 saat kısalttığı saptanmıştır. Sonuç: Kan kültürü kandidemi tanısında altın standart yöntemdir. Üreme süresine tür tanımlaması ve duyarlılık testleri eklendiğinde, hedefe yönelik tedavinin başlanması 36-48 saati aşmaktadır. Bu sürenin kısaltılmasına yönelik yaklaşımlar hayat kurtarıcı olacaktır.
Anahtar Kelime: Growth Time of Candida Species in Blood Culture Bottles and Approaches to Improve This Time
Öz: Introduction: Hospital-acquired Candida infections are difficult to diagnose and treat, and are costly infectious diseases. Mortality rates are very high when compared to those of other infectious diseases. Antifungal therapy should be initiated without delay. Therefore, it is important to develop an approach that accelerates the fungal growth rate and help faster identification in patients with positive blood cultures with Candida species. In this study, our aim is to determine the distribution of yeasts isolated from blood cultures and to determine their growth times, to compare the identification times by MALDI-TOF MS method and by the carbohydrate assimilation method, and to develop new approaches to accelerate their growing time in blood culture bottles. Materials and Methods: In our study, the special fungal medium, which was thought to accelerate the growth of yeasts, was prepared. Serial dilutions of C. albicans ATCC 10231, C. parapsilosis ATCC 22019, C. glabrata ATCC 90030 strains were prepared and inoculated in special fungal medium and standard blood culture bottles. Results: The mean time to positivity in blood culture bottles supplemented with special fungal medium was compared to blood culture bottles without supplementation. It was observed that the addition of a special fungal medium to the aerobic bottles shortened about two hours the growing time of C. albicans. However, no significant difference was found when the mean growth times of the bottles with special fungal medium added and the bottles without added were biostatistically compared, regardless of strain. (p> 0.05). The identification of the colonies by MALDI-TOF MS shortened the identification time about 21.5 hours when compared to the classical methods. Conclusion: Blood culture is the gold standard method in the diagnosis of candidemia. If the identification and the susceptibility testing periods are added into the growth time, the implementation of targeted therapy exceeds 36-48 hours. Any approaches for shortening this period would be life-saving procedures.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- 1. Weinstein MP, Reller LB, Murphy JR, Lichtenstein KA. The clinical significance of positive blood cultures: A comprehensive analysis of 500 episodes of bacteremia and fungemia in adults. I. Laboratory and epidemiologic observations. Rev Infect Dis 1983;5:35-53. https://doi.org/10.1093/ clinids/5.1.35
- 2. Nucci M, Colombo AL, Silveira F, Richtmann R, Salomao R, Branchini ML, et al. Risk factors for death in patients with candidemia. Infect Control Hosp Epidemiol 1998;19:846- 50. https://doi.org/10.2307/30141563
- 3. Lin S, Chen R, Zhu S, Wang H, Wang L, Zou J, et al. Candidemia in adults at a tertiary hospital in china: Clinical characteristics, species distribution, resistance, and outcomes. Mycopathologia 2018;183:679-89. https://doi. org/10.1007/s11046-018-0258-5
- 4. Ishikane M, Hayakawa K, Kutsuna S, Takeshita N, Ohmagari N. Epidemiology of blood stream infection due to Candida species in a tertiary care hospital in japan over 12 years: Importance of peripheral line-associated candidemia. PLoS One 2016;11:e0165346. https://doi.org/10.1371/ journal.pone.0165346
- 5. Spiers R, Smyth B, Lamagni T, Rooney P, Dorgan E, Wyatt T, et al. The epidemiology and management of candidemia in Northern Ireland during 2002-2011, including a 12-month enhanced case review. Med Mycol 2019;57:23-9. https:// doi.org/10.1093/mmy/myx165
- 6. Garey KW, Rege M, Pai MP, Mingo DE, Suda KJ, Turpin RS, et al. Time to initiation of fluconazole therapy impacts mortality in patients with candidemia: A multi-institutional study. Clin Infect Dis 2006;43:25-31. https://doi. org/10.1086/504810
- 7. Puig-Asensio M, Padilla B, Garnacho-Montero J, Zaragoza O, Aguado JM, Zaragoza R, et al. Epidemiology and predictive factors for early and late mortality in Candida bloodstream infections: A population-based surveillance in Spain. Clin Microbiol Infect 2014;20:245-54. https://doi. org/10.1111/1469-0691.12380
- 8. Atlas RM. Handbook of microbiological media. 3rd ed. Boca Raton, Fla: CRC Press;2004.
- 9. De Hoog GS. Atlas of Clinical Fungi. 2nd ed. ASM Press;2000.
- 10. Nylen T, Saeedi B, Borg C, Ullberg M, Ozenci V. The performance of 4 different supplements and 5 blood culture bottles types in detection of bacteria and Candida spp. in simulated sterile body fluid cultures. Diagn Microbiol Infect Dis 2013;77:1-4. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio. 2013.05.017
- 11. Edmond MB, Wallace SE, McClish DK, Pfaller MA, Jones RN, Wenzel RP. Nosocomial bloodstream infections in United States hospitals: A three-year analysis. Clin Infect Dis 1999;29:239-44. https://doi.org/10.1086/520192
- 12. Pfaller M, Neofytos D, Diekema D, Azie N, Meier-Kriesche HU, Quan SP, et al. Epidemiology and outcomes of candidemia in 3648 patients: Data from the Prospective Antifungal Therapy (PATH Alliance(R)) registry, 2004-2008. Diagn Microbiol Infect Dis 2012;74:323-31. https://doi. org/10.1016/j.diagmicrobio.2012.10.003
- 13. Hajjeh RA, Sofair AN, Harrison LH, Lyon GM, Arthington- Skaggs BA, Mirza SA, et al. Incidence of bloodstream infections due to Candida species and in vitro susceptibilities of isolates collected from 1998 to 2000 in a population-based active surveillance program. J Clin Microbiol 2004;42:1519-27. https://doi.org/10.1128/ JCM.42.4.1519-1527.2004
- 14. Gültekin B, Eyigör M, Telli M, Aksoy M, Aydın N. Yedi yillik dönemde kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin retrospektif olarak incelenmesi. ANKEM. 2010;24:202-8.
- 15. Alışkan HE, Bozkırlı ED, Çolakoğlu Ş, Demirbilek M. Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi. Türk Hij Den Biyol Derg 2016;73:15-24. https://doi. org/10.5505/TurkHijyen.2016.49369
- 16. Atalay MA, Sav H, Demir G, Koç N. Kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımı ve amfoterisin B ve flukonazole in vitro duyarlılıkları. Selçuk Tıp 2012;28:149-51.
- 17. Lai CC, Wang CY, Liu WL, Huang YT, Hsueh PR. Time to positivity of blood cultures of different Candida species causing fungaemia. J Med Microbiol 2012;61:701-4. https:// doi.org/10.1099/jmm.0.038166-0
- 18. Yaman G, Akyar I, Can S. Evaluation of the MALDI TOF-MS method for identification of Candida strains isolated from blood cultures. Diagn Microbiol Infect Dis 2012;73:65-7. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2012.01.013
- 19. Spanu T, Posteraro B, Fiori B, D’Inzeo T, Campoli S, Ruggeri A, et al. Direct MALDI-TOF mass spectrometry assay of blood culture broths for rapid identification of Candida species causing bloodstream infections: an observational study in two large microbiology laboratories. J Clin Microbiol 2012;50:176-9. https://doi.org/10.1128/JCM.05742-11
- 20. Phoompoung P, Chayakulkeeree M. Recent progress in the diagnosis of pathogenic candida species in blood culture. Mycopathologia 2016;181:363-9. https://doi. org/10.1007/s11046-016-0003-x
- 21. Ferroni A, Suarez S, Beretti JL, Dauphin B, Bille E, Meyer J, et al. Real-time identification of bacteria and Candida species in positive blood culture broths by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. J Clin Microbiol 2010;48:1542-8. https://doi.org/10.1128/ JCM.02485-09
- 22. Panda A, Ghosh AK, Mirdha BR, Xess I, Paul S, Samantaray JC, et al. MALDI-TOF mass spectrometry for rapid identification of clinical fungal isolates based on ribosomal protein biomarkers. J Microbiol Methods 2015;109:93-105. https:// doi.org/10.1016/j.mimet.2014.12.014
- 23. Cuenca-Estrella M, Verweij PE, Arendrup MC, Arikan-Akdagli S, Bille J, Donnelly JP, et al. ESCMID guideline for the diagnosis and management of Candida diseases 2012: Diagnostic procedures. Clin Microbiol Infect 2012;18(7):9- 18. https://doi.org/10.1111/1469-0691.12038
- 24. Huang AM, Newton D, Kunapuli A, Gandhi TN, Washer LL, Isip J, et al. Impact of rapid organism identification via matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight combined with antimicrobial stewardship team intervention in adult patients with bacteremia and candidemia. Clin Infect Dis 2013;57:1237-45. https://doi.org/10.1093/cid/ cit498
- 25. Taur Y, Cohen N, Dubnow S, Paskovaty A, Seo SK. Effect of antifungal therapy timing on mortality in cancer patients with candidemia. Antimicrob Agents Chemother 2010;54:184-90. https://doi.org/10.1128/AAC.00945-09
| APA | Şahin E, Kalkanci A (2022). Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar. , 241 - 248. 10.5578/flora.20229807 |
| Chicago | Şahin Elif Ayça,Kalkanci Ayse Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar. (2022): 241 - 248. 10.5578/flora.20229807 |
| MLA | Şahin Elif Ayça,Kalkanci Ayse Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar. , 2022, ss.241 - 248. 10.5578/flora.20229807 |
| AMA | Şahin E,Kalkanci A Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar. . 2022; 241 - 248. 10.5578/flora.20229807 |
| Vancouver | Şahin E,Kalkanci A Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar. . 2022; 241 - 248. 10.5578/flora.20229807 |
| IEEE | Şahin E,Kalkanci A "Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar." , ss.241 - 248, 2022. 10.5578/flora.20229807 |
| ISNAD | Şahin, Elif Ayça - Kalkanci, Ayse. "Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar". (2022), 241-248. https://doi.org/10.5578/flora.20229807 |
| APA | Şahin E, Kalkanci A (2022). Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 27(2), 241 - 248. 10.5578/flora.20229807 |
| Chicago | Şahin Elif Ayça,Kalkanci Ayse Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 27, no.2 (2022): 241 - 248. 10.5578/flora.20229807 |
| MLA | Şahin Elif Ayça,Kalkanci Ayse Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, vol.27, no.2, 2022, ss.241 - 248. 10.5578/flora.20229807 |
| AMA | Şahin E,Kalkanci A Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2022; 27(2): 241 - 248. 10.5578/flora.20229807 |
| Vancouver | Şahin E,Kalkanci A Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2022; 27(2): 241 - 248. 10.5578/flora.20229807 |
| IEEE | Şahin E,Kalkanci A "Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar." Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 27, ss.241 - 248, 2022. 10.5578/flora.20229807 |
| ISNAD | Şahin, Elif Ayça - Kalkanci, Ayse. "Kan Kültürlerinde Candida Türlerinin Üreme Süreleri ve Bu Sürenin Kısaltılmasına Yönelik Yaklaşımlar". Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 27/2 (2022), 241-248. https://doi.org/10.5578/flora.20229807 |
