Yıl: 2022 Cilt: 7 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 76 - 83 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.35229/jaes.1015903 İndeks Tarihi: 30-09-2022

Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi

Öz:
Bu çalışma ile Rize İlinde yayılım gösteren 8 Rubus taksonu morfolojik, mikromorfolojik ve moleküler sistematik yönden araştırıldı. Bitki materyalleri 2019 yılında yapılan arazi çalışmaları ile toplandı. Araştırma bölgesinden toplanan örnekler teşhis edildi ve herbaryum haline getirildi. Bu taksonların gövde, yaprak ve çiçek gibi bitki kısımları stereomikroskopta morfolojik, SEM’de ise mikromorfolojik olarak incelendi. Sonrasında örneklere ait ITS bölgeleri PCR ile çoğaltılarak dizi analizi yapıldı. Analiz sonucu 8 takson arasındaki benzerlik ilişkisini ortaya koyan filogenetik ağaç oluşturuldu. Mikromorfolojik görüntülere bakıldığında 8 takson arasında gövde, yaprak tüylenmesi, tüy tipleri ve diken yapısının ayırıcı özellikte olduğu tespit edildi. Morfolojik bulgular sonucunda 8 Rubus taksonunun yaprak, meyve, diken, petal, yaprak ve yaprakçık ölçüsü, meyve tanelerinin yapısı, sayısı ve şekli, yaprak alt ve üst yüzey, petal yüzeyi tüylenme durumu, meyve ve sepallerin rengi, yaprak kenarı yapısı bakımından birbirinden ayrıldığı, bu özelliklerin karakteristik olduğu belirlendi. Moleküler bulgular sonucu Rubus taksonlarının dizi analizi sonucunda ortalama baz uzunluğunun 709 ile 731 bp arasında değiştiği belirlendi. Oluşturulan filogenetik ağaç sonucunun Rosacea familyasına en yakın taksonun Rubus hirtus ve Rubus tereticaulis, en uzak takson ise Rubus sanctus olduğu belirlendi.
Anahtar Kelime: : Rubus Morfoloji Mikromorfoloji ITS Filogenetik Ağaç PCR.

Analysis Of Morphological, Micromorphologica And Molecular Systematic Properties Of Rubus L. (Rosaceae) Species In Rize Province

Öz:
Rubus taxa in Rize province were compared morphologically and micromorphological along with molecular systematic of plants in this work. Analysed plant materials were sampled during field studies conducted in 2019. The collected samples were identified according to known methods and were transferred into herbarium plants. A total of 8 taxa belonging to rubus species were found. Plant parts such as stem, leaves and flowers was examined morphologically and micromorphologically under stereo microscope and SEM. Then, plant genomic DNA was isolated from fresh leaf samples by suitable methods to determine ITS profiles. Then the ITS regions were amplified by PCR and sequenced. A phylogenetic tree showing the similarity among this 8 taxa was then created based on the sequence analysis. The stem, leaf trichomes, trichome types and thorn structure were found to be distinctive among these 8 taxa when micromorphological images were examined. As a result of morphological findings, Rubus plants constitute 8 distinct taxons in terms of leaf, fruit, thorn, shape, petal, leaf and leaflet size, structure, number and shape of fruit grains, leaf adaxial and abaxial surface, trichome amount of petal surface, color of fruit and sepals and leaf edge structure. These features were characteristic for all the taxons examined. Molecular data showed that the average base length of rubus taxa was found to be between 709 and 731 bps. Created phylogenetic tree revealed that the taxa closest to the Rosacea family were Rubus hirtus and Rubus tereticaulis while the most distant taxa was Rubus sanctus.
Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
  • Aksoy, K.P. (2013). Rize ili sınırları içerisinde yetişen Sorbus L. (Rosaceae) türlerinin ekolojik, morfolojik ve anatomik incelenmesi. Yüksek Lisans Tezi, Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Anabilim Dalı, Rize, Türkiye, 178s.
  • Atamov, V. & Çobanoğlu, M. (2019). Floristic Diversity of Handüzü Natural Park and Environs, Turkey. KSU J. Agric Nat, 22(Suppl 1), 84-90.
  • Batan, N., Atamov, V., Ekşi, S. & Erata, H. (2018). Contrubition to the bryophyte flora of the İkizdere district (Rize, Turkey), Phytologıa Balcanica 24(1), 9-15.
  • Baykal, H., Atamov, V. & Yüksek, T. (2018). Tunca Vadisi Tabiat Parkı ve çevresinin florası (Ardeşen-Rize / Türkiye), Biological Diversity and Conservation, 11(2), 9-24.
  • Baykal, H. & Atamov, V. (2018). Flora of Isırlık natural park and environs (Rize-Turkey), OT Sistematik Botanik Dergisi, 25(2), 151-170.
  • Çobanoğlu, M. (2012). Güneysu-Çağrankaya Arası Bölgenin Flora ve Vejetasyonu. Yüksek Lisans Tezi Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Rize, Türkiye, 178s.
  • Davis, P.H. (1972). Flora of Turkey and The East Aegean Island. Edinburgh:University Press, Edinburgh, 4, 540-41.
  • Demir, E. & Atamov, V. (2019). Galerdüzü-Ceymakçur yaylaları (Çamlıhemşin / Rize) arasında kalan bölgenin florası. Anadolu Çev. ve Hay. Dergisi, 4(2), 201-210.
  • Demir, E. (2013). Ayder-Cemakçur (Çamlıhemşin/Rize) Yaylalarının Florası ve Yöre Ballarının Kimyasal ve Palinolojik Özellikleri. Yüksek Lisans Tezi. Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Rize. Türkiye, 118s, 18-40.
  • Eker, S. & Kolören, O. (2017). Yabancı Otların Moleküler Teşhisinde ribozomal RNA (rRNA) internal transcrıbed spacer (ITS) gen bölgelerinin kullanımı. Ordu Üniversitesi Bilim Teknik Dergisi, 7(1), 11-21.
  • Ekşi, S. (2016). Çamlık ve Cimil Deresi (İkizdere/Rize) Çevresinin Briyofit Florasi. Yüksek Lisans Tezi. Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Rize. Türkiye, 63s.
  • Eminağaoğlu, Ö., Yılmaz, H., Aksoy, N., Ok, T., Fırat, M., Akyıldırım Beğen, H. & Akkemik, Ü. (2021). Rosaceae. Şu eserde: Akkemik, Ü. (ed.). Türkiye’nin Bütün Ağaçları ve Çalıları. Türkiye İş Bankası Yayınları, 965-1125s.
  • Gedik, Y. (2019). Samsun çevresinde yayılış gösteren bazı dikotil bitkilerin yaprakları üzerinde morfolojik, anatomik ve mikromorfolojik bir çalışma. Yüksek Lisans Tezi. Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Samsun, Türkiye, 94s.
  • Günay, M. (2015). Rubus idaeus L (Ahududu) ve Punica granatum L. (Nar) meyvelerinden izole edilen maya türlerinin moleküler düzeyde tanımlanması ve hücre dışı enzim aktivitelerinin belirlenmesi. Yüksek Lisans Tezi. Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Çanakkale, Türkiye, 140s.
  • Güner, A. (1984). Rize Florasına Hazırlık I, Rize ‘den Bitki Toplayanlar Listesi. Doğa Bil. Derg. 8(2), 278-281.
  • Güner, A., Aslan, S., Ekim, T., Vural, M. & Babaç, M.T. (2012). Türkiye bitkileri listesi (damarlı bitkiler). Nezahat Gökyiğit Botanik Bahçesi ve Flora Araştırmaları Derneği Yayını. İstanbul. 1. Baskı, ISBN: 978-605-60425-7-7, 1290 s., 488- 500.
  • Güzel, M.E. (2018). Çeşitlilik merkezi GB Asya olan Lactucinae (Asteraceae) alt tribusunun Türkiye odaklı biyosistematik revizyonu. Doktora Tezi, Karadeniz Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Trabzon, Türkiye, 355s.
  • Haymes, K.M. (1996). Mini-prep method suitable for a plant breeding program. Plant Molecular Biology Reporter, 14(3), 280-284.
  • Hekimoğlu, E. (2019). Endemik Lathyrus undulatus Boiss. (Fabaceae) türü üzerinde morfolojik, anatomik, palinolojik ve karyolojik araştırmalar. Yüksek Lisans Tezi. Bursa Uludağ Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bursa, Türkiye, 59s.
  • Işık, G. (2014). Rubus L. cinsi Glandulosı subseksiyonunun ekolojik genetiği. Doktora Tezi. Anadolu Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Eskişehir, Türkiye, 182s.
  • Koday, Z. & Erhan, K. (2013). Rize İlinin idari coğrafya analizi. Atatürk Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Dergisi, 50, 39-54.
  • Kuyumcu, F. (2020). Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi. Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Rize. Türkiye, 86s.
  • Ofluoğlu, E. (2015). Kaçkar Dağları Milli Parkı Sınırları İçerisinde Rhododendron L. (Ericaceae) Cinsine Ait Taksonların Moleküler Sistematik Özellikleri. Yüksek Lisans Tezi. Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Rize. Türkiye, 80s.
  • Özer, C. (2017). Çamlıhemşin (Rize) yüksek dağ kesimlerindeki Trifolium L. (Fabaceae) cinsine ait bazı taksonların yem değerliliğinin (kaloriliğinin) araştırılması. Yüksek Lisans Tezi. Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Rize, Türkiye, 80 s.
  • Polat, İ. & Göçmen, M. (2008). Karadeniz Bölgesinden seçilen bazı kırmızı ahududu (Rubus idaeus L.) tiplerinin genetik farklılığının RAPD tekniği ile belirlenmesi, Akdeniz Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 21(2), 185-191.
  • Sarıgül, A. (2018). Kaçkar Dağları Milli Parkı (Rize) Sınırları İçerisindeki Eğrelti Florası ve Taksonların Morfolojik ve Ekolojik Özellikleri. Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Rize, Türkiye, s. 96, 25-85.
  • Süzen, A. (2017). Ambarlık Yaylası (Çamlıhemşin / Rize)'nın Florası ve Vejetasyonu. Yüksek Lisans Tezi. Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Rize. Türkiye, s. 160, 23-103.
  • Toker, M.C. (2004). Bitki morfolojisi. Ankara Üniversitesi Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, II. Baskı, Ankara, 140 s.
  • URL-1, (2020). https://www.genome.jp/tools- bin/clustalw. (7 Ocak 2020).
  • URL-2, (2020). http://www.endmemo.com/bio/gc.php(7 Ocak 2020).
  • Vural, M., 1996. Rize‟nin Yüksek Dağ Vejetasyonu. Turkish Journal of Botany, 20, 83-102.
APA KUYUMCU F, BERIS F, ATAMOV V (2022). Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi. , 76 - 83. 10.35229/jaes.1015903
Chicago KUYUMCU FATMA,BERIS FATIH SABAN,ATAMOV Vagif Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi. (2022): 76 - 83. 10.35229/jaes.1015903
MLA KUYUMCU FATMA,BERIS FATIH SABAN,ATAMOV Vagif Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi. , 2022, ss.76 - 83. 10.35229/jaes.1015903
AMA KUYUMCU F,BERIS F,ATAMOV V Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi. . 2022; 76 - 83. 10.35229/jaes.1015903
Vancouver KUYUMCU F,BERIS F,ATAMOV V Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi. . 2022; 76 - 83. 10.35229/jaes.1015903
IEEE KUYUMCU F,BERIS F,ATAMOV V "Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi." , ss.76 - 83, 2022. 10.35229/jaes.1015903
ISNAD KUYUMCU, FATMA vd. "Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi". (2022), 76-83. https://doi.org/10.35229/jaes.1015903
APA KUYUMCU F, BERIS F, ATAMOV V (2022). Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi. JOURNAL OF ANATOLIAN ENVIRONMENTAL AND ANIMAL SCIENCES, 7(1), 76 - 83. 10.35229/jaes.1015903
Chicago KUYUMCU FATMA,BERIS FATIH SABAN,ATAMOV Vagif Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi. JOURNAL OF ANATOLIAN ENVIRONMENTAL AND ANIMAL SCIENCES 7, no.1 (2022): 76 - 83. 10.35229/jaes.1015903
MLA KUYUMCU FATMA,BERIS FATIH SABAN,ATAMOV Vagif Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi. JOURNAL OF ANATOLIAN ENVIRONMENTAL AND ANIMAL SCIENCES, vol.7, no.1, 2022, ss.76 - 83. 10.35229/jaes.1015903
AMA KUYUMCU F,BERIS F,ATAMOV V Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi. JOURNAL OF ANATOLIAN ENVIRONMENTAL AND ANIMAL SCIENCES. 2022; 7(1): 76 - 83. 10.35229/jaes.1015903
Vancouver KUYUMCU F,BERIS F,ATAMOV V Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi. JOURNAL OF ANATOLIAN ENVIRONMENTAL AND ANIMAL SCIENCES. 2022; 7(1): 76 - 83. 10.35229/jaes.1015903
IEEE KUYUMCU F,BERIS F,ATAMOV V "Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi." JOURNAL OF ANATOLIAN ENVIRONMENTAL AND ANIMAL SCIENCES, 7, ss.76 - 83, 2022. 10.35229/jaes.1015903
ISNAD KUYUMCU, FATMA vd. "Rize İl Sınırları İçerisindeki Rubus L. (Rosaceae) Türlerinin Morfolojik, Mikromorfolojik ve Moleküler Sistematik Özelliklerinin Analizi". JOURNAL OF ANATOLIAN ENVIRONMENTAL AND ANIMAL SCIENCES 7/1 (2022), 76-83. https://doi.org/10.35229/jaes.1015903