Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü
Yıl: 2022 Cilt: 32 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 300 - 309 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.29133/yyutbd.1039398 İndeks Tarihi: 25-10-2022
Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü
Öz: Bu çalışmada, domateste bazı hastalık ve zararlılar için geliştirilen SCAR ve CAPS markörlerinin moleküler markör destekli seleksiyon çalışmalarında geçerliliğini kontrol etmek amaçlanmıştır. Bu amaçla Domates lekeli solgunluk virüsü (TSWV), Fusarium solgunluğu (FOL), Domates yaprak kıvırcıklığı virüsü (TYLCV), kök-ur nematodu (RKN), gibi hastalık ve zararlılara dayanıklılık için geliştirilmiş olan moleküler markörler test edilmiştir. Bu markörlerden, TSWV için SCAR Scr-001 markörü, FOL için CAPS TAO1 markörü ve P743DF3- P743DR3, P743DF1-P743DR1, At2F- At2R SCAR markörleri; TYLCV için SCAR P6-25 markörü, RKN için SCAR Mi-23 ve PMİ markörleri kullanılmıştır. Bu markörlerin kontrolü, 9’u ticari 12’si yerli çeşit ve kontrol grubu olarak da Mountain Merit, NCICELBR ve NCI123S genotipleri olmak üzere 24 domates genotipinde PCR yöntemiyle yapılmıştır. TSWV için SCAR Scr-001 markörü; FOL için TAO1 CAPS markörü ve P743DF3-P743DR3, P743DF1-P743DR1, At2-F- At2-R SCAR markörleri; TYLCV için P6-25 SCAR markörü ve RKN için SCAR Mi-23 ve PMİ markörlerinden sonuç alınabilmiştir. Bu bağlamda sonuç alınan SCAR ve CAPS markörlerinin domateste moleküler yardımlı seleksiyon çalışmalarında etkin bir şekilde kullanılabileceği sonucuna varılmıştır.
Anahtar Kelime: Validity Control of Markers Used in Molecular Marker Assisted Selection in Tomato
Öz: This study aimed to check the validity of the SCAR and CAPS markers developed for certain diseases and pests on some tomato cultivars and genotypes in molecular marker-assisted selection. For this purpose, developed molecular markers for resistance were tested for tomato wilt virus (TSWV), Fusarium wilt (FOL), Tomato leaf curl virus (TYLCV), and root-knot nematode (RKN). SCAR Scr-001 markers for TSWV, TAO1 CAPS marker, and P743DF1-P743DR1, P743DF3- SCAR P6-25 markers for FOL; Scar P6-25 marker which TYLCV; SCAR Mi-23 and PMI, of RKN, CAPS APS and C8B markers for P743DR3, P743DF1-P743DR1, At2F- ToMV were selected. These selected markers were screened in 24 tomato genotypes, 9 of which were commercial and 12 local genotypes as well as the control group, Mountain Merit, NCICELBR, and NCI123S. SCAR Scr-001 marker for TSWV; TAO1 CAPS marker and P743DF3- P743DR3, P743DF1-P743DR1, At2-F-At2-R SCAR markers for FOL; P6-25 SCAR marker for TYLCV; and SCAR Mi-23 and PMI markers for RKN gave results. In this context, it was concluded that the mentioned markers could be efficiently used in marker-assisted selection studies in tomatoes.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- Arens, P., Mansilla, C., Deinum, D., Cavellini, L., Moretti, A., Rolland, S., & Mathis, R. (2010). Development and evaluation of robust molecular markers linked to disease resistance in tomato for distinctness, uniformity and stability testing. Theoretical and Applied Genetics, 120(3), 655- 664.
- Azeri, T. (1981). Preliminary report of tomato spotted wilt virus (TSWV) and its epidemy on tobacco in the Canakkale region of Turkey. Journal of Turkish Phytopathology. 10(2/3), 79-87.
- Barillas, A. C., Mejia, L., Sanchez-Perez, A., Maxwell, D. P. (2008). CAPS and SCAR markers for detection of I-3 gene introgression for resistance to Fusarium oxysporium f. sp. lycopersici race 3. Rep Tomato Genetic. Coop, 58, 11-17.
- Cho, JJ., Mau, RFL., German, TL., Hartmann, RW., Yudin, LS., Gonsalves, D., Provvidenti, R. (1989). A multidisciplinary approach to management of Tomato spotted wilt virus in Hawaii. Plant Disease, 73, 375-383.
- Collard, B. C., Mackill, D. J. (2008). Marker-assisted selection: an approach for precision plant breeding in the twenty-first century. Philosophical Transactions of the Royal Society of London B: Biological Sciences, 363(1491), 557-572.
- Çolak Ateş, A., Daşgan, H. Y., Fidan, H., & Karacaoğlu, M. (2017). Farklı Domates Genotiplerinde Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici ve Tomato Yellow Leaf Curl Virus Dayanıklılık Durumlarının Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Belirlenmesi. TÜBİTAK TOVAG Proje no: 213O103.
- Dianese E. C., Fonseca, M.E. Goldbach, R., Kormelink, R., Inoue-Nagata, A. K. Resende, R.O., Boiteux, L.S. (2010). Development of a locus-specific, co-dominant SCAR marker for assisted- selection of the Sw-5 (Tospovirus resistance) gene cluster in a wide range of tomato accessions. Molecular Breeding, 25:113-142.
- Dilmaç, M., Dinler, H., Kaki, B. (2020). Nonpatojen Fusarium spp.'lerinin nohutta Fusarium solgunluğuna karşı in vitro koşullarda antagonist etkilerinin belirlenmesi. Türk Tarım ve Doğa Bilimleri Dergisi, 7(3), 775-792.
- Doyle J.J., Doyle J.L. (1990). Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, 12: 13-15. El Mehrach, K., Hatimi, A., Gharsallah Chouchane, S., Salus, M. S., Martin, C. T., Maxwell, D. P., &
- Vidavski, F. (2005). PCR-based methods for tagging the Mi-1 locus for resistance to root-knot nematode in begomovirus-resistant tomato germplasm. Acta Horticulture. 695, 263-270.
- Ertuş, M. M., Sabanci, C. O., & Şensoy, S. (2014). The determination of moleculer diversity among some alfalfa (Medicago sativa L.) ecotypes using RAPD markers. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi, 24(1), 7-15.
- Filiz, E., Koç, İ. (2011). Bitki biyoteknolojisinde moleküler markörler. Gaziosmanpaşa Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, (2): 207-214.
- Güleç, T. E., Yıldırım, A., & Sönmezoğlu, Ö. A. (2010). Bitkilerde markör destekli seleksiyon. Türk Bilimsel Derlemeler Dergisi, 3(2), 67-79.
- Grube, R. C., Radwanski, E. R., & Jahn, M. (2000). Comparative genetics of disease resistance within the Solanaceae. Genetics, 155(2), 873-887.
- Güldür, M. E. (1997). Şanlıurfa ili için yeni bir virüs: Domates lekeli solgunluk virüsü (TSWV). Harran Üniv. Ziraat Fak. Dergisi, 1(3), 71-76.
- Ji, Y., Betteray, B., Smeets, J., Jensen, K. S., Mejía, L., Scott, J. W., & Maxwell, D. P. (2008). Codominant SCAR marker, P6-25, for detection of Ty-3, Ty-3a and Ty-3b introgressions from three Solanum chilense accessions at 25 cM of chromosome 6 of Begomovirus-resistant tomatoes. Proc Tomato Breeders Table, Tampa, FL, USA. roundtable08. ifas. ufl. edu/Schedule. htm.
- Jiang, G., Qu, W., Cruz, Y., Chang, C. J., Ho, G. Y., Klein, R. S., Burk, R. D. (1997). PCR detection of human papillomavirus: comparison between MY09/MY11 and GP5+/GP6+ primer systems. Journal of Clinical Microbiology, 35(6), 1304-1310.
- Özarslandan, A., Ekbiç, E., & Elekcioğlu, İ. H. (2010). Domateste Kök ur nematodu (Meloidogyne javanica (Treub, 1885) Chitwood)’na dayanıklılık sağlayan Mi-1.2 geninin Mi23 SCAR markırı ile belirlenmesi. Turkish Journal of Entomology, 35(4), 677-686.
- Pandey, K. K., Pandey, P. K., Kalloo, G., & Banerjee, M. K. (2003). Resistance to early blight of tomato with respect to various parameters of disease epidemics. Journal of General Plant Pathology, 69(6), 364-371.
- Pınar, H., Atilla, A., Keleş, D., Mutlu, N., Denli, N., & Mustafa, Ü. (2013a). Domates hatlarında Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici’ye dayanıklılığın moleküler markörler yardımıyla belirlenmesi. Derim, 30(1), 15-23.
- Pınar, H., Atilla, A., Keleş, D., Mutlu, N., Denli, N., & Mustafa, Ü. (2013b). Domateste bazı hastalık ve zararlılara dayanıklı hat ve çeşit geliştirmede moleküler markörlerin kullanımı. Alatarım, 12(1), 10-18.
- Prasanna, H. C., D. P., Rai, G.K, Krishna, R., Kashyap, S.P., Singh, N. K., & Malathi, V.G. (2015). Pyramiding Ty-2 ve Ty-3 genes for resistance to monopartite and bipartite tomato leaf curl viruses of India. Plant Pathology, 64(2), 256-264.
- Roselló, S., Ricarte, B., José Díez, M., & Nuez, F. (2001). Resistance to tomato spotted wilt virus introgressed from Lycopersicon peruvianum in line UPV 1 may be allelic to Sw-5 and can be used to enhance the resistance of hybrids cultivars. Euphytica, 119(3), 357-367
- Shi A, Vierling R, Grazzini R, Chen P, Caton H, Panthee D (2011) Identification of molecular markers for Sw-5 gene of tomato spotted wilt virus resistance. Am. J Biotechnol. Mol. Sci. 1: 8–16.
- Seah, S., Williamson, V. M., Garcia, B. E., Mejia, L., Salus, M. S., Martin, C. T., & Maxwell, D. P. (2007). Evaluation of a co-dominant SCAR marker for detection of the Mi-1 locus for resistance to root-knot nematode in tomato germplasm. Report of the Tomato Genetics Cooperative, 57: 37-40.
- Sensoy, S., Demir, S., Buyukalaca, S., & Abak, K. (2007). Response of Turkish melon genotypes to Fusarium oxysporum f. sp. melonis race 1 determined by inoculation tests and RAPD markers. European Journal of Horticultural Science, 72(5), 220.
- Staniaszek, M., Kozik, E. U., & Marczewski, W. (2007). A. CAPS marker TAO1902 diagnostic for the I-2 gene conferring resistance to Fusarium oxyporum f.sp. lycopersici race 2 in tomato. Plant Breeding, 126(3), 331-333.
- Taş, K. , Balkaya, A. & Uncu, A. T. (2021). Capsicum chinense Türüne Ait Biber Popülasyonunun SSR Molekülerleri ile Karakterizasyonu. Yuzuncu Yıl University Journal of Agricultural Sciences, 31 (3),722-732. DOI: 10.29133/yyutbd.928181
- Tekinel, N., Dolar, MS., Sağsöz, S., & Salcan, Y. (1969). Mersin Bölgesinde ekonomik bakımdan önemli bazı sebzelerin virüsleri üzerinde araştırmalar. Bitki Koruma Bülteni, 9: 37-49.
- Thorne, G. (1962). Principles of nematology. Soil Science, 93(1), 70.
- Trudgill, D. L., Blok, V. C. (2001). Apomictic, polyphagous root-knot nematodes: exceptionally successful and damaging biotrophic root pathogens. Annual Review of Phytopathology, 39(1), 53-77.
| APA | Uçar C, SENSOY S (2022). Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü. , 300 - 309. 10.29133/yyutbd.1039398 |
| Chicago | Uçar Ceylan Pınar,SENSOY SUAT Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü. (2022): 300 - 309. 10.29133/yyutbd.1039398 |
| MLA | Uçar Ceylan Pınar,SENSOY SUAT Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü. , 2022, ss.300 - 309. 10.29133/yyutbd.1039398 |
| AMA | Uçar C,SENSOY S Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü. . 2022; 300 - 309. 10.29133/yyutbd.1039398 |
| Vancouver | Uçar C,SENSOY S Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü. . 2022; 300 - 309. 10.29133/yyutbd.1039398 |
| IEEE | Uçar C,SENSOY S "Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü." , ss.300 - 309, 2022. 10.29133/yyutbd.1039398 |
| ISNAD | Uçar, Ceylan Pınar - SENSOY, SUAT. "Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü". (2022), 300-309. https://doi.org/10.29133/yyutbd.1039398 |
| APA | Uçar C, SENSOY S (2022). Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi, 32(2), 300 - 309. 10.29133/yyutbd.1039398 |
| Chicago | Uçar Ceylan Pınar,SENSOY SUAT Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi 32, no.2 (2022): 300 - 309. 10.29133/yyutbd.1039398 |
| MLA | Uçar Ceylan Pınar,SENSOY SUAT Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi, vol.32, no.2, 2022, ss.300 - 309. 10.29133/yyutbd.1039398 |
| AMA | Uçar C,SENSOY S Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi. 2022; 32(2): 300 - 309. 10.29133/yyutbd.1039398 |
| Vancouver | Uçar C,SENSOY S Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi. 2022; 32(2): 300 - 309. 10.29133/yyutbd.1039398 |
| IEEE | Uçar C,SENSOY S "Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü." Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi, 32, ss.300 - 309, 2022. 10.29133/yyutbd.1039398 |
| ISNAD | Uçar, Ceylan Pınar - SENSOY, SUAT. "Domateste Moleküler Markör Yardımlı Seleksiyonda Kullanılan Markörlerin Geçerliliğinin Kontrolü". Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi 32/2 (2022), 300-309. https://doi.org/10.29133/yyutbd.1039398 |
