İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi
Yıl: 2022 Cilt: 27 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 473 - 483 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/flora.20229711 İndeks Tarihi: 24-10-2022
İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi
Öz: Giriş: Komplike cerrahi uygulanması sebebiyle görülen ağır abdominal sepsis olgularında kaynak kontrolü ile birlikte erken ve etkili antimikrobiyal tedavi hayat kurtarıcıdır. Bu çalışmada hastanemizde intra-abdominal infeksiyonlu hastalardan sekonder ve tersiyer peritonit etkeni olarak izole edilen gram-negatif bakterilerin antibiyotik direnç paternlerinin tespiti ve aralarındaki filogenetik ilişkinin belirlenmesi amaçlandı. Materyal ve Metod: Çukurova Üniversitesi Balcalı Hastanesinin Genel Cerrahi Servisinde ve Cerrahi Yoğun Bakım Ünitesinde sekonder ve tersiyer peritonit klinik tanısı ile yatarak takip edilen ardışık hastalar iki grup halinde incelendi. Birinci grubu başka bir hastanede, ikinci grubu ise hastanemizde opere edilen hastalar oluşturdu. İzolatların tür düzeyinde identifikasyonu ve antibiyotik direnç paternlerinin tespiti VITEK-2 otomatize sistemle yapıldı. Suşlar arasındaki akrabalık ilişkisi Pulsed-Field Gel Elektroforezi (PFGE) yöntemi ile belirlendi. Bulgular: Birinci grupta 11, ikinci grupta 21 olmak üzere toplam 32 gram-negatif suşun 20’si Escherichia coli, altısı Klebsiella pneumoniae, üçü Pseudomonas aeruginosa, biri Proteus mirabilis, biri Acinetobacter baumannii ve biri Achromobacter xylosoxidans olarak belirlendi. PFGE yöntemi ile, izolatlarımız arasında önemli bir klonal ilişkinin bulunmadığı gözlendi. E. coli izolatlarının %75.0’ının, K. pneumoniae izolatlarının ise %33.3’ünün genişlemiş spektrumlu beta laktamaz (GSBL) ürettiği tespit edildi. Ancak, birinci gruptaki hastalarımızda hastaneye yatışlarından itibaren herhangi bir antimikrobiyal direnç gelişmedi. Sonuç: Ülkemizde peritonit etkeni gram-negatif bakterilerin klonal ilişkisinin PFGE yöntemi ile ilk kez araştırıldığı çalışmamızın, bu bakterilerle ilgili uzun süreli moleküler sürveyans çalışmalarının hastane infeksiyonlarının kontrolündeki rolünü göstermesi açısından gerekli olduğu düşünüldü.
Anahtar Kelime: Molecular Typing of Gram-Negative Bacteria Causing Seconder and Tertiary Peritonitis in Intra-abdominal Infections
Öz: Introduction: Early and effective antimicrobial treatment together with source control is life-saving in severe abdominal sepsis cases seen due to complicated surgery. In this study, we aimed to detect the antibiotic resistance patterns of gram-negative bacteria isolated as causative agents of secondary and tertiary peritonitis from patients with intra-abdominal infection in our hospital and determine the phylogenetic relationship between them. Materials and Methods: Consecutive patients hospitalised in the General Surgery Clinic and Surgical Intensive Care Unit of Çukurova University Balcalı Hospital wing to clinical diagnosis of secondary and tertiary peritonitis were investigated in two different groups. While the first group included patients operated on in other hospitals, the second group included patients operated on in our hospital. Species-level identification and antibiotic resistance patterns of the isolates were carried out using the VITEK-2 automated system. The relationship between the strains was determined by the pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) method. Results: Among the total of 32 gram-negative strains, 11 were in the first group and 21 in the second group, isolated from patients that were diagnosed with peritonitis 20 Escherichia coli, six Klebsiella pneumoniae, three Pseudomonas aeruginosa, one Proteus mirabilis, one Acinetobacter baumannii, and one Achromobacter xylosoxidans isolates have been identified. No significant clonal relationship between our isolates was observed by the PFGE method. The 75.0% of E. coli isolates and 33.3% of K. pneumoniae isolates were determined to produce extended-spectrum beta-lactamase (ESBL). However, no antimicrobial resistance was developed in our patients in the first group since their hospitalisation. Conclusion: Our study, in which the clonal relationship of gram-negative bacteria causing peritonitis was investigated for the first time in our country, was thought to be necessary to demonstrate the role of long-term molecular surveillance studies on these bacteria in the control of nosocomial infections.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- Schein M. Surgical management of intra-abdominal infection: Is there any evidence. Langenbeck’s Arch Surg 2002;387(1):1-7. https://doi.org/10.1007/s00423-002- 0276-z
- Marques HS, Araújo GRL, da Silva FAF, de Brito BB, Versiani PVD, Caires JS, et al. Tertiary peritonitis: A disease that should not be ignored. World J Clin Cases 2021;9(10):2160- 9. https://doi.org/10.12998/wjcc.v9.i10.2160
- Mazuski JE, Solomkin JS. Intra-abdominal infections. Surg Clin N Am 89 2009;421-37. https://doi.org/10.1016/j. suc.2008.12.001
- Pieracci FM, Barie PS. Intra-abdominal infections. Curr Opin Cri Care 2007;13:440-9. https://doi.org/10.1097/ MCC.0b013e32825a6720
- Jang JY, Lee SH, Shim H, Choi JY, Yong D, Lee JG. Epidemiology and microbiology of secondary peritonitis caused by viscus perforation: A single-center retrospective study. Surg Infect (Larchmt) 2015;16(4):436-42. https:// doi.org/10.1089/sur.2014.148
- Ordoñez CA, Puyana JC. Management of peritonitis in the critically ill patient. Surg Clin North Am 2006;86(6):1323- 49. https://doi.org/10.1016/j.suc.2006.09.006
- Herzog T, Chromik AM, Uhl W. Treatment of complicated intra-abdominal infections in the era of multi-drug resistant bacteria. Eur J Med Res 2010;15(12):525-32. https://doi. org/10.1186/2047-783X-15-12-525
- Lee K, Lee MA, Lee CH, Lee J, Roh KH, Kim S, et al. Increase of ceftazidime- and fluoroquinolone-resistant Klebsiella pneumoniae and imipenem-resistant Acinetobacter spp. in Korea: Analysis of KONSAR study data from 2005 and 2007. Yonsei Med J 2010;51(6):901-11. https://doi. org/10.3349/ymj.2010.51.6.901
- Lee K, Kim MN, Kim JS, Hong HL, Kang JO, Shin JH, et al. Further increases in carbapenem-, amikacin-, and fluoroquinolone-resistant isolates of Acinetobacter spp. and P. aeruginosa in Korea: KONSAR Study 2009. Yonsei Med J 2011;52(5):793-802. https://doi.org/10.3349/ ymj.2011.52.5.793
- Grotelüschen R, Heidelmann LM, Lütgehetmann M, Melling N, Reeh M, Ghadban T, et al. Antibiotic sensitivity in correlation to the origin of secondary peritonitis: A single center analysis. Sci Rep 2020;10:18588. https://doi. org/10.1038/s41598-020-73356-x
- Scott LJ. Eravacycline: A review in complicated ıntraabdominal ınfections. Drugs 2019;79:315-24. https://doi. org/10.1007/s40265-019-01067-3
- Tatman Otkun M. Sürveyans çalışmalarında mikrobiyoloji laboratuvarına düşen görevler nelerdir? Akış şeması ve kriterleri nelerdir? Salgın halinde görevleri nelerdir? 4. Ulusal Sterilizasyon Dezenfeksiyon Kongresi-2005.
- Solomkin JS, Mazuski JE, Bradley, Rodvold KA, Goldstein EJC, Baron EJ, et al. Diagnosis and management of complicated intra-abdominal infections in adults and children: Guidelines by the Surgical Infection Society and Infectious Diseases Society of America. Clin Infect Dis 2010;50:133- 64. https://doi.org/10.1086/649554
- Durmaz R, Otlu B, Koksal F, Hosoglu S, Ozturk R, Ersoy Y, et al. The optimization of rapid pulsed-field gel electrophoresis protocol for typing of Acinetobacter baumannii, Escherichia coli and Klebsiella spp. Jpn J Infect Dis 2009;62(5):372-7.
- Mulvey MR, Chui L, Ismail J, Louie L, Murphy C, Chang N, et al. Development of a Canadian standardized protocol for subtyping methicillin-resistant Staphylococcus aureususing pulsed-field gel electrophoresis. J Clin Microbiol 2001;39(10):3481-85. https://doi.org/10.1128/ JCM.39.10.3481-3485.2001
- Seifert H, Dolzani L, Bressan R, van der Reijden T, van Strijen B, Stefanik D, et al. Standardization and interlaboratory reproducibility assessment of pulsed-field gel electrophoresis-generated fingerprints of Acinetobacter baumannii. J Clin Microbiol 2005;43(9):4328-35. https:// doi.org/10.1128/JCM.43.9.4328-4335.2005
- Struelens MJ, Deplano A, Godard C, Maes N, Serruys E. Epidemiologic typing and delineation of genetic relatedness of methicillin-resistant Staphylococcus aureus by macrorestriction analysis of genomic DNA by using pulsed-field gel electrophoresis. J Clin Microbiol 1992;30(10):2599-605. https://doi.org/10.1128/jcm.30.10.2599-2605.1992
- Sartelli M, Fausto Catena F, Abu-Zidan FM, Ansaloni L, Biffl WL, Boermeester MA. Management of intra-abdominal infections: Recommendations by the WSES 2016 consensus conference. World J Emerg Surg 2017;12:22. https://doi. org/10.1186/s13017-017-0132-7
- Marshall JC. Intra-abdominal infections. Microbes Infect 2004;6(11):1015-25. https://doi.org/10.1016/j. micinf.2004.05.017
- Sartelli M, Catena F, Ansaloni L, Leppaniemi A, Taviloglu K, Van Goor H, et al. Complicated intra-abdominal infections in Europe preliminary data from the first three months of the CIAO Study. World J Emerg Surg 2012;7:15. https:// doi.org/10.1186/1749-7922-7-15
- CLSI. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. 27th ed. CLSI supplement M100. Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standards Institute; 2017.
- Seguin P, Yannick Fe’dun, Bruno Laviolle, Nicolas Nesseler, Pierre-Yves Donnio, Yannick alle’dant. Risk factors for multidrug-resistant bacteria in patients with post-operative peritonitis requiring intensive care. J Antimicrob Chemother 2010;65:342-6. https://doi.org/10.1093/jac/dkp439
- İnal AS. Sekonder ve tersiyer peritonitler. Turkiye Klinikleri J Inf Dis-Special Topics 2014;7(1):6-18.
- Çiftci İH, Aşık G, Karakeçe E, Öksüz L, Yağcı S, Sesli Çetin E, et al. Distribution of blaOXA genes in Acinetobacter baumannii strains: A multicenter study. Mikrobiyol Bul 2013;47(4):592-602. https://doi.org/10.5578/mb.6388
- Bayraktar B, Pelit S, Bulut ME, Aktaş E. Genişlemiş spektrumlu beta laktamaz üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae kan dolaşımı enfeksiyonlarında antibiyotik direnç oranlarının yıllar içindeki değişimi. Med Bull Sisli Etfal Hosp 2019;53(1):70-5
- Pitout JD, Laupland KB. Extended-spectrum beta-lactamase producing Enterobacteriaceae an emerging public-health concern. Lancet Infect Dis 2008;8:159-66. https://doi. org/10.1016/S1473-3099(08)70041-0
- Meyer E, Schwab F, Schroeren-Boersch B, Gastmeier P. Dramatic increase of third-generation cephalosporinresistant E. coli in German intensive care units: Secular trends in antibiotic drug use and bacterial resistance, 2001 to 2008. Crit Care 2010;14:R113. https://doi. org/10.1186/cc9062
- Teklu DS, Negeri AA, Legese MH, Bedada TL, Woldemariam HK, Tullu KD. Extended-spectrum beta-lactamase production and multi-drug resistance among Enterobacteriaceae isolated in Addis Ababa, Ethiopia. Antimicrob Resist Infect Control 2019;8,39. https://doi.org/10.1186/s13756-019- 0488-4
- Abdelrahman DN, Taha AA, Dafaallah MM, Mohammed AA, M. El Hussein ARM, Hashim AI, et al. β-lactamases (bla TEM, bla SHV, bla CTXM-1, bla VEB, bla OXA-1) and class C β-lactamases gene frequency in Pseudomonas aeruginosa isolated from various clinical specimens in Khartoum State, Sudan: A cross sectional study [version 3; peer review: 2 approved]. F1000Research. 2021;9:774. https://doi. org/10.12688/f1000research.24818.3
- Armand-Lefèvre L, Angebault C, Barbier F, Hamelet E, Defrance G, Ruppé E, et al. Emergence of imipenem-resistant gram-negative bacilli in intestinal flora of intensive care patients. Antimicrob Agents Chemother 2013;57(3):1488- 95. https://doi.org/10.1128/AAC.01823-12
- The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 11.0, 2021.
- Baquero F, Hsueh PR, Paterson DL, Rossi F, Bochicchio GV, Gallagher G, et al. Aerobic and facultatively anaerobic gram-negative bacilli ısolated from patients with ıntraabdominal ınfections worldwide: 2005 results from study for monitoring antimicrobial resistance trends (SMART). Surgical Infections 2009;99-104. https://doi.org/10.1089/ sur.2008.0020
- Stiefel U, Nerandzic MM, Pultz MJ, Donskey CJ. Gastrointestinal colonization with a cephalosporinaseproducing bacteroides species preserves colonization resistance against vancomycin-resistant enterococcus and Clostridium difficile in cephalosporin-treated mice. Antimicrob Agents Chemother 2014;58(8):4535-42. https://doi.org/10.1128/AAC.02782-14
| APA | Kandemir T, Nagiyev T, kibar f, Üçkayabaşı A, KÖKSAL f, INAL A, Ülkü A, Yalav O (2022). İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi. , 473 - 483. 10.5578/flora.20229711 |
| Chicago | Kandemir Tülay,Nagiyev Togrul,kibar filiz,Üçkayabaşı Ali,KÖKSAL fatih,INAL AYSE SEZA,Ülkü Abdullah,Yalav Orcun İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi. (2022): 473 - 483. 10.5578/flora.20229711 |
| MLA | Kandemir Tülay,Nagiyev Togrul,kibar filiz,Üçkayabaşı Ali,KÖKSAL fatih,INAL AYSE SEZA,Ülkü Abdullah,Yalav Orcun İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi. , 2022, ss.473 - 483. 10.5578/flora.20229711 |
| AMA | Kandemir T,Nagiyev T,kibar f,Üçkayabaşı A,KÖKSAL f,INAL A,Ülkü A,Yalav O İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi. . 2022; 473 - 483. 10.5578/flora.20229711 |
| Vancouver | Kandemir T,Nagiyev T,kibar f,Üçkayabaşı A,KÖKSAL f,INAL A,Ülkü A,Yalav O İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi. . 2022; 473 - 483. 10.5578/flora.20229711 |
| IEEE | Kandemir T,Nagiyev T,kibar f,Üçkayabaşı A,KÖKSAL f,INAL A,Ülkü A,Yalav O "İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi." , ss.473 - 483, 2022. 10.5578/flora.20229711 |
| ISNAD | Kandemir, Tülay vd. "İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi". (2022), 473-483. https://doi.org/10.5578/flora.20229711 |
| APA | Kandemir T, Nagiyev T, kibar f, Üçkayabaşı A, KÖKSAL f, INAL A, Ülkü A, Yalav O (2022). İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 27(3), 473 - 483. 10.5578/flora.20229711 |
| Chicago | Kandemir Tülay,Nagiyev Togrul,kibar filiz,Üçkayabaşı Ali,KÖKSAL fatih,INAL AYSE SEZA,Ülkü Abdullah,Yalav Orcun İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 27, no.3 (2022): 473 - 483. 10.5578/flora.20229711 |
| MLA | Kandemir Tülay,Nagiyev Togrul,kibar filiz,Üçkayabaşı Ali,KÖKSAL fatih,INAL AYSE SEZA,Ülkü Abdullah,Yalav Orcun İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, vol.27, no.3, 2022, ss.473 - 483. 10.5578/flora.20229711 |
| AMA | Kandemir T,Nagiyev T,kibar f,Üçkayabaşı A,KÖKSAL f,INAL A,Ülkü A,Yalav O İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2022; 27(3): 473 - 483. 10.5578/flora.20229711 |
| Vancouver | Kandemir T,Nagiyev T,kibar f,Üçkayabaşı A,KÖKSAL f,INAL A,Ülkü A,Yalav O İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2022; 27(3): 473 - 483. 10.5578/flora.20229711 |
| IEEE | Kandemir T,Nagiyev T,kibar f,Üçkayabaşı A,KÖKSAL f,INAL A,Ülkü A,Yalav O "İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi." Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 27, ss.473 - 483, 2022. 10.5578/flora.20229711 |
| ISNAD | Kandemir, Tülay vd. "İntra-abdominal İnfeksiyonlarda Sekonder ve Tersiyer Peritonit Etkeni Olan Gram-Negatif Bakterilerin Moleküler Olarak Tiplendirilmesi". Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 27/3 (2022), 473-483. https://doi.org/10.5578/flora.20229711 |
