Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması
Yıl: 2022 Cilt: 56 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 593 - 605 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/mb.20229601 İndeks Tarihi: 28-10-2022
Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması
Öz: Staphylococcus aureus toplum ve hastane kaynaklı enfeksiyonlara yol açan önemli bir insan patojenidir. Metisiline dirençli S.aureus (MRSA) enfeksiyonlarının tedavisinde vankomisinin yeri tartışılmazdır. Ancak, vankomisin kullanımı esnasında tedavide başarısızlıklara neden olan vankomisine orta duyarlı S.aureus (VISA) ve heterojen VISA (hVISA) izolatları rutin laboratuvar yöntemleriyle tespit edilememektedir. Bu izolatların tespitinde altın standart yöntem popülasyon profili analizi-eğri altında kalan alan (PAP-AUC) yöntemidir. Çalışmada, MRSA izolatlarında metisilin direncine neden olan mecA ve mecC gen bölgelerini, izolatlar arasındaki klonal ilişkiyi, VISA ve hVISA varlığını belirlemek amaçlanmıştır. Çalışmaya, 2015-2020 yılları arasında hastanenin mikrobiyoloji laboratuvarında izole edilen 68 MRSA dahil edilmiştir. İzolatların tanımlanması matriks aracılı lazer desorpsiyon iyonizasyon uçuş süresi kütle spektrometrisi [matrix assisted laser desorptionization-time of flight mass spectrophotometry (MALDI-TOF MS) (VITEK MS, BioMérieux, Fransa)] ile yapılmıştır. İzolatlarda, metisilin direnci sefoksitin (30 μg, Bioanalyse, Türkiye) diski kullanıla- rak disk difüzyon, vankomisin minimal inhibitör konsantrasyon (MİK) değerleri sıvı mikrodilüsyon (SMD) yöntemiyle, polimeraz zincir reaksiyonu [polymerase chain reaction (PCR)] yöntemi ile mecA ve mecC gen bölgesi varlığı araştırılmıştır. VISA ve hVISA varlığı modifiye agar tarama, makro gradiyent difüzyon testi tarama yöntemleri ve PAP-AUC doğrulama yöntemiyle, izolatlar arasındaki klonal ilişki pulsed field jel elektroforezi [pulsed field gel elecrophoresis (PFGE)] yöntemi ile araştırılmıştır. Tüm izolatlarda mecA gen bölgesi belirlenmiş, ancak hiçbir izolatta mecC gen bölgesine rastlanmamıştır. SMD yöntemi ile izolatların MİK50 değeri 1 μg/mL, MİK90 değeri ise 2 μg/mL olarak belirlenmiştir. Modifiye agar tarama yöntemiyle altı VISA, dört hVISA şüpheli izolat tespit edilmiştir. Altın standart olan PAP-AUC yöntemi ile, modifiye agar tarama yöntemiyle şüpheli belirlenen bir izolat VISA, bir izolat hVISA olarak değerlendirilmiştir. PFGE ile baskın bir salgın suşu tespit edilmemiştir. Sonuç olarak, hastanede VISA ve hVISA varlığı belirlenmiş- tir. Bu izolatların artması ciddi bir endişe kaynağıdır. Bu nedenle belirli dönemlerde MRSA izolatlarında VISA/hVISA oranlarının araştırılması, toplumda ve hastane ortamında bu izolatların yayılımını önleyecek tedbirlerin ve uygulamaların hayata geçirilmesi için gerekli enfeksiyon kontrol önlemlerinin alınmasının faydalı olacağı kanısına varılmıştır.
Anahtar Kelime: Investigation of the VISA and hVISA Presence in Methicillin- Resistant Staphylococcus aureus Isolates by Various Methods
Öz: Staphylococcus aureus is an important human pathogen that causes community and hospital-acquired infections. The role of vancomycin in the treatment of methicillin-resistant S.aureus infections is indisput- able. However, vancomycin intermediate susceptible S.aureus (VISA) and heterogeneously VISA (hVISA) isolates, that cause treatment failures during the use of vancomycin, cannot be detected by routine labo- ratory methods. The gold standard method for the detection of these isolates is the population profile analysis-area under the curve (PAP-AUC) method. In this study, it was aimed to determine the presence of mecA and mecC gene regions that cause methicillin resistance, the clonal relationship between iso- lates, and the presence of VISA and hVISA. A total 68 methicillin-resistant S.aureus (MRSA) strains were included in this study which were isolated in the microbiology laboratory of the hospital between 2015- 2020. Identification of the isolates were determined by matrix assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrophotometry (VITEK MS, BioMérieux, France). Methicillin resistance was investigated by disk diffusion method using cefoxitin (30 μg, Bioanalyse, Türkiye) disk and vancomycin MIC values were determined by broth microdilution method. mecA and mecC gene regions were investigated by polymerase chain reaction (PCR) method. The presence of VISA and hVISA were investigated by modi- fied agar screening, macro gradient diffusion test and confirmated by PAP-AUC methods, and the clonal relationship between isolates were investigated by pulsed field gel electrophoresis method. The mecA gene region was determined in all isolates, but the mecC gene region was not found in any of the iso- lates. The MIC50 value of the isolates was determined as 1 μg/mL and the MIC90 value was determined as 2 μg/mL by broth microdilution method. Six VISA and four hVISA suspected strains were detected by a modified agar screening method. Among the isolates identified as suspicious by the modified agar screening method, one isolate was evaluated as VISA and one isolate was evaluated as hVISA by the gold standard PAP-AUC method. No dominant epidemic isolate has been identified by PFGE. As a result, VISA and hVISA were determined in the hospital. The increase in these isolates is a serious concern. For this reason, it is believed that it would be beneficial to investigate the VISA/hVISA ratios in MRSA isolates at certain periods, and to take necessary infection control measures to implement measures and practices to prevent the spread of these isolates in the community and hospital environment.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik
- 1. Bagnoli F, Rappuoli R & Grandi G. Staphylococcus aureus: Microbiology, Pathology, Immunology, Therapy and Prophylaxis. 1st ed. 2017. https://doi.org/10.1007/978-3-319-72063-0
- 2. Duman Y, Tekerekoğlu MS, Otlu B. Toplum ve hastane kökenli Staphylococcus aureus klinik izolatlarında Panton-Valentine lökosidin varlığının ve klonal ilişkinin araştırılması. Mikrobiyol Bul 2013; 47(3): 389-400. https://doi.org/10.5578/mb.5760
- 3. Lakhundi S, Zhang K. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus: Molecular characterization, evolution, and epidemiology. Clin Microbiol Rev 2018; 31(4): e00020-18. https://doi.org/10.1128/CMR.00020-18
- 4. Song KH, Kim M, Kim CJ, Cho JE, Choi YJ, Park JS, et al. Impact of vancomycin MIC on treatment outcomes in invasive Staphylococcus aureus infections. Antimicrob Agents Chemother 2017; 61(3): e01845-16. https:// doi.org/10.1128/AAC.01845-16
- 5. Chang S, Sievert DM, Hageman JC, Boulton ML, Tenover FC, Downes FP, et al. Infection with vancomycin- resistant Staphylococcus aureus containing the vanA resistance gene. N Engl J Med 2003; 348(14): 1342-7. https://doi.org/10.1056/NEJMoa025025
- 6. Hiramatsu K, Hanaki H, Ino T, Yabuta K, Oguri T, Tenover FC. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus clinical strain with reduced vancomycin susceptibility. J Antimicrob Chemother 1997; 40(1): 135-46. https:// doi.org/10.1093/jac/40.1.135
- 7. Hiramatsu K, Aritaka N, Hanaki H, Kawasaki S, Hosoda Y, Hori S, et al. Dissemination in Japanese hospitals of strains of Staphylococcus aureus heterogeneously resistant to vancomycin. Lancet 1997; 350(9092): 1670-3. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(97)07324-8
- 8. Howden BP, Davies JK, Johnson PD, Stinear TP, Grayson ML. Reduced vancomycin susceptibility in Staphylococcus aureus, including vancomycin-intermediate and heterogeneous vancomycin-intermediate strains: Resistance mechanisms, laboratory detection, and clinical implications. Clin Microbiol Rev 2010; 23(1): 99-139. https://doi.org/10.1128/CMR.00042-09
- 9. CDC. Available from: https://www.cdc.gov/hai/organisms/mrsa-infection.html (Accessed date: 11.02.2021).
- 10. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 11.0, 2021. Available from: http://www.eucast.org (Accessed date: 11.02.2021).
- 11. Çıkman A, Aydın M, Gülhan B, Karakeçili F, Kurtoğlu MG, Yüksekkaya S, et al. Absence of the mecC gene in methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from various clinical samples: The first multi-centered study in Turkey. J Infect Public Health 2019; 12(4): 528-33. https://doi.org/10.1016/j.jiph.2019.01.063
- 12. CDC. Available from: https://www.cdc.gov/hai/settings/lab/visa_vrsa_lab_detection.html (Accessed date: 11.02.2021).
- 13. Kuşçu F, Öztürk D, Gürbüz Y, Tütüncü E, Şencan İ, Gül S. Metisiline dirençli stafilokoklarda azalmış vankomisin duyarlılığının araştırılması. Mikrobiyol Bul 2011; 45(2): 248-57.
- 14. Wootton M, Mac Gowan AP, Walsh TR, Howe RA. A multicentre study evaluating the current strategies for isolating Staphylococcus aureus strains with reduced susceptibility to glycopeptides. J Clinic Microbiol 2007; 45(2): 329-32. https://doi.org/10.1128/JCM.01508-06
- 15. Wootton M, Howe RA, Hillman R, Walsh TR, Bennett PM, MacGowan AP. A modified population analysis profile (PAP) method to detect hetero-resistance to vancomycin in Staphylococcus aureus in a UK hospital. J Antimicrob Chemother 2001; 47(4): 399-403. https://doi.org/10.1093/jac/47.4.399
- 16. Durmaz R, Köksal F, Hoşoğlu S. Hastane infeksiyonu etkeni olan Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella spp, Escherichia coli, Staphyococcus aureus ve Acinetobacter baumannii izolatlarının moleküler tiplendirmesinde kullanılacak pulsed field gel electrophoresis (PFGE) yöntemlerinin standardizasyonu ve kit formatı haline getirilmesi. TÜBİTAK Proje No: 106S211 (SBAG-3459). Ankara, 2009.
- 17. Tanrıverdi ES, Duman Y, Tekerekoğlu MS. Evaluation of Staphylococcus aureus isolates in a tertiary hospital between years of 2018 and 2019. Fırat Med J 2020; 25(4): 184-8.
- 18. Özel Y, Büyükzengin KB, Yavuz MT. Klinik örneklerden izole edilen metisiline dirençli ve duyarlı Staphylococcus aureus suşlarının antibiyotik direnç profilinin araştırılması. ANKEM Derg 2017; 31(2): 41-7.
- 19. Nazik S, Cingöz E, Şahin AR, Güler S. The alteration of methicillin resistance in Staphylococcus aureus strains isolated from blood culture over years. Kocaeli Med J 2018; 7(1): 32-6. https://doi.org/10.5505/ ktd.2018.94824
- 20. Central Asian and Eastern European Surveillance of Antimicrobial Resistance. Annual report 2020. Available from: https://www.euro.who.int/en/health-topics/disease-prevention/antimicrobial-resistance/ publications/2020/central-asian-and-european-surveillance-of-antimicrobial-resistance.-annual- report-2020. (Accessed date: 12.02.2022).
- 21. García-Álvarez L, Holden MT, Lindsay H, Webb CR, Brown DF, Curran MD, et al. Meticillin-resistant Staphylococcus aureus with a novel mecA homologue in human and bovine populations in the UK and Denmark: A descriptive study. Lancet Infect Dis 2011; 11(8): 595-603. https://doi.org/10.1016/S1473- 3099(11)70126-8
- 22. Kim C, Milheirico C, Gardete S, Holmes MA, Holden MT, de Lencastre H, et al. Properties of a novel PBP2A protein homolog from Staphylococcus aureus strain LGA251 and its contribution to the beta-lactam-resistant phenotype. J Biol Chem 2012; 287(44): 36854-63. https://doi.org/10.1074/jbc.M112.395962
- 23. Çetinkol Y, Altındiş M, Çetinkaya Z, Aktepe OC. Stafilokoklarda metisilin direncinin farklı yöntemlerle araştırılması ve çoklu antibiyotik direncinin saptanması. Mikrobiyol Bul 2008; 42(1): 119-24.
- 24. Schaumburg F, Köck R, Mellmann A, Richter L, Hasenberg F, Kriegeskorte A, et al. Population dynamics among methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates in Germany during a 6-year period. J Clin Microbiol 2012; 50(10): 3186-92. https://doi.org/10.1128/JCM.01174-12
- 25. Becker K, van Alen S, Idelevich EA, Schleimer N, Seggewiß J, Mellmann A, et al. Plasmid-encoded transferable mecB-mediated methicillin resistance in Staphylococcus aureus. Emerg Infect Dis 2018; 24(2): 242-8. https:// doi.org/10.3201/eid2402.171074
- 26. Xu J, Pang L, Ma XX, Hu J, Tian Y, Yang YL, et al. Phenotypic and molecular characterisation of Staphylococcus aureus with reduced vancomycin susceptibility derivated in vitro. Open Med (Wars) 2018; 13: 475-86. https://doi.org/10.1515/med-2018-0071
- 27. Musta AC, Riedere K, Shemes S. Vancomycin MIC plus heteroresistance and outcome of methicillin-resistant Staphylococcus aureus bacteremia: Trends over 11 years. J Clin Microbiol 2009; 47(6): 1640-4. https://doi. org/10.1128/JCM.02135-08
- 28. Iyer RN, Hittinahalli V. Modified PAP method to detect heteroresistance to vancomycin among methicillin resistant Staphylococcus aureus isolates at a tertiary care hospital. Indian J Med Microbiol 2008; 26(2): 176-9. https://doi.org/10.1016/S0255-0857(21)01939-3
- 29. Liu C, Chambers HF. Staphylococcus aureus with heterogeneous resistance to vancomycin: Epidemiology, clinical significance, and critical assessment of diagnostic methods. Antimicrob Agents Chemother 2003; 47(10): 3040-5. https://doi.org/10.1128/AAC.47.10.3040-3045.2003
- 30. Tunç EK, Kuzucu Ç, Otlu B. Metisiline dirençli Staphylococcus aureus suşlarında vankomisine karşı azalmış duyarlılığın araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2017; 47(1): 39-46.
- 31. Çıkman A, Aydın M, Gülhan B, Parlak M, Gültepe B, Kalaycı Y, et al. Metisiline dirençli Staphylococcus aureus izolatlarının antibiyotik direnci ve azalmış vankomisin duyarlılığının araştırılması: Çok merkezli bir çalışma. Mikrobiyol Bul 2015; 49(2): 240-8. https://doi.org/10.5578/mb.9230
- 32. Özmen Çapın BB, Tekeli A, Karahan ZC. Evaluation of the presence and characterization of vancomycin- intermediate and heterogeneous vancomycin-intermediate level resistance among bloodstream isolates of methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Microb Drug Resist 2020; 26(3): 238-44. https://doi. org/10.1089/mdr.2019.0178
- 33. Avcıoglu F, Öztürk CE, Şahin İ, Öksüz Ş, Kızılırmak A, Akar N. Metisiline dirençli stafilokoklarda azalmış vankomisin duyarlılığının araştırılması. DU Health Sci Inst 2020; 10(1): 81-6. https://doi.org/10.33631/ duzcesbed.578228
- 34. Mirza HC, Sancak B, Gür D. The prevalence of vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus and heterogeneous visa among methicillin-resistant strains isolated from pediatric population in a Turkish university hospital. Microb Drug Resist 2015; 21(5): 537-44. https://doi.org/10.1089/mdr.2015.0048
- 35. Aktaş E. Klinik örneklerden izole edilen MRSA suşlarinda vankomisine karşı azalmış duyarlılığın araştırılması. Mikrobiyol Bul 2010; 44(2): 339-41.
- 36. Sancak B, Ercis S, Menemenlioğlu D, Çolakoglu S, Hasçelik G. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus heterogeneously resistant to vancomycin in a Turkish university hospital. J Antimicrob Chemother 2005; 56(3): 519-23. https://doi.org/10.1093/jac/dki272
- 37. Sancak B, Yağcı S, Gür D, Gülay Z, Öğünç D, Söyletir G, et al. Vancomycin and daptomycin minimum inhibitory concentration distribution and occurrence of heteroresistance among methicillin-resistant Staphylococcus aureus blood isolates in Turkey. BMC Infect Dis 2013; 13: 583. https://doi.org/10.1186/1471- 2334-13-583
- 38. Torun MM, Bahar H, Demirci M, Altaş K, Bağdatlı Y, Kocazeybek B, et al. Two heterogeneously vancomycin- intermediate clinical isolates of methicillin-sensitive and methicillin-resistant Staphylococcus aureus in a Turkish university hospital: Brief report of a surveillance study. Int J Antimicrob Agents 2005; 26(2): 508-10. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2005.09.001
- 39. Chaudhari CN, Tandel K, Grover N, Sen S, Bhatt P, Sahni AK, et al. Heterogeneous vancomycin-intermediate among methicillin resistant Staphylococcus aureus. Med J Armed Forces India 2015; 71(1): 15-8. https://doi. org/10.1016/j.mjafi.2014.03.008
- 40. Mather CA, Werth BJ, Sivagnanam S, SenGupta DJ, Butler-Wu SM. Rapid detection of vancomycin- intermediate Staphylococcus aureus by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. J Clin Microbiol 2016; 54(4): 883-90. https://doi.org/10.1128/JCM.02428-15
| APA | UÇAR Ş, DUMAN Y, Tanriverdi E, TEKEREKOGLU M, Otlu B (2022). Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması. , 593 - 605. 10.5578/mb.20229601 |
| Chicago | UÇAR ŞERİFE,DUMAN YUCEL,Tanriverdi Elif Seren,TEKEREKOGLU MEHMET SAIT,Otlu Baris Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması. (2022): 593 - 605. 10.5578/mb.20229601 |
| MLA | UÇAR ŞERİFE,DUMAN YUCEL,Tanriverdi Elif Seren,TEKEREKOGLU MEHMET SAIT,Otlu Baris Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması. , 2022, ss.593 - 605. 10.5578/mb.20229601 |
| AMA | UÇAR Ş,DUMAN Y,Tanriverdi E,TEKEREKOGLU M,Otlu B Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması. . 2022; 593 - 605. 10.5578/mb.20229601 |
| Vancouver | UÇAR Ş,DUMAN Y,Tanriverdi E,TEKEREKOGLU M,Otlu B Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması. . 2022; 593 - 605. 10.5578/mb.20229601 |
| IEEE | UÇAR Ş,DUMAN Y,Tanriverdi E,TEKEREKOGLU M,Otlu B "Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması." , ss.593 - 605, 2022. 10.5578/mb.20229601 |
| ISNAD | UÇAR, ŞERİFE vd. "Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması". (2022), 593-605. https://doi.org/10.5578/mb.20229601 |
| APA | UÇAR Ş, DUMAN Y, Tanriverdi E, TEKEREKOGLU M, Otlu B (2022). Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, 56(4), 593 - 605. 10.5578/mb.20229601 |
| Chicago | UÇAR ŞERİFE,DUMAN YUCEL,Tanriverdi Elif Seren,TEKEREKOGLU MEHMET SAIT,Otlu Baris Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni 56, no.4 (2022): 593 - 605. 10.5578/mb.20229601 |
| MLA | UÇAR ŞERİFE,DUMAN YUCEL,Tanriverdi Elif Seren,TEKEREKOGLU MEHMET SAIT,Otlu Baris Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.56, no.4, 2022, ss.593 - 605. 10.5578/mb.20229601 |
| AMA | UÇAR Ş,DUMAN Y,Tanriverdi E,TEKEREKOGLU M,Otlu B Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2022; 56(4): 593 - 605. 10.5578/mb.20229601 |
| Vancouver | UÇAR Ş,DUMAN Y,Tanriverdi E,TEKEREKOGLU M,Otlu B Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2022; 56(4): 593 - 605. 10.5578/mb.20229601 |
| IEEE | UÇAR Ş,DUMAN Y,Tanriverdi E,TEKEREKOGLU M,Otlu B "Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması." Mikrobiyoloji Bülteni, 56, ss.593 - 605, 2022. 10.5578/mb.20229601 |
| ISNAD | UÇAR, ŞERİFE vd. "Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus İzolatlarında Çeşitli Yöntemlerle VISA ve hVISA Varlığının Araştırılması". Mikrobiyoloji Bülteni 56/4 (2022), 593-605. https://doi.org/10.5578/mb.20229601 |
