TY  - JOUR
TI  - COVID-19 Pandemisi Öncesi ve Sonrasında Solunum Yolu Virüs Paneli PCR Test Sonuçlarının Değerlendirilmesi
AB  - Halen devam etmekte olan Koronavirüs hastalığı-2019 (COVID-19) pandemisi sırasında, diğer so- lunum yolu virüslerinin neden olduğu enfeksiyonlar da görülmeye devam etmekte ve önemli bir sağlık sorunu oluşturmaktadır. Bu çalışmada, solunum yolu virüs paneli (Allplex Respiratory Panel, Seegene, Güney Kore) multipleks gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu [polymerase chain reaction (PCR)] testi ile saptanan solunum yolu virüslerinin şiddetli akut solunum yolu sendromu koronavirüs-2 [severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2)] pandemisi öncesi, pandeminin birinci ve ikinci yılında gözlenen sıklıkları ile bu üç dönem arasında gerçekleşen viral etken dağılımının değerlendirilme- si amaçlanmıştır. Bunun yanı sıra, pandemi esnasında SARS-CoV-2 ve diğer solunum yolu virüsleri ile oluşan koenfeksiyon sıklığının araştırılması planlanmıştır. Üç dönem birlikte değerlendirildiğinde toplam 42 174 örneğin 13 802 (%32.7)’sinde en az bir solunum yolu virüsünün saptandığı görülmüştür. Pan- demi öncesi dönemde 16 002 örneğin 8740 (%54.6)’ında en az bir solunum yolu virüsü saptanırken, pandeminin birinci yılında 17 510 örneğin 1638 (%9.4)’inde, pandeminin ikinci yılında ise 8662 örneğin 3424 (%39.5)’ünde en az bir solunum yolu virüsü saptanmıştır. Pandeminin birinci yılında kapanma ted- birleri ve kişisel koruyucu ekipman kullanımı nedeniyle saptanan virüs sayılarının istatistiksel olarak anlamlı derecede düştüğü gözlenmiştir (p< 0.001). Aşılamanın başladığı ve kapanma tedbirlerinin aşamalı olarak gevşetilerek normalleşmeye geçişin başladığı üçüncü dönemde ise SARS-CoV-2 dışındaki solunum yolu virüslerinin saptanma sıklığının tekrar artmaya başladığı ve istatistiksel olarak anlamlı bir farkın oluştuğu gözlenmiştir (p< 0.001). Çalışmanın üç döneminde de en sık saptanan virüs rinovirüs olmuştur (Birinci dönem: %16.5; ikinci dönem: %5.9; üçüncü dönem: 16.5). Çalışma kapsamında en az bir solunum yolu virüsü saptanan 13 802 örneğin 2061 (%14.9)’inde aynı anda birden fazla solunum yolu virüsü saptanmıştır. Koenfeksiyon olarak saptanan virüsler içinde ilk sırayı rinovirüs (%7.3) almıştır. Pandemi dönemini kapsayan ikinci ve üçüncü dönemlerde, solunum yolu virüs paneli PCR sonucu pozitif olan ve eş zamanlı olarak SARS-CoV-2 PCR istemi de bulunan 4219 örneğin 177 (%4.2)’sinde SARS-CoV-2 PCR sonucunun da pozitif olduğu tespit edilmiştir. Bu nedenle solunum yolu örneklerinde diğer solunum yolu virüsleri ile birlikte, aynı hastada SARS-CoV-2 koenfeksiyonunun gözlenebileceği sonucuna varılmıştır. Halen kullanılmakta olan solunum yolu virüs multipleks PCR panellerine SARS-CoV-2’nin de eklenmesi, bu tür koenfeksiyonların daha hızlı saptanmasını sağlayacaktır. Pandeminin kontrolü için alınan önlemlerin gevşetilmesiyle hem SARS-CoV-2 dışındaki solunum yolu virüs enfeksiyonu görülme sıklığının, hem de SARS-CoV-2 enfeksiyonunda diğer solunum yolu virüsleriyle koenfeksiyon oranının artabileceği düşünül- mektedir. Bu nedenle solunum yolu enfeksiyonlarına neden olan virüslerin klinik örneklerden güvenilir ve hızlı yöntemlerle saptanması, toplum sağlığını koruyacak önlemlerin vakit kaybetmeden alınmasını sağlayacak ve bu sayede enfeksiyonların yayılımının önlenmesine katkıda bulunacaktır.
AU  - ALP, ALPASLAN
AU  - Taşçı, Onur
AU  - Ergin, Alper
AU  - Köseoglu Eser, Özgen
DO  - 10.5578/mb.20229605
PY  - 2022
JO  - Mikrobiyoloji Bülteni
VL  - 56
IS  - 4
SN  - 0374-9096
SP  - 667
EP  - 681
DB  - TRDizin
UR  - http://search/yayin/detay/1135554
ER  -