Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması
Yıl: 2022 Cilt: 29 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 362 - 370 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5505/vtd.2022.04382 İndeks Tarihi: 28-10-2022
Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması
Öz: Amaç: Kan kültürlerinden izole edilen karbapenemlere azalmış duyarlılık gösteren A. baumannii complex (ABC) izolatlarında metallo-beta-laktamaz (MBL) ile oksasilinaz (OXA) enzimlerinin varlığının belirlenmesi, izolatların birbirleriyle ve European clone (EU) I, II, III ili şkilerinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya, 2008-2009 tarihleri aras ında hastaneye ba şvuran 74 hastanın kan örneklerinden izole edilen imipenem veya meropenemin en az birine azalmış duyarlılık gösteren ABC izolatı alınmıştır. İzolatların tan ımlanması ve antimikrobiyal duyarlılıkları BD Phoenix Otomatize Sistemi (Becton-Dickinson, ABD) ile yap ılmıştır. OXA ve MBL genleri polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile araştırılmıştır. İzolatların klonal ilişkisi “pulsed-field” jel elektroforezi (PFGE) yöntemiyle saptanmıştır. Bulgular: İzolatların hiçbirinde MBL geni ve blaOXA-24-like geni saptanmazken; izolatların tümünde blaOXA-51-like geni, 32 izolatta blaOXA-58-like geni ve 26 izolatta blaOXA-23-like geni saptanmıştır. PFGE yöntemiyle blaOXA-23-like ve/veya blaOXA-58-like geni taşıyan 55 kan izolatı; altı kümede tiplendiği görülmüştür. EU klonlarının ait oldukları kümeler içindeki izolatlarla arasındaki benzerliği %90 üzerinde saptanmıştır. Sonuç: Çalışmamız hastanemizde oksasilinaz üreten ABC izolatlarının; ülkemizde çok nadir olar ak bildirilen EU klon III ile ilişkili bulunması, EU klon I ve II ile de muhtemel ilişkili izolatların saptanması bu klonların hastanemizde ve ülkemizde yayılım potansiyelini göstermektedir.
Anahtar Kelime: Investigation of Molecular Mechanisms of Carbapenemase Producing Acinetobacter baumannii complex Isolates Isolated from Blood Cultures
Öz: Introduction: It was aimed to determine the presence of metallo-beta-lactamases (MBL) and oxacillinases (OXA) enzymes in Acinetobacter baumannii complex (ABC) isolates, which show decreased sensitivity to carbapenems isolated from blood cultures and to investigate the relationships of isolates among each other and with European clones (EU) I, II, III. Methods: The study included ABC isolate which has reduced sensitivity to at least one of either imipenem or meropenem which was isolated from blood samples obtained from 74 patients who were admitted to the hospital between 2008 and 2009. Identification of isolat es and their antimicrobial susceptibilities were performed using BD Phoenix Automated System (Becton-Dickinson, US A). OXA and MBL genes were investigated by polymerase chain reaction (PCR). The clonal relationship of the isolates was determined by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) method. Results: MBL genes and blaOXA-24-like gene were not determined in any of the isolates. blaOXA-51-like was detected in all isolates, blaOXA-58-like gene in 32 isolates and blaOXA-23-like gene in 26 isolates. Using PFGE method, it was detected that fifty-five blood isolates carrying the blaOXA23-like and/or blaOXA-58-like gene were clustered under six clusters. The similarity of EU clones with clinical ABC isolates in the clusters was found to be over 90%. Conclusion: ABC isolates producing oxacillinase in our hospital; The presence of association with EU clone III, which is reported very rarely in our country, and the detection of possible related isolates with EU clones I and II show the potential for the spread of thes e clones in our hospital and in our country.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- 1. Higgins PG, Dammhayn C, Hackel M, Seifert H. Global spread of carbapenem- resistant Acinetobacter baumannii. J Antimicrob Chemother 2010; 65(2): 233- 238.
- 2. Peleg AY, Seifert H, Paterson DL. Acinetobacter baumannii: emergence of a successful pathogen. Clin Microbiol Rev 2008; 21(3): 538-582.
- 3. Kempf M, Rolain JM. Emergence of resistance to carbapenems in Acinetobacter baumannii in Europe: clinical impact and therapeutic options. Int J Antimicrob Agents 2012; 39(2): 105-114.
- 4. Walsh TR. Emerging carbapenemases: a global perspective. Int J Antimicrob Agents 2010; 36 Suppl 3: S8-14.
- 5. Djahmi N, Dunyach-Remy C, Pantel A, Dekhil M, Sotto A, Lavigne JP. Epidemiology of Carbapenemase- Producing Enterobacteriaceae and Acinetobacter baumannii in Mediterranean Countries. Biomed Res Int 2014; 2014: 305784.
- 6. Clinical Laboratory Standards Institute. Performance Standards For Antimicrobial Susceptibility Testing; Twenty-Third Informational Supplement. CLSI document M100-S19 Wayne, Pennsylvania, 19087 USA, 2009.
- 7. Ellington MJ, Kistler J, Livermore DM, Woodford N. Multiplex PCR for rapid detection of genes encoding acquired metallobeta-lactamases. J Antimicrob Chemother 2007; 59 (2): 321-322.
- 8. Woodford N, Ellington MJ, Coelho JM, Turton JF, Ward ME, Brown S, et al. Multiplex PCR for genes encoding prevalent OXA carbapenemases in Acinetobacter spp. Int J Antimicrob Agents 2006; 27(4): 351-353.
- 9. Ozgumus OB, Caylan R, Tosun I, Sandalli C, Aydin K, Koksal I. Molecular epidemiology of clinical Pseudomonas aeruginosa isolates carrying IMP1 metallo- beta-lactamase gene in a university hospital in Turkey. Microb Drug Resist 2007;13:191-198.
- 10. Pournaras S, Markogiannakis A, Ikonomidis A, Kondyli L, Bethimouti K, Maniatis AN, et al. Outbreak of multiple clones of imipenem-resistant Acinetobacter baumannii isolates expressing OXA-58 carbapenemase in an intensive care unit. J Antimicrob Chemother 2006; 57(3): 557- 561.
- 11. Durmaz R, Otlu B, Koksal F, Hosoglu S, Ozturk R, Ersoy Y, et al. The optimization of a rapid pulsed-field gel electrophoresis protocol for the typing of Acinetobacter baumannii, Escherichia coli and Klebsiella spp. Jpn J Infect Dis 2009; 62(5): 372-377.
- 12. Tenover FC, Arbeit RD, Goering RV, Mickelsen PA, Murray BE, Persing DH, et al. Interpreting chromosomal DNA restriction patterns produced by pulsed- field gel electrophoresis: criteria for bacterial strain typing. J Clin Microbiol 1995; 33(9): 2233-2239.
- 13. Diancourt L, Passet V, Nemec A, Dijkshoorn L, Brisse S. The Population Structure of Acinetobacter baumannii: Expanding Multiresistant Clones from an Ancestral Susceptible Genetic Pool. PLoS One 2010; 5(4): e10034.
- 14. Nemec A, Krizova L, Maixnerova M, van der Reijden TJ, Deschaght P, Passet V, et al. Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex with the proposal of Acinetobacter pittii sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 3) and Acinetobacter nosocomialis sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 13TU)*. Res Microbiol 2011; 162(4): 393- 404.
- 15. Nemec A, Dolzani L, Brisse S, van den Broek P, Dijkshoorn L. Diversity of aminoglycoside-resistance genes and their association with class 1 integrons among strains of pan-European Acinetobacter baumannii clones. J Med Microbiol 2004; 53(Pt 12): 1233–1240.
- 16. Sarı B, Baran I, Alaçam S, Mumcuoğlu İ, Kurşun Ş, Aksu N. Investigation of oxacillinase genes in nosocomial multidrug- resistant Acinetobacter baumannii isolates by multiplex PCR and evaluation of their clonal relationship with Rep-PCR. Mikrobiyol Bul 2015; 49(2): 249-258.
- 17. Kulah C, Mooij MJ, Comert F, Aktas E, Celebi G, Ozlu N, et al. Characterisation of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii outbreak strains producing OXA-58 in Turkey. Int J Antimicrob Agents 2010; 36(2): 114-118.
- 18. Keskin H, Tekeli A, Dolapci İ, Öcal D. Molecular characterization of beta- lactamase-associated resistance in Acinetobacter baumannii strains isolated from clinical samples. Mikrobiyol Bul 2014; 48(3): 365-376.
- 19. Aksoy MD, Çavu şlu Ş, Tu ğrul HM. Investigation of metallo beta lactamases and oxacilinases in carbapenem resistant Acinetobacter baumannii strains isolated from inpatients. Balkan Med J 2015; 32(1): 79– 83.
- 20. Ahmed SS, Alp E, Ulu-Kilic A, Dinc G, Aktas Z, Ada B, et al. Spread of carbapenem-resistant international clones of Acinetobacter baumannii in Turkey and Azerbaijan: a collaborative study. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2016; 35(9): 1463- 1468.
- 21. Ciftci IH, A şık G, Karakeçe E, Oksüz L, Yağcı S, Sesli Çetin E, et al. Distribution of blaOXA genes in Acinetobacter baumannii strains: a multicenter study. Mikrobiyol Bul 2013; 47(4): 592-602.
- 22. Metan G, Sariguzel F, Sumerkan B, Reijden Tv, Dijkshoorn L. Clonal diversity and high prevalence of OXA-58 among Acinetobacter baumannii isolates from blood cultures in a tertiary care centre in Turkey. Infect Genet Evol 2013; 14: 92-97.
- 23. Keyik S, Arslan U, Türk Dağı H, Seyhan T, Fındık D. Investigation of OXA type beta- lactamases and PFGE patterns in Acinetobacter baumannii strains resistant to carbapenems. Mikrobiyol Bul 2014; 48(4): 556-565.
- 24. Direkel Ş, Çopur Çiçek A, Karagöz A, Aydoğan Ejder N, Oktay E, Delialioğlu N, et al. Antimicrobial susceptibility and molecular characteri zation of multidrug- resistant Acinetobacter baumannii isolated in an university hospital. Mikrobiyol Bul 2016; 50(4): 522-534.
- 25. Ahmed SS, Dinc G, Rossella B, Alp E, Ulu- Kilic A, Melchers W, et al. Molecular characterization of carbapenem resistant Acinetobacter baumannii and investigation of genetic diversity between local and international clones. Applied Microbiology 2016; 10(3): 1675-1682.
- 26. Dessel van H, Dijkshoorn L, Reijden van der T, Bakker N, Paauw A, Broek van den P, et al. Identification of a new geographically widespread multiresistant Acinetobacter baumannii clone from European hospitals. Res Microbiol 2004; 155(2): 105- 112.
- 27. Fu Y, Zhou J, Zhou H, Yang Q, Wei Z, Yu Y & Li L. Wide dissemination of OXA-23- producing carbapenem resistant Acinetobacter baumannii clonal complex 22 in multiple cities of China. J Antimicrob Chemoth 2010; 65: 644-650.
APA | Atay G, BAYRAMOĞLU G, DURMAZ R, TOSUN I, KAKLIKKAYA N, Aydın F (2022). Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması. , 362 - 370. 10.5505/vtd.2022.04382 |
Chicago | Atay Gülşen Uluçam,BAYRAMOĞLU Gülçin,DURMAZ Rıza,TOSUN Ilknur,KAKLIKKAYA NESE,Aydın Faruk Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması. (2022): 362 - 370. 10.5505/vtd.2022.04382 |
MLA | Atay Gülşen Uluçam,BAYRAMOĞLU Gülçin,DURMAZ Rıza,TOSUN Ilknur,KAKLIKKAYA NESE,Aydın Faruk Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması. , 2022, ss.362 - 370. 10.5505/vtd.2022.04382 |
AMA | Atay G,BAYRAMOĞLU G,DURMAZ R,TOSUN I,KAKLIKKAYA N,Aydın F Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması. . 2022; 362 - 370. 10.5505/vtd.2022.04382 |
Vancouver | Atay G,BAYRAMOĞLU G,DURMAZ R,TOSUN I,KAKLIKKAYA N,Aydın F Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması. . 2022; 362 - 370. 10.5505/vtd.2022.04382 |
IEEE | Atay G,BAYRAMOĞLU G,DURMAZ R,TOSUN I,KAKLIKKAYA N,Aydın F "Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması." , ss.362 - 370, 2022. 10.5505/vtd.2022.04382 |
ISNAD | Atay, Gülşen Uluçam vd. "Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması". (2022), 362-370. https://doi.org/10.5505/vtd.2022.04382 |
APA | Atay G, BAYRAMOĞLU G, DURMAZ R, TOSUN I, KAKLIKKAYA N, Aydın F (2022). Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması. Van Tıp Dergisi, 29(4), 362 - 370. 10.5505/vtd.2022.04382 |
Chicago | Atay Gülşen Uluçam,BAYRAMOĞLU Gülçin,DURMAZ Rıza,TOSUN Ilknur,KAKLIKKAYA NESE,Aydın Faruk Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması. Van Tıp Dergisi 29, no.4 (2022): 362 - 370. 10.5505/vtd.2022.04382 |
MLA | Atay Gülşen Uluçam,BAYRAMOĞLU Gülçin,DURMAZ Rıza,TOSUN Ilknur,KAKLIKKAYA NESE,Aydın Faruk Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması. Van Tıp Dergisi, vol.29, no.4, 2022, ss.362 - 370. 10.5505/vtd.2022.04382 |
AMA | Atay G,BAYRAMOĞLU G,DURMAZ R,TOSUN I,KAKLIKKAYA N,Aydın F Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması. Van Tıp Dergisi. 2022; 29(4): 362 - 370. 10.5505/vtd.2022.04382 |
Vancouver | Atay G,BAYRAMOĞLU G,DURMAZ R,TOSUN I,KAKLIKKAYA N,Aydın F Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması. Van Tıp Dergisi. 2022; 29(4): 362 - 370. 10.5505/vtd.2022.04382 |
IEEE | Atay G,BAYRAMOĞLU G,DURMAZ R,TOSUN I,KAKLIKKAYA N,Aydın F "Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması." Van Tıp Dergisi, 29, ss.362 - 370, 2022. 10.5505/vtd.2022.04382 |
ISNAD | Atay, Gülşen Uluçam vd. "Kan Kültürlerinden İzole Edilen Karbapenemaz Üreten Acinetobacter baumannii complex İzolatlarının Moleküler Mekanizmalarının Araştırılması". Van Tıp Dergisi 29/4 (2022), 362-370. https://doi.org/10.5505/vtd.2022.04382 |