Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış
Yıl: 2022 Cilt: 5 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 1082 - 1091 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.47495/okufbed.1093687 İndeks Tarihi: 31-10-2023
Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış
Öz: Biyologların, DNA’nın üç boyutlu yapısından yola çıkarak hücre içindeki bilgilerin kromozomlar tarafından kuşaklar arası taşındığını keşfetmelerinin ardından gen projeleri üzerinde çalışmaları ve bunu yaparken bilişim teknolojilerinde kullanılan araçlardan yararlanmaları kaçınılmaz bir hal almıştır. Biyoinformatik, biyolojik sistemlerden elde edilen verilerin analizinin yapılması ve değerlendirilmesi için biyoloji, tıp bilimleri, bilişim teknolojileri, matematik ve biyoistatistiğin birleşiminden doğan multidisiplinler bir bilim dalıdır. Biyolojik dizilerin analizi için geliştirilen biyoinformatik bilimi; günümüzde biyoloji, genomik çalışmalar ve gen ekspresyon çalışmaları, tanı ve tedavi ile tanısı konmuş hastalıklara ilişkin ilaçlar geliştirme ve benzeri alanlarda kullanılmakta olup bilişim teknolojileri ve biyoistatistik biliminden oldukça faydalanmaktadır. Bu çalışmanın konusu kapsamında, biyoinformatik biliminin ortaya çıkışı, diğer disiplinler ile ilişkisi, uygulama alanları ve bir bilim dalı olarak gelecekte ne anlam ifade edeceği ele alınarak bu sürece ilişkin bilgiler verilecektir.
Anahtar Kelime: An Overview of Bioinformatics as a Multidisciplinary Science
Öz: After biologists discovered that the information in the cell is carried between generations by chromosomes based on the three-dimensional structure of DNA, it has become inevitable to work on gene projects and to benefit from the tools used in information technologies while doing this. Bioinformatics is a multidisciplinary branch of science arising from the combination of biology, medical sciences, information technologies, mathematics and biostatistics for the analysis and evaluation of data obtained from biological systems. The science of bioinformatics developed for the analysis of biological sequences; today, it is used in biology, genomic studies and gene expression studies, diagnosis and treatment, drug development for diagnosed diseases and similar fields, and it makes great use of information technologies and biostatistics. Within the scope of the subject of this study, the emergence of bioinformatics, its relationship with other disciplines, its application areas and what it will mean in the future as a science will be discussed and information about this process will be given.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Derleme Erişim Türü: Erişime Açık
- Akın, A. C., Bürçe, B., Çevirici, B., Şahin, B., Şahin, E., & Şahin, Y. (2014). Disiplinler Arası Bir Bilim Dalı: Biyoinformatik.
- Arhipova, I. (2006). The role of statistical methods in computer science and bioinformatics. Latvia University of Agriculture, Latvia, ICOTS-7.
- Atalay, R. Ç. (2002). Neden Biyoinformatik. Avrasya Dosyası, Moleküler Biyoloji ve Gen Teknolojileri Özel, Sonbahar, 8(3), 129-141.
- Attwood, T. K. (1999). eind Parry-Smith, DJ: Introduction to bioinformatics.
- Chen JN and Chang JS, 1998, Topical clustering of MRD sense based on information retrieval techniques, Computational Linguistics. 24(1),61-95.
- Collins, F. S., Morgan, M., & Patrinos, A. (2003). The Human Genome Project: lessons from large- scale biology. Science, 300(5617), 286-290.
- Dibyajyoti S., Bin ET., Swati P. Bioinformatics: The effects on the cost of drug discovery. Galle Medical Journal 2013; 18(1): 44-50.
- Drews J. Drug discovery: a historical perspective. Science 2000; 287(5460): 1960-1964. Eser U., Öngel K. Güncel Biyoinformatik Yaklaşımlar, 2014.
- Gentleman RC., Carey VJ., Bates DM., Bolstad B., Dettling M., Dudoit S., Zhang J. Bioconductor: open software development for computational biology and bioinformatics. Genome Biology 2004; 5(10): 1-16.
- Gribskov M. The new biological literature. Bioinformatics (Oxford, England) 1999; 15(5): 347-347.
- Hogue CW. Bioinformatics for beginners. Trends in Biochemical Sciences 2002; 10(27): 542-543.
- Karabulut E., Karaoğlu E. Biyoinformatik ve biyoistatistik. Hacettepe Tıp Dergisi 2010; 41, 162-170.
- Kumaresan V., Bhatt P., Palanisamy R., Gnanam A., Pasupuleti M., Arockiaraj J. A murrel cysteine protease, cathepsin L: bioinformatics characterization, gene expression and proteolytic activity. Biologia 2014; 69(3): 395-406.
- Kuonen D. Challenges in bioinformatics for statistical data miners. Bulletin of the Swiss Statistical Society 2003; 46, 10-17.
- Luscombe NM., Greenbaum D., Gerstein M. What is bioinformatics? A proposed definition and overview of the field. Methods of Information in Medicine 2001; 40(04): 346-358.
- Min S., Lee B., Yoon S. Deep learning in bioinformatics. Briefings in Bioinformatics 2017; 18(5): 851-869.
- Polat M., Karahan A. Multidisipliner yeni bir bilim dalı: Biyoinformatik ve tıpta uygulamaları. SDÜ Tıp Fakültesi Dergisi 2009; 16(3): 41-50.
- Rashidi HH., Buehler LK. Bioinformatics basics: Applications in biological science and medicine. CRC press, 1999.
- Searls DB. Using bioinformatics in gene and drug discovery. Drug Discovery Today 2000; 5(4): 135- 143.
- Stransky B., Galante P. Application of bioinformatics in cancer research. An Omics Perspective on Cancer Research 2009; 211-233. https://doi:10.1007/978-90-481-26750_12
- Tandon P., Bhattacharjee P. Bioinformatics: An overview. Plant Tissue Culture and Molecular Markers, 2009.
- Tanyolaç B., Kaya HB., Soya S., Akkale C. Biyoteknoloji ve biyoinformatik, 2012.
- Blundell TL., Sibanda BL., Montalvao RW., Brewerton S., Chelliah V., Worth CL., Harmer NJ., Davies O., Burke D. Structural biology and bioinformaticsin drug design: opportunities and challenges for targetidentification and lead discovery. PhilosophicalTransactions of the Royal Society B: Biological Sciences 2006; 361(1467): 413-423.
- Tyanova S., Temu T., Sinitcyn P., Carlson A., Hein MY., Geiger T., Mann M., Cox J. The perseus computational platform for comprehensive analysis of (prote)omics data. Nat Methods 2016; 13(9): 731–740. https://doi.org/10.1038/nmeth.3901
- Tyanova S., Cox J. Perseus: A bioinformatics platform for ıntegrative analysis of proteomics data in cancer research. Cancer Systems Biology 2018; 133148. https://doi:10.1007/978-1-4939-7493- 1_7
- Wu D., Rice CM., Wang X. Cancer bioinformatics: A new approach to systems clinical medicine. BMC Bioinformatics 2012; 13(1): 71. https://doi:10.1186/1471-2105-13-71
- Xia X. Bioinformatics and drug discovery. Current Topics in Medicinal Chemistry 2017; 17(15): 1709-1726.
- Xiong J., Rayner S., Luo K., Li Y., Chen S. Genome wide prediction of protein function via a generic knowledge discovery approach based on evidence integration. BMC Bioinformatics 2006; 7, 268. https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-268
- www.ncbi.nlm.nih.gov
- www.expasy.org
| APA | Keklik G, Özcan B (2022). Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış. , 1082 - 1091. 10.47495/okufbed.1093687 |
| Chicago | Keklik Gülşah,Özcan Bahri Devrim Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış. (2022): 1082 - 1091. 10.47495/okufbed.1093687 |
| MLA | Keklik Gülşah,Özcan Bahri Devrim Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış. , 2022, ss.1082 - 1091. 10.47495/okufbed.1093687 |
| AMA | Keklik G,Özcan B Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış. . 2022; 1082 - 1091. 10.47495/okufbed.1093687 |
| Vancouver | Keklik G,Özcan B Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış. . 2022; 1082 - 1091. 10.47495/okufbed.1093687 |
| IEEE | Keklik G,Özcan B "Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış." , ss.1082 - 1091, 2022. 10.47495/okufbed.1093687 |
| ISNAD | Keklik, Gülşah - Özcan, Bahri Devrim. "Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış". (2022), 1082-1091. https://doi.org/10.47495/okufbed.1093687 |
| APA | Keklik G, Özcan B (2022). Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış. Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi (Online), 5(2), 1082 - 1091. 10.47495/okufbed.1093687 |
| Chicago | Keklik Gülşah,Özcan Bahri Devrim Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış. Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi (Online) 5, no.2 (2022): 1082 - 1091. 10.47495/okufbed.1093687 |
| MLA | Keklik Gülşah,Özcan Bahri Devrim Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış. Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi (Online), vol.5, no.2, 2022, ss.1082 - 1091. 10.47495/okufbed.1093687 |
| AMA | Keklik G,Özcan B Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış. Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi (Online). 2022; 5(2): 1082 - 1091. 10.47495/okufbed.1093687 |
| Vancouver | Keklik G,Özcan B Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış. Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi (Online). 2022; 5(2): 1082 - 1091. 10.47495/okufbed.1093687 |
| IEEE | Keklik G,Özcan B "Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış." Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi (Online), 5, ss.1082 - 1091, 2022. 10.47495/okufbed.1093687 |
| ISNAD | Keklik, Gülşah - Özcan, Bahri Devrim. "Multidisipliner Bir Bilim Dalı Olarak Biyoinformatiğe Genel Bir Bakış". Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi (Online) 5/2 (2022), 1082-1091. https://doi.org/10.47495/okufbed.1093687 |
