Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması
Yıl: 2024 Cilt: 58 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 1 - 12 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/mb.20249901 İndeks Tarihi: 08-02-2024
Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması
Öz: Grup B streptokoklar (GBS), çeşitli enfeksiyonlara neden olan mikroorganizmalardır. Bu çalışmada, GBS izolatlarında kapsül serotipleri, antibiyotik direnci ve izolatlar arasındaki filogenetik benzerlik ilişkisinin incelenmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya, Adana Şehir Hastanesine çeşitli yakınmalarla başvuran kadın hastalardan izole edilen 110 GBS izolatı dahil edilmiştir. Antibiyotik duyarlılıkları Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile gerçekleştirilmiş ve sonuçlar Klinik ve Laboratuvar Standartları Enstitüsü [Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI)] kriterleri ile değerlendirilmiştir. Eritromisin direnci için ermB, ermTR, mefA ve klindamisin direnci için linB genleri genotipik olarak multipleks polimeraz zincir reaksiyonu [multiplexpolymerase chain reaction (multipleks-PCR)] yöntemiyle araştırılmıştır. GBS kapsül serotiplendirilmesinde multipleks-PCR yöntemi kullanılmıştır. İzolatlar arasındaki benzerlik ilişkisi “pulsed-field” jel elektroforez (PFGE) yöntemiyle analiz edilmiştir. Çalışma sonucunda; GBS izolatlarının tamamının penisilin ve vankomisine duyarlı olduğu görülmüştür. Eritromisin, klindamisin, ofloksasin ve sefriaksona sırasıyla %60, %11.8, %6.4 ve %4.5 oranlarında direnç görülmüştür. Eritromisin dirençli izolatların %53’ünde ermTR, %47’sinde ermB genleri saptanırken, mefA geni tespit edilmemiştir. Klindamisin dirençli suşlarda linB geni bulunmamıştır. GBS’lerin kapsül serotip dağılımları sırası ile Ib %42.7, Ia %35.5, III %10, II %8.2, ve V %3.6 olarak tespit edilmiştir. GBS izolatları arasındaki benzerliğin araştırıldığı PFGE yönteminde elde edilen sonuçların analizinde anlamlı bir ilişki bulunamamıştır. Sonuç olarak, GBS kapsül serotiplerinin yaygınlığını ve antibiyotik direnç paternlerini gösteren daha fazla bölgesel çalışma yapılması gerektiği düşünülmüştür.
Anahtar Kelime: Determination of Capsule Types, Antibiotic Resistance Profiles and Phylogenetic Relationships of Group B Streptococcus Isolates Isolated from Patients Followed in Various Clinics and Polyclinics
Öz: Group B streptococci (GBS) are microorganisms that cause various systemic infections. In this study, it was aimed to investigate the capsule serotypes, antibiotic resistance and phylogenetic similarity relation- ship between GBS isolates. One hundred and ten GBS isolates isolated from female patients who admit- ted to Adana City Hospital with various complaints were included in the study. Kirby-Bauer disc diffusion method was used for the antibiotic resistance patterns and evaluated with CLSI criteria. The genes ermB, ermTR, mefA for erythromycin resistance and linB genes for clindamycin resistance were investigated by multiplex PCR method. Multiplex PCR method was used for GBS capsule serotyping. Similarity relation- ship between the isolates was analyzed by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) method. As a result of the study; all strains were found to be sensitive to penicillin and vancomycin. Erythromycin, clindamycin ofloxacin, and ceftriaxone resistance rates were observed as 60%, 11.8%, 6.4%, and 4.5%, respectively. The mefA gene was not found while 53% and 47% of the erythromycin-resistant isolates carried ermTR and ermB genes, respectively. The linB gene was not found in clindamycin-resistant GBS isolates. The capsule serotype distributions of GBSs were found as, Ib 42.7%, Ia 35.5%, III 10%, II 8.2%, and V 3.6%, respectively. In the analysis of the similarity relationships between GBS isolates with the PFGE method, no significant relationship was found. In conclusion, it was thought that more studies should be conducted to show the prevalence of GBS capsule serotypes and patterns of antibiotic resistance.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik
- 1. Flaherty RA, Aronoff DM, Gaddy JA, Petroff MG, Manning SD. Distinct group B Streptococcus sequence and capsule types differentially impact macrophage stress and inflammatory signaling responses. Infect Immun 2021; 89(5): e00647-20. https://doi.org/10.1128/IAI.00647-20
- 2. Tsai MH, Hsu JF, Lai MY, Lin LC, Chu SM, Huang HR, et al. Molecular characteristics and antimicrobial resistance of group B Streptococcus strains causing invasive disease in neonates and adults. Front Microbiol 2019; 18(10): 264. https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.00264
- 3. Kline KA, Lewis AL. Gram-positive uropathogens, polymicrobial urinary tract infection, and the emerging microbiota of the urinary tract. Microbiol Spectr 2016; 4: 2. https://doi.org/10.1128/microbiolspec.UTI0012-2012
- 4. Falagas ME, Rosmarakis ES, Avramopoulos I, Vakalis N. Streptococcus agalactiae infections in non-pregnant adults: Single center experience of a growing clinical problem. Med Sci Monit 2006; 12: 447-51.
- 5. Jalalifar S, Havaei SA, Motallebirad T, Moghim S, Fazeli H, Esfahan BN. Determination of surface proteins profile, capsular genotyping, and antibiotic susceptibility patterns of Group B Streptococcus isolated from urinary tract infection of Iranian patients. BMC Res Notes 2019; 12(1): 437. https://doi.org/10.1186/ s13104-019-4428-4
- 6. Sadowy E, Matynia B, Hryniewicz W. Population structure, virulence factors and resistance determinants of invasive, non-invasive and colonizing Streptococcus agalactiae in Poland. J Antimicrob Chemother 2010; 65(9): 1907-14. https://doi.org/10.1093/jac/dkq230
- 7. Sheppard AE, Vaughan A, Jones N, Turner P, Turner C, Efstratiou A, et al. Capsular typing method for Streptococcus agalactiae using whole genome sequence data. J Clin Microbiol 2016; 54(5): 1388-90. https://doi. org/10.1128/JCM.03142-15
- 8. Graux E, Hites M, Martiny D, Maillart E, Delforge M, Melin P, et al. Invasive group B Streptococcus among non-pregnant adults in Brussels-Capital Region, 2005-2019. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2021; 40(3): 515-23. https://doi.org/10.1007/s10096-020-04041-0
- 9. Hayes K, Fiona O’Halloran F, Cotter L. A review of antibiotic resistance in group B Streptococcus: The story so far. Crit Rev Microbiol 2020; 46(3): 253-69. https://doi.org/10.1080/1040841X.2020.1758626
- 10. Seki T, Kimura K, Reid ME, Miyazaki A, Banno H, Jin W, et al. High isolation rate of MDR group B streptococci with reduced penicillin susceptibility in Japan. J Antimicrob Chemother 2015; 70(10): 2725-8. https://doi. org/10.1093/jac/dkv203
- 11. Gajic I, CelinePlainvert C, Kekic D, Dmytruk N, Mijac V, Tazi A, et al. Molecular epidemiology of invasive and non-invasive group B Streptococcus circulating in Serbia. Int J Med Microbiol 2019; 309(1): 19-25. https:// doi.org/10.1016/j.ijmm.2018.10.005
- 12. Bolukaoto JY, Monyama CM, Chukwu MO, Lekala SM, Nchabeleng M, Maloba MRB, et al. Antibiotic resistance of Streptococcus agalactiae isolated from pregnant women in Garankuwa, South Africa. BMC Res Notes 2015; 8: 364. https://doi.org/10.1186/s13104-015-1328-0
- 13. Amundson NR, Flores AE, Hillier SL, Baker CJ, Ferrieri P. DNA macrorestriction analysis of nontypeable group B streptococcal isolates: Clonal evolution of nontypeable and type V isolates. J Clin Microbiol 2005; 43(2): 572-6. https://doi.org/10.1128/JCM.43.2.572-576.2005
- 14. Corrêa ABA, Silva GL, Pinto TCA, Oliveira ICM, Fernandes FG, Costa NS, et al. The genetic diversity and phenotypic characterisation of Streptococcus agalactiae isolates from Rio de Janeiro, Brazil. Mem Inst Oswaldo Cruz 2011; 106(8): 1002-6. https://doi.org/10.1590/S0074-02762011000800017
- 15. Poyart C, Tazi A, Réglier-Poupet H, Billoët A, Tavares N, Raymond J, et al. Multiplex PCR assay for rapid and accurate capsular typing of group B streptococci. J Clin Microbiol 2007; 45(6): 1985-8. https://doi. org/10.1128/JCM.00159-07
- 16. Imperi M, Pataracchia M, Alfarone G, Baldassarri L, Orefici G, Creti R. A multiplex PCR assay for the direct identification of the capsular type (Ia to IX) of Streptococcus agalactiae. J Microbiol Methods 2010; 80(2): 212-4. https://doi.org/10.1016/j.mimet.2009.11.010
- 17. Safari D, Gultom SM, Tafroji W, Azzahidah A, Soesanti F, Khoeri MM, et al. Prevalence, serotype and antibiotic susceptibility of Group B Streptococcus isolated from pregnant women in Jakarta, Indonesia. PLoS ONE 2021; 16(5): e0252328. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0252328
- 18. Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Standardized protocol for molecular subtyping of Listeria monocytogenes by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). Available from: https://www.cdc.gov/pulsenet/ protocols/pulsenet_listeria_protocol%20.pdf
- 19. Manning SD, Neighbors K, Tallman PA, Gillespie B, Marrs CF, Borchardt SM, et al. Prevalence of group B Streptococcus colonization and potential for transmission by casual contact in healthy young men and women. Clin Infect Dis 2004; 39(3): 380-8. https://doi.org/10.1086/422321
- 20. Atalay A, Ölçü M, Perçin D. Antibiotic susceptibilities and serotyping of clinical Streptococcus agalactiae isolates. Balkan Med J 2011; 28: 362-5. https://doi.org/10.5174/tutfd.2010.03979.2
- 21. Ulett KB, Benjamin WH, Zhuo F, Xiao M, Kong F, Gilbert GL, et al. Diversity of group B Streptococcus serotypes causing urinary tract infection in adults. J Clin Microbiol 2009; 47(7): 2055-60. https://doi. org/10.1128/JCM.00154-09
- 22. Desjardins M, Delgaty KL, Ramotar K, Seetaram C, Toye B. Prevalence and mechanisms of erythromycin resistance in group A and group B Streptococcus: Implications for reporting susceptibility results. J Clin Microbiol 2004; 42(12): 5620-3. https://doi.org/10.1128/JCM.42.12.5620-5623.2004
- 23. Evren K, Demir HAY, Sarıgüzel FM, Dinç B. Klinik örneklerden izole edilen Streptococcus agalactiae izolatlarının antibiyotik duyarlılıkları. Turk Mikrobiyol Cemiy Derg 2021; 51(3): 239-44.
- 24. Lachenauer C, Creti R, Michel J, Madoff L. Mosaicism in the alpha-like protein genes of group B streptococci. Proc Natl Acad Sci 2000; 97(17): 9630-5. https://doi.org/10.1073/pnas.97.17.9630
- 25. Madrid L, Seale AC, Kohli-Lynch M, Edmond KM, Lawn JE, Heath PT, et al. Infant group B streptococcal disease incidence and serotypes worldwide: Systematic review and meta-analyses. Clin Infect Dis 2017; 65(suppl_2): 160-72. https://doi.org/10.1093/cid/cix656
- 26. Arabacı Ç, Dal T, Ekin İH, Babacan F. Investigation of Streptococcus agalactiae serotypes in clinical samples: Streptococcus agalactiae serotypes. The Injector 2023; 2(1): 9-15.
- 27. Topkaya AE, Ciragil P, Sezer O, Karateke A, Küçükercan M. The serotype distrubition of group B streptococci isolated from pregnant women. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2005; 35: 81-4.
- 28. Yenisehirli G, Bulut Y, Demirturk F, Caliskan AC. Gebe kadınlardan izole edilen Streptococcus agalactiae suşlarının antimikrobiyal duyarlılıkları ve serotip dağılımı. Mikrobiyol Bul 2006; 40(3): 155-60.
- 29. Baba S, Aydin MD. İdrar örneklerinden izole edilen grup B streptokokların serotip dağılımı, biyofilm üretimi ve antibiyotik duyarlılıklarının araştırılması. Mikrobiyol Bul 2016; 50(3): 353-60. https://doi.org/10.5578/ mb.26466
- 30. Yan Y, Hu H, Lu T, Fan H, Hu Y, Li G, et al. Investigation of serotype distribution and resistance genes profile in group B Streptococcus isolated from pregnant women: A Chinese multicenter cohort study. Apmis 2016; 124(9): 794-9. https://doi.org/10.1111/apm.12570
- 31. Madzivhandila M, Adrian PV, Cutland CL, Kuwanda L, Schrag SJ, Madhi SA. Serotype distribution and invasive potential of group B Streptococcus isolates causing disease in infants and colonizing maternal-newborn dyads. PLoS ONE 2011; 6(3): e17861. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0017861
- 32. Fitoussi F, Loukil C, Gros I, Clermont O, Mariani P, Bonacorsi S, et al. Mechanisms of macrolide resistance in clinical group B streptococci isolated in France. Antimicrob Agents Chemother 2001; 45(6): 1889-91. https://doi.org/10.1128/AAC.45.6.1889-1891.2001
- 33. Palmeiro JK, Dalla-Costa LM, Fracalanzza SEL, Botelho ACN, Nogueira KS, Scheffer MC, et al. Phenotypic and genotypic characterization of group B streptococcal isolates in Southern Brazil. J Clin Microbiol 2010; 48(12): 4397-403. https://doi.org/10.1128/JCM.00419-10
- 34. Dutra VG, Alves VMN, Olendzki AN, Dia CAG, Bastos AFA, Santos GO, et al. Streptococcus agalactiae in Brazil: Serotype distribution, virulence determinants and antimicrobial susceptibility. BMC Infect Dis 2014; 14: 323. https://doi.org/10.1186/1471-2334-14-323
| APA | Kızılyıldırım S, Kandemir T, Sucu B, KÖKSAL f (2024). Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması. , 1 - 12. 10.5578/mb.20249901 |
| Chicago | Kızılyıldırım Suna,Kandemir Tülay,Sucu Berfin,KÖKSAL fatih Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması. (2024): 1 - 12. 10.5578/mb.20249901 |
| MLA | Kızılyıldırım Suna,Kandemir Tülay,Sucu Berfin,KÖKSAL fatih Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması. , 2024, ss.1 - 12. 10.5578/mb.20249901 |
| AMA | Kızılyıldırım S,Kandemir T,Sucu B,KÖKSAL f Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması. . 2024; 1 - 12. 10.5578/mb.20249901 |
| Vancouver | Kızılyıldırım S,Kandemir T,Sucu B,KÖKSAL f Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması. . 2024; 1 - 12. 10.5578/mb.20249901 |
| IEEE | Kızılyıldırım S,Kandemir T,Sucu B,KÖKSAL f "Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması." , ss.1 - 12, 2024. 10.5578/mb.20249901 |
| ISNAD | Kızılyıldırım, Suna vd. "Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması". (2024), 1-12. https://doi.org/10.5578/mb.20249901 |
| APA | Kızılyıldırım S, Kandemir T, Sucu B, KÖKSAL f (2024). Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, 58(1), 1 - 12. 10.5578/mb.20249901 |
| Chicago | Kızılyıldırım Suna,Kandemir Tülay,Sucu Berfin,KÖKSAL fatih Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni 58, no.1 (2024): 1 - 12. 10.5578/mb.20249901 |
| MLA | Kızılyıldırım Suna,Kandemir Tülay,Sucu Berfin,KÖKSAL fatih Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.58, no.1, 2024, ss.1 - 12. 10.5578/mb.20249901 |
| AMA | Kızılyıldırım S,Kandemir T,Sucu B,KÖKSAL f Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2024; 58(1): 1 - 12. 10.5578/mb.20249901 |
| Vancouver | Kızılyıldırım S,Kandemir T,Sucu B,KÖKSAL f Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2024; 58(1): 1 - 12. 10.5578/mb.20249901 |
| IEEE | Kızılyıldırım S,Kandemir T,Sucu B,KÖKSAL f "Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması." Mikrobiyoloji Bülteni, 58, ss.1 - 12, 2024. 10.5578/mb.20249901 |
| ISNAD | Kızılyıldırım, Suna vd. "Çeşitli Klinik ve Polikliniklerde Takip Edilen Hastalardan İzole Edilen Grup B Streptokok İzolatlarının Kapsül Tiplerinin Belirlenmesi, Antibiyotik Direnç Profilleri ve Filogenetik İlişkilerinin Araştırılması". Mikrobiyoloji Bülteni 58/1 (2024), 1-12. https://doi.org/10.5578/mb.20249901 |
