Süt sığırlarında genomik değerlendirme

OZBEYAZ, CEYHAN; KOCAKAYA, AFSIN

Süt sığırlarında genomik değerlendirme

Ceyhan ÖZBEYAZ, (Ankara Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Zootekni Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Afşin KOCAKAYA (Ankara Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Zootekni Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Lalahan Hayvancılık Araştırma Enstitüsü Dergisi

29 3

Yıl: 2011 Cilt: 51 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 93 - 104 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Süt sığırlarında genomik değerlendirme

Öz:

Süt sığırlarında hızlı bir genetik ilerleme sağlanabilmesi için generasyon aralığının mümkün olduğu kadar kısa olması gerekmektedir. Günümüzde yaygın olarak kullanılan ıslah yöntemlerinde generasyon aralığının uzun olması nedeniyle genetik ilerleme hızı düşük olmaktadır. Genomik değerlendirme yöntemi sayesinde generasyon aralığının kısalması mümkün olabilecektir. Islah çalışmalarının başarılı olabilmesi için genetik yapının tahmininde başarının yüksek olması gerekir. Hayvan populasyonlarındaki genetik varyasyonun belirlenebilmesi için DNA düzeyinde çalışmalar yapılması daha güvenilir sonuçlar vermektedir. Bu amaçla DNA polimorfizmlerini belirlemek için birçok yöntem kullanılmaktadır. Bunlar; SNP, mikrosatellitler, RFLP, RAPD gibi yöntemlerdir. Bu yöntemler içerisinde genetik ilerlemenin sağlanmasında SNP yöntemi diğer yöntemlere göre daha fazla potansiyele sahiptir. Bu derlemede süt sığırlarında genomik değerlendirme ve SNP yönteminden yararlanma imkanları ele alınmıştır.

Anahtar Kelime: genom analizleri seleksiyon genom süt sığırı genetik çeşitlilik

Konular: Biyoloji Tıbbi İnformatik Bilgisayar Bilimleri, Yazılım Mühendisliği Genetik ve Kalıtım Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Bilgisayar Bilimleri, Bilgi Sistemleri Ziraat Mühendisliği Bilgisayar Bilimleri, Yapay Zeka

Genomic evaluation in dairy cattle

Öz:

In order to rapid genetic improvement in dairy cattle, generation interval should be as short as possible. Because of the long generation interval, using breeding methods have lower rate of genetic improvement. Through genomic evaluation, generation interval could be shorter. Beceause of accomplishment for breeding studies, prediction for genetic structure must be successful. In order to identify genetic variation in animal population, DNA studies gives more reliable results. Many methods are used for the determine DNA polymorphism. These methods such as; SNPs, microsatellites, RFLP and RAPD are included. SNPs method has more potential than the other methods for the genetic improvement. In this paper, genomic evaluation in dairy cattle and potantialities of using SNPs method were reviewed.

Anahtar Kelime: genomes dairy cattle genetic variation genome analysis selection

Belge Türü: Makale Makale Türü: Çeviri Erişim Türü: Erişime Açık

1. Anonim (2011a): GoldenDate Bovine3K Genotyping BeadChip. Erişim Adresi: www.illumina.com Erişim Tarihi: 06.06.2011.
2. Anonim (2011b): Igenity Trade Mark of Merial. Erişim Adresi: www.igenity.com Erişim Tarihi: 22.07.2011.
3. Cassell (2010): Genetic Improvement Using Young Sires With Genomic Evaluations Virginia Cooperative Extension. Publication 404-090.
4. Dechow C (2009): Genomic Genetic Evaluations Have Arrived. Erişim Adresi: www.crbh.psu.edu Erişim Tarihi: 22.07.2011.
5. Decker JE, Pires JC, Conant GC, McKay SD, Heaton MP, Chen K, Cooper A, Vilkki J, Seabury CM, Caetano AR, Johnson GS, Brenneman RA, Hanott O, Egger LS, Wiener P, Kim JJ, Kim KS, Sonstegard TS, Van Tassell CP, Neibergs HL, McEwan JC, Brauning R, Countinhor LL, Babar ME, Wilson GA, McClure MC, Rolf MM, Kim JW, Schnabel RD and Taylor JF (2009): Resolving the evolution of extant and extinct ruminants with high-throughput phylogenomics. PNAS vol. 106 no. 44 18644- 18649 (2009) Erişim Adresi: www.pnas.org Erişim Tarihi: 19.06.2011.
6. Goddard ME, Hayes BJ (2007): Genomic Slection. J Anim Breed Genet ISSN 0931-2668.
7. Hanson J, Wılson R and Coburn A (2010): Genomics: The Past, Present and Future. Horizons vol. 16/No.1.
8. Hayes B (2007): QTL Mapping, MAS, and Genomic Selection. A shorth-course organized by Animal Breeding of Animal Science Iowa State University.
9. Hayes BJ, Bowman PJ, Chamberlaın AJ and Goddard ME (2009): Invited review: Genomic selection in dairy cattle: Progress and challenges. J. Dairy Sci. 92:433-443.
10. Interbull (2011): Interbull Survey on the Use of Genomic Information. Erişim Adresi: www.interbull.slu.se Erişim Tarihi: 27.06.2011.
11. Lüleci G, Sakızlı M ve Alper Ö. (2009): Renkli Genetik Atlası. Nobel Tıp Kitapevleri Ltd. Şti. ISBN: 978-975-420-677-7.
12. Maceachern S, McEwan J, McCulloch A, Mather A, Savin K. and Goddard M (2009): Molecular evolution of the Bovini tribe (Bovidae, Bovinae): Is there evidance of rapid evolution or reduced selective constraint in Domestic cattle? BMC Genomics 2009, 10:179 (2009).
13. Meuwissen THE, Hayes BJ and Goddard ME (2001): Prediction of Total Genetic Value Using Genome-Wide Dense Marker Maps Genetics. 157:1819-1829.
14. Meuwissen T (2011): Genomic Selection: The Future of Marker Assisted Selection and Animal Breeding. Erişim Adresi: www.fao.org Erişim Tarihi: 03.07.2011.
15. Moser G, Khatkar MS, Hayes BJ, Raadsma HW (2010): Accuracy of direct genomic values in Holstein bulls and cows using subsets of SNP markers. Genetics Selction Evolution 42:37.
16. Rolf MM, McKay SD, McClure MC, Decker JE, Taxis TM, Chapple RH, Vasco DA, Gregg SJ, Kim JW, Schnabel RD and Taylor JF (2010): How the Next Generation of Genetic Technologies Will Impact Beef Cattle Selection. Erişim Adresi: www.bifconferance.com Erişim Tarihi: 08.05.2011.
17. Seidel Jr GE (2010): Brief introduction to whole-genome selection in cattle using single nucleotide polymorphisms. Reproduction, Fertility and Development, 2010, 22, 138-144 Csiro Publishing.
18. Strauss S (2010): Biotech breeding goes Bovine. Nature Biotechnology 28, 540–543.
19. Van Der Werf J (2000): Identifying and incorporating genetic markers and major genes in animal breeding programs. QTL Course: June 2000 Belo Horizonte - Brasil.
20. VanRaden PM, Van Tassell CP, Wiggans GR, Sonstegard T S, Schnabel R D, Taylor JF and Schenkel FS (2009): Invited review: Reliability of genomic predictions for North American Holstein bulls. J. Dairy Sci 92:16-24.
21. VanRaden PM and Sullivan PG (2010): International genomic evaluation methods for dairy cattle Genetics. Selection Evaluation 2010,42:7.
22. Weigel KA, De Los Campos G, Gonzelez- Recio O, Naya H, Wu XL, Long N, Rosa GJM and Gianola D (2009): Predictive ability of direct genomic values for lifetime net merit of Holstein sires using selected subsets of single nucleotide polymorphism markers. J. Dairy Sci. 92:5248-5257.
23. Wiggans GR, VanRaden PM and Cooper TA (2011): Dairy Genomics in Application. Erişim Adresi: www.aipl.arsusda.gov Erişim Tarihi: 26.06.2011.
24. Williams JL (2005): The use of markerasissted selection in animal breeding and biotechnology. Rev. Sci. Tech. Off. Int. Epiz., 2005, 24 (1), 379-391.

APA	OZBEYAZ C, KOCAKAYA A (2011). Süt sığırlarında genomik değerlendirme. , 93 - 104.
Chicago	OZBEYAZ CEYHAN,KOCAKAYA AFSIN Süt sığırlarında genomik değerlendirme. (2011): 93 - 104.
MLA	OZBEYAZ CEYHAN,KOCAKAYA AFSIN Süt sığırlarında genomik değerlendirme. , 2011, ss.93 - 104.
AMA	OZBEYAZ C,KOCAKAYA A Süt sığırlarında genomik değerlendirme. . 2011; 93 - 104.
Vancouver	OZBEYAZ C,KOCAKAYA A Süt sığırlarında genomik değerlendirme. . 2011; 93 - 104.
IEEE	OZBEYAZ C,KOCAKAYA A "Süt sığırlarında genomik değerlendirme." , ss.93 - 104, 2011.
ISNAD	OZBEYAZ, CEYHAN - KOCAKAYA, AFSIN. "Süt sığırlarında genomik değerlendirme". (2011), 93-104.

APA	OZBEYAZ C, KOCAKAYA A (2011). Süt sığırlarında genomik değerlendirme. Lalahan Hayvancılık Araştırma Enstitüsü Dergisi, 51(2), 93 - 104.
Chicago	OZBEYAZ CEYHAN,KOCAKAYA AFSIN Süt sığırlarında genomik değerlendirme. Lalahan Hayvancılık Araştırma Enstitüsü Dergisi 51, no.2 (2011): 93 - 104.
MLA	OZBEYAZ CEYHAN,KOCAKAYA AFSIN Süt sığırlarında genomik değerlendirme. Lalahan Hayvancılık Araştırma Enstitüsü Dergisi, vol.51, no.2, 2011, ss.93 - 104.
AMA	OZBEYAZ C,KOCAKAYA A Süt sığırlarında genomik değerlendirme. Lalahan Hayvancılık Araştırma Enstitüsü Dergisi. 2011; 51(2): 93 - 104.
Vancouver	OZBEYAZ C,KOCAKAYA A Süt sığırlarında genomik değerlendirme. Lalahan Hayvancılık Araştırma Enstitüsü Dergisi. 2011; 51(2): 93 - 104.
IEEE	OZBEYAZ C,KOCAKAYA A "Süt sığırlarında genomik değerlendirme." Lalahan Hayvancılık Araştırma Enstitüsü Dergisi, 51, ss.93 - 104, 2011.
ISNAD	OZBEYAZ, CEYHAN - KOCAKAYA, AFSIN. "Süt sığırlarında genomik değerlendirme". Lalahan Hayvancılık Araştırma Enstitüsü Dergisi 51/2 (2011), 93-104.