Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma

TURAN, TURHAN; PARMAKSIZ, AYŞE; GÜRÇAY, METIN

Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma

Metin GÜRÇAY, (Gıda Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı, Veteriner Kontrol Enstitüsü, Viroloji Laboratuvarı, Elazığ, Türkiye)

Turhan TURAN, (Gıda Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı, Veteriner Kontrol Enstitüsü, Viroloji Laboratuvarı, Elazığ, Türkiye)

Ayşe PARMAKSIZ (Gıda Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı, Veteriner Kontrol Enstitüsü, Viroloji Laboratuvarı, Elazığ, Türkiye)

Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi

6 1

Yıl: 2013 Cilt: 19 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 141 - 146 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma

Öz:

Bu çalışmada, Türkiye’nin farklı bölgelerindeki gökkuşağı alabalık çiftliklerinde infeksiyöz pankreatik nekroz virusunun (IPNV) varlığı araştırılmıştır. Bu amaçla, Aralık 2010 ile Mart 2011 tarihleri arasında, 30 alabalık çiftliğindeki anaçlardan 47 seminal sıvı, 62 ovarial sıvı alınmış ve 134 yavru alabalıktan oluşan toplam 243 izolasyon materyali temin edilmiştir. Virus izolasyonu için izolasyon materyallerinin BF-2 (Bluegill fry-2) hücresinde iki pasajı yapılmıştır. Sitopatik effekt (SPE) gösteren hücre kültür süpernatantları, IPNV identifikasyonu için antijen enzyme linked immunosorbent assay (Ag-ELİSA) metodu ile analize tabi tutulmuştur. Bütün izolasyon materyallerine, hücre kültürü izolasyonu testiyle karşılaştırmak amacıyla Ters transkriptaz-polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PZR) testi de uygulanmıştır. Toplam 243 izolasyon materyalinin 26’sından (%10.7) IPNV izole edilmiştir. İzolasyon materyali alınan 11 ilin 7’sinde (%63.6) ve toplam 30 çitliğin 17’sinde (%56.6) IPNV varlığı tespit edildi. Ayrıca, virus izolasyon yöntemine göre daha ucuz ve daha hızlı bir metot olan RT-PZR testinin, IPNV’nun direkt dokudan tanısında alternatif bir metot olarak kullanılabileceği belirlenmiştir.

Anahtar Kelime: sitopatojenite teşhis yumurtalıklar sucul organizmalar sucul kültür gökkuşağı alabalığı Türkiye sucul hayvanlar balık hastalıkları tanı teknikleri viral hastalıklar kültür balığı seminal plazma ELISA

Konular: Biyoloji Balıkçılık Mikrobiyoloji Viroloji Zooloji

A study on the presence of infectious pancreatic necrosis virus infections in farmed rainbow trout (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) in Turkey

Öz:

In this study, the presence of infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) was investigated in farmed rainbow trout in different regions of Turkey. For this purpose, total of 243 isolation materials (47 seminal fluids, 62 ovarian fluids and 134 fingerling) were collected from 30 farms in the period of December and March 2010-2011. Isolation materials were passaged twice in BF-2 (Bluegill fry-2) cell cultures for virus isolation. The cell culture supernatants showed cytopathic effect (CPE) were tested by antigen-capture enzyme linked immunosorbent assay (Ag-ELISA) for IPNV identification. All isolation materials were tested also by reverse transcriptase polymerase cahin reaction (RT-PCR) in order to compare with the test of the virüs isolation. IPNV was detected from 26 (10.7%) of total 243 isolation materials obtained from 17 (56.6%) of 30 farms in 7 (63.6%) of 11 provinces. In addition, that RT-PCR test can be used as an alternative method in the IPNV-diagnosis by directly tissue-testing due to less expensive and faster than the virus isolation method was determined.

Anahtar Kelime: rainbow trout Turkey aquatic animals fish diseases diagnostic techniques viral diseases fish culture seminal plasma ELISA cytopathogenicity diagnosis ovaries aquatic organisms aquaculture

Konular: Biyoloji Balıkçılık Mikrobiyoloji Viroloji Zooloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Anonim: Su ürünleri istatistikleri 2010 yılı raporu, Türkiye İstatistik Kurumu, 2010.
2. Wolf K: Infectious pancreatic necrosis. In, Wolf K (Ed): Fish viruses and fish viraldiseases. pp. 115-157, Cornell University Press, Ithaca, NY, 1988.
3. Smail DA, Munro ALS: Infectious pancreatic necrosis virus persistence in farmed Atlantic salmon Salmo salar L. In, Ellis AE (Ed): Fish and Shellfish Pathology. pp. 277-288, Academic Press, New York, 1985.
4. Ogut H, Altuntas C: Occurrence and prevalence of infectious pancreatic necrosis virus in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) cultured in cages in the Black Sea. Aquacult Res, 2011, doi: 10.1111/j.1365-2109.2011.02959.x.
5. Anonim: Infectious pancreatic necrosis. Manual of Diagnostic Tests for Aquatic Animals. Office International des Epizooties, 2003.
6. Taksdal T, Dannevig BH, Rimstad E: Detection of infectious pancreatic necrosis (IPN)-virus in experimentally infected Atlantic salmon parr by RT-PCR and cell culture isolation. Bull Eur Ass Fish Pathol, 21, 214-219, 2001.
7. Ortega C, Vega F Enríquez R: Occurrence of the ınfectious pancreatic necrosis virus in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) farms in Hidalgo State, Mexico. Bull Eur Ass Fish Pathol, 27(3): 100-107 2007
8. Varvarigos P, Way K: First isolation and identification of the infectious pancreatic necrosis (IPN) virus from rainbow trout Onchorhynchus mykiss fingerlings farmed in Greece. Bull Eur Ass Fish Pathol, 22 (3): 195-199, 2002.
9. Crane MSJ, Hardy-Smith P, Williams LM, Hyatt AD, Eaton LM, Gould A, Handlinger J, Kattenbelt J, Gudkovs N: First isolation of an aquatic birnavirus from farmed and wild fish species in Australia. Dis Aquat Org, 43, 1-14, 2000.
10. Zhao ZF, Ke F, Li Z, Gui J, Zhang O: Isolation, characterization and genome sequence of a birnavirus strain from flounder Paralichthys olivaceus in China. Arch Virol, 153, 1143-1148, 2008.
11. Candan A: First report on the diagnosis of infectious pancreatic necrosis (IPN) based on reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) in Turkey. Bull Eur Ass Fish Pathol, 22 (1): 45, 2002.
12. Değirmenci U, Nemli E, Çağırgan H: Türkiye’nin değişik bölgelerinden infeksiyöz pankreatik necrozis virüsü izolasyonu. I. Ulusal Alabalık Sempoz-yumu, 14-16 Ekim, Isparta, p. 35, 2008.
13. Toplu N, Albayrak H, Aydoğan A, Epikmen ET, Metin N: Gökkuşağı alabalıklarında (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) enfeksiyöz pankreatik nekrozun patogenezisinde apoptozisin rolü. Ankara Üniv Vet Fak Derg, 57, 191-196, 2010.
14. Albayrak H, Özan E: Gökkuşağı alabalıklarında (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis ve infeksiyöz hemato-poietik nekrozis virus enfeksiyonlarının varlığının araştırılması. Ankara Üniv Vet Fak Derg, 57, 125-129, 2010.
15. Anonim: Hayvan hastalıkları ile mücadele ve hayvan hareketleri kontrolü genelgesi. Gıda ve Kontrol Genel Müdürlüğü, 2012.
16. Lorenzen E, Carstensen B, Olesen NJ: Interlaboratory comparison of cell lines for susceptibility to three viruses: VHSV, IHNV. Dis Aquat Org, 37, 81-88, 1999.
17. Dopoza CP, Barja JL: Diagnosis and identification of IPNV in salmonids by molecular methods. In, Cunningham CO (Ed): Molecular Diagnosis of Salmonid Disease. pp. 23-48, Kluwer Academic Publishers, Notherlans, 2002.
18. Anon: Qiagen one step RT-PCR kit handbook. http://www.qiagen.com. Accessed: 02.11.2010.
19. Williams K, Blake S, Sweeny A, Singer JT, Nicholson BL: Multiplex reverse transcriptase PCR assay for simultaneus detection of three fish viruses. J Clin Microbiol, 37, 4139-4141, 1999.
20. Smail DA, Munro ES: Isolation and quantification of infectious pancreatic necrosis virus from ovarian and seminal fluids of Atlantic salmon, Salmo salar L. J Fish Dis, 31 (1): 49-58, 2008.
21. Snieszko SF, Wood EM, Yasutake WT: Infectious pancreatic necrosis in trout. A.M.A. Archives of Pathology 63, 229-233, 1957.
22. Ahne W, Negele RD: Studies on the transmission of infectious pancreatic necrosis virus via eyed eggs and sexual products of salmonid fish. In, Ellis AE (Ed): Fish and Shellfish Pathology. Academic Press, pp. 261-269, 1985.
23. Mulcahy D, Pascho RJ: Adsorption of fish sperm to vertically transmitted fish viruses. Sci Magazine, 225, 333-335, 1984.
24. Ahne W, Kelly RK, Schlotfeldt HJ: Factors affecting the transmission and outbreak of infectious pancreatic necrosis (IPN). In, Lillelund K, Rosenthal H (Eds: Fish Health Protection Strategies. Federal Ministry for Research and Technology, Hamburg/Bonn, pp. 19-67, 1989.
25. Dorson MCT: Experimental transmission of infectious pancreatic necrosis virus via the sexual products. In, Ellis AE (Ed): Fish and Shellfish Pathology. pp. 251-260, Academic Press, London, 1985.
26. Agius C, Mangunwiryo H, Johnson RH, Smail DA: A more sensitive technique for isolating infectious pancreatic necrosis virus from asymptomatic carrier rainbow trout, Salmo gairdneri Richardson. J Fish Dis, 5, 285-292, 1982.
27. Hill BJ, Way K: Serological classification of infectious pancreatic necrosis (IPN) virüs and other aquatic birnaviruses, Ann Rev Fish Dis, 5, 55-77, 1995.
28. Dixon PF, Hill BJ: Rapid detection of infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) by the enzyme-linked immunosorbent assay. J Gen Virol, 64, 321-330, 1983.
29. McAllister, PE, Schill, WB: Immunoblot assay: A rapid and sensitive method for identification of salmonid fish viruses. J Wildl Dis, 22, 468-474, 98, 1986.
30. Lopez-Lastra M, Gonzalez M, Jashes M, Sandino AM: A detection method for infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) based on reverse transcription (RT)-polymerase chain-reaction (PCR). J Fish Dis, 17, 269-282, 1994.

APA	GÜRÇAY M, TURAN T, PARMAKSIZ A (2013). Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma. , 141 - 146.
Chicago	GÜRÇAY METIN,TURAN TURHAN,PARMAKSIZ AYŞE Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma. (2013): 141 - 146.
MLA	GÜRÇAY METIN,TURAN TURHAN,PARMAKSIZ AYŞE Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma. , 2013, ss.141 - 146.
AMA	GÜRÇAY M,TURAN T,PARMAKSIZ A Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma. . 2013; 141 - 146.
Vancouver	GÜRÇAY M,TURAN T,PARMAKSIZ A Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma. . 2013; 141 - 146.
IEEE	GÜRÇAY M,TURAN T,PARMAKSIZ A "Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma." , ss.141 - 146, 2013.
ISNAD	GÜRÇAY, METIN vd. "Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma". (2013), 141-146.

APA	GÜRÇAY M, TURAN T, PARMAKSIZ A (2013). Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 19(1), 141 - 146.
Chicago	GÜRÇAY METIN,TURAN TURHAN,PARMAKSIZ AYŞE Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 19, no.1 (2013): 141 - 146.
MLA	GÜRÇAY METIN,TURAN TURHAN,PARMAKSIZ AYŞE Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, vol.19, no.1, 2013, ss.141 - 146.
AMA	GÜRÇAY M,TURAN T,PARMAKSIZ A Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi. 2013; 19(1): 141 - 146.
Vancouver	GÜRÇAY M,TURAN T,PARMAKSIZ A Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi. 2013; 19(1): 141 - 146.
IEEE	GÜRÇAY M,TURAN T,PARMAKSIZ A "Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma." Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 19, ss.141 - 146, 2013.
ISNAD	GÜRÇAY, METIN vd. "Türkiye’de kültürü yapılan Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) infeksiyöz pankreatik nekrozis virus varlığının tespiti üzerine bir araştırma". Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 19/1 (2013), 141-146.