TY  - JOUR
TI  - Antalya eğitim ve araştırma hastanesinde kronik hepatit C hastalarının genotip dağılımının araştırılması
AB  - Hepatit C virusu (HCV), yüksek kronikleşme oranı, ciddi karaciğer hastalıklarına neden olması, kesin bir tedavi ve etkin bir aşısının olmaması gibi nedenlerden dolayı tüm dünyada ciddi bir sağlık sorunudur. HCV genomu yüksek derecede değişkenlik göstermekte olup, filogenetik olarak HCV’nin en az altı majör genotipi ve birçok alt tipinin bulunduğu bilinmektedir. HCV genotip dağılımı coğrafi ve epidemiyolojik farklılık göstermektedir. Doz ve tedavi süresi farklı genotipler için değişken olabileceğinden, tedavi öncesinde genotiplerin belirlenmesi klinik açıdan önemlidir. Bu çalışmada, hastanemizde izlenen kronik hepatit C’li hastalarda HCV genotiplerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya, Antalya Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarına, 01 Ocak 2011-30 Haziran 2013 tarihleri arasında, farklı servislerden gönderilen anti-HCV ve HCV-RNA pozitif toplam 148 kronik hepatit C’li hasta (67 kadın, 81 erkek; yaş ortalaması: 50.5 ± 10.8, yaş aralığı: 17-73 yıl) dahil edilmiştir. Hastaların epidemiyolojik verileri ve HCV genotip çalışmaları retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Viral genotipler gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (Rt-PCR) yöntemiyle (Abbott Molecular Diagnostic, ABD) belirlenmiştir. Bu yöntemle her örnek, 6 genotip (Gt) ve alt tip 1a ve 1b için test edilmiştir. Hastaların 119 (%80.4)’unda Gt-1 saptanmış; bunların %15.9 (19/119)’u 1a, %75.6 (90/119)’sı 1b olarak tiplendirilmiştir. Gt-2, -3 ve -4 prevalans oranları sırasıyla %3.4 (n= 5), %11.5 (n= 17) ve %2 (n= 3) olarak bulunmuş; Gt-6’ya ise rastlanmamıştır. Rt-PCR yöntemiyle çalışılan hastaların 4 (%2.7)’ünde karışık tip tespit edilmiş; bu örnekler RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) ve dizi analizi yöntemiyle çalışıldığında üçü Gt-1, biri ise Gt-2 olarak tiplendirilmiştir. Çalışmamızda saptanan yüksek Gt-3 prevalansının (%11.5), yabancı uyruklu 13 hastanın yedisinde saptanan Gt-3 pozitifliğinden kaynaklanmış olabileceği düşünülmüştür. Bu çalışmada kullanılan Rt-PCR yöntemi, kullanıcıdan bağımsız, standart otomatize ve hızlı sonuç veren güvenilir bir yöntemdir; ancak karışık tip saptanan örneklerin başka bir yöntemle doğrulanması gerekmektedir. Sonuç olarak, hastanemizde izlenen kronik hepatit C’li hastalar arasında en yaygın genotipin Gt-1b olduğu, Gt-3’ün ise şimdiye kadar bildirilmiş en yüksek oran olduğu söylenebilir.
AU  - SERTÖZ YAZAN, Rüçhan
AU  - Gür, Nilgün
AU  - Altuglu, Imre
AU  - Çekin, Yeşim
AU  - ÇEKİN, Ayhan Hilmi
PY  - 2014
JO  - Mikrobiyoloji Bülteni
VL  - 48
IS  - 3
SN  - 0374-9096
SP  - 484
EP  - 490
DB  - TRDizin
UR  - http://search/yayin/detay/161358
ER  -