Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1

KOTAN, Recep; GÖKÇE, Ahmet Yasin

Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1

Ahmet Yasin GÖKÇE, (Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü, Bitki Sağlığı Araştırmaları Daire Başkanlığı, Ankara , Türkiye)

Recep KOTAN (Atatürk Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Bitki Koruma Bölümü, Erzurum, Türkiye)

Bitki Koruma Bülteni

19 4

Yıl: 2016 Cilt: 56 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 49 - 75 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1

Öz:

Bu çalışmanın amacı; PGPR ve biyoajan bakteriler kullanılarak buğday kök çürüklüğü hastalığı Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'nın kontrolü ve bitki gelişimi üzerine etkisinin belirlenmesidir. 2012-2013 yıllarında yapılan bu çalışmada; daha önce yapılmış olan farklı araştırmalarda yabani ve kültür bitkilerinin toprak altı veya toprak üstü aksamlarından izole edilerek, Mikrobiyal Tanı Sistemi (MIS) ile tanılanan 25 faklı türe ait toplam 212 antagonist bakteri izolatı kullanılmıştır. Bu antagonist bakteriler in-vitro koşullarda patojene karşı antifungal özelliklerinin belirlenmesi için test edilmiştir. Antifungal özellikleri, azot fiksasyonu ve fosfatı çözebilme özellikleri dikkate alınarak seçilen 39 antagonist bakteri izolatı sıvı taşıyıcı formülasyonda geliştirilmiştir. Tohum kaplama yöntemi kullanılarak saksı denemelerinde hastalık gelişimi ve buğday bitkisinin gelişim parametreleri üzerine etkinlikleri bakımından test edilmiştir. Antagonistik bakterilerin pek çoğunun hem hastalığı baskılamakta etkili olduğu hem de bitki gelişiminde önemli katkılar sağladığı tespit edilmiştir. Sonuç olarak, antagonist bakteri izolatlarından oluşturulan sıvı formülasyonlardan bazılarının (Bacillus megaterium TV-6D, Brevibacillus choshinensis TV-53D ve Bacillus pumilus TV-3C) hem buğday kök çürüklüğü hastalığını kontrolünde biyopestisit ve hem de buğday yetiştiriciliğinde mikrobiyal gübre olarak kullanılabileceği tespit edilmiştir.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Ziraat Mühendisliği Gıda Bilimi ve Teknolojisi

Investigation of biological control possibilities of wheat root rot disease caused by Bipolaris sorokiniana (Sacc.) using PGPR and bio-control bacteria in controlled condition

Öz:

The aim of this study was to determine the effect of using PGPR and biocontrol bacteria against root rot disease on wheat caused by Bipolaris sorokiniana (Sacc.) control and plant growth promotion. A total of 212 antagonistic bacterial isolates belonging to 25 different species isolated from under-ground or above-ground of wild and cultivated plants in the previous studies were used in this study, carried on in 2012-2013. They were identified using fatty acid methyl esters profiles by the Microbial Identification System (MIS). The antagonistic bacterial strains were tested to determine their antifungal properties against the fungal pathogen in vitro conditions. A total of 39 antagonistic bacterial isolates, selected by determining antifungal properties, nitrogen fixation and phosphate solubulising activities, were growth in suitable liquid carrier formulation. They tested for suppressing root rot disease and wheat plant growth parameters by using seed coating method in pot experiments. It was found that many of the antagonistik bacteria both suppressed the disease and provided important contributions to the development of the plant. Consequently our results indicated that some of the liquid formulation consist of antagonistic bacteria (Bacillus megaterium TV-6D, Brevibacillus choshinensis TV-53D and Bacillus pumilus TV-3C) can be used as both biopesticide for the control of wheat root rot disease and biofertilizers for wheat crop.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Ziraat Mühendisliği Gıda Bilimi ve Teknolojisi

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

Agrios G. N. 1997. Plant pathology. Department of Plant Pathology, University of Florida, Academic Press, p 635.
Aktaş H. 2001. Önemli hububat hastalıkları ve sürvey yöntemleri, Tarımsal Araştırmalar Genel Müdürlüğü Yayını, 74 s., Ankara.
Aktaş B. 2010. Kuru koşullar için ıslah edilmiş bazı ekmeklik buğday (Triticum aestivum L.) çeşitlerinin karakterizasyonu. Ankara Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Tarla Bitkileri Anabilim Dalı, Doktora tezi, s 126.
Alippi A. M., Perelló A. E., Sisterna M. N., Greco N. M. and Cordo C. A. 2000. Remove from marked records potential of spore-forming bacteria as biocontrol agents of wheat foliar diseases under laboratory and greenhouse conditions. Zeitschrift für Pflanzenkrankheiten und Pflanzenschutz, 107 (2): 155-169.
Anonim 2012. Türkiye İstatistik Kurumu verileri. www.tuik.gov.tr (Erişim tarihi: 28.07.2015)
Anonymous 2012. Food and Agricultural Organization (FAO). www.fao.org (Erişim tarihi: 28.07.2015)
Bora T. ve Özaktan H. 1998. Bitki hastalıklarıyla biyolojik savaş. Ege Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Bitki Koruma Bölümü, Fitopatoloji Anabilim Dalı, İzmir. s 205.
Conner R. L. 1990. Interrelationship of cultivar reactions to common root rot, black point, and spot blotch in spring wheat. Plant Disease, 74: 224-227.
Couture L. and Sutton J. C. 1978. Control of spot blotch in barley by fungicide applications timed according to weather factors. Phytoprotection, 59: 65-75.
Demirci F. 2003. Bazı buğday çeşitlerinin önemli kök ve kök boğazı hastalık etmenleri (Fusarium spp., Bipolaris sorokiniana)'e karşı reaksiyonlarının belirlenmesi. Tarım Bilimleri Dergisi, 9 (4), 460-466.
Dickson J. G. 1956. Diseases of Field Crops, McGraw-Hill Book Company, Inc. Newyork (2nd ed.), 517.
Duczek L. J., Verma P. R. and Spurr D. T. 1985. Effect of inoculum density of Cochliobolus sativus on common root rot of wheat and barley. Canadian Journal of Plant Pathology, 7: 382-386.
Eken C. ve Demirci E. 1998. Erzurum yöresinde buğday ve arpa ekim alanlarında Drechslera sorokiniana'nın yayılışı, morfolojisi ve patojenitesi. Turkish Journal of Agriculture and Forestry, 22 (2), 175-180.
Ekmekci Y. and Terzioglu S. 1998. Interactive effects of vernalization, day length and light intensity on the number of leaves and flag leaf area in some wheat cultivars. Türkish Journal of Botany, 22: 303-312.
Harman G. E. 2000. Myths and dogmas of biocontrol: Changes in perceptions derived from research on Trichoderma harzianum T-22. Plant Disease, 84(4), 377-393.
Karagöz K. 2009. Bazı PGPR bakterilerin marulun gelişimi ve Marul Yaprak Leke hastalığı üzerine etkileri. Yüksek Lisans Tezi, Atatürk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Erzurum, 95 s.
Karman M. 1971. Bitki Koruma Araştırmalarında Genel Bilgiler, Denemelerin Kuruluşu ve Değerlendirme Esasları. 279s., Bornova-İzmir.
Koda N., Aoki M., Kawahara H., Yamade K. and Obata H. 2000. Characterization and properties of intracellular proteins after cold acclimation of the ice-nucleating bacterium Pantoea agglomerans (Erwinia herbicola) IFO12686. Cryobiology, 41 (3), 195-203.
Kotan R. 1997. Biber ve domatesteki bakteriyel leke hastalığı (Xanthomonas campestris pv. vesicatoria (Doidge) Dye.)'nın biyolojik ve kimyasal kontrolü. Yüksek Lisans Tezi, Atatürk Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Bitki Koruma Bölümü, Erzurum, 49 s.
Kotan R. 2002. Doğu Anadolu Bölgesi'nde yetiştirilen yumuşak çekirdekli meyve ağaçlarından izole edilen patojen ve saprofitik bakteriyel organizmaların klasik ve moleküler metotlar ile tanısı ve biyolojik mücadele imkânlarının araştırılması. Doktora Tezi, Atatürk Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bitki Koruma Anabilim Dalı, Erzurum, 217 s.
Kotan R., Sahin F. and Ala A. 2004. Nutritional similarity in carbon source utilization of Erwinia amylovora and its potential biocontrol agents. Journal of Turkish Phytopathology, 33 (1-3), 25-38.
Kün E. 1988. Serin iklim tahılları. Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Yayınları. No:1032 Ders Kitabı, Ankara, 322 s.
Ledingham R.J., Atkinson T.G., Horricks J.S., Mills J.T., Piening L.J. and Tinline R.D. 1973. Wheat losses due to common root rot in the prairie provinces of Canada, 1969-1971. Canadian Plant Disease Survey, 53: 113-122.
Lindh E., Kjaeldgaard P., Frederiksen W. and Ursing J. 1991. Phenotypical properties of Enterobacter agglomerans (Pantoea agglomerans) from human, animal and plant sources. APMIS: Acta Pathologica, Microbiologica, et Immunologica Scandinavica, 99 (4), 347-352.
Luz W.C. and Bergstrom G.C. 1986. Temperature-sensitive development of spot blotch in spring wheat cultivars differing in resistance. Fitopatology Brasileira, 11: 197-204.
Nunes C., Usall J., Teixido N. and Vinas I. 2001. Biological control of postharvest pear disease using a bacterium, Pantoea agglomerans CPA-2. International Journal of Food Microbiology, 70 (1-2), 53-61.
Paulitz T. C. 1991. Effect of Pseudomonas putida on the stimulation of Pythium ultimum by seed volatiles of pea and soybean. Phytopathology, 81: 1282-1287.
Piening L.J., Atkinson T.G., Horricks J.S., Ledingham R.J., Mills J.T. and Tinline R.D. 1976. Barley losses due to commen root rot in the prairie provinces of Canada, 1970-1972. Canadian Plant Disease Survey, 56: 41-45.
Szekeres A. 2006. Echophysiological and molecular investigation of Trichoderma strains isolated from winter wheat rhizosphere. Acta Biological Szeged, 49: 61.
Tinline R.D. and Ledingham R.J. 1979. Yields losses in wheat and barley cultivars from common root rot in field tests. Canadian Journal of Plant Science, 59: 313-320.
Turan M., Güllüce M., Karadayi M., Barıs O. and Sahin F. 2011. Role of soil enzymes produced by PGPR strains in wheat growth and nutrient uptake parameters in the filed conditions. Current Opinion in Biotechnology, 22 (1), 133.
Turan M., Güllüce M. and Sahin F. 2012a. Effects of plant-growth-promoting rhizobacteria on yield, growth, and some physiological characteristics of wheat and barley plants. Communcations in Soil Science and Plant Analysis, 43 (12), 1658-1673.
Turan M., Güllüce M., von Wiren N. and Sahin F. 2012b. Yield promotion and phosphorus solubilization by plant growth-promoting rhizobacteria in extensive wheat production in Turkey. Journal of Plant Nutrition and Soil Science, 175 (6), 818-826.
Turan M., Güllüce N., Cakmakcı R. and Sahin F. 2013. Effect of plant growth-promoting rhizobacteria strain on freezing injury and antioxidant enzyme activity of wheat and barley. Journal of Plant Nutrition, 36 (5), 731-748.
Uçkun Z. ve Yıldız M. 2004. İzmir, Aydın ve Denizli illeri buğday alanlarındaki kök ve kökboğazı hastalıklarının yoğunluğunun ve etmenlerinin belirlenmesi. Bitki Koruma Bülteni, 44 (1-4), 79-92.
Wallwork H. 2000. Cereal root and crown diseases. SARDI, Adelaide, 58 p.
Wiese M. V. 1987a. Compendium of Wheat Diseases, American Phytopathological Society, St. Paul, MN, (2nd ed.), 112.
Wiese M. V. 1987b. Compendium of Barley Diseases, American Phytopathological Society, St. Paul, MN, (2nd ed.) 78.
Zhang Z., Yuen G.Y., Sarath G. and Penheiter A.R. 2001. Chitinases from the plant disease biocontrol agent, Stenotrophomonas maltophilia C3. Phytopathology, 91(2), 204- 211.

APA	GÖKÇE A, KOTAN R (2016). Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1. , 49 - 75.
Chicago	GÖKÇE Ahmet Yasin,KOTAN Recep Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1. (2016): 49 - 75.
MLA	GÖKÇE Ahmet Yasin,KOTAN Recep Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1. , 2016, ss.49 - 75.
AMA	GÖKÇE A,KOTAN R Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1. . 2016; 49 - 75.
Vancouver	GÖKÇE A,KOTAN R Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1. . 2016; 49 - 75.
IEEE	GÖKÇE A,KOTAN R "Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1." , ss.49 - 75, 2016.
ISNAD	GÖKÇE, Ahmet Yasin - KOTAN, Recep. "Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1". (2016), 49-75.

APA	GÖKÇE A, KOTAN R (2016). Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1. Bitki Koruma Bülteni, 56(1), 49 - 75.
Chicago	GÖKÇE Ahmet Yasin,KOTAN Recep Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1. Bitki Koruma Bülteni 56, no.1 (2016): 49 - 75.
MLA	GÖKÇE Ahmet Yasin,KOTAN Recep Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1. Bitki Koruma Bülteni, vol.56, no.1, 2016, ss.49 - 75.
AMA	GÖKÇE A,KOTAN R Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1. Bitki Koruma Bülteni. 2016; 56(1): 49 - 75.
Vancouver	GÖKÇE A,KOTAN R Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1. Bitki Koruma Bülteni. 2016; 56(1): 49 - 75.
IEEE	GÖKÇE A,KOTAN R "Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1." Bitki Koruma Bülteni, 56, ss.49 - 75, 2016.
ISNAD	GÖKÇE, Ahmet Yasin - KOTAN, Recep. "Buğday kök çürüklüğüne neden olan Bipolaris sorokiniana (Sacc.)'ya karşı PGPR ve biyoajan bakterileri kullanılarak kontrollü koşullarda biyolojik mücadele imkanlarının araştırılması1". Bitki Koruma Bülteni 56/1 (2016), 49-75.