Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi

günseren, filiz; GÜLTEKİN, Meral; ZEYTINOGLU, AYSIN; MUTLU, Derya; Ozkul, Aykut; ÖNGÜT, Gözde; MİDİLLİ, Kenan; ÖĞÜNÇ, MERAL DİLARA; Çolak, Dilek; EREN DAĞLAR, Duygu; gökahmetoğlu, selma

Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi

Duygu EREN DAĞLAR, (Aydın Devlet Hastanesi, Aydın, Türkiy)

Gözde ÖNGÜT, (Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye)

Dilek ÇOLAK, (Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye)

Aykut ÖZKUL, (Ankara Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Viroloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Derya MUTLU, (Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye)

AYŞIN ZEYTİNOĞLU TÜRKEŞ, (Ege Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İzmir, Türkiye)

Kenan MİDİLLİ, (İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, İstanbul, Türkiye)

Selma GÖKAHMETOĞLU, (Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji, Anabilim Dalı, Kayseri)

Filiz GÜNSEREN, (Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye)

MERAL DİLARA ÖĞÜNÇ, (Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye)

Meral GÜLTEKİN, (Akdeniz Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Antalya, Türkiye)

Diğer Yazarlar

Mikrobiyoloji Bülteni

3 0

Yıl: 2016 Cilt: 50 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 53 - 62 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi

Öz:

Tüm dünyada yaygın olarak bulunan sitomegalovirus (cytomegalovirus; CMV), immün sistemi normal konaklarda sıklıkla belirtisiz enfeksiyonlara yol açarken, immün yetmezliği olanlarda ve fetusta çok ciddi komplikasyonlara neden olabilmektedir. CMV'nin zarf yapısında yer alan glikoprotein B (gB), bu proteini kodlayan UL55 genindeki polimorfi zmlere göre dört genotipe ayrılmaktadır. CMV gB geninde saptanan nükleotid polimorfi zmlerinin; virusun hücre tropizmini, konağın immün yanıtını ve sonuçta CMV'nin patogenezini etkileyebileceği düşünülmektedir. Bu araştırmanın amacı, Türkiye'nin farklı bölgelerinden ve farklı hasta gruplarından elde edilen CMV izolatlarının gB genotiplerinin belirlenmesidir. Çalışmaya

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji

Determination of Cytomegalovirus Glycoprotein B Genotypes in Different Geographical Regions and Different Patient Groups in Turkey

Öz:

Cytomegalovirus (CMV), a common virus found all around the world, usually causes asymptomatic infections in immunocompetent hosts, however it may lead to serious complications in immunodefi cient patients and in the fetus. CMV is divided into four genotypes according to the polymorphisms in UL55 gene that encodes for envelope glycoprotein B. Nucleotide polymorphisms of CMV gB gene can affect the cell tropism of the virus and host immune response and believed to have important changes in the pathogenesis of CMV. The aim of this study was to determine the gB genotypes of CMV isolates from different patient groups selected from different regions of Turkey. A total of 136 clinical specimens from patients (66 female, 70 male; age range: 0-65 years, mean age: 24.03 ± 17.17) who were diagnosed to have CMV infection by polymerase chain reaction (PCR) and/or antigenemia tests, between 2001-2014, in the medical school hospitals of Akdeniz, Ege, Istanbul Cerrahpasa and Erciyes Universities (located at Mediterranean, Aegean, northwest and central Anatolia regions, respectively), were included in the study. The patient group consisted of 80 renal transplant (RT) recipients, 35 stem cell transplant (SCT) recipients, 13 newborns, seven heart transplant (HT) recipients and one pregnant woman. CMV gB genotypes were determined by PCR-RFLP (restriction fragment length polymorphism) method, and DNA sequencing and phylogenetic analysis were performed for the randomly selected 15 isolates with different genotypes. Among 136 (135 plasma, 1 amnion fl uid) samples, the most frequent genotype was gB1 (n= 44, 32.4%), followed by gB2 (n= 39, 28.6%), gB3 (n= 36, 26.5%) and gB4 (n= 8, 5.9%); however nine (6.6%) samples could not be genotyped. When analysis were interpreted according to the patient groups, it was determined that the genotypes in RT recipients were gB1 32.3%, gB2 28.7%, gB3 26.5% and gB4 5.9%; in SCT recipients gB1 34.3%, gB2 28.6%, gB3 22.9% and gB4 5.7%; in HT recipients gB3 57.1%, gB1 14.3% and gB2 14.3%; in newborns gB1 38.4%, gB3 30.8%, gB2 15.4% and gB4 7.7%, and gB2 genotype in the pregnant woman. As our study was a descriptive study to determine the genotypes of CMV gB, the relationship between the genotypes and the variants such as viral load, symptomatic disease and prognosis were not analyzed. As a result, the isolation of different gB genotypes in various case groups from four distinctive provinces, underlines the diversity of CMV gB genotypes in Turkey

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik

Griffi ths P, Baraniak I, Reeves M. The pathogenesis of human cytomegalovirus. J Pathol 2015; 235(2): 288-97.
Alberola J, Tamarit A, Igual R, Navarro D. Early neutralizing and glycoprotein B (gB)-specifi c antibody responses to human cytomegalovirus (HCMV) in immunocompetent individuals with distinct clinical presentations of primary HCMV infection. J Clin Virol 2000; 16(2): 113-22.
Hopkins JI, Fiander AN, Evans AS, Delchambre M, Gheysen D, Borysiewicz LK. Cytotoxic T cell immunity to human cytomegalovirus glycoprotein B. J Med Virol 1996; 49(2): 124-31.
Renzette N, Pokalyuk C, Gibson L, et al. Limits and patterns of cytomegalovirus genomic diversity in humans. Proc Natl Acad Sci USA 2015; 112(30): 4120-8.
Shepp DH, Match ME, Lipson SM, Pergolizzi RG. A fi fth human cytomegalovirus glycoprotein B genotype. Res Virol 1998; 149(2): 109-14.
Wu X, Wang Y, Xu Y, et al. Cytomegalovirus glycoprotein B genotype in hematopoietic stem cell transplant patients from China. Biol Blood Marrow Transplant 2010; 16(5): 647-52.
Renzette N, Gibson L, Jensen JD, Kowalik TF. Human cytomegalovirus intrahost evolution-a new avenue for understanding and controlling herpesvirus infections. Curr Opin Virol 2014; 8: 109-15.
Barbi M, Binda S, Caroppo S, et al. CMV gB genotypes and outcome of vertical transmission: study on dried blood spots of congenitally infected babies. J Clin Virol 2001; 21(1): 75-9.
Yamamoto AY, Mussi-Pinhata MM, de Deus Wagatsuma VM, Marin LJ, Duarte G, Figueiredo LT. Human cytomegalovirus glycoprotein B genotypes in Brazilian mothers and their congenitally infected infants. J Med Virol 2007; 79(8): 1164-8.
Manuel O, Asberg A, Pang X, et al. Impact of genetic polymorphisms in cytomegalovirus glycoprotein B on outcomes in solid-organ transplant recipients with cytomegalovirus disease. Clin Infect Dis 2009; 49(8): 1160-6.
Sahiner F, Cekmez F, Cetinkaya M, et al. Congenital cytomegalovirus infections and glycoprotein B genotypes in live-born infants: a prevalence study in Turkey. Infect Dis 2015; 47(7): 465-71.
Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol 2011; 28(10): 2731-9.
Gandhoke I, Hussain SA, Pasha ST, Chauhan LS, Khare S. Glycoprotein B genotyping in congenital/perinatal cytomegalovirus infection in symptomatic infants. Indian Pediatr 2013; 50(7): 663-7.
Gonzalez-Sanchez HM, Alvarado-Hernandez DL, Guerra-Palomares S, Garcia-Sepulveda CA, Noyola DE. Cytomegalovirus glycoprotein B genotypes in Mexican children and women. Intervirology 2015; 58(2): 115-21.
Arellano-Galindo J, Villanueva-García D, Cruz-Ramirez JL, et al. Detection and gB genotyping of CMV in Mexican preterm infants in the context of maternal seropositivity. J Infect Dev Ctries 2014; 8(6): 758-67.
Roubalová K, Zufanová S, Vítek A, Stanková M. Prevalence of glycoprotein B (gB) genotypes in the patients with high risk of symptomatic cytomegalovirus infection. Epidemiol Mikrobiol Imunol 2009; 58(4): 148-53.
de Vries JJ, Wessels E, Korver AM, et al. Rapid genotyping of cytomegalovirus in dried blood spots by multiplex real-time PCR assays targeting the envelope glycoprotein gB and gH genes. J Clin Microbiol 2012; 50(2): 232-7.
Nijman J, Mandemaker FS, Verboon-Maciolek MA, et al. Genotype distribution, viral load and clinical characteristics of infants with postnatal or congenital cytomegalovirus infection. PLoS One 2014; 9(9):e108018.
Paradowska E, Studzinska M, Suski P, et al. Human cytomegalovirus UL55, UL144, and US28 genotype distribution in infants infected congenitally or postnatally. J Med Virol 2015; 87(10): 1737-48.
Nogueira E, Ozaki KS, Tomiyama H, Câmara NO, Granato CF. Clinical correlations of human cytomegalovirus strains and viral load in kidney transplant recipients. Int Immunopharmacol 2009; 9(1):26-31.
Dieamant DC, Bonon SH, Peres RM, et al. Cytomegalovirus (CMV) genotype in allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. BMC Infect Dis 2013; 13: 310.
Ding ZY, Xu F, Chen DZ, et al. A multifactorial analysis of the pregnancy outcomes in cytomegalovirus- infected women. Gynecol Obstet Invest 2015; 80(2): 106-12.
Oka N, Suzuki T, Inoue T, Kobayashi T, Ohashi Y. Polymorphisms in cytomegalovirus genotype in immunocompetent patients with corneal endotheliitis or iridocyclitis. J Med Virol 2015; 87(8): 1441-5.
Taherkhani R, Farshadpour F, Makvandi M, et al. Determination of cytomegalovirus prevalence and glycoprotein B genotypes among ulcerative colitis patients in ahvaz, Iran. Jundishapur J Microbiol 2015; 8(2): e17458.
Tang N, Li JW, Liu YM, et al. Human cytomegalovirus infection is associated with essential hypertension in Kazakh and Han Chinese populations. Med Sci Monit 2014; 20: 2508-19.
Jin H, Wang X, Li S. Human cytomegalovirus glycoprotein B genotype correlates with different symptoms of infected infants. Intervirology 2007; 50(3): 219-23.
Coaquette A, Bourgeois A, Dirand C, Varin A, Chen W, Herbein G. Mixed cytomegalovirus glycoprotein B genotypes in immunocompromised patients. Clin Infect Dis 2004; 39(2): 155-61.
Emery VC, Manuel O, Asberg A, et al. Differential decay kinetics of human cytomegalovirus glycoprotein B genotypes following antiviral chemotherapy. J Clin Virol 2012; 54(1): 56-60.
Rieder F, Steininger C. Cytomegalovirus vaccine: phase II clinical trial results. Clin Microbiol Infect 2014; 20(5): 95-102.
Sowmya P, Dhanya V, Madhavan HN, Therese KL. Comparative effi cacy of PCR-based restriction fragment length polymorphism (RFLP) & multiplex PCR for glycoprotein B (gB) genotyping of human cytomegalovirus. Indian J Med Res 2007; 126(2): 122-7.

APA	EREN DAĞLAR D, ÖNGÜT G, Çolak D, Ozkul A, MUTLU D, ZEYTINOGLU A, MİDİLLİ K, gökahmetoğlu s, günseren f, ÖĞÜNÇ M, GÜLTEKİN M (2016). Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi. , 53 - 62.
Chicago	EREN DAĞLAR Duygu,ÖNGÜT Gözde,Çolak Dilek,Ozkul Aykut,MUTLU Derya,ZEYTINOGLU AYSIN,MİDİLLİ Kenan,gökahmetoğlu selma,günseren filiz,ÖĞÜNÇ MERAL DİLARA,GÜLTEKİN Meral Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi. (2016): 53 - 62.
MLA	EREN DAĞLAR Duygu,ÖNGÜT Gözde,Çolak Dilek,Ozkul Aykut,MUTLU Derya,ZEYTINOGLU AYSIN,MİDİLLİ Kenan,gökahmetoğlu selma,günseren filiz,ÖĞÜNÇ MERAL DİLARA,GÜLTEKİN Meral Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi. , 2016, ss.53 - 62.
AMA	EREN DAĞLAR D,ÖNGÜT G,Çolak D,Ozkul A,MUTLU D,ZEYTINOGLU A,MİDİLLİ K,gökahmetoğlu s,günseren f,ÖĞÜNÇ M,GÜLTEKİN M Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi. . 2016; 53 - 62.
Vancouver	EREN DAĞLAR D,ÖNGÜT G,Çolak D,Ozkul A,MUTLU D,ZEYTINOGLU A,MİDİLLİ K,gökahmetoğlu s,günseren f,ÖĞÜNÇ M,GÜLTEKİN M Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi. . 2016; 53 - 62.
IEEE	EREN DAĞLAR D,ÖNGÜT G,Çolak D,Ozkul A,MUTLU D,ZEYTINOGLU A,MİDİLLİ K,gökahmetoğlu s,günseren f,ÖĞÜNÇ M,GÜLTEKİN M "Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi." , ss.53 - 62, 2016.
ISNAD	EREN DAĞLAR, Duygu vd. "Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi". (2016), 53-62.

APA	EREN DAĞLAR D, ÖNGÜT G, Çolak D, Ozkul A, MUTLU D, ZEYTINOGLU A, MİDİLLİ K, gökahmetoğlu s, günseren f, ÖĞÜNÇ M, GÜLTEKİN M (2016). Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni, 50(1), 53 - 62.
Chicago	EREN DAĞLAR Duygu,ÖNGÜT Gözde,Çolak Dilek,Ozkul Aykut,MUTLU Derya,ZEYTINOGLU AYSIN,MİDİLLİ Kenan,gökahmetoğlu selma,günseren filiz,ÖĞÜNÇ MERAL DİLARA,GÜLTEKİN Meral Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni 50, no.1 (2016): 53 - 62.
MLA	EREN DAĞLAR Duygu,ÖNGÜT Gözde,Çolak Dilek,Ozkul Aykut,MUTLU Derya,ZEYTINOGLU AYSIN,MİDİLLİ Kenan,gökahmetoğlu selma,günseren filiz,ÖĞÜNÇ MERAL DİLARA,GÜLTEKİN Meral Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.50, no.1, 2016, ss.53 - 62.
AMA	EREN DAĞLAR D,ÖNGÜT G,Çolak D,Ozkul A,MUTLU D,ZEYTINOGLU A,MİDİLLİ K,gökahmetoğlu s,günseren f,ÖĞÜNÇ M,GÜLTEKİN M Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2016; 50(1): 53 - 62.
Vancouver	EREN DAĞLAR D,ÖNGÜT G,Çolak D,Ozkul A,MUTLU D,ZEYTINOGLU A,MİDİLLİ K,gökahmetoğlu s,günseren f,ÖĞÜNÇ M,GÜLTEKİN M Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2016; 50(1): 53 - 62.
IEEE	EREN DAĞLAR D,ÖNGÜT G,Çolak D,Ozkul A,MUTLU D,ZEYTINOGLU A,MİDİLLİ K,gökahmetoğlu s,günseren f,ÖĞÜNÇ M,GÜLTEKİN M "Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi." Mikrobiyoloji Bülteni, 50, ss.53 - 62, 2016.
ISNAD	EREN DAĞLAR, Duygu vd. "Türkiye'de Farklı Coğrafi Bölgelerde ve Farklı Hasta Gruplarındaki Sitomegalovirus İzolatlarının Glikoprotein B Genotiplerinin Belirlenmesi". Mikrobiyoloji Bülteni 50/1 (2016), 53-62.