Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması

AKISÜ, Çiler; Ozkoc, Soykan; BAYRAM DELİBAŞ, SONGÜL; ERGÜDEN, Ceren; ERBAYCU, Ahmet Emin

Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması

Soykan ÖZKOÇ, (Dokuz Eylül Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Parazitoloji Anabilim Dalı, İzmir, Türkiye)

SONGÜL BAYRAM DELİBAŞ, (Dokuz Eylül Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Parazitoloji Anabilim Dalı, İzmir, Türkiye)

Ahmet Emin ERBAYCU, (SB İzmir Dr. Suat Seren Göğüs Hastalıkları ve Göğüs Cerrahisi Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Göğüs Hastalıkları Kliniği, İzmir, Türkiye)

Ceren ERGÜDEN, (Dokuz Eylül Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Parazitoloji Anabilim Dalı, İzmir, Türkiye)

Çiler AKISÜ (Dokuz Eylül Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Parazitoloji Anabilim Dalı, İzmir, Türkiye)

Türkiye Parazitoloji Dergisi

9 0

Yıl: 2014 Cilt: 38 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 214 - 219 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması

Öz:

Amaç: Pnömoni semptom ve bulguları bulunmayan kişilerin klinik örneklerinde Pneumocystis jirovecii (P. jirovecii)'nin veya DNA'sının gösterilmesi kolonizasyon olarak tanımlanmıştır. Çalışmamızda İzmir Dr. Suat Seren Göğüs Hastalıkları Hastanesi'nde pulmoner semptomları ve/veya allta yatan akciğer hastalıklarının tanısı için bronkoskopi yapılan hastalarda P. jirovecii kolonizasyon prevalansının araştırmayı hedefledik. Yöntemler: Hastaların bronkoalveolar lavaj (BAL) sıvısı örnekleri, P. jirovecii ribosomal RNA geniş alt ünitesini kodlayan mitokondriyal geni (mt-LSUrRNA) çoğaltan nested-PCR (nPCR) yöntemi ile değerlendirildi. Ek olarak bütün örneklere giemsa, Gomori'nin metenamin gümüş (GMG) ve indirekt floresan antikor (IFA) boyama yöntemleri uygulandı. Bulgular: nPCR testi sonucunda 30 BAL örneğinin 21 (%70)'inde P. jirovecii DNA'sı saptandı. Bununla birlikte nPCR ile pozitif saptanan 21 hastanın sadece bir tanesinde giemsa ve GMG boyası ile P. jirovecii kistleri saptandı. IFA boyama yöntemi ile 6 hasta pozitif olarak değerlendirilirken bunların sadece 4'ü nPCR ile pozitif olarak bulundu. Sonuç: Çalışmamızın sonuçları özellikle kronik akciğer hastalığı olan hastalarda yüksek P. jirovecii kolonizasyon prevelanslarının saptanabileceğini ve P. jirovecii kolonizasyonunun saptanmasında nPCR'ın iyi bir yöntem olduğunu göstermiştir.

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Hematoloji Enfeksiyon Hastalıkları

Investigation of Pneumocystis jirovecii Colonization in Patients with Pulmonary Diseases

Öz:

Objective: The detection of Pneumocystis jirovecii or its DNA in respiratory samples from individuals who do not have signs or symptoms of pneumonia has been defined as colonization. In this study, we aimed to investigate the prevalence of P. jirovecii colonization in patients with various lung diseases.Methods: Thirty patients who were followed-up and who had undergone bronchoscopy for diagnosis of different underlying diseases or pulmonary signs were included in the study. Bronchoalveolar lavage (BAL) fluids of these patients were analyzed with nPCR amplification of the mt-LSUrRNA gene of P. jirovecii. In addition to nPCR, giemsa, Gomori's methenamine silver (GMS), and indirect fluorescence antibody (IFA) staining assays were applied to all samples.Results: P. jirovecii DNA was detected in 21 of 30 (70%) BAL samples by nPCR. However, P. jirovecii cysts were found in 1 of 21 nPCR-positive samples by giemsa and GMS. IFA assay showed six samples to be positive, but only four of them were found to be positive by nPCR.Conclusion: Result of our study showed that prevalence of P. jirovecii colonization is particularly high in patients with chronic pulmonary.

Anahtar Kelime:

Konular: Mikrobiyoloji Hematoloji Enfeksiyon Hastalıkları

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

Krajiceka BJ, Limpera AH, Thomas CF. Advances in the biology, pathogenesis and identification of Pneumocystis pneumonia. Curr Opin Pulm Med 2008; 14: 228-34. [CrossRef]
Morris A, Wei K, Afshar K, Huang L. Epidemiology and clinical sig- nificance of pneumocystis colonization. J Infect Dis 2008; 197: 10-7. [CrossRef]
Mekinian A, Durand-Joly I, Hatron PY, Moranne O, Denis G, Dei-Cas E, et al. Pneumocystis jirovecii colonization in patients with systemic autoimmune diseases: prevalence, risk factors of colonization and outcome. Rheumatology (Oxford) 2011; 50: 569-77. [CrossRef]
Tasaka S, Tokuda H. Recent advances in the diagnosis of Pneumocystis jirovecii pneumonia in HIV-infected adults. Expert Opin Med Diagn 2013; 7: 85-97.[CrossRef]
Tia T, Putaporntip C, Kosuwin R, Kongpolprom N, Kawkitinarong K, Jongwutiwes S. A highly sensitive novel PCR assay for detection of P. jirovecii DNA in bronchoalveloar lavagespecimens from immuno- compromised patients. Clin Microbiol Infect 2012; 18: 598-603. [CrossRef]
Norris KA, Morris A. Pneumocystis infection and the pathogenesis of chronic obstructive pulmonary disease. Immunol Res 2011; 50: 175-80. [CrossRef]
Gutiérrez S, Respaldiza N, Campano E, Martínez-Risquez MT, Calderón EJ, De La Horra C. Pneumocystis jirovecii colonization in chronic pulmonary disease. Parasite 2011; 18: 121-26. [CrossRef]
Özkoç S, İnceboz T, Sifil A, Tuncay S, Akisü Ç. Pneumocystis pneu- monia in a renal transplant recipient]. Turkiye Parazitol Derg 2010; 34: 186-89. [CrossRef]
Calderón EJ, Rivero L, Respaldiza N, Morilla R, Montes-Cano MA, Friaza V, et al. Systemic inflammation in patients with chronic obst- ructive pulmonary disease who are colonized with Pneumocystis jiroveci. Clin Infect Dis 2007; 45: 17-9. [CrossRef]
Pederiva MA, Wissmann G, Friaza V, Morilla R, de La Horra C, Montes-Cano MA, et al. High prevalence of Pneumocystis jirovecii colonization in Brazilian cystic fibrosis patients. Med Mycol 2012; 50: 556-60. [CrossRef]
Probst M, Ries H, Schmidt-Wieland T, Serr A. Detection of Pneumocystis carinii DNA in patients with chronic lung diseases. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2000; 19: 644-5. [CrossRef]
Vidal S, de la Horra C, Martín J, Montes-Cano MA, Rodríguez E, Respaldiza N, et al. Pneumocysti jirovecii colonisation in patients with interstitial lung disease. Clin Microbiol Infect 2006; 12: 231-5. [CrossRef]
de la Horra C, Varela JM, Fernández-Alonso J, Medrano FJ, Respaldiza N, Montes-Cano MA, et al. Association between human-Pneumocystis infection and small-cell lung carcinoma. Eur J Clin Invest 2004; 34: 229-35. [CrossRef]
Calderón EJ. Pneumocystis infection: seeing beyond the tip of the iceberg. Clin Infect Dis 2010; 50: 354-6. [CrossRef]
Miller RF, Ambrose HE, Wakefield AE. Pneumocystis carinii f. sp. hominis DNA in immunocompetent health care workers in contact with patients with P. carinii pneumonia. J Clin Microbiol 2001; 39: 3877-82. [CrossRef]
Vargas SL, Ponce CA, Gigliotti F, Ulloa AV, Prieto S, Mu-oz MP, et al. Transmission of Pneumocystis carinii DNA from a patient with P. carinii pneumonia to immunocompetent contact health care wor- kers. J Clin Microbiol 2000; 38: 1536-8.
Rivero L, de la Horra C, Montes-Cano MA, Rodríguez-Herrera A, Respaldiza N, Friaza V, et al. Pneumocystis jirovecii transmission from immunocompetent carriers to infant. Emerg Infect Dis 2008; 14: 1116-8. [CrossRef]
Tekinşen FF, Koç AN. Investigation of Pneumocystis jirovecii in Clinical Specimens by Different Methods. Mikrobiyol Bul 2013; 47: 658-67. [CrossRef]
Tosun I, Buruk K, Dede R, Kaklıkaya N. Investigation of Pneumocystis jirovecii in Respiratory Samples of Immunocompromised Patients with PCR, IFA and Giemsa Staining Methods. Mikrobiyol Bul 2013; 47: 195-7. [CrossRef]
Güneş I, Kalkanci A, Kuştimur S, Ergüven S, Ozet G, Ekim N. Comparison of the methenamine silver staining, direct fluorescent antibody and nested-polymerase chain reaction methods in the diagnosis of Pneumocystis carinii pneumonia. Mikrobiyol Bul 2004; 38: 105-12.
Döskaya M, Caner A, Degirmenci A, Wengenack NL, Yolasigmaz A, Turgay N, et al. Degree and frequency of inhibition in a routine real-time PCR detecting Pneumocystis jirovecii for the diagnosis ofPneumocystis pneumonia in Turkey. J Med Microbiol 2011; 60: 937-44. [CrossRef]
Özmen A, Mıstık R, Alver O, Coşkun F, Ursavaş A, Uzaslan E. "The Pneumocystis jirovecii colonization in bronchoalveolar lavage (BAL) and bronchial washing and the comparison of methods which are used in diagnosis". Tuberk Toraks 2013; 61: 303-11. [CrossRef]
Fritzsche C, Riebold D, Munk-Hartig A, Klammt S, Neeck G, Reisinger E. High prevalence of Pneumocystis jirovecii colonizati- on among patients with autoimmune inflammatory diseases and corticosteroid therapy. Scand J Rheumatol 2012; 41: 208-13. [CrossRef]
Mori S, Cho I, Sugimoto M. A followup study of asymptomatic carriers of Pneumocystis jiroveci during immunosuppressive the- rapy for rheumatoid arthritis. J Rheumatol 2009; 36: 1600-5. [CrossRef]
Maskell NA, Waine DJ, Lindley A, Pepperell JC, Wakefield AE, Miller RF, et al. Asymptomatic carriage of Pneumocystis jiroveci in subjects undergoing bronchoscopy: a prospective study. Thorax 2003; 58: 594-7. [CrossRef]

APA	Ozkoc S, BAYRAM DELİBAŞ S, ERBAYCU A, ERGÜDEN C, AKISÜ Ç (2014). Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması. , 214 - 219.
Chicago	Ozkoc Soykan,BAYRAM DELİBAŞ SONGÜL,ERBAYCU Ahmet Emin,ERGÜDEN Ceren,AKISÜ Çiler Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması. (2014): 214 - 219.
MLA	Ozkoc Soykan,BAYRAM DELİBAŞ SONGÜL,ERBAYCU Ahmet Emin,ERGÜDEN Ceren,AKISÜ Çiler Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması. , 2014, ss.214 - 219.
AMA	Ozkoc S,BAYRAM DELİBAŞ S,ERBAYCU A,ERGÜDEN C,AKISÜ Ç Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması. . 2014; 214 - 219.
Vancouver	Ozkoc S,BAYRAM DELİBAŞ S,ERBAYCU A,ERGÜDEN C,AKISÜ Ç Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması. . 2014; 214 - 219.
IEEE	Ozkoc S,BAYRAM DELİBAŞ S,ERBAYCU A,ERGÜDEN C,AKISÜ Ç "Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması." , ss.214 - 219, 2014.
ISNAD	Ozkoc, Soykan vd. "Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması". (2014), 214-219.

APA	Ozkoc S, BAYRAM DELİBAŞ S, ERBAYCU A, ERGÜDEN C, AKISÜ Ç (2014). Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması. Türkiye Parazitoloji Dergisi, 38(4), 214 - 219.
Chicago	Ozkoc Soykan,BAYRAM DELİBAŞ SONGÜL,ERBAYCU Ahmet Emin,ERGÜDEN Ceren,AKISÜ Çiler Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması. Türkiye Parazitoloji Dergisi 38, no.4 (2014): 214 - 219.
MLA	Ozkoc Soykan,BAYRAM DELİBAŞ SONGÜL,ERBAYCU Ahmet Emin,ERGÜDEN Ceren,AKISÜ Çiler Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması. Türkiye Parazitoloji Dergisi, vol.38, no.4, 2014, ss.214 - 219.
AMA	Ozkoc S,BAYRAM DELİBAŞ S,ERBAYCU A,ERGÜDEN C,AKISÜ Ç Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması. Türkiye Parazitoloji Dergisi. 2014; 38(4): 214 - 219.
Vancouver	Ozkoc S,BAYRAM DELİBAŞ S,ERBAYCU A,ERGÜDEN C,AKISÜ Ç Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması. Türkiye Parazitoloji Dergisi. 2014; 38(4): 214 - 219.
IEEE	Ozkoc S,BAYRAM DELİBAŞ S,ERBAYCU A,ERGÜDEN C,AKISÜ Ç "Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması." Türkiye Parazitoloji Dergisi, 38, ss.214 - 219, 2014.
ISNAD	Ozkoc, Soykan vd. "Akciğer Hastalığı Olan Hastalarda Pneumocystis jirovecii Kolonizasyonunun Araştırılması". Türkiye Parazitoloji Dergisi 38/4 (2014), 214-219.