TY  - JOUR
TI  - SODYUM KANALINDA İYON TRANSFERİNİN ENERJİSİ
AB  - Voltaj-kapılı bakteriyel Nav kanalının kristal yapısı Arcobacter butzleri'den alınmıştır [1]. Voltajkapılı sodyum kanalları aksiyon potansiyellerinin başlaması için çok önemlidir. Moleküler dinamik modelleme bu kanalın yapı-fonksiyon ilişkisini anlamak için kullanılmıştır (Şekil 1'de gösterildi). Serbest enerji metodları kullanarak iyon bağlanmasının enerjisi çalışılmış, Na+ iyonu için filtre içinde bağlanma pozisyonları ve bağlanma enerjileri elde edilmiştir. Deneysel verilerden Nav kanalının Cav kanalına benzer olduğu bilinmekte ve Nav kanalında Ca++ iyonu geçtiği gözlenmektedir. Ca++ iyonunun Nav kanalında geçmesini anlamak için kanal filtresi boyunca Ca ++ iyonu için Ortalama Kuvvet Potansiyel hesabı (PMF) yapılmıştır. Bu çalışma sonucunda Ca++ iyonunun Na+ iyonu ile karşılaştırıldığında daha yüksek bir bağlanma afinitesine sahip olduğu gözlenmiştir. Bunlardan yola çıkarak kanal fitresinde bir Ca++ iyonu varken Na+ iyonunun Ortalama Kuvvet Potaniyeli çalışılıldı. Eğer tek bir kalsiyum iyonu kanalının seçici filtresinin belirli bir konumuna bağlanırsa, kalsiyumun bulunduğu bölgedeki enerji bariyerini yükselterek sodyum kanalı boyunca sodyum geçişini blokladığı sonucuna varıldı.
AU  - BAŞTUĞ, Turgut
AU  - KUYUCAK, Serdar
AU  - Çavuş, Murat
PY  - 2015
JO  - Journal of the Turkish Chemical Society, Section A: Chemistry
VL  - 2
IS  - 2
SN  - 2149-0120
SP  - 99
EP  - 101
DB  - TRDizin
UR  - http://search/yayin/detay/229723
ER  -