Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu

ÖZKAN, Bora; Karaca, Serkan; MUTLU, Fatih; ERDOĞAN, Emrah; ŞAHİN, İzzet

Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu

Emrah ERDOĞAN, (Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Parazitoloji Anabilim Dalı, Kayseri.)

Bora ÖZKAN, (Mustafa Kemal Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Parazitoloji Anabilim Dalı, Hatay.)

Fatih MUTLU, (Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi, Genel Cerrahi Anabilim Dalı, Aydın.)

Serkan KARACA, (Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Parazitoloji Anabilim Dalı, Kayseri.)

İzzet ŞAHİN (Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Parazitoloji Anabilim Dalı, Kayseri.)

Mikrobiyoloji Bülteni

56 0

Yıl: 2017 Cilt: 51 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 79 - 86 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu

Öz:

Echinococcus granulosus dünya genelinde görülebilen bir parazittir. Bugüne kadar Echinococcus cinsinin insanda parazitlendiği belirlenen beş türü tanımlanmıştır: E.granulosus, E.multilocularis, E.vogeli ve E.oligarthrus, E.shiquicus. Parazitin larval (metasestod) formu; tırnaklı hayvanlar (sığır, keçi, domuz, at, koyun vs.) ve insanın iç organlarında yerleşirken; erişkin formu son konak köpekgillerin ince bağırsağında bulunur. Parazitin neden olduğu "kistik ekinokokkozis (KE)" yurdumuzun da içinde bulunduğu hayvancılığın yaygın olduğu birçok ülkede önemli sağlık sorunları oluşturmakta ve ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Ara konaklar enfektif yumurtaları oral yolla ve nadiren de olsa solunum yoluyla alarak enfeksiyona yakalanırlar. Alınan yumurtalar ara konakların mide ve ince bağırsaklarında açılarak onkosferin serbest kalmasına neden olur. Onkosfer çengelleri ve histolitik enzimleri ile süratle villus epitelinde lamina propriyaya ulaşmaktadır. Buradan venüllere geçerek genellikle karaciğer ve akciğerlere, daha az sıklıkla da kas, beyin, dalak, böbrek ve diğer organlara taşınır. Yapılan moleküler çalışmalarda taksonomik olarak doğrulanan beş türün yanında; E.granulosus türünün varyasyonları veya suşları denilen 10 farklı suş tanımlanmıştır. Suşlar arasındaki ara konak farklılıkları ve gelişimsel farklılıklar parazitle mücadeleyi ve kontrol çalışmalarını olumsuz yönde etkileyebilmektedir. Bu çalışmada, Türkiye'de farklı bölgelerden ve farklı ara konaklardan elde edilen hidatik kist materyallerinden moleküler yöntemlerle E.granulosus suş tayini yapılması amaçlanmıştır. Çalışmada, 25 insan, 8 sığır, 6 koyun ve 2 keçiden elde edilen kist materyali incelemeye alınmıştır. Hidatik kist sıvısındaki protoskolekslerden total genomik DNA izolasyonu yapılmış olup COX-1(L) ve COX-1(S) primerleri ile polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) analizi yapılmıştır. PCR ürünlerinin her birine DNA dizi analizi yaptırılmıştır. DNA dizi analiz sonuçları, BLAST analizi ve MEGA program ile filogenetik analiz yapılarak değerlendirilmiştir. DNA dizi analizi sonucunda bu çalışmaya dahil edilen tüm izolatların E.granulosus sensu stricto (G1) olduğu belirlenmiştir. Elde ettiğimiz verilerin; KE'nin ülkemiz için önemli bir halk sağlığı sorunu olması sebebiyle; parazitin kontrolü, etkin teşhis ve tedavi teknikleri, eradikasyon, aşı ve ilaç geliştirme çalışmalarına önemli kaynak teşkil edeceği kanısındayız. Ülke genelinde etkin ve başarılı kontrol programlarının yapılabilmesi için benzer çalışmaların tüm bölgeleri kapsayacak şekilde planlanması yararlı olacaktır.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji

Molecular Characterization of Echinococcus granulosus Isolates Obtained From Different Hosts

Öz:

Echinococcus granulosus is a parasite that can be seen throughout the world. So far, five species of genus Echinococcus have been identified as parasite in people: E.granulosus, E.multilocularis, E.vogeli, E.oligarthrus, E.shiquicus. Larval (metacestod) form of parasite settles in internal organs of hoofed animals (cattle, goats, pigs, horses, sheep, etc.) and human; the adult form is found in small intestine of final host, canine. Disease caused by parasite called as "Cystic echinococcosis" (CE) is an important health problem and causes economic losses in many countries including our country that livestock is common. Infective eggs cause infections in intermediate hosts by taking oral way and rarely inhalation. Received egg opens in the stomach and intestines of intermediate host and oncosphere is released. Oncosphere quickly reaches the lamina propria of the villus epithelium by its histolytic enzymes and hooks. It usually transported from here to the liver and lungs, less frequently, muscle, brain, spleen, kidney and to other organs through the veins. By molecular studies, five species have been validated taxonomically and 10 different variants or strains of E.granulosus have been identified. Host and developmental differences between strains may negatively affect control studies and fight against the parasite. This study aimed to determinate E.granulosus strains obtained from cyst material of different intermediate hosts from different regions of Turkey by molecular methods. In the study, 25 human, 8 cattle, 6 sheep and 2 goat cysts material has been collected. Total genomic DNA was isolated from protoscoleces in cyst fluid and analyzed by PCR with COX-1 (L) and COX-1 (S) genes specific primers. DNA sequence analysis for each PCR product has been made. DNA sequence analysis results evaluated phylogenetically by MEGA analyze and BLAST software. As a result of this study, all isolates were identified as E.granulosus sensu stricto (G1) by DNA sequence analysis. CE is a major public health problem for our country so we believe that obtained data from this study is an important source for parasite control, effective diagnosis, treatment techniques, eradication, vaccination and drug development. Similar studies will be beneficial to cover all other regions of Turkey and to develop effective and successful control programs.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik

1. Kilimcioglu AA. Kistik echinococcosis, pp: 541-66. In: Özcel MA (Ed), Özcel'in Tıbbi Parazit Hastalıkları'nda. 2007, Türkiye Parazitoloji Derneği, İzmir.
2. Soulsby EJL. Helminths, arthropods and of domesticated animals, pp: 92-136. Bailliere Tindall. 1986, 7th ed., London.
3. Eckert J, Deplazes P. Biological, epidemiological, and clinical aspects of Echinococcosis, a zoonosis of increasing concern. Clin Microbiol Rev 2004;17:107-35.
4. Xiao N, Qiu J, Nakao M, et al. Echinococcus shiquicus sp., A taeniid cestode from Tibetan fox and plateaupika in China. Int J for Parasitol 2005; 35: 693-731.
5. Junying M, Hu W, Gonghua L, Fang Z, Chao L, Tongzuo Z, et al. Surveillance of Echinococcus isolates from Qinghai. China Vet Parasitol 2015; 207: 44-8.
6. Torgerson PR, Budke CM. Echinococcosis- an international public health challenge. Res Vet Sci 2003;74:191- 202.
7. Plorde JJ. Cestodes, pp: 791-802. In: Ryan KJ, Ray CG (eds), Sherris medical microbiology an introduction to infectious diseases. 2004, 4th ed. McGraw Hill Co, New York.
8. Bostan H, Yücel AF, Şahin DA. Ameliyat sırasında oluşan şokun nadir bir sebebi: Karaciğer hidatik kist rüptürüne bağlı anaflaksi. Olgu sunumu. J Surg Arts 2010; 1: 1-4.
9. King CH. Cestodes (Tapeworms). pp: 3285-93. In: Mandell GL, Bennet JE, Dolin R (eds). Mandell, Douglas, and Bennett's principles and practice of infectious diseases. 2005, 6th ed. Elsevier Churchill Livingstone, Philadelphia.
10. Nakao M, Lavikainen A, Yanagida T, Ito A. Phylogenetic systematics of the genus Echinococcus (Cestoda: Taeniidae). Int J Parasitol 2013; 43:1017-29.
11. McManus DP, Zhang W, Li J, Bartley PB. Echinococosis. The Lancet 2003; 362: 1295-304.
12. De La Rue ML, Dinkel A, Mackenstedt U, Romig T. New data on Echinococcus spp. in southern Brazil. Rev Inst Med Trop S Paulo 2006; 48:103-4.
13. Bowles J, Blair D, McManus DP. Genetic variants within the genus Echinococcus identified by mitochondrial DNA sequencing. Mol Biochem Parasitol 1992; 54: 165-73.
14. Capuano F, Rinaldi L, Maurelli MP, et al. Cystic echinococcosis in water buffaloes: Epidemiological survey and molecular evidence of ovine (G1) and buffalo (G3) strains. Vet Parasitol 2006; 137: 262-8.
15. Tashani OA, Zhang LH, Boufana B, Jegi A, McManus DP. Epidemiology and strain characteristics of Echinococcus granulosus in the Benghazi Area of Eastern Libya. Ann Trop Med Parasitol 2002; 96: 369-81.
16. Breyer I, Georgieva D, Kurdova R, Gottstein B. Echinococcus granulosus strain typing in Bulgaria: The G1 genotype is predominant in intermediate and definitive wild hosts. Parasitol Res 2004; 93: 127-30.
17. Bhattacharya D, Bera AK, Bera BC, Maity A, Das SK. Genotypic characterisation of Indian cattle, buffalo and sheep isolates of Echinococcus granulosus. Vet Parasitol 2007; 143: 371-4.
18. Bart JM, Abdulkader M, Zhang YL, et al. Genotyping of human cystic echinococcosis in Xinjiang, PR China. Parasitol 2006; 133: 571-579.
19. Vural G, Unsal Baca A, Gauci CG, Bagci O, Gicik Y, Lightowlers MW. Variability in the Echinococcus granulosus cytochrome c oxidase 1 mitochondrial gene sequence from livestock in Turkey and a re-appraisal of the G1-3 genotype cluster. Vet Parasitol 2008; 154: 347-50.
20. Snabel V, Altintas N, D'Amelio S, et al. Cystic echinococcosis in Turkey: genetic variability and first record of the pig strain (G7) in the country. Parasitol Res 2009; 105: 145-54.

APA	ERDOĞAN E, ÖZKAN B, MUTLU F, Karaca S, ŞAHİN İ (2017). Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu. , 79 - 86.
Chicago	ERDOĞAN Emrah,ÖZKAN Bora,MUTLU Fatih,Karaca Serkan,ŞAHİN İzzet Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu. (2017): 79 - 86.
MLA	ERDOĞAN Emrah,ÖZKAN Bora,MUTLU Fatih,Karaca Serkan,ŞAHİN İzzet Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu. , 2017, ss.79 - 86.
AMA	ERDOĞAN E,ÖZKAN B,MUTLU F,Karaca S,ŞAHİN İ Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu. . 2017; 79 - 86.
Vancouver	ERDOĞAN E,ÖZKAN B,MUTLU F,Karaca S,ŞAHİN İ Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu. . 2017; 79 - 86.
IEEE	ERDOĞAN E,ÖZKAN B,MUTLU F,Karaca S,ŞAHİN İ "Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu." , ss.79 - 86, 2017.
ISNAD	ERDOĞAN, Emrah vd. "Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu". (2017), 79-86.

APA	ERDOĞAN E, ÖZKAN B, MUTLU F, Karaca S, ŞAHİN İ (2017). Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu. Mikrobiyoloji Bülteni, 51(1), 79 - 86.
Chicago	ERDOĞAN Emrah,ÖZKAN Bora,MUTLU Fatih,Karaca Serkan,ŞAHİN İzzet Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu. Mikrobiyoloji Bülteni 51, no.1 (2017): 79 - 86.
MLA	ERDOĞAN Emrah,ÖZKAN Bora,MUTLU Fatih,Karaca Serkan,ŞAHİN İzzet Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.51, no.1, 2017, ss.79 - 86.
AMA	ERDOĞAN E,ÖZKAN B,MUTLU F,Karaca S,ŞAHİN İ Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu. Mikrobiyoloji Bülteni. 2017; 51(1): 79 - 86.
Vancouver	ERDOĞAN E,ÖZKAN B,MUTLU F,Karaca S,ŞAHİN İ Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu. Mikrobiyoloji Bülteni. 2017; 51(1): 79 - 86.
IEEE	ERDOĞAN E,ÖZKAN B,MUTLU F,Karaca S,ŞAHİN İ "Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu." Mikrobiyoloji Bülteni, 51, ss.79 - 86, 2017.
ISNAD	ERDOĞAN, Emrah vd. "Farklı Konaklardan Elde Edilen Echinococcus granulosus İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu". Mikrobiyoloji Bülteni 51/1 (2017), 79-86.