Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi

BİLGEN, Güldehan; KOŞUM, NEDİM; TASKIN, TURGAY; IŞIK, Raziye; KANDEMIR, ÇAGRI

Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi

Turgay TAŞKIN, (Ege University, Faculty of Agriculture, Department of Animal Science, İzmir)

Çağrı KANDEMİR, (Ege University, Faculty of Agriculture, Department of Animal Science, İzmir)

Nedim KOŞUM, (Ege University, Faculty of Agriculture, Department of Animal Science, İzmir)

Güldehan BİLGEN, (Ege University, Faculty of Agriculture, Department of Animal Science, İzmir)

Raziye IŞIK (Namık Kemal University, Faculty of Agriculture, Department of Agricultural Biotechnology, Tekirdağ)

Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi

1 0

Yıl: 2017 Cilt: 0 Sayı: Sayfa Aralığı: 35 - 40 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi

Öz:

Süt proteinlerinden biri olan ?-Laktoglobulin (?-LG), peynir yapımı gibi sütün teknolojik özellikleri üzerinde önemli bir fonksiyona sahiptir. Serum protein genleri ile süt verimi/bileşimi arasındaki ilişkiler daha önceki çalışmalarda araştırılmıştır. ?-LG, süt verimi ve protein kalitesini artırmak için seleksiyon ve ıslah programları için aday bir gen olarak kullanılabilmektedir. Bu çalışmanın amacı, ?-LG gen polimorfizmini ve ?-LG genotipleri ile süt verimi arasındaki ilişkiyi araştırmaktır. Bu çalışmada, PCR-RFLP yöntemi ile polimorfizm belirlenmesi amacıyla Avustralya kökenli toplam 74 safkan Saanen keçi kullanılmıştır. SacII restriksiyon enzimi ile ?-LG geni 427 baz çiftlik yedinci ekzonu (GenBank: Z33881.1) genotiplenmiştir. ?-LG/SacII lokusunda iki alel (S1, S2) ve üç genotip (S1S1, S1S2, S2S2) belirlenmiştir. ?- LG/S1S1, genotipi tek kesim bölgesine sahip olduğundan iki bant vermektedir (347 bç ve 80 bç). ?-LG/S1S2 heterozigot genotipi üç bant oluşturmaktadır (427 bp, 347 bp ve 80 bp). ?-LG/S2S2 genotipig.4601G> A pozisyonunda tek nükleotid değişiminden dolayı 427 bç uzunluğunda kesilmemiş ürün vermektedir. SS2 genotip frekansı (% 43.3) diğer genotiplerden daha yüksektir. S1 allel frekansı predominant olarak belirlenmiştir. Saanen ırkında Hardy-Weinberg dengesinde sapma gözlenmemiştir. ?-LG/ SacII lokusunda, genotipler ile laktasyon süt verimi arasında önemli bir ilişki bulunmamıştır. Ancak ?-LG/ S1S1 genotipinin daha yüksek laktasyon süt verimine sahip olduğu belirlenmiştir. ?-LG geninin süt verimi ve kompozisyonu gibi ekonomik özellikler için moleküler marker olarak kullanılabileceği sonucuna varılmaktadır

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji

Polymorphism in Exon 7 of ?- Lactoglobulin (?-LG) Gene and Its Association with Milk Yield in Saanen Goats

Öz:

B-Lactoglobulin (?-LG) is one of milk protein and has important function on technological properties of milk such as cheese making. The relations between whey protein genes and milk yield/ composition have been investigated in previous researches. ?-LG can be utilized as a candidate gene for selection and breeding programs to increase milk yield and protein quality. The aim of this study is to investigate the ?-LG gene polymorphism and relation between ?- LG genotypes and milk yield. In this study, a total of 74 purebred Saanen goats originated from Australia were used to detect polymorphism with PCR-RFLP method. SacII digestion in 427 bp of ?-LG exon 7 (GenBank: Z33881.1) was revealed. Two alleles (S1, S2) and 3 genotypes (S1S1, S1S2, S2S2) were determined in ?-LG/ SacII locus. The ?-LG/S1S1 genotype with only one restriction site revealed two bands (347 bp and 80 bp). The ?-LG/S1S2 heterozygote genotype generated three bands (427 bp, 347 bp and 80 bp). An undigested product, 427 bp was ?-LG/S2S2 genotype which was due to a single nucleotide substitution at position g.4601G>A. S1S2 with genotype frequency (43.3%) higher than the other genotypes. S1 allele frequency was determined predominantly. Deviation from Hardy-Weinberg equilibrium was not identified in the Saanen breed. In ?-LG/ SacII locus, a significant relationship was not found between genotypes and lactation milk yield. However, ?-LG/ S1S1 genotype was observed to have higher lactation milk yield. It is concluded that ?-LG gene could be used as a molecular marker for economic traits such as milk yield and composition.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

Ağaoğlu, Ö.K., B.Ç. Kul, B. Akyüz, Ö. Elmaz, M. Ö. Metin, M. Saatçı and O. Ertuğrul, 2012. Identification of ?- Lactoglobulin gene SacII polymorfphism in Honamlı, Hair and Saanen goat breeds reared in Burdur vicinity. Kafkas Univ Vet Fak Derg. 18 (3) 385-388
Aschaffenburg, R. and J. Drewry, 1955. Occurrence of different ?-lactoglobulins in cow's milk, Nature, 176 218-219
Chen, H., X.Y. Lan, R.B. Li, C.Z. Lei, W.B. Sun, R.F. Zhang, Y.L. Zheng and B.C. Zhu, 2005. The effect of CSN1 S2, CSN3 and beta-lg genes on milk performance in Xinong Saanen dairy goat. Yi Chuan Xue Bao. 32 (8), 804-810
Eigel, WN., J.E. Butler, C.A. Ernstrom, H.M. Farrell, V.R. Harwalkar, R. Jenness and R.M. Whitney, 1984. Nomenclature of proteins of cows milk: 5 th revision. J. Dairy Sci. 67:1599-1631
El-Hanafy, A.A., M.A. El-Saadani, M. Eissa, G. Maharem and M.Z.A. Khalifa, 2010. Polymorphısm of ?-lactoglobulın gene in Barki and Damascus and their cross bred goats in relation to milk yield. Biotechnol in Anim. Husbandry. 26 (1-2), 1-12
El-Hanafy, A.A.M., M.I. Qureshi, J. Sabir, M. Mutawakil, M.M.M. Ahmed, H. El Ashmaoui, H.A.M.I. Ramadan, M. Abou-Alsoud and M.A. Sadek, 2015. Nucleotide sequencing and DNA polymorphism studies of beta-lactoglobulin gene in native Saudi goat breeds in relation to milk yield. Czech J. Anim. Sci. 60, (3): 132-138
El-Shazly, S.A., M.E. Mahfouz, S.A. Otaibi and M.M. Ahmed, 2012. Genetic Polymorphism in Betalactoglobulin Gene of Some Sheep Breeds in KSA and its Influence on Milk Composition. African J. of Biotech. 11 (19):4330-4337
Elmaci, C., Y. Öner and M. Koyuncu, 2008. Determination of ?-lactoglobulin Genotype Using by PCR - RFLP in Saanen Goats. Hayvansal Üretim. 49(1): 1-4
Elmacı, C., Y. Öner and M. Koyuncu, 2009. Allelic frequencies of a SacII RFLP at exon 7 of the goat b-lactoglobulin gene in Turkish breeds. Asian Journal of Animal and Veterinary Advances. 4(3):130-133
Erhardt, G. 1989. Evidence for a third allele at the ?- lactoglobulin (?-LG) locus of sheep milk and its occurrence in different breeds. Anim Genet. 20:197-207
FAO, 2016. Food and Agriculture Organization of the United Nations. http://www.fao.org/economic/ess/en/ (Erişim tarihi: 10. 06. 2016)
Folch, J.M., A. Coll and A. Sa´nchez, 1993. Rapid communication: Cloning and sequencing of the cDNA encoding goat ?-lactoglobulin. J Anim Sci. 71:2832.
Folch, J.M., A. Coll and A. Sanchez, 1994. Complete sequence of the caprine ?-lactoglobulin gene. J. Dairy Sci. 77, 3493-3497
Gaye, P., D. Hue-Delhaie, J.C. Mercier, S. Soulier, J.L. Vilotte and J.P. Furet, 1986. Ovine ?- lactoglobulin messenger RNA: nucleotide sequence and mRNA levels during functional differentiation of the mammary gland. Biochimie. 68: 1097-1107
Gharedaghi L., H. Moradi Shahrbabak and M. Sadeghi, 2016. Identification of novel SNP in caprine ?-lactoglobulin gene. J. Genet. 95, 485-490
Godovac-Zimmerman, J., I. Krause, M. Barany, S. Fisher-Fruhloz, J. Juszczak, G. Erhardt, J. Buchberger and H. Klostermeyer, 1996. Isolation and rapid sequence characterization of two novel ?-lactoglobulins. J. Protein. Chem. 5: 743-750
Graziano, M., M. D'Andrea, A.R. Lagonigro and F. Pilla, 2003. Short communication: A new polymorphism in goat ?-lactoglobulin promoter region. Ital. J. Anim. Sci. 2: 67-70
Gür, F., M. Güzel, N. Öncül, Z. Yıldırım and M. Yıldırım, 2010. Süt serum proteinleri ve türevlerinin biyolojik ve fizyolojik aktiviteleri. Akademik Gıda. 8 (1) 23-31
Hambling, S., A. McAlpine and L. Sawyer, 1992. Beta-lactoglobulin, In: Advanced Dairy Chemistry, Ed. Fox PF, London, Elsevier, Appl. Sci., 141-190 p.
Hayes, H.C. and E.J. Petit, 1993. Mapping of the blactoglobulin gene and of immunoglobulin heavy chain-like sequence to homologous cattle, sheep and goat chromosomes. Mamm. Gen. 4, 207-210
Jain, A., D.S. Gour, P.S. Bisen, P.P. Dubey, D.K. Sharma, R.P. Tiwari, N. Gupta and D. Kumar, 2012. Allele mining in ?- lactoglobulin gene of capra hircus. Afr J. Biotechnol. 11(50), 11057- 11064
Kahilo, K., S. EL-Shazly, A. El-Khadrawy and I. Fattouh, 2014. Genetic Polymorphism in ?- lactoglobulin gene of some goat breeds in Egypt and its influence on milk yield. Life Sci J. 11(10):232-238
Kumar, A., P.K. Rout and R. Roy, 2006. Polymorphism of ? -lacto globulin gene in Indian goats and its effect on milk yield. J Appl Genet. 47(1), 49-53
Lekerpes, S.S., J.O. Jung'a, M.S. Badamanaa and D.I. Rubenstein, 2014. Genetic polymorphism of beta-lactoglobulin in kenyan small east African goat breed using PCR-RFLP and sequencing. Scientific Journal of Animal Science. 3(9) 233-239
Özdil, F. and S. Asal, 2002. The polymorphism of ?- Lactoglobulin. Proceedings of the 3rd Annual Meeting on Animal Science. September, 14-16
Pena, R.N., A. Sa´nchez and J.M. Folch, 2000. Characterization of genetic polymorphism in the goat ?-lactoglobulin gene. J. Dairy Res. 67: 217-24
Perez, M.D. and M. Calvo, 1995. Interaction of ?- lactoglobulin with retinol and fatty acids and its role as a possible biological function for this protein: A review. J. Dairy Sci. 78: 978
Rout, P.K., A. Kumar, A. Mandal, D. Laloe, S.K. Singh and R. Roy, 2010. Characterization of casein gene complex and genetic diversity analysis in Indian goats. Anim Biotechnol. 21: 122-134
Sánchez, A., H. İlahi, E. Manfredi and J.M. Serradilla, 2005. Potential benefit from using the ?s1-casein genotype information in a selection scheme for dairy goats. J. Anim. Breed. Genet. 122: 21-29
Schaar, J. 1985. Effects of genetic variants of kcasein and ?- lactoglobulin on cheesemaking. J Dairy Res. 52: 429-437
Selvaggi, M., V. Laudadio, C. Dario and V. Tufarelli, 2015. ?-Lactoglobulin gene polymorphisms in sheep and effects on milk production traits: A Review. Adv. Anim. Vet. Sci. 3(9): 478-484.
Wagner V.A., T.A. Schild and H. Geldermann, 1994. DNA variants within the 5'-flanking region of milk-protein-encoding genes II. The ?- lactoglobulin-encoding gene. Theor Appl Genet 89: 121-126.
Yeh, F., R.C. Yang and T. Boyle, 2000. Popgene (v.1.32), Microsoft Windows-based freeware for Population Genetic Analysis. http://www.ualberta.ca/~fyeh/ Pop32.exe.
Yüksel, M. and B. Akyüz, 2014. Detection of ?etalactoglobulin gene polymorphism with PCRRFLP method in hair goat breed raising at Kayseri and Province. Journal of Health Sciences. 23 (2) 62-66.

APA	TASKIN T, KANDEMIR Ç, KOŞUM N, BİLGEN G, IŞIK R (2017). Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi. , 35 - 40.
Chicago	TASKIN TURGAY,KANDEMIR ÇAGRI,KOŞUM NEDİM,BİLGEN Güldehan,IŞIK Raziye Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi. (2017): 35 - 40.
MLA	TASKIN TURGAY,KANDEMIR ÇAGRI,KOŞUM NEDİM,BİLGEN Güldehan,IŞIK Raziye Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi. , 2017, ss.35 - 40.
AMA	TASKIN T,KANDEMIR Ç,KOŞUM N,BİLGEN G,IŞIK R Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi. . 2017; 35 - 40.
Vancouver	TASKIN T,KANDEMIR Ç,KOŞUM N,BİLGEN G,IŞIK R Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi. . 2017; 35 - 40.
IEEE	TASKIN T,KANDEMIR Ç,KOŞUM N,BİLGEN G,IŞIK R "Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi." , ss.35 - 40, 2017.
ISNAD	TASKIN, TURGAY vd. "Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi". (2017), 35-40.

APA	TASKIN T, KANDEMIR Ç, KOŞUM N, BİLGEN G, IŞIK R (2017). Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi. Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi, 0(), 35 - 40.
Chicago	TASKIN TURGAY,KANDEMIR ÇAGRI,KOŞUM NEDİM,BİLGEN Güldehan,IŞIK Raziye Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi. Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi 0, no. (2017): 35 - 40.
MLA	TASKIN TURGAY,KANDEMIR ÇAGRI,KOŞUM NEDİM,BİLGEN Güldehan,IŞIK Raziye Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi. Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi, vol.0, no., 2017, ss.35 - 40.
AMA	TASKIN T,KANDEMIR Ç,KOŞUM N,BİLGEN G,IŞIK R Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi. Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi. 2017; 0(): 35 - 40.
Vancouver	TASKIN T,KANDEMIR Ç,KOŞUM N,BİLGEN G,IŞIK R Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi. Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi. 2017; 0(): 35 - 40.
IEEE	TASKIN T,KANDEMIR Ç,KOŞUM N,BİLGEN G,IŞIK R "Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi." Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi, 0, ss.35 - 40, 2017.
ISNAD	TASKIN, TURGAY vd. "Saanen Keçilerinde ?- Laktoglobulin (?-LG) Geni Ekzon 7 Polimorfizmi ve Süt Verimi ile İlişkisi". Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi (2017), 35-40.