Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması
Yıl: 2019 Cilt: 16 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 68 - 72 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.32707/ercivet.537995 İndeks Tarihi: 23-07-2019
Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması
Öz: Brusellozis, Latin Amerika, Orta doğu, Afrika ve Asya’da endemik seyreden zoonotik bir enfeksiyondur. Günümüze kadar 11 Brusella türü tanımlanmıştır. Brusella türleri içerisinde insanlarda en şiddetli enfeksiyona neden olan B. melitensis türü olup bunu B. suis ve B. abortus izlemektedir. Brusella türleri farklı sayılarda biyovarlardan oluşmakta ve immun serumlar ile aglütinasyon, bazı boyalar ve fajlara duyarlık özelliklerine göre de ayırımları yapılmaktadır. Enfeksiyon kaynağının tespiti, enfeksiyon ve/veya aşı suşlarının karakterizasyonu ve yeni türlerin ortaya konulması önceleri biyovarlara göre yapılır iken, son yıllarda Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP) ve Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) gibi PZR tabanlı yöntemler ile Multilokus variable number tandem repeat analysis (MLVA), Multilokus Sekans Tiplendirme (MLST) gibi moleküler test ve yöntemler ile yapılmaktadır. Bu derleme ile bu yöntemler ve bu alanda yapılan çalışmalar ile ilgili güncel bilgiler sunulmaktadır.
Anahtar Kelime: Konular:
Molecular Methods and Applications in Brucellosis Diagnosis and Epidemiological Studies Molecular Methods in Brucellosis
Öz: : Brucellosis is an endemic zoonotic infection in Latin America, the Middle East, Africa and Asia. Up to 11 Brucella species are described. Among the Brucella species, B. melitensis is the most severe infectious species in humans, followed by B. suis and B. abortus. These Brucella species are differentiated into biovar and characterized by immunological sera and agglutination, some dyes and phage susceptibility properties. However, some biovars can not be distinguished by these methods and additional molecular tests such as Multilocus variable number tandem repeat analysis (MLVA), Multilocus Sequence Typing (MLST) and PCR based methods such as Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP), Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) are needed for the detection of infection source. This compilation provides current information on these methods and the work done in this area.
Anahtar Kelime: Konular:
Belge Türü: Makale Makale Türü: Derleme Erişim Türü: Erişime Açık
- Amin AS, Hamdy ME, Ibrahim AK. Detection of Brucella melitensis in semen using the polymera-se chain reaction assay. Vet Microbiol 2001; 83 (1): 37-44.
- Bricker BJ, Halling SM. Differentiation of Brucella abortus bv. 1, 2, and 4, Brucella melitensis, Bru-cella ovis and Brucella suis bv. 1 by PCR. J Clin Microbiol 1994; 32(11): 2660-6.
- Bricker BJ, Halling SM. Enhancement of the Bru-cella AMOS PCR assay for differentiation of Bru-cella abortus vaccine strains S19 and RB51. J Clin Microbiol 1995; 33(6): 1640-2.
- Bricker BJ, Ewalt DR, Olsen SC, Jensen AE. Eva-luation of the Brucella abortus species-specific polymerase chain reaction assay, an improved version of the Brucella AMOS polymerase chain reaction assay for cattle. J Vet Diagn Invest 2003; 15(4): 374-8.
- Corbell MJ. Brucellosis: An overview. EmergInfect Disease 1997; 3(2): 213-21.
- De Massis F, Ancora M, Atzeni M, Rolesu M, Bandino E, Danzetta ML, Zilli K, Di Ginnatale E, Scacchia M. MLVA as an epidemiological tool to trace back Brucella melitensis biovar 1 re-emergence in Italy. Transbound Emerg Dis, 2015; 62(5): 463-9.
- DelVecchio VG, Kapatral V, Redkar RJ, Patra G, Mujer C, Los T, Ivanova N, Anderson I,Bhattacharyya A, Lykidis A, Reznik G, Jablonski L, Larsen N, D'Souza M, Bernal A, Mazur M, Goltsman E, Selkov E, Elzer PH, Hagius S, O'Cal-laghan D, Letesson JJ, Haselkorn R, Kyrpides N,Overbeek R. The genome sequence of the fa-cultative intracellular pathogen Brucella meliten-sis. Proc Natl Acad Sci USA 2002; 99(1): 443-8.
- Dorneles EM, de Faria AP, Pauletti RB, Santana JA, Caldeira GA, Heinemann MB, Titze-de Almei-da R, Lage AP. Genetic stability of Brucella abor-tus S19 and RB51 vaccine strains by multiple locus variable number tandem repeat analysis (MLVA16). Vaccine 2013; 31(42): 4856-9.
- Fekete A, Bantle JA, Halling SM, Sanborn MR. Preliminary development of a diagnostic test for Brucella using polymerase chain reaction. J Appl Bacteriol 1990; 69(2): 216-27.
- Garcia-Yoldi D, Marín CM, de Miguel MJ, Munoz PM, Vizmanos JL, Lopez-Goni I. Multiplex PCR assay for the identification and differentiation of all Brucella species and the vaccine strains Brucella abortus S19 and RB51 and Brucella melitensis Rev1. Clin Chem 2006; 52(4): 779-81.
- Garcia-Yoldi D, Le Fleche P, Miguel MJ, Munoz PM, Blasco JM, Cvetnic Z, Marin CM, Vergnaud G, Lopez-Goni I. Compariscon of multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis withother PCR-based methods for typing Brucella suis Iso-lates. J Clin Microbiol 2007; 45(12): 4070-72.
- Genç O, Kamber U. Biotyping of Brucella strains isolated from abortions of cows in Kars province. Indian Vet J 2004; 81: 1164-5.
- Genç O, Büyüktanır Ö, Doğancı L, Yurdusev N. Brusella tanısında “in-house” enzimatik immuno-assay modeller ve multipleks PCR ile tür ayırımı: Ön sonuçlar. Klimik XIII. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Kongresi, 2007, Antal-ya.
- Güler L, Gündüz K, Ok U. Comparison of polyme-rase chain reaction and bacteriological culture for the diagnosis of sheep brucellosis using aborted fetus samples. Vet Microbiol 2003; 93: 53–61.
- Her M, Kang SI, Cho DH, Cho YS, Hwang IY, Heo YR, Jung SC, Yoo HS. Application and evaluation of the MLVA typing assay for the Brucella abortus strains isolated in Korea. BMC Microbiol 2009; 9: 230.
- Kılıç S, Ivanov IN, Durmaz R, Bayraktar MR, Ayaslıoglu E, Uyanık MH, Alıskan H, Yasar E, Bayramoglu G, Arslantürk A, Vergnaud G, Kan-tardjiev TV. Multiple-locus variable-number tan-dem-repeat analysis genotyping of human Brucel-la isolates from Turkey. J Clin Microbiol 2011; 49 (9): 3276-83.
- Kumkrong K, Chankate P, Tonyoung W, Intarapuk A, Kerdsin A, Kalambaheti T. Multiple-locus vari-able number tandem repeat analysis of Brucella isolates from Thailand. Southeast Asian J Trop Med Public Health. 2017; 48(1): 124-42.
- Le Fleche I, Grayon JM, Al Dahouk S, Bouchon P, Denoeud F, Nöckler F, Neubauer H, Guilloteau L, Vergnaud G. Evaluation and selection of tandem repeat loci for a Brucella MLVA typing assay. BMC Microbiol 2006; 6(9): 1-14.
- Lopez-Goni I, Garcia-Yoldi D, Marin CM, de Mi-guel MJ, Muñoz PM, Blasco JM, Jacques I, Gra-yon M, Cloeckaert A, Ferreira AC, Cardoso R, Correa de Sa MI, Walravens K, Albert D, Garin-Bastuji B. Evaluation of a multiplex PCR assay (Bruce-ladder) for molecular typing of all Brucella species, including the vaccine strains. J Clin Mic-robiol 2008; 46(10): 3484-7.
- Miranda KL, Poester FP, Minharro S, Dorneles EM, Stynen AP, Lage AP. Evaluation of Brucella abortus S19 vaccines commercialized in Brazil: immunogenicity, residual virulence and MLVA15 genotyping. Vaccine 2013; 31(29): 3014-8.
- MLVA-NET for Brucella. http://mlva.u-psud.fr. Erişim tarihi: 19.12.2017
- Notomi T, Okayama H, Masubuchi H, Yonekawa T, Watanabe K, Amino N, Hase T. Loop mediated isothermal amplification of DNA. Nucleic Acids Res 2000; 28(12): E63.
- Ohtsuki R, Kawamoto K, Kato Y, Shah MM, Ezaki T, Makino SI. Rapid detection of Brucella spp. by the loop-mediatedisothermal amplification met-hod. J App Microbiol 2008; 104: 1815-1823.
- OIE2009. Bovine brucellosis.http://web.oie.int/ eng/normes/MMANUAL/2008/ pdf/2.04.03_BOVINE RUCELL. pdf Erişim tari-hi: 10.01.2017.
- O'Leary JG, Goodarzi M, Drayton DL, von And-rian UH. T cell- and B cell-independent adaptive immunity mediated by natural killer cells. Nat Im-munol 2006; 7(5): 507-16.
- Pan W, Wang JY, Shen HY, Zhao MQ, Ju CM, Dong XY, Yi L, Chen JD. Development and appli-cation of the novel visual loop-mediated isother-mal amplification of Omp25 sequence for rapid detection of Brucella sp. J Anim Vet Advances 2011; 10(16): 2120-6.
- Piao D, Liu X, Di D, Xiao P, Zhao Z, Xu L, Tian G, Zhao H, Fan W, Cui B, Jiang H. Genetic poly-morphisms identify in species/biovars of Brucella isolated in China between 1953 and 2013 by MLST. BMC Microbiology 2018; 18 (7): 1-6.
- Probert WS, Schrader KN, Khuong NY, Bystrom SL, Graves MH. Real-time multiplex PCR assay for detection of Brucella spp., B. abortus, and B. melitensis. J Clin Microbiol 2004; 42(3):1290-3.
- Ratushna VG, Sturgill DM, Ramamoorthy S, Reic-how SA, He Y, Lathigra R, Sriranganathan N, Halling SM, Boyle SM, Gibas CJ. Molecular tar-gets for rapid identification of Brucella spp. BMC Microbiol 2006; 6(13): 2180-6.
- Rijpens N, Jannes G, Asbroeck MV, Rossau R, Herman LMF. Direct detectian of Brucella spp. In raw milk by PCR and reverse hybridizaton with 16S-23S rRNA spacer probes. Appl Environ Mic-robiol 1996; 62(5): 1683-88.
- Rossen L, Norksov P, Holmstrom K, Rasmussen OF. Inhibition of PCR by components of food samples, microbial diagnostic assays and DNA-extraction solutions. Int J Food Microbiol 1992;17: 37-45.
- Scholz HC, Vergnaud G. Molecular characterisa-tion of Brucella species. Rev Sci Tech 2013; 32(1): 149-62.
- Sidamonidze K, Hang J, Yang Y, Dzavashvili G, Zhgenti E, Trapaidze N, Imnadze P, Nikolich MP. Genome sequences of human and livestock isola-tes of Brucella melitensis and Brucella abortus from the country of Georgia. Genome Anno-unc 2017; 5(6): 1-3.
- Sun M, Jing Z, Di D, Yan H, Zhang Z, Xu Q, Zhang X, Wang X, Ni B, Sun X, Yan C, Yang Z, Tian L, Li J, Fan W. Multiple locus variable num-ber tandem repeat and single nucleotid polymorp-hism based Brucella typing reveals multiple linea-ges in Brucella melitensis currently endemic in China. Front Vet Sci 2017;4: 1-10.
- Şahin M, Genç O, Ünver A, Otlu S. Investigation of bovine brucellosis in the northeastern Turkey. Trop Anim Health Prod 2008; 40(4): 281-6.
- Terzi G, Büyüktanır Ö, Genç O, Gücükoğlu A., Yurdusev N. Detection of Brucella antibody and DNA in cow milk by ELISA and PCR methods. Kafkas Univ Vet Fak Derg,16(Suppl-A). 2010; 47-52.
- Tomita N, Mori Y, Kanda H, Notomi T. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) of gene sequences and simple visual detection of pro-ducts. Nat Protoc 2008; 3(5): 877–82.
- Vergnaud G, Pourcel C. Multiple locus VNTR (Variable Number of Tandem Repeat) analysis Stackebrandt E ed. In: Molecular Identification, Systematics and Population Structure of Prokar-yotes. Berlin, Heidelberg: Springer,. 2006; pp: 83-104.
- Whatmore AM. Current understanding of the ge-netic diversity of Brucella, an expanding genus of zoonotic pathogens. Inf Gen Evol 2009; 9(6): 1168-84.
- Whatmore AM, Koylass MS, Muchowski J, Small-bone JE, Gopaul KK, Perrett LL. Extended multi-locus sequence analysis to describe the global population structure of the genus Brucella: Phylo-geography and relationship to biovars. Front Mic-robiol 2016; 7: 2049.
- Wilson IG. Inhibition and facilitation of nucleic acid amplification. Appl Environ Microbiol 1997; 63 (10): 3741-51.
- Yu WL, Nielsen K. Review of detection of Brucella spp. by polymerase chain reaction. Croat Med J 2010; 51(4): 306-13.
| APA | GENÇ O, Serdar G (2019). Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması. , 68 - 72. 10.32707/ercivet.537995 |
| Chicago | GENÇ Oktay,Serdar Gülnur Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması. (2019): 68 - 72. 10.32707/ercivet.537995 |
| MLA | GENÇ Oktay,Serdar Gülnur Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması. , 2019, ss.68 - 72. 10.32707/ercivet.537995 |
| AMA | GENÇ O,Serdar G Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması. . 2019; 68 - 72. 10.32707/ercivet.537995 |
| Vancouver | GENÇ O,Serdar G Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması. . 2019; 68 - 72. 10.32707/ercivet.537995 |
| IEEE | GENÇ O,Serdar G "Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması." , ss.68 - 72, 2019. 10.32707/ercivet.537995 |
| ISNAD | GENÇ, Oktay - Serdar, Gülnur. "Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması". (2019), 68-72. https://doi.org/10.32707/ercivet.537995 |
| APA | GENÇ O, Serdar G (2019). Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması. Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 16(1), 68 - 72. 10.32707/ercivet.537995 |
| Chicago | GENÇ Oktay,Serdar Gülnur Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması. Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 16, no.1 (2019): 68 - 72. 10.32707/ercivet.537995 |
| MLA | GENÇ Oktay,Serdar Gülnur Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması. Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, vol.16, no.1, 2019, ss.68 - 72. 10.32707/ercivet.537995 |
| AMA | GENÇ O,Serdar G Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması. Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi. 2019; 16(1): 68 - 72. 10.32707/ercivet.537995 |
| Vancouver | GENÇ O,Serdar G Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması. Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi. 2019; 16(1): 68 - 72. 10.32707/ercivet.537995 |
| IEEE | GENÇ O,Serdar G "Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması." Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 16, ss.68 - 72, 2019. 10.32707/ercivet.537995 |
| ISNAD | GENÇ, Oktay - Serdar, Gülnur. "Bruselloz Tanısı ve Epidemiyolojik Çalışmalarda Moleküler Yöntemlerin Kullanılması". Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 16/1 (2019), 68-72. https://doi.org/10.32707/ercivet.537995 |
