Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi
Yıl: 2018 Cilt: 66 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 234 - 238 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/tt.67376 İndeks Tarihi: 02-07-2019
Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi
Öz: Giriş: Tüberküloz genel olarak akciğerlerde görülmekle birlikte tüm organları etkileyebilmektedir. Ancak akciğer dışı tutulum olduğunda tanı koymak, akciğer tutulumundan daha zordur. Mycobacterium tuberculosis’in izole edilmesi, ekstrapulmoner tüberküloz (EPTB)tanısında altın standart olmasına karşın, özellikle EPTB’de bakteriyolojik izolasyon oranı düşüktür. Eğer M. tuberculosis elde edilebilirse, hastalığın epidemiyolojik özellikleri ve ilaç duyarlılığı hakkında bilgi vermektedir.Materyal ve Metod: Bu çalışmada, 2009-2016 yılları arasında mikobakteriyoloji laboratuvarında M. tuberculosis izole edilen ekstrapulmoner örnekler değerlendirilmiştir. İzole edilen bakterilerin genotiplerin belirlenme işlemi ve ilaç duyarlılık testleri yapılmıştır.Spoligotipleme, daha önce tarif edilen standart bir teknik kullanılarak gerçekleştirilmiştir.Bulgular: Çalışma süresince 165 hastaya ait 171 ekstrapulmoner örnekte M. tuberculosis (75 erkek, 90 kadın, ortalama yaş: 53.35 ±19.92) kültürde üretilmiştir. Birden fazla ekstrapulmoner organ tutulumu 6 hastada mevcuttur. En yaygın EPTB şekli 60 hastada lenfnodu, 32 hastada plevral tüberküloz ve 25 hastada kemik tüberkülozdur. Yedi hasta insan immün yetmezlik virüsüyle infekte olmaküzere 44 hastada immün yetmezlik saptanmıştır. Tüberküloz ilaç direnci 175 örneğin 21’inde tespit edilmiştir. Rifampisin direnci 7örnekte, yüksek düzeyde izoniazid direnci 11 örnekte ve rifampisin ve izoniazid direnci (çoklu ilaç direnci) 6 örnekte gösterilmiştir.Tüberküloz hastalarının farklı örneklerinden elde edilen 135 klinik izolatın genetik profili Spoligotyping kullanılarak belirlenmiştir.Majör Spoligotipler, T (n= 62; %45.9), LAM7-TUR (ST41) (n= 11;%8.1) ve H1 (n= 9; %6) genotipleridir.Sonuç: En yaygın EPTB şekli, kültürle kanıtlanmış hastalarda lenfnodu tüberkülozudur. Bu hasta grubunda, çoklu ilaç direnci oranıdüşüktür (%3.6). Spoligotip T (%45.9) en sık görülen genetikprofil olarak tespit edilmiştir.
Anahtar Kelime: Culture proven extra pulmonary tuberculosis: drug susceptibility and genetic profile analysis
Öz: Introduction: Tuberculosis is seen generally in the lungs. Besides, all organs in the body can be affected by tuberculosis. Diagnosis of extra pulmonary tuberculosis (EPTB) is more difficult than pulmonary tuberculosis (PTB). Although, the isolation of Mycobacterium tuberculosis is gold standard of diagnosis of EPTB, the rate of bacteriologic isolation is low especially in EPTB. If M. tuberculosis is detected, it gives some information about the epidemiological features of the disease and drug susceptibility. Materials and Methods: In this study, extra pulmonary samples isolated M. tuberculosis in mycobacteriology laboratory were evaluated between 2009-2016. The identification of the genotype of isolated bacteria and drug sensitivity tests were conducted. Spoligotyping was accomplished using a standard technique as described previously. Results: During the study period, M. tuberculosis were cultured in 171 extra pulmonary samples of 165 patients (75 male, 90 female, mean age: 53.35 ± 19.92). Initial direct microscopically examination was revealed M. tuberculosis in 44 patients. There were more than one extra pulmonary organ involvement in six patients. The most common EPTB forms were lymph node TB in 60 patients, pleural tuberculosis in 32 patients and bone tuberculosis in 25 patients. Immunosuppression was detected in 44 (%26.6) patients. Among these, seven patients were infected with HIV. In 21 of 175 samples, drug resistance was detected. Rifampicin resistance in 7 samples, high level isoniazid resistance in 11 samples and rifampicin plus isoniazid resistance (multiply drug resistance) in 6 samples were demonstrated. One hundred thirty-five clinical isolates were cultured from tuberculosis patient’s different samples, of which the genetic profile was determined by using Spoligotyping. The major Spoligotypes were T (n= 62; 45.9%), LAM7-TUR (ST41) (n= 11; 8.1%) and H1 (n= 9; 6%) genotypes. Conclusion: The most common EPTB form was lymph node tuberculosis in culture proven patients. In these patients group, multiply drug resistance rate was low (3.6%). Spoligotypes T (45.9%) was detected as most common genetic profile.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- Taşbakan MS, Pullukçu H, Sipahi OR, Işıkgöz Taşbakan M, Ozkören Çalık S, Yamazhan T. Evaluation of 694 tuberculous lymphadenitis cases reported from Turkey between 1997-2009 period by pooled analysis method. Mikrobiyol Bul 2010;44:385-93.
- Aslan G, Ülger M, Delialioğlu N, Otağ ZF, Düşmez Apa D, Ersöz G, et al. Mersin ilindeki akciğer dışı tüberküloz olgularının mikrobiyolojik ve demografik olarak değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2017;47:197-204.
- Türkiye Cumhuriyeti Sağlık Bakanlığı Türkiye’de Verem Savaşı 2017 Raporu. https://hsgm.saglik.gov.tr/depo/ haberler/verem-savas-raporu-2016 2017/Turkiyede_ Verem_Savasi_2017_Raporu.pdf
- Zeytinli U, Köksal F. Genotyping of Mycobacterium tuberculosis strains isolated from pulmonary tuberculosis patients in Cukurova Region, Turkey by spoligotyping and MIRU-VNTR methods. Mikrobiyol Bul 2012;46:202-10.
- Clinical and Laboratory Standards Institute. Susceptibility testing of Mycobacteria, Nocardiae, and other aerobic Actinomycetes. Approved Standard M24-A2, Second Edition. CLSI, Wayne, PA, 2011.
- Naing C, Mak JW, Maung M, Wong SF, Kassim AIBM. Meta-analysis: the association between HIV infection and extrapulmonary tuberculosis. Lung 2013;191:27-34.
- World Health Organization World Health Organization Global Tuberculosis Report, 2018. Available from: http://www.who.int/tb/publications/global_report/ archive/en/
- Sunnetcioglu M, Baran AI, Binici I, Esmer F, Gultepe B. Evaluation of 257 extra pulmonary tuberculosis cases at the Tuberculosis Control Dispensary, Van, Turkey. J Pak Med Assoc 2018;68:764-7.
- Prasad R, Kumar Srivastava D. Multi drug and extensively drug-resistant TB (M/XDR-TB) management: Current issues. Clinical epidemiology and global health 2013;1:124-28.
- Caminero JA, Sotgiu G, Zumla A, Migliori GB. Best drug treatment for multidrug-resistant and extensively drugresistant tuberculosis. Lancet Infect Dis 2010;10:621-9.
- Baylan O. Çok ilaca dirençli tüberkülozdan sonra yaygın ilaca dirençli ve tüm ilaçlara dirençli tüberküloz formları: eski hastalığın yeni yüzleri. Mikrobiyol Bul 2011;45:181- 95.
- Zozio T, Allix C, Gunal S, Saribas Z, Alp A, Durmaz R, et al. Genotyping of mycobacterium tuberculosis clinical isolates in two cities of Turkey: description of a new family of genotypes that is phylogeographically specific for Asia Minor. MC Microbiol 2005:26;5:44.
- Günal S. Türkiye’nin farklı coğrafik bölgelerinden toplanan Mycobacterium tuberculosis izolatlarının ıs6110 rflp (restrıctıon fragment length polymorphısm) ve spoligotip profillerinin belirlenmesi (tez). Malatya: İnönü Üniversitesi, 2006.
APA | TAŞBAKAN M, Akdağ D, kahraman h, Akyol D, TAŞBAKAN M, ÇAVUSOGLU C (2018). Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi. , 234 - 238. 10.5578/tt.67376 |
Chicago | TAŞBAKAN Mehmet Sezai,Akdağ Damla,kahraman hasip,Akyol Deniz,TAŞBAKAN Meltem,ÇAVUSOGLU CENGIZ Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi. (2018): 234 - 238. 10.5578/tt.67376 |
MLA | TAŞBAKAN Mehmet Sezai,Akdağ Damla,kahraman hasip,Akyol Deniz,TAŞBAKAN Meltem,ÇAVUSOGLU CENGIZ Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi. , 2018, ss.234 - 238. 10.5578/tt.67376 |
AMA | TAŞBAKAN M,Akdağ D,kahraman h,Akyol D,TAŞBAKAN M,ÇAVUSOGLU C Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi. . 2018; 234 - 238. 10.5578/tt.67376 |
Vancouver | TAŞBAKAN M,Akdağ D,kahraman h,Akyol D,TAŞBAKAN M,ÇAVUSOGLU C Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi. . 2018; 234 - 238. 10.5578/tt.67376 |
IEEE | TAŞBAKAN M,Akdağ D,kahraman h,Akyol D,TAŞBAKAN M,ÇAVUSOGLU C "Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi." , ss.234 - 238, 2018. 10.5578/tt.67376 |
ISNAD | TAŞBAKAN, Mehmet Sezai vd. "Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi". (2018), 234-238. https://doi.org/10.5578/tt.67376 |
APA | TAŞBAKAN M, Akdağ D, kahraman h, Akyol D, TAŞBAKAN M, ÇAVUSOGLU C (2018). Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi. Tüberküloz ve Toraks, 66(3), 234 - 238. 10.5578/tt.67376 |
Chicago | TAŞBAKAN Mehmet Sezai,Akdağ Damla,kahraman hasip,Akyol Deniz,TAŞBAKAN Meltem,ÇAVUSOGLU CENGIZ Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi. Tüberküloz ve Toraks 66, no.3 (2018): 234 - 238. 10.5578/tt.67376 |
MLA | TAŞBAKAN Mehmet Sezai,Akdağ Damla,kahraman hasip,Akyol Deniz,TAŞBAKAN Meltem,ÇAVUSOGLU CENGIZ Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi. Tüberküloz ve Toraks, vol.66, no.3, 2018, ss.234 - 238. 10.5578/tt.67376 |
AMA | TAŞBAKAN M,Akdağ D,kahraman h,Akyol D,TAŞBAKAN M,ÇAVUSOGLU C Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi. Tüberküloz ve Toraks. 2018; 66(3): 234 - 238. 10.5578/tt.67376 |
Vancouver | TAŞBAKAN M,Akdağ D,kahraman h,Akyol D,TAŞBAKAN M,ÇAVUSOGLU C Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi. Tüberküloz ve Toraks. 2018; 66(3): 234 - 238. 10.5578/tt.67376 |
IEEE | TAŞBAKAN M,Akdağ D,kahraman h,Akyol D,TAŞBAKAN M,ÇAVUSOGLU C "Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi." Tüberküloz ve Toraks, 66, ss.234 - 238, 2018. 10.5578/tt.67376 |
ISNAD | TAŞBAKAN, Mehmet Sezai vd. "Kültür ile kanıtlanmış akciğer dışı tüberküloz: ilaç duyarlılığı ve genetik profil analizi". Tüberküloz ve Toraks 66/3 (2018), 234-238. https://doi.org/10.5578/tt.67376 |