Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu
Yıl: 2018 Cilt: 42 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 122 - 129 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5152/tpd.2018.5882 İndeks Tarihi: 11-10-2019
Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu
Öz: Amaç: Türkiye’deki kene türlerine ait genetik veriler kısıtlıdır ve belirli bir kaç kene türüne veya grubuna aittir. Bundan dolayı bu çalışmada Türkiye’deyayılış gösteren bazı ixodid kene türlerinin 16S rDNA filogeni temelli moleküler karakterizasyonunun yapılması amaçlanmıştır.Yöntemler: Bu çalışmada, Türkiye’de yerleşik doğal kolonileri bulunan 17 ixodid kene türüne ait birer izolatın parsiyel 16S rDNA bölgelerinin molekülerkarakterizasyonları yapılmış ve ilgili gen bölgesine göre filogenetik ilişkileri belirlenmiştir.Bulgular: Çalışma ile 16S rDNA gen bölgesi karakterizasyonu yapılan kene türlerine ait izolatların Dünya’daki homolog izolatlarla filogenetik ilişkileriortaya konmuştur. Ixodes laguri türünün ilk defa 16S rDNA verisi elde edilmiş ve filogenetik yerleşimi gösterilmiştir. Ayrıca, genetik olarak hakkındasınırlı veri bulunan Haemahysalis inermis, Ha. parva ve Ha. sulcata türlerine ait orijinal veriler elde edilmiş ve kayıt altına alınmıştır. Bunların yanında,Türkiye’de günümüze kadar üzerine moleküler karakterizasyon verisi bulunmayan Dermacentor marginatus, D. reticulatus, Hyalomma anatolicum, H.detritum, Ha. inermis, Ha. parva, Ha. punctata, Ha. sulcata ve I. laguri türlerine ait genetik veriler bu araştırma ile ilk defa kayıt altına alınmıştır.Sonuç: Bu çalışma ile Türkiye’de yayılış gösteren 17 ixodid kene türüne ait nesillerin 16S rDNA gen bölgesine göre moleküler filogenetik karakterizasyonuyapılmış olup elde edilen çıktılar dünyada ilgili kene türleri üzerine mevcut genetik bilgiye önemli katkıda bulunmuştur.
Anahtar Kelime: Konular:
Molecular Characterization Based on 16S rDNA Phylogeny of Some Ixodid Ticks in Turkey
Öz: Objective: The genetic data related to Turkish ticks is limited. Therefore, this study was aimed to perform of the molecular characterization based on 16S rDNA gene region of some ixodid tick species in Turkey. Methods: The molecular characterizations of partial 16S rDNA gene region belonging to 17 individual ixodid tick species in Turkey have been made and their phylogenetic relationships based on the relevant gene region have been analysed. Results: The 16S rDNA phylogenetic relationships between the isolates obtained from this study and the homolog isolates have been revealed. The 16S rDNA data belonging to Ixodes laguri has been obtained for the first time and its phylogenetic location has been demonstrated. Original genetic data related to Haemaphysalis inermis, Ha. parva and Ha. sulcata, which have a limited number of genetic information, has been obtained. Besides, the new genetic data belonging to Dermacentor marginatus, D. reticulatus, Hyalomma anatolicum, H. detritum, Ha. inermis, Ha. parva, Ha. punctata, Ha. sulcata and I. laguri has been recorded for the first time from Turkey. Conclusion: The molecular phylogenetic characterization based on 16S rDNA gene region of 17 ixodid tick species in Turkey has been performed. The obtained data has made a significant contribution to the genetic knowledge of the mentioned ticks species.
Anahtar Kelime: Konular:
Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- 1. Sonenshine DE. Biology of Ticks. Volume 1. Oxford: Oxford University Press; 1991.
- 2. Guglielmone AA, Robbins RG, Apanaskevich DD, Petney TN, Estrada-Pena A, Horak IG. The hard ticks of the World (Acari: Ixodidae). New York: Springer; 2014.
- 3. Nicholson WL, Sonenshine DE, Lane RS, Uilenberg G. Ticks (Ixodida). Mullen GR, Durden LA, editors. Medical and Veterinary Entomology. London: Academic Press, Elsevier; 2009. p. 493-542.
- 4. Estrada-Pena A., Jongejan F. Ticks feding on humans: a review of records on human-biting Ixodidea with special reference to pathogen transmission. Exp Appl Acarol 1999; 23: 685-715. [CrossRef]
- 5. Jongejan F, Uilenberg G. The global importance of ticks. Parasitology 2004; 129: 3-13. [CrossRef]
- 6. Estrada-Pena A, Ayllon N, de la Fuente J. Impact of climate trends on tick-borne pathogens transmission. Front Physiol 2012; 3: 1-12. [CrossRef]
- 7. İnci A, Yıldırım A, Düzlü Ö, Doğanay M, Aksoy S. Tick-borne diseases in Turkey: A review based on one health perspective. PLoS Negl Trop Dis 2016; 10: e0005021.
- 8. Dantas-Torres F, Chomel BB, Otranto D. Ticks and tick-borne diseases: a one health perspective. Trends Parasitol 2012; 28: 437-46. [CrossRef]
- 9. Ergönül Ö. Crimean-Congo hemorrhagic fever. Lancet Infect Dis 2006; 6: 203-14. [CrossRef]
- 10. Yılmaz GR, Buzgan T, Irmak H, Safran A, Uzun R, Çevik MA, et al. The epidemiology of Crimean-Congo hemorrhagic fever in Turkey, 2002- 2007. Int J Infect Dis 2009; 13: 380-6. [CrossRef]
- 11. Orkun Ö, Karaer Z, Çakmak A, Nalbantoğlu S. Crimean-Congo hemorrhagic fever virüs in ticks in Turkey: A broad range tick surveillance study. Infect Genet Evol 2017; 52: 59-66. [CrossRef]
- 12. Leblebicioğlu H, Özaras R, Irmak H, Şencan İ. Crimean-Congo hemorrhagic fever in Turkey: Current status and future challenges. Antivir Res 2016; 126: 21-34. [CrossRef]
- 13. Durden LA, Beati L. Modern tick systematics. Sonenshine DE, Roe M, editors. Biology of Ticks. Second Edition, Volume 1. Oxford: Oxford University Press; 2014. p. 17-58.
- 14. Black WC, Piesman J. Phylogeny of hard- and soft tick taxa (Acari: Ixodida) based on mitochondrial 16S rDNA sequences. Proc Nat Acad Sci USA 1994; 91: 10034-8. [CrossRef]
- 15. Meyer JM, Hill CA. Tick genetics, genomics, and transformation. Sonenshine DE, Roe M, editors. Biology of Ticks. Second Edition, Volume 2. Oxford: Oxford University Press; 2014. p. 61-87.
- 16. Murrell A, Baker SC. Synonymy of Boophilus Curtice, 1891 with Rhipicephalus Koch, 1844 (Acari: Ixodidae). Syst Parasitol 2003; 56: 169- 72. [CrossRef]
- 17. Venzal JM, Gonzales-Acuna D, Munoz-Leal S, Mangold AJ, Nava S. Two new species of Ornithodoros (Ixodida; Argasidae) from the Southern Cone of South America. Exp Appl Acarol 2015; 66: 127- 39. [CrossRef]
- 18. Orkun Ö, Karaer K. First record of the tick Ixodes (Pholeoixodes) kaiseri in Turkey. Exp Appl Acarol 2018; 74: 201-5. [CrossRef]
- 19. Porretta D, Mastrantonio V, Mona S, Epis S, Montagna M, Sassera D, et al. The integration of multiple independent data reveals an unusual response to Pleistocene climatic changes in the hard tick Ixodes ricinus. Mol Ecol 2013; 22: 1666-82. [CrossRef]
- 20. Keskin A, Köprülü TK, Bursalı A, Özdemir AC, Yavuz KE, Tekin S. First record of Ixodes arboricola (Ixodida: Ixodidae) from Turkey with presence of Candidatus Rickettsia vini (Rickettsiales: Rickettsiaceae). J Med Entomol 2014; 51: 864-7. [CrossRef]
- 21. Çelebi ARC, Orkun Ö. A rare case of tick infestation of the eyelid: case report and literatüre review. Rev Bras Oftalmol 2016; 75: 144-6. [CrossRef]
- 22. Hornok S, Wang Y, Otranto D, Keskin A, Lia RP, Kontschan J, et al. Phylogenetic analaysis of Haemaphysalis erinacei Pavesi, 1884 (Acari: Ixodidae) from China, Turkey, Italy and Romania. Parasit Vectors 2016; 9: 643. [CrossRef]
- 23. Hekimoğlu O, Sağlam İK, Özer N, Estrada-Pena A. New molecular data shed light on the global phylogeny and species limits of the Rhipicephalus sanguineus complex. Ticks Tick Borne Dis 2016; 7: 798-807. [CrossRef]
- 24. Hekimoğlu O., Özer AN. Distribution and phylogeny of Hyalomma ticks (Acari: Ixodidae) in Turkey. Exp Appl Acarol 2017; 73: 501-19. [CrossRef]
- 25. Hoogstraal H. African Ixodidae, ticks of the Sudan. Washington: Burg Med Surg, Dept Navy., US Govt. Print. Of. (USGPO); 1956.
- 26. Arthur DR. Ticks of the genus Ixodes in Africa. London: The Athlone Press; 1965.
- 27. Filippova NA. Ixodid ticks (Ixodinae), Fauna USSR New Ser 4(4). Nauka, Leningrad, Moscow: 1977.
- 28. Filippova NA. Fauna of Russia and neighbouring countries, Arachnoidea, Volum IV, issue 5, Ixodid ticks od subfamily Amblyomminae. St. Petersburg: Nauka Publishing House; 1997.
- 29. Walker BJ, Keirans JE, Horak IG. The genus Rhipicephalus (Acari, Ixodidae): aguide to the brown ticks of the world. Cambridge: Cambridge University, 2000. [CrossRef]
- 30. Apanaskevich DA. The diagnostics of Hyalomma (Hyalomma) aegyptium (Acari: Ixodidae). Parasitologiia 2003; 37: 47-59.
- 31. Estrada-Pena A., Bouattour A, Camicas JL, Walker AR. Ticks of domestic animals in the Mediterranean region. A guide of identification of species. Zaragoza: University of Zaragoza Press; 2004.
- 32. Apanaskevich DA, Horak IG. The genus Hyalomma Koch, 1844. II. Taxonomic status of H. (Euhyalomma) anatolicum Koch, 1844 and H. (E.) excavatum Koch 1844 (Acari, Ixodidae) with redescriptions of all stages. Acarine 2005; 13: 181-97.
- 33. Apanaskevich DA, Horak IG. The genus Hyalomma Koch, 1844: V. Re-evaluation of the taxonomic rank of taxa comprising the H. (Euhyalomma) marginatum Koch complex of species (Acari: Ixodidae) with redescription of all parasitic stages and notes on biology. Internat J Acarol 2008; 34: 13-42. [CrossRef]
- 34. Hall TA. BioEdit: A user-friently biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acid Symposium 1999; 41: 95-8.
- 35. Posada D. jModelTest: Phylogenetic model averaging. Mol Biol Evol 2008; 25: 1253-6. [CrossRef]
- 36. Kumar S, Stecher G, Tamura K. MEGA7: molecular evolutionary genetic analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol Biol Evol 2016; 33: 1870-4. [CrossRef]
- 37. Xu G, Fang QQ, Keirans J, Durden LA. Molecular phylogenetic analyses indicate that the Ixodes ricinus complex is a paraphyletic group. J Parasitol 2003; 89: 452-7. [CrossRef]
- 38. Radulovic Z, Mihaljica D, Cosic N, Penezic A, Cakic S, Sukara R, et al. Hard ticks parasitizing European ground squirrel, Spermophilus citellus (L., 1766) (Rodentia: Sciuridae) in Serbia. Acta Zool Bulg 2017; 69: 547-54.
- 39. Burger TB, Shao R, Barker SC. Phylogenetic analysis of the mitochondrial genomes and nuclear rRNA genes of ticks reveals a deep phylogenetic structure within the genus Haemaphysalis and further elucidates the polyphyly of the genus Amblyomma with respect to Amblyomma sphenodonti and Amblyomma elaphense. Tick Tick Borne Dis 2013; 4: 265-74. [CrossRef]
- 40. Nava S, Estrada-Pena A, Petney T, Beati L, Labruna MB, Szabo MPJ, et al. The taxonomic status of Rhipicephalus sanguineus (Latreille, 1806). Vet Parasitol 2015; 208: 2-8. [CrossRef]
- 41. Gray J, Dantas-Torres F, Estrada-Pena A, Levin M. Systematics and ecology of the brown dog tick, Rhipicephalus sanguineus. Ticks Tick Borne Dis 2013; 4: 171-80. [CrossRef]
- 42. Kaur H, Chhilar JS, Chhillar S. Mitochondrial 16s rDNA based analysis of some hard ticks belonging to genus Hyalomma Koch, 1844 (Acari: Ixodidae). J Adv Parasitol 2016; 3: 32-48. [CrossRef]
- 43. Dobson SJ, Baker SC. Phylogeny of the hard ticks (Ixodidae) inferred from 18S rRNA indicates that the genus Aponnoma is paraphyletic. Mol Phylogenet Evol 1999; 11: 288-95. [CrossRef]
- 44. Sands AF, Apanaskevich DA., Matthee S, Horak IG, Harrison A, Karim S, et al. Effects of tectonic and large scale slimatic changes on the evolutionary history of Hyalomma ticks. Mol Phylogenet Evol 2017; 114: 153-65. [CrossRef]
- 45. Apanaskevich DA, Filipova NA, Horak IG. The genus Hyalomma Koch, 1844. X. Redescription of all parasitic stage of H. (Euhyalomma) scupense Schulze, 1919 (= H. detritum Schulze) (Acari: Ixodidae) and notes on its biology. Folia Parasit 2010; 57: 69-78. [CrossRef]
- 46. Karaer Z, Güven E, Nalbantoğlu S, Kar S, Orkun Ö, Ekdal K, et al. Tick on humans in Ankara, Turkey. Exp Appl Acarol 2011; 54: 85-91. [CrossRef]
- 47. Aktaş M. A survey of ixodid tick species and molecular identification of tick-borne pathogens. Vet Parasitol 2014; 200: 276-83. [CrossRef]
- 48. Waner T, Keysary A, Eremeeva ME, Din AB, Mumcuoğlu K, King R, et al. Rickettsia africa and Candidatus Rickettsia barbariae in ticks in Israel. Am J Trop Med Hyg 2014; 90: 920-2. [CrossRef]
- 49. Moshaverinia A, Moghaddas E. Prevalance of tick infestation in dromedary camels (Camelus dromedarius) brought for slaughter in Mashhad abattoir, Iran. J Parasit Dis 2015; 39: 452-5. [CrossRef]
- 50. Düzlü Ö, Yıldırım A, İnci A, Gümüşsoy KS, Çiloglu A, Önder Z. Molecular investigation of Francisella-like endosymbiont in ticks and Francisella tularensis in ixodid ticks and mosquitoes in Turkey. Vector-Borne Zoonot 2016; 16: 26-32. [CrossRef]
- 51. Khan V, Zala DB, Joshi KM. Occurence of Hyalomma (Acari: Ixodidae) Koch, 1844 on domestic animal in the Union Territory of Dadra & Nagar Haveli, Indian. J Parasit Dis 2016; 40: 543-5. [CrossRef]
- 52. Kar S, Akyıldız G, Vatansever Z. Trakya’da ineklerde Hyalomma scupense enfestasyonu ve enfestasyonun mevsimsel karakteristiği. 19. Ulusal Parazitoloji Kongresi ve Uluslararası Katılımlı Ekinokokkozis Sempozyumu; 5-9 Ekim Erzurum-Türkiye: 2015. p. 79-80.
| APA | Orkun Ö (2018). Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu. , 122 - 129. 10.5152/tpd.2018.5882 |
| Chicago | Orkun Ömer Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu. (2018): 122 - 129. 10.5152/tpd.2018.5882 |
| MLA | Orkun Ömer Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu. , 2018, ss.122 - 129. 10.5152/tpd.2018.5882 |
| AMA | Orkun Ö Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu. . 2018; 122 - 129. 10.5152/tpd.2018.5882 |
| Vancouver | Orkun Ö Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu. . 2018; 122 - 129. 10.5152/tpd.2018.5882 |
| IEEE | Orkun Ö "Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu." , ss.122 - 129, 2018. 10.5152/tpd.2018.5882 |
| ISNAD | Orkun, Ömer. "Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu". (2018), 122-129. https://doi.org/10.5152/tpd.2018.5882 |
| APA | Orkun Ö (2018). Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu. Türkiye Parazitoloji Dergisi, 42(2), 122 - 129. 10.5152/tpd.2018.5882 |
| Chicago | Orkun Ömer Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu. Türkiye Parazitoloji Dergisi 42, no.2 (2018): 122 - 129. 10.5152/tpd.2018.5882 |
| MLA | Orkun Ömer Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu. Türkiye Parazitoloji Dergisi, vol.42, no.2, 2018, ss.122 - 129. 10.5152/tpd.2018.5882 |
| AMA | Orkun Ö Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu. Türkiye Parazitoloji Dergisi. 2018; 42(2): 122 - 129. 10.5152/tpd.2018.5882 |
| Vancouver | Orkun Ö Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu. Türkiye Parazitoloji Dergisi. 2018; 42(2): 122 - 129. 10.5152/tpd.2018.5882 |
| IEEE | Orkun Ö "Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu." Türkiye Parazitoloji Dergisi, 42, ss.122 - 129, 2018. 10.5152/tpd.2018.5882 |
| ISNAD | Orkun, Ömer. "Türkiye’de Yayılış Gösteren Bazı İxodid Kene Türlerinin 16S rDNA Filogenisi Temelli Moleküler Karakterizasyonu". Türkiye Parazitoloji Dergisi 42/2 (2018), 122-129. https://doi.org/10.5152/tpd.2018.5882 |
