Amaç: İlk kez 1857’de izole edilip tanımlanan ve zorunlu hücre içi paraziti olan microsporidialar farklı hayvan gruplarında ve omurgasızlarda görülmektedir. Microsporidiaların epidemiyolojisi ile ilgili yurt dışı çalışmalarında genellikle HIV pozitif, immün süpresif ve homoseksüel hastalar araştırma grubunu oluşturmuştur. Ülkemizde parazitin görülme yüzdesiyle ilgili araştırmalara, ulaşılan kaynak bilgilerde rastlanılmamıştır. Çalışmada microsporidiaların epidemiyolojisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Yöntem ve Gereç: Malatya ili ve çevresinden, 2006 yılında sindirim sistemi şikayetleri ile İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi polikliniklerine başvuran ve Parazitoloji Anabilim Dalına gelen hastalar dikkate alınarak sindirim sistemi şikayetler olan bireylere ulaşma hedefi konmuş olup bu doğrultuda 2665 dışkı örneği incelenmiştir. Bulgular: Dışkı örnekleri modifiye trichrome boyası (MTS), Asit-Fast-Trichrome, Calcofluor white ve Giemsa boyama yöntemi ile incelenmiş ve 226 (% 8,5) pozitiflik saptanmıştır. Çalışmada iştahsızlık, genel vücut kaşıntısı, allerji, immün süpresif+kanserde, nefes darlığı olanlarda ve ülseratif kolitli hastalarda yapılan istatistiki değerlendirmeye göre anlamlı ilişki bulunmuştur. Sonuç: Sonuç olarak Microsporidium spp.’nin ülkemizde tanınan bir parazit olmadığından nedeni belirlenemeyen ishallerde, karın ağrısında, iştahsızlıkta, genel vücut kaşıntısı ve allerjide, immün süpresif+kanserde, nefes darlığında ve ülseratif kolitte rutin olarak dışkıda parazitin aranması gereğinin önemi vurgulanmıştır.