TY  - JOUR
TI  - Otopsi Olgularında Viral Solunum Yolu Enfeksiyonu Etkenlerinin Multipleks PCR Yöntemi ile Araştırılması: Beş Yıllık Bir Çalışma
AB  - Viral solunum yolu enfeksiyonları, çocuk ve erişkinlerde önemli morbidite ve mortalite nedenleri arasındailk sıralarda yer almaktadır. Mortaliteye neden olan enfeksiyonların tanısına postmortem incelemelerin dahiledilmesi, yeni patojenlerin belirlenmesinde, tedavi ve önleme stratejilerinin geliştirilmesinde yarar sağlayabilir. Bu çalışmanın amacı, solunum yolu enfeksiyonu düşünülen otopsi olgularında multipleks polimerazzincir reaksiyonu (PCR) yöntemi ile viral etiyolojinin araştırılması, histopatolojik bulgularla birlikte, tespitedilen virüslerin gerçek enfeksiyon etkeni olup olmadığı ve ölüm sebebine katkısını değerlendirmektir. Buçalışmada, Ocak 2013-Mayıs 2017 tarihleri arasında otopsi yapılan olgulardan solunum yolu enfeksiyonuşüphesi olan erişkinler ile bebek-çocuk yaş grubunu kapsayan ani ölüm olguları değerlendirilmiştir. Toplam834 olgunun 468 (%56.1)’i erkek, 366 (%43.9)’sı kadın olup; 0-1 ay arasında 191 (%22.9), 1 ay-18 yaşarasında 593 (%71.1), > 18 yaş grubunda 50 (%6) olgu incelenmiştir. Tüm olguların 728 (%87.3)’indepostmortem alınan nazofarengeal/trakeal sürüntü örnekleri, 106 (%12.7)’sında parafine gömülü akciğerdokusu örnekleri multipleks gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (Rt-PCR) yöntemi ile incelenmiştir.Postmortem örnekler; insan rinovirüsü (HRV), parainfluenza virüsler (PIV) (1, 2, 3, 4), influenza virüs tip A veB (INF-A, INF-B), enterovirüs (EV), insan bokavirüsü (HBoV), adenovirüs (AdV), insan koronavirüsleri (HCoV229, 63, HKU, 43), insan metapnömovirüsü A ve B (HMPV-A/B), parekovirüs (PV), solunum sinsityal virüsü(RSV A/B) ve Mycoplasma pneumoniae varlığı açısından araştırılmıştır. Multipleks Rt-PCR yöntemi ile “FTDRespiratory 21 (Fast-track Diagnostics, Luxemburg)” kiti kullanılarak üretici firmanın önerileri doğrultusundaRotor Gene (Qiagen, Almanya) cihazında amplifiye edilmiştir. Çalışmada olguların 379 (%45.4)’unda RtPCR ile en az bir solunum virüsü saptanırken, 455 (%54.6)’inde herhangi bir viral etken saptanmamıştır.Olguların 278 (%33.3)’inde bir viral etken pozitif saptanırken, 83 (%9.94) olguda iki viral etken, 18 (%2.16)olguda da üç viral etken pozitif olarak saptanmıştır. Olguların tümünde ilk sırada HRV 110 (%13.2), ikinci sırada AdV 39 (%4.7), üçüncü sırada ise RSV A/B 33 (%4) olgu ile en sık saptanan viral etkenler olmuştur.Çocuk olgularda solunum virüslerinin pozitiflik oranı %31.8, erişkin grupta ise %20 olarak tespit edilmiştir(p= 0.032). Çocuklarda en sık HRV saptanırken, erişkinlerde en sık saptanan patojen INF-A olmuştur. Olguların 101 (%12.1)’inde iki veya üçlü etken enfeksiyonları tespit edilmiştir. İkili etken enfeksiyon oranı 0-1ay yaş grubunda %2.6 (5/191), 1 ay-18 yaş grubunda %13 (77/593), > 18 yaş grubunda ise %2 (1/50)oranında saptanmıştır. İkili etken ile gelişen enfeksiyonlarda HRV ve INF-B, HRV ve PIV, HRV ve HBoV, HRVve AdV birlikteliği sırasıyla en sık görülmüştür. Üçlü etken enfeksiyonlarının tamamı 1 ay-18 yaş grubunda[%3 (18/593)] tespit edilmiştir. Çalışmamızda akciğer dokularının postmortem histopatolojik incelemesinde318 (%38.1) olguda enfeksiyon bulgusu saptanmazken, en sık saptanan bulgular 233 (%28) olguda lobülerpnömoni, pürülan bronşit ve 168 (%20.1) olguda interstisyel pnömoni olarak saptanmıştır. Olguların tamamı enfeksiyon açısından değerlendirildiğinde 469 (%56.2) olguda enfeksiyon lehine bulgu tespit edilmiştir.Sonuç olarak; solunum yolu enfeksiyonu düşünülen olguların otopsi ve histopatolojik incelemelerle birliktepostmortem mikrobiyolojik incelemelerinin de yapılması, ölüme neden olan enfeksiyon etkenlerinin tespitedilmesini sağlayacaktır.
AU  - Ziyade, Nihan
AU  - Elgörmüş, Neval
AU  - Karayel, Ferah
AU  - KARA, ERDOGAN
DO  - 10.5578/mb.67960
PY  - 2019
JO  - Mikrobiyoloji Bülteni
VL  - 53
IS  - 2
SN  - 0374-9096
SP  - 179
EP  - 191
DB  - TRDizin
UR  - http://search/yayin/detay/371560
ER  -