Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi
Yıl: 2020 Cilt: 12 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 77 - 81 Metin Dili: Türkçe DOI: doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 İndeks Tarihi: 06-11-2020
Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi
Öz: Amaç: Tüberkülozun laboratuvar tanısında altın standart etkenin izolasyonudur. İzolasyon için en sık kullanılan besiyerleri, Lowenstein-Jensen (L-J) ve otomatize sıvı besiyerleridir (OSB). Ancak bu besiyerleri maliyet ve üretme zamanı açısından sorun olmaya devam etmektedir. Çalışmamızda alternatif olarak %5 koyun kanlı ağarın (KKA) etkinliği araştırılmıştır. Yöntem: Marmara Üniversitesi Hastanesi ve T.C. Sağlık Bakanlığı Süreyyapaşa Göğüs Hastalıkları Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarlarına mikobakteri kültürü için gelen 617 alt solunum yolu örneği OSB, L-J ve KKA’ya ekildi. Bulgular: Örneklerin 38’inde (%6.2) üreme saptanmış, bunların 36’sı OSB (%5.8), 31’i L-J (%5), sadece 5’i KKA (%0.8) ile izole edilmiştir. İzolasyon süreleri sırasıyla 14.53, 29.09 ve 19.2 gün olarak saptanmıştır. Çalışmanın ikinci aşamasında, aside dirençli basil saptanan alt solunum yolu örnekleri (n=108) işleme alınmış; standart besiyerlerinin yanı sıra örnekler, KKA’nın yarısına doğrudan diğer yarısına ise Middlebrook 7H9 sıvı besiyerinde 48 saat inkübe edildikten (M-7H9+KKA) sonra ekilmiştir. Örneklerin 75’i OSB (%69.4), 73’ü L-J (%67.6), 72’si ise M-7H9+KKA’da (%66.7) üretilebilmiştir. Doğrudan KKA’ya ekilen sadece bir örnekte (%1) üreme saptanmıştır. İzolasyon süresi OSB’de 14.57 gün iken, L-J’de 26.10 ve M-7H9+KKA’da 18.74 gün olarak saptanmış olup, izolasyon süreleri arasındaki fark istatistiksel olarak anlamlı saptanmıştır (p<0.001). Sonuç: Mikobakteri izolasyonunda OSB etkin ve hızlı sonuç veren ama maliyeti en yüksek seçenektir. Düşük maliyetli L-J ise geç izolasyon dezavantajına sahiptir. KKA, bakterinin ilk izolasyonunda en düşük etkinliği sergilemekle birlikte, M-7H9 ile zenginleştirme, besiyerini OSB ve L-J ile kıyaslanabilir düzeye çekmiştir. M-7H9+KKA yöntemi maliyet ve etkinlik açısından L-J’ye benzerlik gösterirken süre açısından üstünlük sağlamıştır. Çalışmamızın sonuçlarına göre otomatize sistemlere sahip olamayan laboratuvarlar için M-7H9+KKA yöntemi uygun bir alternatif olabilir.
Anahtar Kelime: Isolation of Mycobacterium Species Using Simple Media Prepared From Lower Respiratory Tract Samples and Analysis of Cost/Effectiveness
Öz: Objective: Isolation of the causative agent is the gold standard for the diagnosis of tuberculosis. Most commonly used culture media for isolation are Lowenstein-Jensen (L-J) and automatic liquid medium (ALM). However, the cost and bacterial growth time still poses challenging concerns. In this study, as an alternative, effectiveness of 5% sheep blood agar (SBA) was investigated. Method: Samples from lower respiratory tract (n=617) which were sent to laboratories of Marmara University Hospital and Sureyyapaşa Chest Diseases Hospital for mycobacterial culture were inoculated on ALM, L-J and SBA. Results: Mycobactetrial growth was observed in 38 samples. Thirty- six strains were grown on ALM (5.8%), 31 on L-J (5%) and only 5 on SBA (0.8%). Times to their isolation were calculated as 14.53, 29.09 and 19.2 days respectively. In the study period, we also inoculated 108 lower respiratory tract samples which were positive for acid- fast bacteria, on ALM, L-J and SBA. For inoculation on SBA, samples were seeded after enrichment by incubation in Middlebrook-7H9 broth for 48 hours. Totally, 75 of the samples (69.4%) exhibited growth in ALM, 73 (67.6%) on L-J and, 72 (66.7%) on M-7H9+SBA, requiring isolation times of 14.57 days for ALM, 26.10 days for L-J and, 18.74 days for M-7H9+SBA. Statistically significant differences were detected between isolation times of these media (p<0.001). Conclusion: SBA showed comparable growth rates with that of ALM and L-J media and was superior than L-J in respect to mycobacterial isolation time while their costs were similar. Lowcost L-J has an disadvantage of having longer isolation times. Although SBA displayed the lowest effectiveness at first bacterial isolation, thanks to enrichment with M-7HD its performance reached comparable levels with ALM and L-J. M-7H9+KKA method resembles L-J in terms of costeffectiveness, but it is superior to L-J in terms of isolation times. According to the results of our study, M-7H9+SBA method might be an alternative for laboratories where automated systems are not available.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- Heifets L. Gen-Probe test should not be considered final in Mycobacterium tuberculosis identification. J Clin Microbiol 1989 Jan;27(1):229. Available from: https://www.ncbi.nlm. nih.gov/pmc/articles/PMC267276/
- Tarshis MS, Weed WA, Kinsella PC, Parker MV and Dunham WB. Further Experience with a New Blood Medium fort he Cultivation of Mycobacterium tuberculosis. Am J Public Health 1955 Sep;45(9):1157-61. https://doi.org/10.7759/cureus.757
- Drancourt M, Raoult D. Cost-Effectiveness of Blood Agar for Isolation of Mycobacteria. PLos Negl Trop Dis. 2007 Nov 28;1(2):e83. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0000083
- Mathur ML, Gaur J, Sharma R, Solanki A. Rapid culture of Mycobacterium tuberculosis on Blood Agar in Resource Limited Setting. Dan Med Bull 2009 Nov;56(4):208-10. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ 19939338
- Coban AY, Bilgin K, Uzun M, Fisgin NT, Akgunes A, et al. Susceptibilities of Mycobacterium tuberculosis to isoniazid and rifampin on blood agar. J Clin Microbiol. 2005 Apr;43(4):1930-1. https://doi.org/10.1128/JCM.43.4.1930-1931.2005
| APA | YANILMAZ Ö, soyletir g (2020). Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi. , 77 - 81. doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| Chicago | YANILMAZ Özgür,soyletir güner Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi. (2020): 77 - 81. doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| MLA | YANILMAZ Özgür,soyletir güner Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi. , 2020, ss.77 - 81. doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| AMA | YANILMAZ Ö,soyletir g Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi. . 2020; 77 - 81. doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| Vancouver | YANILMAZ Ö,soyletir g Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi. . 2020; 77 - 81. doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| IEEE | YANILMAZ Ö,soyletir g "Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi." , ss.77 - 81, 2020. doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| ISNAD | YANILMAZ, Özgür - soyletir, güner. "Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi". (2020), 77-81. https://doi.org/doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| APA | YANILMAZ Ö, soyletir g (2020). Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi. İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi, 12(1), 77 - 81. doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| Chicago | YANILMAZ Özgür,soyletir güner Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi. İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi 12, no.1 (2020): 77 - 81. doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| MLA | YANILMAZ Özgür,soyletir güner Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi. İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi, vol.12, no.1, 2020, ss.77 - 81. doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| AMA | YANILMAZ Ö,soyletir g Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi. İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi. 2020; 12(1): 77 - 81. doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| Vancouver | YANILMAZ Ö,soyletir g Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi. İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi. 2020; 12(1): 77 - 81. doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| IEEE | YANILMAZ Ö,soyletir g "Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi." İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi, 12, ss.77 - 81, 2020. doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
| ISNAD | YANILMAZ, Özgür - soyletir, güner. "Mycobacterium Türlerinin Alt Solunum Yolu Örneklerinden Basit Besiyerleri ile İzolasyonu ve Maliyet/Etkinlik Analizi". İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi 12/1 (2020), 77-81. https://doi.org/doi: 10.5222/iksstd.2020.25238 |
