TY  - JOUR
TI  - Klinik Örneklerden Mycobacterium tuberculosis Saptanmasında Anyplex MTB/NTM Testinin Değerlendirilmesi
AB  - Klinik örneklerden Mycobacterium tuberculosis’in hızlı ve doğru bir şekilde saptanabilmesi, tüberkülozun etkin kontrolündeki en önemli basamaklardan biridir. Tüberkülozun erken ve doğru tanısı, tedavininmümkün olan en kısa süre içerisinde başlatılabilmesini sağlamaktadır. Altın standart kültür yöntemlerineek olarak, tüberkülozun erken tanısında hızlı sonuç veren moleküler yöntemlerin de tanı algoritmasınaeklenmesi gerekmektedir. Bu nedenle son yıllarda tüberkülozun rutin tanısının yapıldığı laboratuvarlardamoleküler yöntemler önemli bir basamak haline gelmiştir. Bu çalışmanın amacı, rutin moleküler tanı laboratuvarlarında klinik örneklerden M.tuberculosis saptanması amacıyla kullanılmakta olan Anyplex MTB/NTM testinin (Seegene, Güney Kore) hızlı tanıdaki etkinliğinin araştırılmasıdır. Çalışmada yanı sıra, yurtdışı kökenli ticari kitlere alternatif olabilecek yerli kitler üretebilmek amacıyla tasarlanmış olan primerlerinpolimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemiyle ön değerlendirilmesinin yapılması hedeflenmiştir. Çalışmaya toplam üç yıllık süre içerisinde, tüberküloz şüphesi bulunan hastalardan elde edilerek laboratuvaragönderilmiş olan 10.652 klinik örnek dahil edilmiştir. Tüm örnekler boyama sonrasında mikroskobik inceleme, kültür ve gerçek zamanlı PCR (Rt-PCR) yöntemleri kullanılarak test edilmiştir. Hasta örneklerinden hazırlanan yaymalar aside dirençli basil varlığı açısından, Kinyoun boyama yöntemi ile boyandıktansonra mikroskop ile incelenmiştir. Kültür amacıyla, örneklere N-asetil-L-sistein-sodyum hidroksit yöntemiile homojenizasyon-dekontaminasyon işlemi uygulanmış, MGIT (Mycobacteria Growth Indicator Tube)şişelerine (Becton Dickinson, ABD) ve Löwenstein-Jensen besiyerine ekim yapılmıştır. Rt-PCR yöntemi iseAnyplex MTB/NTM testi ile gerçekleştirilmiştir. Çalışmanın birinci aşamasında, tüberkülozun molekülertanısında kullanılan Anyplex MTB/NTM testinin etkinliği, altın standart kültür yöntemiyle karşılaştırılarakdeğerlendirilmiştir. Bu amaçla seçilen 100 kültür-pozitif örneğe laboratuvar içi tasarımlı PCR yöntemi uygulanmıştır. Toplam 10.652 örneğin 178 (%1.7)’inde kültürde M.tuberculosis üremesi saptanmıştır. Altınstandart kültür yöntemiyle yapılan karşılaştırma sonucunda Anyplex MTB/NTM testinin duyarlılık ve özgüllüğü akciğer kökenli örneklerde sırasıyla %84 ve %99, akciğer dışı örneklerde ise sırasıyla %74 ve %99olarak bulunmuştur. Çalışmanın ikinci aşamasında ise, kültür sonucu pozitif olan örneklere, laboratuvar içitasarımla oluşturulan primerlerin kullanıldığı PCR yöntemi uygulanarak, ileriki çalışmalarda geliştirilmesi planlanan laboratuvar yapımı tüberküloz tanı kitinde kullanımının uygun olup olmadığı araştırılmıştır. Buamaçla seçilen 100 kültür pozitif örneğe laboratuvar içi tasarımlı PCR yöntemi uygulanmıştır. Bu örneklerin 98’inde kültür ile uyumlu pozitif sonuç elde edilirken, iki örnekte M.tuberculosis DNA’sı saptanmamıştır. Çalışma sonucunda Anyplex MTB/NTM testinin rutin tüberküloz tanısında kullanılabilecek hızlı, pratikve güvenilir bir test olduğu sonucuna varılmıştır. Laboratuvar içi tasarıma sahip primerlerin kullanıldığıPCR yönteminin ön değerlendirme sonuçlarının rutinde kullanılan yöntemlerle uyumlu çıkması, daha uygun maliyetli yerli üretim tüberküloz moleküler tanı kitlerinin geliştirilmesine ışık tutacaktır. Böylece rutintanı laboratuvarlarında hızlı tanının, daha uygun maliyetle gerçekleştirilmesi mümkün olacaktır.
AU  - SARIBAS, Zeynep
AU  - ALP, ALPASLAN
DO  - 10.5578/mb.67783
PY  - 2019
JO  - Mikrobiyoloji Bülteni
VL  - 53
IS  - 4
SN  - 0374-9096
SP  - 355
EP  - 363
DB  - TRDizin
UR  - http://search/yayin/detay/377115
ER  -