Yıl: 2019 Cilt: 29 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 652 - 661 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.29133/yyutbd.597443 İndeks Tarihi: 28-04-2021

Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele

Öz:
Bu çalışma ile biberde Phytophthora yanıklığı hastalığına karşı antagonistbakteriler ile biyolojik mücadele olanakları araştırılmıştır. Biyolojik mücadeleçalışmalarında kullanılmak üzere biber köklerinden antagonist bakteri adaylarıizole edilmiştir. Daha sonra antagonistlerin hastalık etmenine karşı olanantimikrobiyal etkileri ikili kültür, kökçük testi, saksı ve tarla denemeleri iledeğerlendirilmiştir. Çalışmalar sırasında toplam 95 adet antagonist bakteriizolatı elde edilirken, bunlardan 21 tanesi ikili kültür testlerinde hastalıketmeninin misel gelişimini %20-82 oranında engellemiştir. Kullanılanantagonistlerin yapılan kökçük testlerinde hastalık çıkışını %93’e varan biroranda engellemek suretiyle etkili olduğu saptanmıştır. Yapılan saksıdenemelerinde test edilen antagonistlerden bazıları hastalık etmeniniengellerken bazılarının da hastalık şiddetini arttırdığı bulunmuştur. Biyolojikmücadelenin değerlendirildiği tarla denemelerinde ise ümitvar sonuçlar eldeedilmiştir
Anahtar Kelime:

Biological Control of Phytophthora Blight of Pepper with Antagonistic Bacteria

Öz:
The aim of this study was to investigate the possibilities of biological control of Phytophthora blight in pepper by using antagonistic bacteria. For biological control studies, antagonist bacteria were isolated from pepper roots. Antimicrobial effects of bacterial antagonists against disease agent was tested by dual culture, radicle assay, potting and field experiments. A total of 95 isolates of antagonists were isolated during the study, of which 21 had mycelial inhibition rates of 20-82% in the dual culture tests. Bacterial antagonists were found to be effective for suppression of disease development up to 93% in radicle assay. Some of the antagonists tested in the pot experiments inhibited the disease, however others were found to increase disease severity. Promising results were obtained in field trials.
Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
  • Akgül, S. D., & Mirik, M. (2008). Biocontrol of Phytophthora capsici on pepper plants by Bacillus megaterium strains. J. Plant Pathol., 90(1), 29–34.
  • Berg, G., Roskot, N., Steidle, A., Eberl, L., Zock, A., & Smalla, K. (2002). Plant-Dependent genotypic and phenotypic diversity of antagonistic rhizobacteria isolated from different verticillium host plants. Appl Environ Microbiol, 68(7), 3328–3338.
  • Chang, S. H., Kwack, M. S., Kim, Y. S., Lee, J. Y., & Kim, K. D. (2001). A Rapid radicle assay for prescreening antagonistic bacteria against Phytophthora capsici on pepper. Mycobiology, 29(4), 218–223.
  • Fierer, N., Jackson, J. A., Vilgalys, R., & Jackson, R. B. (2005). Assessment of soil microbial community structure by use of taxon-specific quantitative PCR assays. Appl Environ Microbiol, 71(7), 4117–4120.
  • Hausbeck, M. K., & Lamour, K. H. (2004). Phytophthora capsici on vegetable crops: research progress and management challenges. Plant Dis., 88(12), 292–1303.
  • Kim, H. S., Sang, M. K., Jung, H. W., Jeun, Y. C., Myung, I. S., & Kim, K. D. (2012). Identification and characterization of Chryseobacterium wanjuense strain kj9c8 as a biocontrol agent of phytophthora blight of pepper. Crop Prot, 32, 129–137.
  • Klement, Z., Rudolph, K., & Sands, D. C. (1990). Methods in Phytobacteriology. Budapest, Hungary: Akademiai Kiadó.
  • Kurze, S., Bahl, H., Dahl, R., & Berg, G. (2001). Biological control of fungal strawberry diseases by Serratia plymuthica HRO-C48. Plant Dis, 85(5), 529–534.
  • Lane, D. J. (1991). 16S/23S rRNA sequencing. In: Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics (Stackebrandt, E. and Goodfellow, M., Eds.), pp. 115–147. John Wiley and SonsChichester.
  • Mei, X., Zhao, Q., Tan, S., Xu, Y., Shen, B., & Shen, Q. (2010). Screening, identification, and biocontrol effect of antagonistic bacteria against Phytophthora capsici. J Appl Ecol, 21(10), 2652–2658.
  • Messiha, N. A. S., Diepeningen, A. D., Farag, N. S., Abdallah, S. A., Janse, J. D., & Bruggen, A. H. C (2007). Stenotrophomonas maltophilia: a new potential biocontrol agent of Ralstonia solanacearum, causal agent of potato brown rot. Eur. J. Plant Pathol, 118(3), 211–225.
  • Özyılmaz, Ü. (2007). Biological control of strawberry root diseases by rhizobacteria in Aydin province. PhD thesis, Adnan Menderes Univ., Turkey.
  • Özyılmaz, Ü., & Benlioğlu, K. (2013). Enhanced biological control of phytophthora blight of pepper by biosurfactant-producing pseudomonas. Plant Pathol J, 29(4), 418–426.
  • Park, J. H., Kim, R., Aslam, Z., Jeon, C. O., & Chung, Y. R. (2008). Lysobacter capsici sp. nov., with antimicrobial activity, isolated from the rhizosphere of pepper, and emended description of the genus Lysobacter. Int J Syst Evol Microbiol, 58(2), 387–392.
  • Pal, K. K., & Mc Spadden Gardener, B. (2006). Biological control of plant pathogens, the plant health instructor. http://dx.doi.org/10.1094/phi-a-2006-1117-02 Erişim tarihi 24.07.2019.
  • Pang, Z., Shao, J., Chen, L., Lu, X., Hu, J., Qin, Z., & Liu, X. (2013). Resistance to the novel fungicide pyrimorph in phytophthora capsici: risk assessment and detection of point mutations in CesA3 that confer resistance. PLoS ONE, 8(2), 1–12.
  • Parra, G., & Ristaino, J. B. (2001). Resitance to mefenoxam and metalaxil among field isolates of Phytophthora capsici causing phytophthora blight of bell peper. Plant Dis, 85, 1069–1075.
  • Pavón, C. F., Babadoost, M., & Lambert, K. N. (2008). Quantification of Phytophthora capsici oospores in soil by sieving-centrifugation and real-time polymerase chain reaction. Plant Dis, 92(1), 143–149.
  • Puopolo, G., Raio, A., & Zoina, A. (2010). Identification and charactherization of Lysobacter capsici strain PG4: A new plant health-promoting rhizobacterium. J Plant Pathol, 92(1), 157-164.
  • Qi, R., Wang, T., Zhao, W., Li, P., Ding, J., & Gao, Z. (2012). Activity of ten fungicides against Phytophthora capsici isolates resistant to metalaxyl. J. Phytopathol, 160(11–12), 717–722.
  • Robles-Yerena, L., Rodríguez-Villarreal, R. A., Ortega-Amaro, M. A., Fraire-Velázquez, S., Simpson, J., Rodríguez-Guerra, R., & Jiménez-Bremont, J. F. (2010). Characterization of a new fungal antagonist of Phytophthora capsici. Sci Hortic, 125, 248–255.
  • Sang, M. K., Chun, S. C., & Kim, K. D. (2008). Biological control of Phytophthora blight of pepper by antagonistic rhizobacteria selected from a sequential screening procedure. Biol Control, 46, 424–433.
  • Sanzani, S. M., Li Destri Nicosia, M. G., Faedda, R., Cacciola, S. O., & Schena, L. (2014). Use of quantitative PCR detection methods to study biocontrol agents and phytopathogenic fungi and oomycetes in environmental samples. J Phytopathol, 162, 1–13.
  • Schaad, N. W., Jones, J. B., & Chun, W. (2001). Laboratory Guide for Identification of Plant Pathogenic Bacteria. 3rd ed. APS Press, St. Paul Minnesota.
  • Shafi, J., Tian, H., & Ji, M. (2017). Bacillus species as versatile weapons for plant pathogens: a review. Biotechnol Biotechnol Equip, 31(3), 446–459.
  • Sopheareth, M., Chan, S., Naing, K. W., Lee, Y. S., Hyun, H. N., Kim, Y. C., & Kim, K. Y. (2013). Biocontrol of late blight (Phytophthora capsici) disease and growth promotion of pepper by Burkholderia cepacia MPC-7. Plant Pathol J, 29(1), 67–76.
  • Taylor, S., Wakem, M., Dijkman, G., Alsarraj, M., & Nguyen, M. (2010). A practical approach to RTqPCR-Publishing data that conform to the MIQE guidelines. Methods, 50(4), S1-S5.
  • Weller, D. M. (2007). Pseudomonas Biocontrol Agents of Soilborne Pathogens: Looking Back Over 30 Years. Phytopathology, 97(2), 250–256.
  • Zhang, S., Klassen, W., Mo, X., Ji, P., & Gevens, A. J. (2011). Evaluation of Acibenzolar-S-methyl and silicic acid for control of Phytophthora blight caused by Phytophthora capsici in squash. Proc Fla State Hort Soc, 124, 154–161.
  • Zhang, Z, Schwartz, S., Wagner, L., & Miller, W. (2000). A greedy algorithm for aligning DNA sequences. J. Comput Biol, 7(1-2), 203-14.
APA ÖZYILMAZ Ü (2019). Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele. , 652 - 661. 10.29133/yyutbd.597443
Chicago ÖZYILMAZ Ümit Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele. (2019): 652 - 661. 10.29133/yyutbd.597443
MLA ÖZYILMAZ Ümit Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele. , 2019, ss.652 - 661. 10.29133/yyutbd.597443
AMA ÖZYILMAZ Ü Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele. . 2019; 652 - 661. 10.29133/yyutbd.597443
Vancouver ÖZYILMAZ Ü Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele. . 2019; 652 - 661. 10.29133/yyutbd.597443
IEEE ÖZYILMAZ Ü "Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele." , ss.652 - 661, 2019. 10.29133/yyutbd.597443
ISNAD ÖZYILMAZ, Ümit. "Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele". (2019), 652-661. https://doi.org/10.29133/yyutbd.597443
APA ÖZYILMAZ Ü (2019). Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi, 29(4), 652 - 661. 10.29133/yyutbd.597443
Chicago ÖZYILMAZ Ümit Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi 29, no.4 (2019): 652 - 661. 10.29133/yyutbd.597443
MLA ÖZYILMAZ Ümit Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi, vol.29, no.4, 2019, ss.652 - 661. 10.29133/yyutbd.597443
AMA ÖZYILMAZ Ü Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi. 2019; 29(4): 652 - 661. 10.29133/yyutbd.597443
Vancouver ÖZYILMAZ Ü Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi. 2019; 29(4): 652 - 661. 10.29133/yyutbd.597443
IEEE ÖZYILMAZ Ü "Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele." Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi, 29, ss.652 - 661, 2019. 10.29133/yyutbd.597443
ISNAD ÖZYILMAZ, Ümit. "Biberde Phytophthora Yanıklığına Karşı Antagonist Bakterilerle Biyolojik Mücadele". Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi 29/4 (2019), 652-661. https://doi.org/10.29133/yyutbd.597443