Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu

Cebeci Aydın, Aysun; Doğan, Osman

Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu

Osman DOĞAN, (Erciyes Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi, Kayseri, Türkiye)

Aysun CEBECİ (Abdullah Gül Üniversitesi, Malzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Mühendisliği Bölümü, Kayseri, Türkiye)

Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi

6 2

Yıl: 2021 Cilt: 58 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 87 - 95 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 27-05-2021

Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu

Öz:

Amaç: Bu çalışma ülkemizde geleneksel yöntemlerle üretilen gıda ürünlerindenlaktik asit bakterilerinin izolasyonunu ve tanımlanmasını sağlamak amacıylayapılmıştır.Materyal ve Yöntem: Çalışma kapsamında Van otlu peynir ve ekşi hamur örneğikullanılmıştır. Bu örnekler içerdikleri laktik asit bakterileri için çalışılmış vetanımlanmaları için biyokimyasal ve PCR bazlı moleküler biyolojik tekniklere tabitutulmuşlardır. Biyokimyasal testler kapsamında örnekler, Gram reaksiyonları,katalaz aktivitesi, gaz üretimi, 10oC ve 45oC'de, %6 ve %16 NaCl konsantrasyonda,pH 4.4 ve pH 9.6’da gelişim göstermeleri açısından incelenmiştir. Moleküler biyolojideneyleri kapsamında ise tür ve suş düzeyinde tanımlama için PCR-RFLP, 16SrRNA gen dizileme ve RAPD-PCR teknikleri kullanılmıştır.Araştırma Bulguları: Bir dizi mikrobiyolojik deneylerin sonucunda 26 adet bakteripotansiyel laktik asit bakterisi olarak izole edilmiştir. Bunlardan 25 adedininLactobacillus, Pediococcus ve Enterococcus cinslerine ait olduğu tespit edilmiş vetür ve suş düzeyinde tanımlanmaları sağlanmıştır. Kalan bir adet izolat iseStaphylococcus hominis olarak tanımlanmıştır.Sonuç: Çalışmamız sonucunda 25 adet laktik asit bakterisi gen dizileme ve RAPDPCR teknikleri kullanılarak tür ve suş düzeyinde başarıyla tanımlanmıştır.

Anahtar Kelime:

Isolation of lactic acid bacteria from some traditional Turkish foods

Öz:

Objective: The objective of this study was to isolate and identify lactic acid bacteria from traditionally produced food samples in Turkey. Material and Methods: Traditional sourdough and herb cheese sample were used for the study. The samples were studied to determine their lactic acid bacteria content, and subjected to biochemical and PCR-based molecular biology techniques for identification and typing purposes. The samples were studied for their Gram reaction, catalase activity, gas production, growth at 10o C and 45o C, 6% and 16% NaCl and pH 4.4 and pH 9.6 for the biochemical tests. For the molecular biology experiments, PCR-RFLP, 16S rRNA gene sequencing and RAPD-PCR were performed to identify organisms at the species and strain level. Results: Upon completion of a series of microbiology experiments, a total of 26 potential lactic acid bacteria were isolated. Among those, 25 of them belonged to the genera Lactobacillus, Pediococcus and Enterococcus they were further identified at species and strain level. The remaining isolate was identified as Staphylococcus hominis. Conclusion: Identification of 25 lactic acid bacteria at species and strain level was successfully achieved using gene sequencing and RAPD-PCR.

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

Amaral, D.M.F., L.F. Silva, S.N. Casarotti, L.C.S. Nascimento and A.L.B. Penna. 2017. Enterococcus faecium and Enterococcus durans isolated from cheese: Survival in the presence of medications under simulated gastrointestinal conditions and adhesion properties. Journal of Dairy Science, 100 (2): 933–949.
Bakırcı F. ve Köse E. 2017. Ekşi Hamurlardan Laktik Asit Bakterileri ve Mayaların İzolasyonu ve Tanımlanması. Akademik Gıda, 15 (2): 149-154.
Barbosa, J., S. Borges, and P. Teixeira. 2015. Pediococcus acidilactici as a potential probiotic to be used in food industry. International Journal of Food Science & Technology, 50 (5): 1151–1157.
Cebeci, A., and G.C. Gürakan. 2008. Molecular methods for identification of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus and Streptococcus thermophilus using methionine biosynthesis and 16S rRNA genes. Journal of Dairy Research, 75 (04): 392.
Cebeci, A., and G.C. Gürakan. 2011. Comparative typing of L. delbrueckii subsp. bulgaricus strains using multilocus sequence typing and RAPD–PCR. European Food Research and Technology, 233 (3): 377–385.
Coton, E., M.H. Desmonts, S. Leroy, M. Coton, E. Jamet, S. Christieans and R. Talon. 2010. Biodiversity of Coagulase-Negative Staphylococci in French cheeses, dry fermented sausages, processing environments and clinical samples. International Journal of Food Microbiology, 137 (2-3): 221–229.
Esteve-Zarzoso, B., C. Belloch, F. Uruburu, and A. Querol. 1999. Identification of yeasts by RFLP analysis of the 5.8S rRNA gene and the two ribosomal internal transcribed spacers. International Journal of Systematic Bacteriology, 49 (1): 329–337.
Ferguson, R. M. W., D. L. Merrifield, G. M. Harper, M. D. Rawling, S. Mustafa, S. Picchietti, S. J. Davies. 2010. The effect of Pediococcus acidilactici on the gut microbiota and immune status of on-growing red tilapia (Oreochromis niloticus). Journal of Applied Microbiology, 109 (3): 851–862.
Gelsomino, R., M., Vancanneyt, T.M., Cogan, S., Condon and J. Swings. 2002. Source of Enterococci in a Farmhouse Raw-Milk Cheese. Applied and Environmental Microbiology, 68 (7): 3560–3565.
Gezginç, Y. ve İ. Akyol. 2010. Geleneksel Yoğurtlardan İzole Edilen Streptococcus thermophilus ve Lactobacillus bulgaricus’ların Tanımlanması. KSÜ Doğa Bilimleri Dergisi, 13 (2): 23–29.
Gül H., Özçelik S., Sağdıç O. and Certel M. 2005. Sourdough bread production with lactobacilli and S. cerevisiae isolated from sourdoughs. Process Biochemistry, 40 (2): 691-697.
İnoğlu, Z.N., and Y. Tuncer. 2013. Safety Assessment of Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis Strains Isolated from Turkish Tulum Cheese. Journal of Food Safety, 33 (3): 369–377.
İşleyici Ö. ve Akyüz N. 2009. Van İlinde Satışa Sunulan Otlu Peynirlerde Mikrofloranın ve Laktik Asit Bakterilerinin Belirlenmesi. YYU Veteriner Fakultesi Dergisi, 20 (2): 59-64.
Kabak, B. and A.D.W. Dobson. 2011. An Introduction to the Traditional Fermented Foods and Beverages of Turkey. Critical Reviews in Food Science and Nutrition, 51 (3): 248–260.
Kesenkaş H., Ö., Kınık, K., Seçkin, P., Günç Ergönül, E., Akan E. 2016. Keçi Sütünden Üretilen Sinbiyotik Beyaz Peynirde Enterococcus faecium, Bifidobacterium longum ve Lactobacillus paracasei ssp. paracasei Sayılarının Değişimi. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 53 (1): 75-81.
Leroy, F. and L. De Vuyst. 2004. Lactic acid bacteria as functional starter cultures for the food fermentation industry. Trends in Food Science & Technology, 15 (2): 67–78.
Pauer, H., T. Glatthardt, N.V. Ferreira, R.B.R. Ferreira, and L.C.M. Antunes. 2019. Bioactive Molecules of the Human Microbiome. Microbiome and Metabolome in Diagnosis, Therapy, and Other Strategic Applications, 115–125.
Ruiz, A., M. Poblet, A. Mas, and J. M. Guillamon. 2000. Identification of acetic acid bacteria by RFLP of PCRamplified 16S rDNA and 16S--23S rDNA intergenic spacer. International Jounal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 50 (6): 1981–1987.
Sağdıç O., Şimşek B., and Küçüköner E. 2003. Microbiological and physicochemical characteristics of Van herby cheese, a traditional Turkish dairy product. Milchwissenschaft 58 (7): 382-385.
Santos K.M.O., A.D.S. Vieira, H.O. Salles, J.S. Oliveira, C.R.C. Rocha, M.F. Borges and S.D. Todorov. 2015. Safety, beneficial and technological properties of Enterococcus faecium isolated from Brazilian cheeses. Brazilian Journal of Microbiology, 46 (1): 237–249.
Sengun, I.Y., D.S. Nielsen, M. Karapinar, and M. Jakobsen. 2009. Identification of lactic acid bacteria isolated from Tarhana, a traditional Turkish fermented food. International Journal of Food Microbiology, 135 (2): 105–111.
Taghi-Zadeh, A. and F. Nejati. 2017. Screening of Lactic Acid Bacteria Isolated from Iranian sourdoughs for Antifungal Activity: Enterococcus faecium showed the Most Potent Antifungal Activity in Bread. Applied Food Biotechnology, 4 (4): 219-227.
Takata, K., M. Kinoshita, T. Okuno, M. Moriya, T. Kohda, J.A. Honorat and Y. Nakatsuji. 2011. The Lactic Acid Bacterium Pediococcus acidilactici Suppresses Autoimmune Encephalomyelitis by Inducing IL-10-Producing Regulatory T Cells. PLoS ONE, 6 (11): e27644.
Tekinsen K.K. and Ozdemir Z. 2006. Prevalence of foodborne pathogens in Turkish Van otlu (Herb) cheese. Food Control, 17 (9): 707-711.
Tan, Q., H. Xu, Z.P. Aguilar, S. Peng, S. Dong, B. Wang and H. Wei. 2013. Safety Assessment and Probiotic Evaluation of Enterococcus faecium YF5 Isolated from Sourdough. Journal of Food Science, 78 (4): M587–M593.

APA	Doğan O, Cebeci Aydın A (2021). Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu. , 87 - 95.
Chicago	Doğan Osman,Cebeci Aydın Aysun Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu. (2021): 87 - 95.
MLA	Doğan Osman,Cebeci Aydın Aysun Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu. , 2021, ss.87 - 95.
AMA	Doğan O,Cebeci Aydın A Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu. . 2021; 87 - 95.
Vancouver	Doğan O,Cebeci Aydın A Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu. . 2021; 87 - 95.
IEEE	Doğan O,Cebeci Aydın A "Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu." , ss.87 - 95, 2021.
ISNAD	Doğan, Osman - Cebeci Aydın, Aysun. "Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu". (2021), 87-95.

APA	Doğan O, Cebeci Aydın A (2021). Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 58(1), 87 - 95.
Chicago	Doğan Osman,Cebeci Aydın Aysun Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi 58, no.1 (2021): 87 - 95.
MLA	Doğan Osman,Cebeci Aydın Aysun Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, vol.58, no.1, 2021, ss.87 - 95.
AMA	Doğan O,Cebeci Aydın A Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi. 2021; 58(1): 87 - 95.
Vancouver	Doğan O,Cebeci Aydın A Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi. 2021; 58(1): 87 - 95.
IEEE	Doğan O,Cebeci Aydın A "Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu." Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 58, ss.87 - 95, 2021.
ISNAD	Doğan, Osman - Cebeci Aydın, Aysun. "Bazı geleneksel Türk gıdalarından laktik asit bakterilerinin izolasyonu". Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi 58/1 (2021), 87-95.