İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması
Yıl: 2020 Cilt: 54 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 619 - 628 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/mb.70062 İndeks Tarihi: 29-07-2022
İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması
Öz: Sitomegalovirüs (CMV), sağlıklı bireylerde asemptomatik seyreden ancak transplantasyon hastaları ve kazanılmış immün yetmezlik sendromlu (AIDS) hasta gruplarında ciddi mortalite ve morbiditeye sebep olan bir virüstür. Gansiklovir (GCV), CMV’ye bağlı enfeksiyonlarda morbidite ve mortaliteyi belirgin bir şekilde azaltan ve tedavide ilk tercih olarak kullanılan bir nükleozit analoğudur. GCV, insanda CMV hasta-lığının tedavisinde etkinliği gösterilmiş ilk ilaç olup, aynı zamanda asiklovirle homologtur. CMV hastalığını önlemek veya tedavi etmek için uzun süreli antiviral tedavi gereklidir, ancak bu durum direnç gelişimini beraberinde getirmektedir. CMV’de görülen antiviral direnç oranı %8-14 olarak bildirilmektedir. CMV izolatlarında GCV direnci en sık olarak UL97 kinaz gen bölgesinde görülmektedir. Bu çalışmada, immün yetmezliği olan hastalardan elde edilen CMV izolatlarında GCV direncinin araştırılması amaçlanmıştır. Hematoloji servisinde takip edilen 20 çocuk, 29 erişkin toplam 49 hasta çalışmaya dahil edilmiştir. CMV DNA viral yükü ≥ 103 kopya/ml olan 49 hastadan elde edilen 53 örnek GCV direnci yönünden incelenmiş-tir. Çalışmada UL97 gen bölgesinin, 674 baz çifti (bp) büyüklüğündeki kısmında 3500 Abi Prism Genetik Analiz cihazı (Applied Biosystems, Thermo Fisher Scientific, ABD) kullanılarak yapılan Sanger dizi analizi yöntemiyle DNA dizileri belirlenmiştir. Bu yöntemle değerlendirilemeyen örneklere yeni nesil dizileme (NGS) yöntemi uygulanmıştır. Sanger yöntemi ile 53 örneğin 35 (%66)’inde GCV direnci saptanma-mıştır. Üç hastada ise C592G, C607S ve M460I GCV direnç mutasyonu tespit edilmiştir. Diziler karışık olduğundan, 15 örnekte Sanger ile direnç değerlendirilememiş ve NGS ile çalışılan bu örneklerde direnç saptanmamıştır. Toplam 49 hastanın 3 (%6.1)’ünde antiviral direnç mutasyonu saptanmıştır. Çalışmaya dahil edilen 20 hastada, literatürde bildirilen ve fenotipik testlerle ilaçlara duyarlı olduğu belirlenen üç varyant sekans (A442G, C592F, A427V) ile literatürde bildirilmeyen 78 varyant sekans saptanmıştır. Sonuç olarak, antiviral direnç saptanması hastaların takibinde önemli olup, tedavinin planlanmasında klinisyeni yönlendirmektedir. Sanger yöntemi ile değerlendirilemeyen örneklerin NGS ile çalışılması gerektiği ve ilk defa saptanan varyant sekansların ilaç direncindeki rolünün belirlenmesi için daha ileri çalışmalara ihtiyaç olduğu sonucuna varılmıştır.
Anahtar Kelime: Investigation of Ganciclovir Resistance in Cytomegalovirus Strains Obtained from Immunocompromised Patients
Öz: CMV is a virus that is asymptomatic in healthy individuals but can cause serious mortality and mor-bidity in transplant patients and patients with acquired immunodeficiency syndrome (AIDS). Ganciclovir (GCV) is a nucleoside analog that significantly reduces morbidity and mortality in CMV-related infections and is used as the first choice in treatment. It is the first drug shown to be effective in the treatment of CMV disease in humans, and is also homologous to acyclovir. Long-term antiviral therapy is required to prevent or treat CMV disease, but this can cause antiviral resistance which was reported to be 8-14% in CMV. In CMV strains, GCV resistance is most common in the UL97 kinase gene region. The aim of this study was to investigate GCV resistance in CMV strains obtained from the patients with immune defi-ciency. A total of 49 patients, including 20 children, 29 adults, who were followed in the department of hematology were included in the study. Fifty-three samples from 49 patients with CMV DNA viral load ≥ 103 copies/ml were examined for GCV resistance. In the study, DNA sequences were determined by Sanger sequence analysis method 3500 Abi Prism Genetic Analyser (Applied Biosystems, Thermo Fisher Scientific, USA) in the 674 bp part of the UL97 gene region. The next generation sequencing (NGS) method was applied to the samples that could not be evaluated with this method. GCV resistance was not detected in 35 (66%) of 53 samples with the Sanger method. C592G, C607S and M460I GCV re-sistance mutation was detected in three patients. Since the sequences were mixed, resistance analysis could not be evaluated with Sanger in 15 patient samples and the resistance was not detected in these samples studied with NGS. Antiviral resistance mutation was detected in three of 49 patients (6.1%). In 20 patients included in the study, three variant sequences (A442G, C592F, A427V) reported in the liter-ature and determined to be sensitive to drugs by phenotypic tests and 78 variant sequences that were not reported in the literature were detected. As a result, the detection of antiviral resistance is important in the follow-up of the patients and guides the clinician in planning of the treatment. It was concluded that the samples that could not be evaluated with the Sanger method should be studied with NGS and further studies are needed to determine the role of the variant sequences detected for the first time in drug resistance.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Kısa Bildiri Erişim Türü: Bibliyografik
- 1. Chen K, Cheng MP, Hammond SP, Einsele H, Marty FM. Antiviral prophylaxis for Cytomegalovirus infection in allogeneic hematopoietic cell transplantation. Blood Adv 2018;(16):2159-75.
- 2. Razonable RR. Drug-resistant Cytomegalovirus: clinical implications of specific mutations. Curr Opin Organ Transpl 2018;23(4):388-94.
- 3. Chaer FE, Shah DP, Chemaly RF. How I treat resistant Cytomegalovirus infection in hematopoietic cell transplantation recipients. Blood 2016;128(23):2624-36.
- 4. Razonable RR, Humar A. Cytomegalovirus in solid organ transplant recipients- guidelines of the American society of transplantation infectious diseases community of practice. Clin Transplant 2019;33(9):e13512.
- 5. Aslani HR, Ziaie S, Salamzadeh J, Zaheri S, Samadia F, Tehrani SM. Incidence of ganciclovir resistance in CMV-positive renal transplant recipients and its association with UL97 gene mutations. Iran J Pharm Res 2017;16(2):805-10.
- 6. Chou S, Ercolani RJ, Vanarsdall AL. Differentiated levels of ganciclovir resistance conferred by mutations at codons 591 to 603 of the Cytomegalovirus UL97 kinase gene. J Clin Microbiol 2017;55(7):2098-104.
- 7. Hosseini SM, Nemati E, Behzadian F, Einollahi B, Petrudy AR, Sohraby M, et al. Evaluation of ganciclovir resistance in Cytomegalovirus infection of renal transplant recipients in Tehran. Transplant Proc 2015;47(4):1140-2.
- 8. Arellano-Galindo J, Vázquez-Meraz E, Jiménez-Hernández E, Velazquez-Guadarrama N, Mikeler E, Hamprecht K, et al. The role of Cytomegalovirus infection and disease in pediatric bone marrow transplant recipients in Mexico City in the context of viral drug resistance. Pediatr Transplant 2011;15(1):103-11.
- 9. Kim YJ, Boeckh M, Cook L, Stempel H, Jerome KR, Boucek R Jr, et al. Cytomegalovirus infection and ganciclovir resistance caused by UL97 mutations in pediatric transplant recipients. Transpl Infect Dis 2012;14(6):611-7.
- 10. Zeytinoğlu A, Turhan A, Keskinoglu A, Aksoylar S, Dincel N, Deveci B, et al. The first two ganciclovir resistant Cytomegalovirus isolates from kidney and pediatric stem cell transplant recipients in Turkey. J Immunol Clin Microbiol 2016;1(3):1-4.
- 11. Delice S, Gökahmetoğlu S, Kaynar L, Karakükcü M. Gansiklovir tedavisi alan immün yetmezlikli hastalarda, CMV UL54 ve UL97 gen bölgelerinde gansiklovir direncinin araştırılması. Mikrobiyol Bul 2015;49(3):393- 402.
- 12. Arslan F, Tabak F, Avşar E, Midilli K, Mert A, Ozaras R, et al. Ganciclovir-resistant Cytomegalovirus encephalitis in a hematopoietic stem cell transplant recipient. J Neurovirol 2010;16(2):174-8.
- 13. Chou S, Bowlin TL. Cytomegalovirus UL97 mutations affecting cyclopropavir and ganciclovir susceptibility. Antimicrob Agents Chemother 2011;55(1):382-4.
- 14. Choi SH, Hwang JY, Park KS, Kim Y, Lee SH, Yoo KH, et al. The impact of drug-resistant Cytomegalovirus in pediatric allogeneic hematopoietic cell transplant recipients: a prospective monitoring of UL97 and UL54 gene mutations. Transpl Infect Dis 2014;16(1):919-29.
- 15. Campanini G, Zavattoni M, Cristina E, Gazzolo D, Stronati M, Baldanti F. Multiple ganciclovir-resistant strains in a newborn with symptomatic congenital human Cytomegalovirus infection. J Clin Virol 2012;54(1):86-8.
- 16. Lopez-Aladid R, Guiu A, Mosquera M, Lopez-Medrano F, Cofan F, Linares L, et al. Improvement in detecting Cytomegalovirus drug resistance mutations in solid organ transplant recipients with suspected resistance using next generation sequencing. PloS ONE 2019;14(7):1-13.
- 17. Garrigue I, Moulinas R, Pinson-Recordon P, Delacour ML, Essig M, Kaminski H, et al. Contribution of next generation sequencing to early detection of Cytomegalovirus UL97 emerging mutants and viral subpopulations analysis in kidney transplant recipients. J Clin Virol 2016:80(1):74-81.
- 18. Guermouche H, Burrel S, Mercier-Darty M, Kofman T, Rogier O, Pawlotsky JM, et al. Characterization of the dynamics of human Cytomegalovirus resistance to antiviral drugs by ultra-deep sequencing. Antivir Res 2020;173 :104647.
| APA | COŞKUN A, gökahmetoğlu s, ÇEVİK Ş, ÖZMEN P, Karakukcu M, Kaynar L, Midilli K, KUSKUCU M (2020). İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması. , 619 - 628. 10.5578/mb.70062 |
| Chicago | COŞKUN AYŞENUR,gökahmetoğlu selma,ÇEVİK ŞERİFE,ÖZMEN PELİN,Karakukcu Musa,Kaynar Leylagul,Midilli Kenan,KUSKUCU MERT AHMET İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması. (2020): 619 - 628. 10.5578/mb.70062 |
| MLA | COŞKUN AYŞENUR,gökahmetoğlu selma,ÇEVİK ŞERİFE,ÖZMEN PELİN,Karakukcu Musa,Kaynar Leylagul,Midilli Kenan,KUSKUCU MERT AHMET İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması. , 2020, ss.619 - 628. 10.5578/mb.70062 |
| AMA | COŞKUN A,gökahmetoğlu s,ÇEVİK Ş,ÖZMEN P,Karakukcu M,Kaynar L,Midilli K,KUSKUCU M İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması. . 2020; 619 - 628. 10.5578/mb.70062 |
| Vancouver | COŞKUN A,gökahmetoğlu s,ÇEVİK Ş,ÖZMEN P,Karakukcu M,Kaynar L,Midilli K,KUSKUCU M İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması. . 2020; 619 - 628. 10.5578/mb.70062 |
| IEEE | COŞKUN A,gökahmetoğlu s,ÇEVİK Ş,ÖZMEN P,Karakukcu M,Kaynar L,Midilli K,KUSKUCU M "İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması." , ss.619 - 628, 2020. 10.5578/mb.70062 |
| ISNAD | COŞKUN, AYŞENUR vd. "İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması". (2020), 619-628. https://doi.org/10.5578/mb.70062 |
| APA | COŞKUN A, gökahmetoğlu s, ÇEVİK Ş, ÖZMEN P, Karakukcu M, Kaynar L, Midilli K, KUSKUCU M (2020). İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, 54(4), 619 - 628. 10.5578/mb.70062 |
| Chicago | COŞKUN AYŞENUR,gökahmetoğlu selma,ÇEVİK ŞERİFE,ÖZMEN PELİN,Karakukcu Musa,Kaynar Leylagul,Midilli Kenan,KUSKUCU MERT AHMET İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni 54, no.4 (2020): 619 - 628. 10.5578/mb.70062 |
| MLA | COŞKUN AYŞENUR,gökahmetoğlu selma,ÇEVİK ŞERİFE,ÖZMEN PELİN,Karakukcu Musa,Kaynar Leylagul,Midilli Kenan,KUSKUCU MERT AHMET İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.54, no.4, 2020, ss.619 - 628. 10.5578/mb.70062 |
| AMA | COŞKUN A,gökahmetoğlu s,ÇEVİK Ş,ÖZMEN P,Karakukcu M,Kaynar L,Midilli K,KUSKUCU M İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2020; 54(4): 619 - 628. 10.5578/mb.70062 |
| Vancouver | COŞKUN A,gökahmetoğlu s,ÇEVİK Ş,ÖZMEN P,Karakukcu M,Kaynar L,Midilli K,KUSKUCU M İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması. Mikrobiyoloji Bülteni. 2020; 54(4): 619 - 628. 10.5578/mb.70062 |
| IEEE | COŞKUN A,gökahmetoğlu s,ÇEVİK Ş,ÖZMEN P,Karakukcu M,Kaynar L,Midilli K,KUSKUCU M "İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması." Mikrobiyoloji Bülteni, 54, ss.619 - 628, 2020. 10.5578/mb.70062 |
| ISNAD | COŞKUN, AYŞENUR vd. "İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması". Mikrobiyoloji Bülteni 54/4 (2020), 619-628. https://doi.org/10.5578/mb.70062 |
