İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi

Parlak, Mehmet; BATUR, Muhammed; ÖLMEZ, Serpil; Guducuoglu, Huseyin; Otlu, Baris

doi:10.5578/mb.69286

İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi

Mehmet PARLAK, (Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Van, Türkiye.)

Muhammed BATUR, (Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tıp Fakültesi Göz Hastalıkları Anabilim Dalı, Van, Türkiye.)

Serpil ÖLMEZ, (Yüksekova Devlet Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Hakkari, Türkiye.)

Hüseyin GÜDÜCÜOĞLU, (Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Van, Türkiye.)

Barış OTLU (İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Malatya, Türkiye)

Mikrobiyoloji Bülteni

1 0

Yıl: 2020 Cilt: 54 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 235 - 245 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/mb.69286 İndeks Tarihi: 07-10-2021

İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi

Öz:

Doğada bulunan ve tümörijenik bitki hastalıklarına neden olan Rhizobium radiobacter, özellikle alttayatan hastalığı olan kişilerde fırsatçı enfeksiyonlara neden olabilmektedir. Çalışmamızda Göz HastalıklarıKliniğinde intravitreal ranibizumab enjeksiyonu sonrasında R.radiobacter bakterisinin etken olduğu 10hastada ortaya çıkan endoftalmit olguları mikrobiyolojik açıdan irdelenmiştir. Van Yüzüncü Yıl ÜniversitesiTıp Fakültesi Göz Hastalıkları Kliniğinden Mikrobiyoloji Laboratuvarına 21.12.2016 tarihinde intravitrealranibizumab enjeksiyonu yapılmış olan 13 hastaya ait vitreus sıvısı örnekleri mikrobiyolojik açıdan incelenmesi amacıyla gönderilmiştir. Örnekler Gram boyama ile boyanıp mikroskop altında incelenmiş ve%5 koyun kanlı agar ile “Eosin Methylene Blue (EMB)” agara ekimi yapılmıştır. Besiyerleri %5 CO2’liortamda, 37°C’de 18-24 saat inkübasyona bırakılmış ve üreyen kolonilere katalaz, oksidaz ve üreaz testleri yapılmıştır. Vitreus sıvısı örneklerinde üreyen bakteriler BD Phoenix (Becton Dickinson, ABD), Vitek 2Compact (BioMerieux, Fransa) ve Vitek MS (BioMerieux, Fransa) sistemleri ile tanımlanmış ve antibiyotikduyarlılık testleri yapılmıştır. Ayrıca izolatlara 16S rDNA dizi analizi yapılmış ve izolatlar arasındaki klonalilişkinin tespiti için “pulsed field gel electrophoresis (PFGE)” yöntemi uygulanmıştır. Kültürlerde üremesaptandıktan sonra (işlemden bir gün sonra) işlemin yapıldığı alanda bulunan eşyalardan, tıbbi alet vegereçlerden, sağlık çalışanlarının ellerinden ve yeni enjeksiyon çözeltisinden kültür örnekleri alınmıştır.On üç hastaya ait vitreus sıvısı örneklerinin 10’unun kültüründe R.radiobacter üremesi olurken 3'ündebakteri üremesi saptanmamıştır. Mikroskobik incelemede mikroorganizmanın gram-negatif basil olduğugörülmüş ve izolatların R.radiobacter ile uyumlu olarak, nonfermenter, hareketli, katalaz/oksidaz/üreazpozitif olduğu saptanmıştır. İzolatların tamamı, BD Phoenix (Becton Dickinson, ABD), Vitek 2 Compact (BioMerieux, Fransa) ve Vitek MS (BioMerieux, Fransa) (database v2.0) otomatize sistemlerinin 3'ü ile deR.radiobacter olarak tanımlanmıştır. R.radiobacter izolatları; ampisilin, amoksisilin-klavulonik asit, trimetoprim-sülfametoksazol, sefotaksim ve seftazidime dirençli; sefuroksim, sefepim, amikasin, gentamisin,imipenem, meropenem, siprofloksasin, levofloksasin, piperasilin-tazobaktama duyarlı bulunmuştur. 16SrDNA dizi analizi ile izolatlar R.radiobacter olarak tanımlanmıştır. PFGE sonucunda izolatların tamamınınaynı bant profiline sahip olduğu görülmüştür. Aynı bant profiline sahip R.radiobacter izolatları muhtemelolarak aynı kaynaktan bulaş olduğunu ortaya koymaktadır. Ancak işlemin yapıldığı alanda bulunan eşyalardan, tıbbi alet ve gereçlerden, sağlık personelinin ellerinden ve yeni enjeksiyon çözeltisinden yapılankültürlerde R.radiobacter üremesi saptanamamış ve etkenin kaynağı belirlenememiştir. Elde edilen sonuçlar, intravitreal enjeksiyon işleminin R.radiobacter enfeksiyonu açısından risk taşıdığını göstermektedir.Buna göre, işlemden önce ve işlem esnasında dezenfeksiyon ve antisepsi şartlarının sağlanması bu gibienfeksiyonların önlenmesi açısından önem taşımaktadır. Bu çalışma, R.radiobacter endoftalmitinde aynısuşun neden olduğu ilk epidemik salgın ve intravitreal enjeksiyon sonrası R.radiobacter’in etken olarakbildirildiği ikinci makaledir.

Anahtar Kelime:

The Microbiological Analysis of a Rhizobium radiobacter Outbreak After Intravitreal Injection

Öz:

Rhizobium radiobacter, which is found in nature and causes tumorigenic plant diseases can lead to opportunistic infections, especially in people with underlying diseases. In our study, endophthalmitis that observed in ten patients caused by R.radiobacter bacteria after intravitreal ranibizumab injection in Ophthalmology Clinic were examined microbiologically. Vitreous fluid samples of 13 patients who received intravitreal ranibizumab injection were sent to the Microbiology Laboratory from Van Yuzuncu Yil University Faculty of Medicine’s Ophthalmology Clinic for microbiological examination in December 21, 2016. Samples were examined under microscope after staining with Gram and cultured with 5% sheep blood agar and Eosin Methylene Blue (EMB) agar. The culture plates were incubated for 18-24 hours at 37°C in 5% CO2. At the end of this period, catalase, oxidase, and urease tests were performed on the colonies. The identification and antibiotic susceptibility tests of microorganisms growing in vitreous fluid samples were performed using BD Phoenix (Becton Dickinson, USA), Vitek 2 Compact (BioMerieux, France), and Vitek MS (BioMerieux, France) systems. In addition, 16S rDNA sequence analysis was performed and the pulsed field gel electrophoresis (PFGE) method was used to determine the clonal relationship between the isolates. After growing in cultures (one day after the procedure), culture samples were collected from the objects, medical tools and equipment, hands of healthcare staff and a new injection solution in the area where the procedure was performed. R.radiobacter was isolated in 10 of the vitreous fluid samples of 13 patients, and no bacterial growth was detected in 3. The microorganisms were found to be gram-negative bacilli, non-fermenter, motile, catalase/oxidase/urease positive, in compliance with R.radiobacter. All isolates were identified as R.radiobacter by BD Phoenix (Becton Dickinson, USA), Vitek 2 Compact (BioMerieux, France), and Vitek MS (BioMerieux, France) (database v2.0) systems. R.radiobacter isolates were found to be resistant to ampicillin, amoxicillin/clavulanate, trimethoprim/ sulfamethoxazole, cefotaxime and ceftazidime; susceptible to cefuroxime, cefepime, amikacin, gentamicin, imipenem, meropenem, ciprofloxacin, levofloxacin and piperacillin/tazobactam. The isolates were identified as R.radiobacter by 16S rDNA sequence analysis. PFGE showed that all isolates had the same band profile. R.radiobacter isolates with the same band profile likely revealed that the contamination was from the same source. However, the growth of R.radiobacter was not detected in the cultures made from the objects, medical instruments and supplies, the hands of healthcare professionals and the new injection solution in the area where the procedure was performed, and the source of the agent could not be determined. The results have shown that intravitreal injection procedure carries a risk for R.radiobacter infection. Disinfection and antisepsis conditions, before and during the procedure, is important for the prevention of such infections. This study is the first epidemic outbreak report of endophthalmitis caused by the same strain of R.radiobacter and the second article in which R.radiobacter was reported as the cause of endophthalmitis after intravitreal injection.

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Diğer Erişim Türü: Bibliyografik

1. Young JM, Kuykendall LD, Martinez-Romero E, Kerr A, Sawada H. Classification and nomenclature of Agrobacterium and Rhizobium. Int J Syst Evol Microbiol 2003; 53(5): 1689-95.
2. Kersters K, de Ley J. Genus III. Agrobacterium Conn 1942, 359AL, pp: 244-54. In: Krieg NR, Holt JG, eds. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. 1984, vol 1. Baltimore, Williams and Wilkins.
3. Young JM, Kuykendall LD, Martinez-Romero E, Kerr A, Sawada H. A revision of Rhizobium Frank 1889, with an emended description of the genus, and the inclusion of all species of Agrobacterium Conn 1942 and Allorhizobium undicola de Lajudie et al. 1998 as new combinations: Rhizobium radiobacter, R.rhizogenes, R.rubi, R.undicola and R.vitis. Int J Syst Evol Microbiol 2001; 51(Pt 1): 89-103.
4. Namdari H, Hamzavi S, Peairs RR. Rhizobium (Agrobacterium) radiobacter identified as a cause of chronic endophthalmitis subsequent to cataract extraction. J Clin Microbiol 2003; 41(8): 3998-4000.
5. Paphitou NI, Rolston KV. Catheter-related bacteremia caused by Agrobacterium radiobacter in a cancer patient: case report and literature review. Infection 2003; 31: 421-4. 6. Plotkin GR. Agrobacterium radiobacter prosthetic valve endocarditis. Ann Intern Med 1980; 93(6): 839-40.
7. Owensby JE, Elliott S, Tu K, Hernandez JE. Cellulitis and myositis caused by Agrobacterium radiobacter and Haemophilus parainfluenzae after influenza virus vaccination. South Med J 1997; 90(7): 752-4.
8. Edmond MB, Riddler SA, Baxter CM, Wicklund BM, Pasculle AW. Agrobacterium radiobacter: a recently recognized opportunistic pathogen. Clin Infect Dis 1993; 16(3): 388-91.
9. Miller MJ, Novy C, Hiott M. Case of bacterial endophthalmitis caused by an Agrobacterium radiobacter-like organism. J Clin Microbiol 1996; 34(12): 3212-3.
10. Moreau-Gaudry V, Chiquet C, Boisset S, Croize J, Benito Y, Cornut PL, et al. Three cases of post-cataract surgery endophthalmitis due to Rhizobium (Agrobacterium) radiobacter. J Clin Microbiol 2012 ;50(4): 1487- 90.
11. Pierre-Filho PT, Ribeiro AP, Passos ED, Torigoe M, de Vasconcellos JP. Endophthalmitis caused by Agrobacterium radiobacter. Scand J Infect Dis 2003; 35(6-7): 410-1.
12. Alnor D, Frimodt-Moller N, Espersen F, Frederiksen W. Infections with the unusual human pathogens Agrobacterium species and Ochrobactrum anthropi. Clin Infect Dis 1994; 18(6): 914-20.
13. Butler SL, Doherty CJ, Hughes JE, Nelson JW, Govan JR. Burkholderia cepacia and cystic fibrosis: do natural environments present a potential hazard? J Clin Microbiol 1995; 33(4): 1001-4.
14. Landron C, Le Moal G, Roblot F, Grignon B, Bonnin A, Becq-Giraudon B. Central venous catheter-related infection due to Agrobacterium radiobacter: a report of 2 cases. Scand J Infect Dis 2002; 34(9): 693-4.
15. Detrait M, D’Hondt L, Andre M, Lonchay C, Holemans X, Maton JP, et al. Agrobacterium radiobacter bacteremia in oncologic and geriatric patients: presentation of two cases and review of the literature. Int J Infect Dis 2008; 12(6): e7-10.
16. Chen CY, Hansen KS, Hansen LK. Rhizobium radiobacter as an opportunistic pathogen in central venous catheter-associated bloodstream infection: case report and review. J Hosp Infect 2008; 68(3): 203-7.
17. Karadeniz A, Aydemir HA, Uyanık MH, Uyanık A, Çankaya E. A rare agent of continuous ambulatory peritoneal dialysis peritonitis: Rhizobium radiobacter. Saudi J Kidney Dis Transpl 2019; 30(1): 250-3.
18. Halas R, Jacob C, Badwal K, Mir R. Rare case of Rhizobium radiobacter bioprosthetic mitral valve endocarditis. IDCases 2017; 10: 88-90.
19. Pinerua-Gonsalvez JF, Zambrano-Infantinot R, Calcano C, Montano C, Fuenmayor Z, Rodney H, et al. Infective endocarditis by Rhizobium radiobacter: a case report. Invest Clin 2013; 54: 68-73.
20. Romano L, Spanu T, Calista F, Zappacosta B, Mignogna S, Sali M, et al. Tsukamurella tyrosinosolvens and Rhizobium radiobacter sepsis presenting with septic pulmonary emboli. Clin Microbiol Infect 2011; 17(7): 1049-52.
21. Wang DL, Zhao LD, Li LJ, Zhou MJ. Septic shock caused by Rhizobium radiobacter in an elderly woman: a case report. Medicine (Baltimore) 2019; 98(49): e18267.
22. Alos JI, de Rafael L, Gonzalez-Palacios R, Aguiar JM, Allona A, Baquero F. Urinary tract infection probably caused by Agrobacterium radiobacter. Eur J Clin Microbiol 1985; 4(6): 596-7.
23. Fenner BJ, Kumar A, Tan NYQ, Ang M. Case of isolated Rhizobium radiobacter contact lens-related infectious keratitis: a plant microbe now emerging as a human pathogen. Am J Ophthalmol Case Rep 2019; 15: 100476.
24. Al-Abdullah AA, Al-Falah M, Al-Rashaed S, Khandekar R, Arevalo JF. Endophthalmitis caused by Rhizobium radiobacter after posterior chamber phakic intraocular lens implantation to correct myopia. J Refract Surg 2015; 31(8): 561-3.
25. Joshi L, Morarji J, Tomkins-Netzer O, Lightman S, Taylor SRJ. Rhizobium radiobacter endophthalmitis following Intravitreal ranibizumab injection. Case Rep Ophthalmol 2012; 3(3): 283-5.
26. Dhatariya K, Gooday C, Morrow D, Murchison R, Turner J, Hutchinson R, et al. Rhizobium radiobacter wound infection in a patient with diabetes-fact, factitious or justplain unlucky? QJM 2012; 105(4): 365-8.
27. Sen V, Sen P, Sahin MO. Fournier gangrene due to Rhizobium radiobacter. Pak J Med Sci 2018; 34(4): 1027-9. 28. Pereira LA, Chan DS, Ng TM, Lin R, Jureen R, Fisher DA, et al. Pseudo-outbreak of Rhizobium radiobacter infection resulting from laboratory contamination of saline solution. J Clin Microbiol 2009; 47(7): 2256-9.
29. Lai CC, Teng LJ, Hsueh PR, Yuan A, Tsai KC, Tang JL, et al. Clinical and microbiological characteristics of Rhizobium radiobacter infections. Clin Infect Dis 2004; 38(1): 149-53.
30. Amaya RA, Edwards MS. Agrobacterium radiobacter bacteremia in pediatric patients: case report and review. Pediatr Infect Dis J 2003; 22(2): 183-6.

APA	Parlak M, BATUR M, ÖLMEZ S, Guducuoglu H, Otlu B (2020). İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi. , 235 - 245. 10.5578/mb.69286
Chicago	Parlak Mehmet,BATUR Muhammed,ÖLMEZ Serpil,Guducuoglu Huseyin,Otlu Baris İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi. (2020): 235 - 245. 10.5578/mb.69286
MLA	Parlak Mehmet,BATUR Muhammed,ÖLMEZ Serpil,Guducuoglu Huseyin,Otlu Baris İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi. , 2020, ss.235 - 245. 10.5578/mb.69286
AMA	Parlak M,BATUR M,ÖLMEZ S,Guducuoglu H,Otlu B İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi. . 2020; 235 - 245. 10.5578/mb.69286
Vancouver	Parlak M,BATUR M,ÖLMEZ S,Guducuoglu H,Otlu B İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi. . 2020; 235 - 245. 10.5578/mb.69286
IEEE	Parlak M,BATUR M,ÖLMEZ S,Guducuoglu H,Otlu B "İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi." , ss.235 - 245, 2020. 10.5578/mb.69286
ISNAD	Parlak, Mehmet vd. "İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi". (2020), 235-245. https://doi.org/10.5578/mb.69286

APA	Parlak M, BATUR M, ÖLMEZ S, Guducuoglu H, Otlu B (2020). İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi. Mikrobiyoloji Bülteni, 54(2), 235 - 245. 10.5578/mb.69286
Chicago	Parlak Mehmet,BATUR Muhammed,ÖLMEZ Serpil,Guducuoglu Huseyin,Otlu Baris İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi. Mikrobiyoloji Bülteni 54, no.2 (2020): 235 - 245. 10.5578/mb.69286
MLA	Parlak Mehmet,BATUR Muhammed,ÖLMEZ Serpil,Guducuoglu Huseyin,Otlu Baris İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.54, no.2, 2020, ss.235 - 245. 10.5578/mb.69286
AMA	Parlak M,BATUR M,ÖLMEZ S,Guducuoglu H,Otlu B İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2020; 54(2): 235 - 245. 10.5578/mb.69286
Vancouver	Parlak M,BATUR M,ÖLMEZ S,Guducuoglu H,Otlu B İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2020; 54(2): 235 - 245. 10.5578/mb.69286
IEEE	Parlak M,BATUR M,ÖLMEZ S,Guducuoglu H,Otlu B "İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi." Mikrobiyoloji Bülteni, 54, ss.235 - 245, 2020. 10.5578/mb.69286
ISNAD	Parlak, Mehmet vd. "İntravitreal Enjeksiyon Sonrası Ortaya Çıkan Rhizobium radiobacter Salgınının Mikrobiyolojik Analizi". Mikrobiyoloji Bülteni 54/2 (2020), 235-245. https://doi.org/10.5578/mb.69286