Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana
Yıl: 2020 Cilt: 8 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 51 - 59 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.33202/comuagri.624715 İndeks Tarihi: 25-10-2021
Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana
Öz: Tarhana is a staple food in Turkey and produced mainly by the fermentation of wheat flour and yogurt.There are variations in its use, it can be consumed as a snack, or as a soup, and its exact ingredients vary betweendifferent geographical regions. Our study aims to isolate and identify lactic acid bacteria in tarhana samples viabiochemical and molecular biology identification techniques. Three different tarhana samples were studied forbacterial Gram reactions, catalase activity, gas production, growth at 10°C and 45°C, in 6% and 16% NaClconcentrations and at pH 4,4 and pH 9,6 for the biochemical tests. For the molecular biology experiments, PCRRFLP, sequencing and RAPD-PCR were performed to identify organisms at the species and strain level.
Anahtar Kelime: Tarhanadan Laktik Asit Bakterilerinin İzolasyonu
Öz: Tarhana ülkemizin temel gıda maddelerinden biridir ve aslen buğday unu ve yoğurdun fermentasyonundan üretilir. Kullanım alanları farklılık gösterebilir, atıştırmalık ya da çorba olarak tüketilebilir, içeriğindeki malzemeler de üretildiği coğrafi bölgeye göre değişiklik gösterir. Çalışmamızın amacı biyokimyasal ve moleküler biyoloji tekniklerini kullanarak tarhana örneklerinden laktik asit bakterilerini izole etmek ve tanımlamalarını sağlamaktır. Üç farklı tarhana örneği kullanılmış olup, biyokimyasal testler kapsamında bakterilerin Gram reaksiyonları, katalaz aktiviteleri, gaz üretimleri, 10°C and 45°C’de, %6 ve %16 NaCl konsantrasyonlarında ve 4,4 ve 9,6 pH değerinde büyümeleri çalışılmıştır. Mikroorganizmaların tür ve suş düzeyinde tanımlanmaları amacıyla çalışılan moleküler biyoloji teknikleri arasında ise PCR-RFLP, dizileme ve RAPD-PCR bulunmaktadır. **Corresponding author e-mail: aysun.cebeciaydin@agu.edu.tr 1 https://orcid.org/, 2 https://orcid.org/,3 https://orcid.org/
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
- Bayrakçı, H.A., Bilgiçli, N., 2015. Influence of resistant starches on chemical and functional properties of tarhana. Journal of Food Science and Technology. 52(8): 5335–5340.
- Cebeci, A., Gürakan, C., 2003. Properties of potential probiotic Lactobacillus plantarum strains. Food Microbiology. 20(5): 511–518.
- Cebeci, A., Gürakan, G.C., 2008. Molecular methods for identification of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus and Streptococcus thermophilus using methionine biosynthesis and 16S rRNA genes. Journal of Dairy Research. 75(04): 392-398.
- Cebeci, A., Gürakan, G.C., 2011. Comparative typing of L. delbrueckii subsp. bulgaricus strains using multilocus sequence typing and RAPD–PCR. European Food Research and Technology. 233(3): 377– 385.
- Çelik, İ., Işık, F., Şimşek, Ö., Gürsoy, O., 2005. The effects of the addition of baker’s yeast on the functional properties and quality of Tarhana, a traditional fermented food. Czech J. Food Sci. 23: 190–195.
- Damodharan, K., Lee, Y.S., Palaniyandi, S.A., Yang, S.H., Suh, J.-W., 2015. Preliminary probiotic and technological characterization of Pediococcus pentosaceus strain KID7 and in vivo assessment of its cholesterol-lowering activity. Frontiers in Microbiology. 4: 768.
- Gelsomino, R., Vancanneyt, M., Cogan, T.M., Condon, S., Swings, J., 2002. Source of Enterococci in a Farmhouse Raw-Milk Cheese. Applied and Environmental Microbiology. 68(7): 3560–3565.
- Gezginç, Y., Akyol, İ., 2010. Geleneksel Yoğurtlardan İzole Edilen Streptococcus thermophilus ve Lactobacillus bulgaricus’ların Tanımlanması. KSÜ Doğa Bilimleri Dergisi. 13(2), 23–29.
- Jonganurakkun, B., Wang, Q., Xu, S. H., Tada, Y., Minamida, K., Yasokawa, D., Asano, K., 2008. Pediococcus pentosaceus NB-17 for probiotic use. Journal of Bioscience and Bioengineering. 106(1): 69–73.
- İnoğlu, Z., Tuncer, Y., 2013. Safety assessment of Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis strains isolated from Turkish tulum cheese. Journal of Food Safety. 33: 369–377.
- Kabak, B., Dobson, A.D.W., 2011. An Introduction to the Traditional Fermented Foods and Beverages of Turkey. Critical Reviews in Food Science and Nutrition. 51(3): 248–260.
- Kumar, S., Stecher, G.G., Li, M., Knyaz, C., Tamura K., 2018. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across Computing Platforms. Molecular Biology and Evolution. 35(6): 1547–1549
- Mujagic, Z., de Vos, P., Boekschoten, M.V., Govers, C., Pieters, H.-J. H. M., de Wit, N. J. W., Troost, F. J., 2017. The effects of Lactobacillus plantarum on small intestinal barrier function and mucosal gene transcription; a randomized double-blind placebo controlled trial. Scientific Reports. 7: 40128.
- Özdemir, S., Gocmen, D., Yildirim Kumral, A., 2007. A Traditional Turkish Fermented Cereal Food: Tarhana. Food Reviews International. 23(2): 107–121.
- Rosselló-Mora, R., Amann, R., 2001. The species concept for prokaryotes. FEMS Microbiology Reviews. 25(1): 39–67.
- Şengün, I. Y., Nielsen, D. S., Karapinar, M., Jakobsen, M., 2009. Identification of lactic acid bacteria isolated from Tarhana, a traditional Turkish fermented food. International Journal of Food Microbiology. 135(2): 105–111.
- Settanni, L., Tanguler, H., Moschetti, G., Reale, S., Gargano, V., Erten, H., 2011. Evolution of fermenting microbiota in tarhana produced under controlled technological conditions. Food Microbiology. 28(7): 1367–1373.
- Şimşek, Ö., Özel, S., Çon, A. H., 2017. Comparison of lactic acid bacteria diversity during the fermentation of Tarhana produced at home and on a commercial scale. Food Science and Biotechnology. 26(1): 181– 187.
| APA | ÇALIŞ B, POLAT M, Cebeci Aydın A (2020). Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana. , 51 - 59. 10.33202/comuagri.624715 |
| Chicago | ÇALIŞ Burak,POLAT Muhammet Fatih,Cebeci Aydın Aysun Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana. (2020): 51 - 59. 10.33202/comuagri.624715 |
| MLA | ÇALIŞ Burak,POLAT Muhammet Fatih,Cebeci Aydın Aysun Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana. , 2020, ss.51 - 59. 10.33202/comuagri.624715 |
| AMA | ÇALIŞ B,POLAT M,Cebeci Aydın A Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana. . 2020; 51 - 59. 10.33202/comuagri.624715 |
| Vancouver | ÇALIŞ B,POLAT M,Cebeci Aydın A Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana. . 2020; 51 - 59. 10.33202/comuagri.624715 |
| IEEE | ÇALIŞ B,POLAT M,Cebeci Aydın A "Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana." , ss.51 - 59, 2020. 10.33202/comuagri.624715 |
| ISNAD | ÇALIŞ, Burak vd. "Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana". (2020), 51-59. https://doi.org/10.33202/comuagri.624715 |
| APA | ÇALIŞ B, POLAT M, Cebeci Aydın A (2020). Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana. ÇOMÜ Ziraat Fakültesi Dergisi, 8(1), 51 - 59. 10.33202/comuagri.624715 |
| Chicago | ÇALIŞ Burak,POLAT Muhammet Fatih,Cebeci Aydın Aysun Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana. ÇOMÜ Ziraat Fakültesi Dergisi 8, no.1 (2020): 51 - 59. 10.33202/comuagri.624715 |
| MLA | ÇALIŞ Burak,POLAT Muhammet Fatih,Cebeci Aydın Aysun Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana. ÇOMÜ Ziraat Fakültesi Dergisi, vol.8, no.1, 2020, ss.51 - 59. 10.33202/comuagri.624715 |
| AMA | ÇALIŞ B,POLAT M,Cebeci Aydın A Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana. ÇOMÜ Ziraat Fakültesi Dergisi. 2020; 8(1): 51 - 59. 10.33202/comuagri.624715 |
| Vancouver | ÇALIŞ B,POLAT M,Cebeci Aydın A Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana. ÇOMÜ Ziraat Fakültesi Dergisi. 2020; 8(1): 51 - 59. 10.33202/comuagri.624715 |
| IEEE | ÇALIŞ B,POLAT M,Cebeci Aydın A "Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana." ÇOMÜ Ziraat Fakültesi Dergisi, 8, ss.51 - 59, 2020. 10.33202/comuagri.624715 |
| ISNAD | ÇALIŞ, Burak vd. "Isolation of Lactic Acid Bacteria from Tarhana". ÇOMÜ Ziraat Fakültesi Dergisi 8/1 (2020), 51-59. https://doi.org/10.33202/comuagri.624715 |
