Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi

ŞENER, Burçin; KÖSEOĞLU, Özgen; Gur, Deniz

Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi

Özgen KÖSEOĞLU, (Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Burçin ŞENER, (Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Deniz GÜR (Hacettepe Üniversitesi, İhsan Doğramacı Çocuk Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Ankara, Türkiye)

Mikrobiyoloji Bülteni

1 0

Yıl: 2004 Cilt: 38 Sayı: 1-2 Sayfa Aralığı: 9 - 19 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi

Öz:

Stenotrophomonas maltophilia enfeksiyonlarında tedavi seçeneklerinin sınırlı olması nedeniyle enfeksiyondan korunmada yeni önlemlerin geliştirilebilmesi bakımından bu mikroorganizmanın epidemiyolojik açıdan araştırılması gerekmektedir. "Enterobacterial repetetive intergenic consensus-polimeraz zincir reaksiyonu (ERIC-PZR)", S. maltophilia'ya bağlı nozokomiyal salgınlarda suşlar arasında genetik ilişkinin belirlenmesinde kullanılabilecek kolay ve hızlı bir yöntemdir. Bu çalışmada, Hacettepe Üniversitesi Hastanesinde 1998-2001 yılları arasında çocuk hastalardan izole edilen S.maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi araştırılmıştır. Otuzbeş hastadan birer, iki hastadan ikişer ve hastane çevre örneğinden bir izolat olmak üzere toplam 40 suş çalışmaya alınmıştır. İzolatların onbir antimikrobik ilaca karşı duyarlılığı NCCLS kriterlerine göre ağar dilüsyon yöntemi ile belirlenmiştir. Çalışılan suşların %57.5'u piperasiline, %25'i piperasilin-tazobaktama, %85'i seftriaksona, %37.5'u seftazidime, %47.5'u sefepime, %20'si siprofloksasine, %100'ü imipeneme, %95'i meropeneme, %62.5'u amikasine, %62.5'u gentamisine ve %5'i trimetoprim-sulfametoksazole (TMP/SMX) dirençli bulunmuştur. TMP/SMX, test edilen izolatlara karşı en etkili antibiyotik olarak saptanmıştır. İzolatlar ERIC-I ve ERIC-II primerlerinin herbiri kullanılarak ERIC-PZR yöntemiyle moleküler epidemiyoloji yönünden incelenmiş, genotipik analiz sonucu 24 majör ve 4 minör profil belirlenmiştir. Birbirinden farklı olan 4 grupta bulunan üçer izolat, başka 4 grupta bulunan ikişer izolat kendi aralarında birebir eş bulunmuştur. Sonuç olarak bu çalışmada, genomik farklılığın yüksek ve klonal suşların düşük sayıda olması, S,maltophilia suşlarının hastanemizde hastadan hastaya klonal yayılımından çok, hastane ortamında bulunan çeşitli suşların hastalarda kolonize olarak antibiyotik baskısı ile enfeksiyon etkeni haline gelebileceği fikrini güçlendirmektedir.

Anahtar Kelime: İlaç direnci, bakteriyel Mikrobiyal duyarlılık testleri Trimetoprim-sulfametoksazol kombinasyonu Stenotrophomonas maltophilia Çapraz enfeksiyon Anti-enfektif ajanlar Gram-negatif bakteriyel enfeksiyonlar

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Molecular epidemiology of Stenotrophomonas maltophilia strains isolated from paediatric patients

Öz:

As alternative regimens in therapy of Stenotrophomonas maltophilia infections are limited, epidemiological investigation of S. maltophilia is necessary for developing new strategies in prophylaxis of these infections. "Enterobacterial repetetive intergenic consensus-polymerase chain reaction (ERIC-PCR)", is a simple and rapid method to detect the genomic polymorphism at the strain level in nosocomial outbreaks due to S. maltophilia. The aim of this study was to investigate the molecular epidemiology of S. maltophilia strains isolated from paediatric patients in a university hospital. A total of 40 clinical isolates one from each of 35 patients, two pairs from two patients and one from an environmental source, were collected between 1998-2001 period. Susceptibility to eleven antimicrobials was studied by agar dilution test according to NCCLS criteria. Resistance rates of the tested isolates against piperacillin, piperacillin-tazobactam, ceftriaxone, ceftazidime, cefepime, ciprofloxacin, imipenem, meropenem, amikacin, gentamicin and trimethoprim-sulfamethoxazole were 57.5%, 25%, 85%, 37.5%, 47.5%, 20%, 100%, 95%, 62.5%, 62.5% and 5%, respectively. Trimethoprim-sulfamethoxazole was the most active agent against the tested isolates. The isolates were analyzed by ERIC-PCR by using each of ERIC-I and ERIC-II primers. Genotypic analysis by ERIC-PCR identified 24 different major and 4 minor profiles. Three isolates from each of four different groups, two isolates from each of other four different groups were unique. The results of this study, revealing a great genomic diversity and low clonality within the strains of S. maltophilia strains suggest that patients may be colonized with the naturally occuring isolates in the hospital environment and then get infected with these strains under the selective antibiotic pressure, thus supporting the view that clonal spread of S. maltophilia strains between patients is of rather low possibility

Anahtar Kelime: Stenotrophomonas maltophilia Cross Infection Anti-Infective Agents Gram-Negative Bacterial Infections Drug Resistance, Bacterial Microbial Sensitivity Tests Trimethoprim-Sulfamethoxazole Combination

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Palleroni NJ. Bradbury JF: Stenotrophomonas, a new bacterial genus for Xanthomonas maltophilia (Hugh 1980). Int J Syst Bacteriol 1993, 43: 606-609
2 Khardori N, Elting L, Wong E, Schable B, Bodey GP Nosocomial infections due to Xanthomonas maltophilia (Pseudomonas maltophilia) in patients with cancer. Rev Infect Dis 1990,12: 997-1003
3. Yao J DC, Conly JM, Krajden M: Molecular typing of Stenotrophomonas (Xanthomonas) maltophilia by DNA macrorestriction analysis and random amplified polymorphic DNA analysis. J Clin Microbiol 1995, 33: 2195-2198.
4 Denton M, Kerr KG Microbiological and clinical aspects of infection associated with Stenotrophomonas maltophilia. Clin Microb Rev 1998, 11: 57-80.
5. Denton M, Todd NJ, Kerr KG, Hawkey PM, Littlewood JM: Molecular epidemiology of Stenotrophomonas maltophilia isolated from clinical specimens from patients with cystic fibrosis and associated environmental samples. J Clin Microbiol 1998, 36: 1953-1958.
6 Laıng FPY, Ramotar K, Read RR, et al, Molecular epidemiology of Xanthomonas maltophilia colonization and infection in the hospital environment. J Clin Microbiol 1995, 33: 513-518.
7 Chatelut M, Dournes JL, Chabanon G, Marty N. Epidemiological typing of Stenotrophomonas (Xanthomonas) maltophilia by PCR J Clin Microbiol 1995, 33: 912-914.
8. Olive DM. Bean P Principles and applications of methods for DNA based typing of microbial organisms. J Clin Microbiol 1999, 37:1661-1669.
9. Belkum A, Leeuwen W. Kluytmans J, Verbrugh H: Molecular nosocomial epidemiology: High speed typing of microbial pathogens by arbitrary primed polymerase chain reaction assays. Infect Cont Hosp Epidemiol 1995, 16: 658-666
10 National Committee for Clinical Laboratory Standards. Methods for dilution antimicrobial susceptibility tests for bacteria that grow aerobically. Approved Standard M7-A5, 2000, 5th ed. National Committee for Clinical Laboratory Standards. Wayne, Pa
11. Tenover FC, Arbeit RD, Goering RV, and the Molecular Typing Working Group of the Society for Healthcare Epidemiology of America: How to select and interpret molecular strain typing methods for epidemiological studies of bacterial infections: A review for healthcare epidemiologists. Infect Cont Hosp Epidemiol 1997, 18: 426-439.
12. Versalovic J, Koeuth T and Lupski J: Distribution of repetetive DNA sequences in eubacteria and application to fingerprinting of bacterial genomes Nucleic Acids Res 1991, 19: 6823-6831.
13. Van Belkum A. DNA fingerprinting of medically important microoıganisrrıs by use of PCR. Clin Microbiol Rev 1994, 7 174-184
14. Durmaz R. Moleküler epidemiyolojinin prensipleri, p. 139-147. Durmaz R (ed), Uygulamalı Moleküler Mikrobiyoloji. 2001, Nobel Tıp Kitabevleri, istanbul
15. Alfieri N, Ramotar K, Armstrong R et al: Two consecutive outbreaks of Stenotrophomonas maltophilia (Xanthomonas maltophilia) in an intensive-care unit defined by restriction fragment-length polymorphism typing, Infect Control Hosp Epidemiol 1995, 20: 553-556.
16. Denton M, Rajgopal A, Mooney L, Qureshi A, Kerr KG, Keer V et al. Stenotrophomonas maltophilia contamination of nebulizers used to deliver aerosolized therapy to inpatients with cystic fibrosis. J Hosp Infect 2003; 55:180-83
17 Mukhopadhyay C. Bhargava A, Ayyagari A Novel nosocomial infections by Stenotrophomonas maltophilia First reported case from Lucknow, North India. J Clin Microbiol 2003, 41. 3989-3990
18. Marty N: Epidemiological typing of Stenotrophomonas maltophilia. J Hosp Infect 1997, 36: 261-266.
19. Belkum A, Leeuwen W, Kluytmans J, Ve'burg H: Molecular nosocomial epidemiology: High speed typing of microbial pathogens by arbitrary primed polymerase chain reaction assays. Infect Control Hosp Epidemiol 1995, 16. 658-666.
20 Valdezate S, Vindel A, Loza E, Baquero F. Canton R: Antimicrobial susceptibilities of unique Stenotrophomonas maltophilia clinical strains. Antimicrob Agents Chemother 2001, 45 1581-1584
21. Muder RR, Yu VL, Dummer JS, Vinson C. Lumish RM: Infections caused by Stenotrophomonas (Xanthomonas) maltophilia: A prospective multi-center study of 91 episodes. Clin Infect Dis 1996. 22: 508-512.

APA	KÖSEOĞLU Ö, ŞENER B, Gur D (2004). Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi. , 9 - 19.
Chicago	KÖSEOĞLU Özgen,ŞENER Burçin,Gur Deniz Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi. (2004): 9 - 19.
MLA	KÖSEOĞLU Özgen,ŞENER Burçin,Gur Deniz Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi. , 2004, ss.9 - 19.
AMA	KÖSEOĞLU Ö,ŞENER B,Gur D Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi. . 2004; 9 - 19.
Vancouver	KÖSEOĞLU Ö,ŞENER B,Gur D Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi. . 2004; 9 - 19.
IEEE	KÖSEOĞLU Ö,ŞENER B,Gur D "Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi." , ss.9 - 19, 2004.
ISNAD	KÖSEOĞLU, Özgen vd. "Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi". (2004), 9-19.

APA	KÖSEOĞLU Ö, ŞENER B, Gur D (2004). Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi. Mikrobiyoloji Bülteni, 38(1-2), 9 - 19.
Chicago	KÖSEOĞLU Özgen,ŞENER Burçin,Gur Deniz Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi. Mikrobiyoloji Bülteni 38, no.1-2 (2004): 9 - 19.
MLA	KÖSEOĞLU Özgen,ŞENER Burçin,Gur Deniz Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.38, no.1-2, 2004, ss.9 - 19.
AMA	KÖSEOĞLU Ö,ŞENER B,Gur D Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2004; 38(1-2): 9 - 19.
Vancouver	KÖSEOĞLU Ö,ŞENER B,Gur D Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2004; 38(1-2): 9 - 19.
IEEE	KÖSEOĞLU Ö,ŞENER B,Gur D "Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi." Mikrobiyoloji Bülteni, 38, ss.9 - 19, 2004.
ISNAD	KÖSEOĞLU, Özgen vd. "Çocuk hastalardan izole edilen Stenotrophomonas maltophilia suşlarının moleküler epidemiyolojisi". Mikrobiyoloji Bülteni 38/1-2 (2004), 9-19.