SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi

Yıl: 2021 Cilt: 55 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 207 - 222 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/mb.20219907 İndeks Tarihi: 23-11-2021

SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi

Öz:
Şiddetli akut solunum sendromu koronavirüs-2 (SARS CoV-2)’nin ortaya çıkmasının ve tanıda yal nız polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) kullanılmasının ardından, antikor testleri hızla çeşitli ticari firma lar tarafından geliştirilmiştir. Farklı viral hedef proteinleri ve antikor alt sınıflarını saptayan bu testlerin,duyarlılık ve özgüllüğü de farklılık göstermektedir. Çalışmada, testlerin tanı amaçlı kullanımını değer lendirmek için çeşitli firmaların (Abbott, Roche, Euroimmun, Dia.Pro, Anshlabs, Vircell, UnScience ve RedCell) farklı prensiplere sahip (ECLIA/CLIA, EIA, LFA) SARS-CoV-2 IgM, IgA ve IgG testlerinin duyarlılıkve özgüllük başta olmak üzere tanısal performanslarının incelenmesi amaçlanmıştır. İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa (İÜC), Cerrahpaşa Tıp Fakültesi (CTF) Hastanesi, Pandemi Polikliniğine COVID-19 şüphesi ilebaşvuran, sonrasında COVID-19 klinik ve moleküler tanısı almış, 180 akut ve 180 geçirilmiş COVID-19hastası çalışmamıza dahil edilmiştir. Semptomların başlangıcından itibaren ilk üç hafta içerisinde alınanhastalar akut hasta grubuna, üçüncü hafta ve sonrasında alınan hastalar geçirilmiş hasta grubuna da hil edilmiştir. Nisan-Haziran 2018 tarihleri arasında COVID-19 pandemisi öncesinde, Şişli Hamidiye EtfalEğitim ve Araştırma Hastanesi, Kan Merkezi biriminden temin edilen 180 serum örneği kontrol grubuolarak çalışmaya dahil edilmiştir. Bu çalışmaya dahil edilen tüm testler üretici firmaların önerileri doğrul tusunda çalışılmıştır. COVID-19 geçirmiş hastalarda farklı prensiplere sahip IgG saptayan testler arasındaen etkili testlerin duyarlılık ve özgüllük değerleri sırasıyla %86.7/%99.4 (Abbott), %86.1/%98.9 (Dia. Pro), %91.3/%95 (RedCell)’tir. Akut COVID-19 hastalarında farklı prensiplere sahip IgM saptayan test ler arasında ise duyarlılık ve özgüllük değerleri sırasıyla %67.8/%99.4 (Abbott), %68.9/%98.6 (Vircell),%50/%97.5 (RedCell)’tir. Akut COVID-19 hastalarında en iyi uyumu 0.67 kappa katsayısı ile Abbott IgMve 0.65 kappa katsayısı ile Vircell IgM + IgA testi göstermiştir. Geçirilmiş COVID-19 hastalarında ise en iyiuyumu 0.86 kappa katsayısı ile Abbott IgG ve 0.85 kappa katsayısı ile Dia.Pro IgG testi göstermiştir. IgMsaptayan antikor testlerinin duyarlılıklarının düşük olması nedeniyle rutin tanıda gerçek zamanlı reverstranskriptaz polimeraz zincir reaksiyonu yerine tercih edilmemelidir. IgG saptayan testler ise, toplumsalseroprevalans ve özellikle terapötik immünplazma üretimi için COVID-19 geçirmiş kişilerde antikor yanıtı nı ve titrelerini saptamak için tercih edilebilir. Bununla birlikte, bu çalışmayı yürütenlerce SARS-CoV-2 IgGtestleri için rutin kullanımda hem ECLIA/CLIA prensipli çalışan testler hem de EIA/ELISA prensipli testlerinbirlikte kullanımının daha etkili olabileceği düşünülmektedir.
Anahtar Kelime:

Evaluation of the Diagnostic Performance of Different Principles of SARS-CoV-2 Commercial Antibody Tests in COVID-19 Patients

Öz:
Following the emergence of severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS CoV-2) and usingonly PCR for diagnosis, antibody tests have been rapidly developed by various commercial companies.There are differences between the sensitivity and specificity of these tests due to the usage of different viraltarget proteins and antibody subclasses. In order to evaluate the diagnostic use of these tests, we aimed toexamine the diagnostic performance, especially sensitivity and specificity, of SARS-CoV-2 IgM, IgA and IgGtests of various companies (Abbott, Roche, Euroimmun, Dia.Pro, Anshlabs, Vircell, UnScience and RedCell),which have different principles (ECLIA/CLIA, EIA, LFA). Current (n= 180) and past (n= 180) COVID-19 pati ents with clinical and molecular diagnosis of COVID-19 admitted to Istanbul University-Cerrahpaşa, Cerrah paşa Faculty of Medicine Hospital, Pandemic Polyclinic with suspected COVID-19 infection, were includedin our study. The patients admitted within the first 3 weeks after the onset of symptoms were included inthe current patient group, and those admitted at the third and after the third week were included in thepast patient group. Serum samples (n= 180) obtained from Istanbul Sisli Hamidiye Etfal Training and Rese arch Hospital, Blood Center between April and June 2018 before the COVID-19 pandemic were includedin the study as a control group. All the tests included in our study were studied with the recommendati ons of the manufacturer companies. Between the IgG detection tests with different principles in patientswith past COVID-19, the sensitivity and specificity values of the most effective tests were; 86.7%/99.4%(Abbott), 86.1%/98.9% (Dia.Pro), 91.3%/95% (RedCell). Between the IgM detection tests with differentprinciples in current COVID-19 patients, the sensitivity and specificity values were; 67.8%/99.4% (Abbott),68.9%/98.6% (Vircell), 50%/97.5% (RedCell). Abbott IgM with a kappa coefficient of 0.67 and Vircell IgM+ IgA test with a kappa coefficient of 0.65 showed the best fit in patients with current COVID-19 infection.In patients with past COVID-19, Abbott IgG with 0.86 kappa coefficient and Dia.Pro IgG test with 0.85kappa coefficient showed the best match. Due to the low sensitivity of IgM detection antibody tests, theyshould not be preferred instead of real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction in routine di agnosis. IgG detection tests may be preferred to detect the antibody response and the titers in people whohave had COVID-19 for population seroprevalence and especially therapeutic immune plasma production.However, it is thought that the combined use of both ECLIA/CLIA-based and EIA/ELISA-based tests togethermay be more effective in routine use for SARS-CoV-2 IgG tests.
Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Diğer Erişim Türü: Bibliyografik
  • 1. Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 2020; 579(7798): 270-73.
  • 2. World Health Organization (WHO). Available from: https://www.who.int/dg/speeches/detail/whodirector-general-s-opening-remarks-at-the-mission-briefing-on-covid-19---12-march-2020. (Accessed date: 21.03.2021)
  • 3. Li X, Geng M, Peng Y, Meng L, Lu S. Molecular immune pathogenesis and diagnosis of COVID-19. J Pharm Analysis 2020; 10(2): 102-8.
  • 4. Favresse J, Eucher C, Elsen M, Marie T-H, Dogné J-M, Douxfils J, et al. Clinical performance of the Elecsys electrochemiluminescent immunoassay for the detection of SARS-CoV-2 total antibodies. Clin Chem 2020; 66(8): 1104-6.
  • 5. Tang MS, Hock KG, Logsdon NM, Hayes JE, Gronowski AM, Anderson NW, et al. Clinical performance of two SARS-CoV-2 serologic assays. Clin Chem 2020; 66(8): 1055-62.
  • 6. Tang MS, Hock KG, Logsdon NM, Hayes JE, Gronowski AM, Anderson NW, et al. Clinical Performance of the Roche SARS-CoV-2 Serologic Assay. Clin Chem 2020; 66(8): 1107-9.
  • 7. Schnurra C, Reiners N, Biemann R, Kaiser T, Trawinski H, Jassoy C. Comparison of the diagnostic sensitivity of SARS-CoV-2 nucleoprotein and glycoprotein-based antibody tests. J Clin Virol 2020; 129: 104544.
  • 8. Naaber P, Hunt K, Pesukova J, Haljasmägi L, Rumm P, Peterson P, et al. Evaluation of SARS-CoV-2 IgG antibody response in PCR positive patients: Comparison of nine tests in relation to clinical data. PloS One 2020; 15(10): e0237548.
  • 9. Kohmer N, Westhaus S, Rühl C, Ciesek S, Rabenau HF. Brief clinical evaluation of six high-throughput SARSCoV-2 IgG antibody assays. J Clin Virol 2020; 104480.
  • 10. Cota G, Freire ML, de Souza CS, Pedras MJ, Saliba JW, Faria V, et al. Diagnostic performance of commercially available COVID-19 serology tests in Brazil. Int J Inf Dis 2020; 101: 382-90.
  • 11. Jääskeläinen AJ, Kuivanen S, Kekäläinen E, Ahava MJ, Loginov R, Kallio-Kokko H, et al. Performance of six SARS-CoV-2 immunoassays in comparison with microneutralisation. J Clin Virol 2020; 129: 104512.
  • 12. Nicol T, Lefeuvre C, Serri O, Pivert A, Joubaud F, Dubée V, et al. Assessment of SARS-CoV-2 serological tests for the diagnosis of COVID-19 through the evaluation of three immunoassays: Two automated immunoassays (Euroimmun and Abbott) and one rapid lateral flow immunoassay (NG Biotech). J Clin Virol 2020; 129: 104511.
  • 13. Yassine HM, Al-Jighefee H, Al-Sadeq DW, Dargham SR, Younes SN, Shurrab F, et al. Performance evaluation of five ELISA kits for detecting anti-SARS-COV-2 IgG antibodies. Int J Inf Dis 2020; 102: 181-7.
  • 14. Lassaunière R, Frische A, Harboe ZB, Nielsen AC, Fomsgaard A, Krogfelt KA, et al. Evaluation of nine commercial SARS-CoV-2 immunoassays. J Medrxiv 2020.
  • 15. Serrano MM, Rodríguez DN, Palop NT, Arenas RO, Córdoba MM, Mochón MDO, et al. Comparison of commercial lateral flow immunoassays and ELISA for SARS-CoV-2 antibody detection. J Clin Virol 2020; 129: 104529.
  • 16. Shirin T, Bhuiyan TR, Charles RC, Amin S, Bhuiyan I, Kawser Z, et al. Antibody responses after COVID-19 infection in patients who are mildly symptomatic or asymptomatic in Bangladesh. Int J Inf Dis 2020; 101: 220-5.
  • 17. Kohmer N, Westhaus S, Rühl C, Ciesek S, Rabenau HF. Clinical performance of different SARS‐CoV‐2 IgG antibody tests. J Med Virol 2020; 92(10): 2243-7.
  • 18. Qu J, Wu C, Li X, Zhang G, Jiang Z, Li X, et al. Profile of immunoglobulin G and IgM antibodies against severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Clin Infect Dis 2020; 71(16): 2255-8.
  • 19. Perez-Garcia F, Perez-Tanoira R, Iglesias ME, Romanyk J, Arroyo T, Gomez-Herruz P, et al. Comparative evaluation of six immunoassays for the detection of antibodies against SARS-CoV-2. J Virol Methods 2021; 289: 114047.
  • 20. Chew KL, Tan SS, Saw S, Pajarillaga A, Zaine S, Khoo C, et al. Clinical evaluation of serological IgG antibody response on the Abbott Architect for established SARS-CoV-2 infection. J Clin Microbiol 2020; 26(9): 1256. e9-1256.
  • 21. Yassine HM, Al-Jighefee H, Al-Sadeq DW, Dargham SR, Younes SN, Shurrab F, et al. Performance evaluation of five ELISA kits for detecting anti-SARS-COV-2 IgG antibodies. Inter J of Inf Dis 2021; 102: 181-7.
  • 22. Patel EU, Bloch EM, Clarke W, Hsieh Y-H, Boon D, Eby Y, et al. Comparative performance of five commercially available serologic assays to detect antibodies to SARS-CoV-2 and identify individuals with high neutralizing titers. J Clin Microbiol 2021; 59(2): e02257-20.
APA Dinç H, ÖZDEMİR Y, alkan s, GÜNGÖRDÜ DALAR Z, Gareayaghi N, SİREKBASAN S, Tuyji Tok Y, KUSKUCU M, KARAALİ R, Ozbey D, AYGÜN G, Midilli K, Kocazeybek B (2021). SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi. , 207 - 222. 10.5578/mb.20219907
Chicago Dinç Harika Öykü,ÖZDEMİR YUSUF EMRE,alkan sena,GÜNGÖRDÜ DALAR Zeynep,Gareayaghi Nesrin,SİREKBASAN Serhat,Tuyji Tok YEŞİM,KUSKUCU MERT AHMET,KARAALİ Rıdvan,Ozbey Dogukan,AYGÜN Gökhan,Midilli Kenan,Kocazeybek Bekir S SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi. (2021): 207 - 222. 10.5578/mb.20219907
MLA Dinç Harika Öykü,ÖZDEMİR YUSUF EMRE,alkan sena,GÜNGÖRDÜ DALAR Zeynep,Gareayaghi Nesrin,SİREKBASAN Serhat,Tuyji Tok YEŞİM,KUSKUCU MERT AHMET,KARAALİ Rıdvan,Ozbey Dogukan,AYGÜN Gökhan,Midilli Kenan,Kocazeybek Bekir S SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi. , 2021, ss.207 - 222. 10.5578/mb.20219907
AMA Dinç H,ÖZDEMİR Y,alkan s,GÜNGÖRDÜ DALAR Z,Gareayaghi N,SİREKBASAN S,Tuyji Tok Y,KUSKUCU M,KARAALİ R,Ozbey D,AYGÜN G,Midilli K,Kocazeybek B SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi. . 2021; 207 - 222. 10.5578/mb.20219907
Vancouver Dinç H,ÖZDEMİR Y,alkan s,GÜNGÖRDÜ DALAR Z,Gareayaghi N,SİREKBASAN S,Tuyji Tok Y,KUSKUCU M,KARAALİ R,Ozbey D,AYGÜN G,Midilli K,Kocazeybek B SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi. . 2021; 207 - 222. 10.5578/mb.20219907
IEEE Dinç H,ÖZDEMİR Y,alkan s,GÜNGÖRDÜ DALAR Z,Gareayaghi N,SİREKBASAN S,Tuyji Tok Y,KUSKUCU M,KARAALİ R,Ozbey D,AYGÜN G,Midilli K,Kocazeybek B "SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi." , ss.207 - 222, 2021. 10.5578/mb.20219907
ISNAD Dinç, Harika Öykü vd. "SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi". (2021), 207-222. https://doi.org/10.5578/mb.20219907
APA Dinç H, ÖZDEMİR Y, alkan s, GÜNGÖRDÜ DALAR Z, Gareayaghi N, SİREKBASAN S, Tuyji Tok Y, KUSKUCU M, KARAALİ R, Ozbey D, AYGÜN G, Midilli K, Kocazeybek B (2021). SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi. Mikrobiyoloji Bülteni, 55(2), 207 - 222. 10.5578/mb.20219907
Chicago Dinç Harika Öykü,ÖZDEMİR YUSUF EMRE,alkan sena,GÜNGÖRDÜ DALAR Zeynep,Gareayaghi Nesrin,SİREKBASAN Serhat,Tuyji Tok YEŞİM,KUSKUCU MERT AHMET,KARAALİ Rıdvan,Ozbey Dogukan,AYGÜN Gökhan,Midilli Kenan,Kocazeybek Bekir S SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi. Mikrobiyoloji Bülteni 55, no.2 (2021): 207 - 222. 10.5578/mb.20219907
MLA Dinç Harika Öykü,ÖZDEMİR YUSUF EMRE,alkan sena,GÜNGÖRDÜ DALAR Zeynep,Gareayaghi Nesrin,SİREKBASAN Serhat,Tuyji Tok YEŞİM,KUSKUCU MERT AHMET,KARAALİ Rıdvan,Ozbey Dogukan,AYGÜN Gökhan,Midilli Kenan,Kocazeybek Bekir S SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.55, no.2, 2021, ss.207 - 222. 10.5578/mb.20219907
AMA Dinç H,ÖZDEMİR Y,alkan s,GÜNGÖRDÜ DALAR Z,Gareayaghi N,SİREKBASAN S,Tuyji Tok Y,KUSKUCU M,KARAALİ R,Ozbey D,AYGÜN G,Midilli K,Kocazeybek B SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2021; 55(2): 207 - 222. 10.5578/mb.20219907
Vancouver Dinç H,ÖZDEMİR Y,alkan s,GÜNGÖRDÜ DALAR Z,Gareayaghi N,SİREKBASAN S,Tuyji Tok Y,KUSKUCU M,KARAALİ R,Ozbey D,AYGÜN G,Midilli K,Kocazeybek B SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2021; 55(2): 207 - 222. 10.5578/mb.20219907
IEEE Dinç H,ÖZDEMİR Y,alkan s,GÜNGÖRDÜ DALAR Z,Gareayaghi N,SİREKBASAN S,Tuyji Tok Y,KUSKUCU M,KARAALİ R,Ozbey D,AYGÜN G,Midilli K,Kocazeybek B "SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi." Mikrobiyoloji Bülteni, 55, ss.207 - 222, 2021. 10.5578/mb.20219907
ISNAD Dinç, Harika Öykü vd. "SARS-CoV-2 ile İlgili Farklı Prensipli Ticari AntikorTestlerinin COVID-19 Hastalarındaki TanısalPerformanslarının Değerlendirilmesi". Mikrobiyoloji Bülteni 55/2 (2021), 207-222. https://doi.org/10.5578/mb.20219907