Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter
Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve
Direnç Genlerinin İrdelenmesi

TEKEREKOGLU, MEHMET SAIT; DUMAN, YUCEL

doi:10.4274/tybd.galenos.2020.47965

Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi

Yücel DUMAN, (İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Malatya, Türkiye)

Mehmet Sait TEKEREKOĞLU (İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Malatya, Türkiye)

Türk Yoğun Bakım Dergisi

3 0

Yıl: 2021 Cilt: 19 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 71 - 75 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.4274/tybd.galenos.2020.47965 İndeks Tarihi: 29-05-2022

Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi

Öz:

Amaç: Acinetobacter baumannii yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalarda sağlık bakımı ilişkili enfeksiyonlara neden olan fırsatçı bir patojendir. A. baumannii farklı mekanizmalarla hızlı bir şekilde antimikrobiyallere karşı direnç geliştirebilmektedir. Çoklu ilaç dirençli (ÇİD) izolatlarının oluşturduğu enfeksiyonlar; morbidite ve mortalitesi yüksek, uzun süreli hospitalizasyon gerektiren enfeksiyonlardır. Kolistin, ÇİD A. baumannii izolatlarına karşı kullanılabilen son antimikrobiyallerden biridir. Bu izolatlarının artmasına bağlı olarak kolistin kullanımı tüm dünyada artmıştır. Çalışmamızda yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen ÇİD A. baumannii izolatlarında kolistin direnç oranlarının, minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) değerlerinin ve kolistin direncine neden olan plazmid aracılı yayılım gösteren direnç genlerinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmamıza Ocak 2017-Aralık 2018 tarihleri arasında laboratuvarımızda kan kültür örneklerinden izole edilen 97 A. baumannii izolatı alındı. İzolatların MİK değerleri Avrupa Antimikrobiyal Duyarlılık Testi Komitesi önerileri doğrultusunda broth mikrodilüsyon yöntemiyle araştırıldı. Polimeraz zincir reaksiyonu ile kolistin direnç gen bölgeleri mcr 1-5 çalışıldı. Bulgular: Çalışılan A. baumannii izolatlarının 8’i (%8,2) dirençli, 89’u (%91,8) duyarlı saptandı. Kolistin MİK50 değeri 0,5 µg/mL, MİK90 değeri 2 µg/mL olarak bulundu. Kolistin direncinin horizontal yayılım tehlikesi açısından araştırılan plazmid aracılı mcr gen bölgeleri (1-5 mcr genleri) belirlenemedi. Sonuç: Kolistin hastanemiz yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların, A. baumannii izolatlarına bağlı enfeksiyonlarının tedavisinde hala etkin olarak kullanılabilecek önemli bir antimikrobiyaldir. Ancak kolistine karşı direnç gelişimini önlemek için, irrasyonel antibiyotik kullanımı engellenerek antimikrobiyal duyarlılık testi sonuçlarına göre tedavi uygulanması gerekmektedir. Ayrıca dirençli izolatların hastanelerde kolonizasyonunun önlemesi için gerekli enfeksiyon kontrol önlemlerinin alınmasının önemli olduğu kanısındayız

Anahtar Kelime:

Colistin MICs and Resistance Genes of Acinetobacter Baumannii Isolated in Intensive Care Units

Öz:

Objective: Acinetobacter baumannii is an opportunistic pathogen that causes healthcare-associated infections in hospitalised patients in intensive care units. A. baumannii can quickly develop resistance to antimicrobials through different mechanisms. Infections caused by multidrug-resistant (MDR) isolates have high morbidity and mortality and require long-term hospitalisation. Colistin is one of the last antimicrobials that can be used against MDR A. baumannii isolates. Due to the increase of these isolates, the use of colistin has increased worldwide. Our study aimed to investigate colistin resistance rates, minimum inhibitory concentration (MIC) values and plasmid-mediated resistance genes in isolates from the blood cultures of patients hospitalised in intensive care units. Materials and Methods: A total of 97 A. baumannii isolates from blood culture samples were included in our study. MIC values of the isolates were investigated by the broth microdilution method according to The European Committee for Antimicrobial Susceptibility Testing recommendations. Colistin resistance gene regions mcr 1-5 were studied by polymerase chain reaction. Results: Eight (8.2%) of the A. baumannii isolates were resistant, and 89 (91.8%) were sensitive. The colistin MIC50 value was 0.5 µg/mL, and its MIC90 value was 2 µg/mL. The plasmid-mediated mcr gene regions (1-5 mcr genes) investigated for the risk of horizontal spread of colistin resistance could not be determined. Conclusion: Colistin is an important antimicrobial that can still be used effectively to treat infections due to A. baumannii isolates in our intensive care units. However, to prevent the development of resistance against colistin, irrational antibiotic use should be prevented, and treatment according to antimicrobial susceptibility test results is required. In addition, we believe that it is important to take the necessary infection control measures to prevent the colonisation of resistant isolates in hospitals

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Nasr P. Genetics, epidemiology, and clinical manifestations of multidrugresistant Acinetobacter baumannii. J Hosp Infect 2020;104:4-11.
2. Alp E, Coruh A, Gunay GK, Yontar Y, Doganay M. Risk factors for nosocomial infection and mortality in burn patients: 10 years of experience at a university hospital. J Burn Care Res 2012;33:379- 85.
3. Vincent JL. Nosocomial infections in adult intensive-care units. Lancet 2003;361:2068-77.
4. Duman Y, Kuzucu C, Tekerekoglu MS. Comparison of minimal inhibitory concentrations (MICs) of tigecycline in 2011 and 2015 years against multidrugresistance acinetobacter baumannii strains. Med Science 2017;6:26-9.
5. Talan L, Guven G, Yılmaz G, Altıntaş ND. Yoğun Bakım Unitelerinde Kontrol Altına Alınmakta Gucluk Cekilen Mikroorganizmalar: Acinetobacter. Yoğun Bakım Derg 2015;6:44-7.
6. Central Asian and Eastern European Surveillance of Antimicrobial Resistance, Annual report 2018. World Health Organization, Denmark: 2019. www. euro.who.int
7. Central Asian and Eastern European Surveillance of Antimicrobial Resistance, Annual report 2017. World Health Organization, Denmark: 2018. www. euro.who.int
8. Gkentzi D, Tsintoni A, Christopoulou I, Mamalis I, Paliogianni F, Assimakopoulos SF, et al. Extensively-drug resistant Acinetobacter baumannii bacteremia in neonates: effective treatment with the combination of colistin and ampicillin/ sulbactam. J Chemother 2020;32:103-6.
9. Pogue JM, Lee J, Marchaim D, Yee V, Zhao JJ, Chopra T, et al. Incidence of and risk factors for colistin-associated nephrotoxicity in a large academic health system. Clin Infect Dis 2011;53:879-84.
10. Liu YY, Wang Y, Walsh TR, Yi LX, Zhang R, Spencer J, et al. Emergence of plasmid-mediated colistin resistance mechanism MCR-1 in animals and human beings in China: a microbiological and molecular biological study. Lancet Infect Dis 2016;16:161-8.
11. Wang Y, Tian GB, Zhang R, Shen Y, Tyrrell JM, Huang X, et al. Prevalence, risk factors, outcomes, and molecular epidemiology of mcr-1-positive Enterobacteriaceae in patients and healthy adults from China: an epidemiological and clinical study. Lancet Infect Dis 2017;17:390-9.
12. EUCAST,http://www.eucast.org/ fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/ Breakpoint_tables/v_8.1_Breakpoint_ Tables.pdf.
13. Rebelo AR, Bortolaia V, Kjeldgaard JS, Pedersen SK, Leekitcharoenphon P, Hansen IM, et al. Multiplex PCR for detection of plasmid-mediated colistin resistance determinants, mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4 and mcr-5 for surveillance purposes. Euro Surveill 2018;23:17- 00672.
14. Garnacho-Montero J, Amaya-Villar R. Multiresistant Acinetobacter baumannii infections: epidemiology and management. Curr Opin Infect Dis 2010;23:332-9.
15. Centers for Disease Control and Prevention. Antibiotic resistance threats in the United States, 2013. Available from: https://www.cdc.gov/ drugresistance/pdf/ar-threats-2013-508. pdf. Accessed December, 2019.
16. Hoffman-Roberts H, Scoble P, Tabak YP, Mohr J, Johannes RS, Gupta V. National prevalence of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii infections in the ambulatory and acute care settings, including carbapenem-resistant acinetobacter infections, in the United States in 2015. Open Forum Infect Dis 2017;3(Suppl 1):1488.
17. Lee CR, Lee JH, Park KS, Kim YB, Jeong BC, Lee SH. Global Dissemination of Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae: Epidemiology, Genetic Context, Treatment Options, and Detection Methods. Front Microbiol 2016;7:895.
18. Yolbaş İ, Tekin R, Güneş A, Kelekçi S, Şen V, Tan İ, ve ark. Bir üniversite hastanesindeki Acinetobacter baumannii suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. J Clin Exp Invest 2013;4:318-21.
19. Boral B, Unaldi Ö, Ergin A, Durmaz R, Eser ÖK; Acinetobacter Study Group. A prospective multicenter study on the evaluation of antimicrobial resistance and molecular epidemiology of multidrugresistant Acinetobacter baumannii infections in intensive care units with clinical and environmental features. Ann Clin Microbiol Antimicrob 2019;18:19.
20. Çetinkol Y, Telli M, Altunçekiç Yıldırım A, Çalgın MK. Karbapeneme dirençli Acinetobacter baumannii suşlarında kolistin/sulbaktam kombinasyonu etkinliğinin değerlendirilmesi [Evaluation of the efficacy of colistin/sulbactam combination on carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii strains]. Mikrobiyol Bul 2016;50:460-5.
21. Maraki S, Mantadakis E, Mavromanolaki VE, Kofteridis DP, Samonis G. A 5-year Surveillance Study on Antimicrobial Resistance of Acinetobacter baumannii Clinical Isolates from a Tertiary Greek Hospital. Infect Chemother 2016;48:190- 8.
22. Gao L, Lyu Y, Li Y. Trends in Drug Resistance of Acinetobacter baumannii over a 10-year Period: Nationwide Data from the China Surveillance of Antimicrobial Resistance Program. Chin Med J (Engl) 2017;130:659-64.
23. Bogiel T, Kwiecińska-Piróg J, JachnaSawicka K, Gospodarek E. Szczepy acinetobacter baumannii oporne na karbapenemy [Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii strains]. Med Dosw Mikrobiol 2010;62:119-26.

APA	DUMAN Y, TEKEREKOGLU M (2021). Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi. , 71 - 75. 10.4274/tybd.galenos.2020.47965
Chicago	DUMAN YUCEL,TEKEREKOGLU MEHMET SAIT Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi. (2021): 71 - 75. 10.4274/tybd.galenos.2020.47965
MLA	DUMAN YUCEL,TEKEREKOGLU MEHMET SAIT Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi. , 2021, ss.71 - 75. 10.4274/tybd.galenos.2020.47965
AMA	DUMAN Y,TEKEREKOGLU M Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi. . 2021; 71 - 75. 10.4274/tybd.galenos.2020.47965
Vancouver	DUMAN Y,TEKEREKOGLU M Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi. . 2021; 71 - 75. 10.4274/tybd.galenos.2020.47965
IEEE	DUMAN Y,TEKEREKOGLU M "Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi." , ss.71 - 75, 2021. 10.4274/tybd.galenos.2020.47965
ISNAD	DUMAN, YUCEL - TEKEREKOGLU, MEHMET SAIT. "Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi". (2021), 71-75. https://doi.org/10.4274/tybd.galenos.2020.47965

APA	DUMAN Y, TEKEREKOGLU M (2021). Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi. Türk Yoğun Bakım Dergisi, 19(2), 71 - 75. 10.4274/tybd.galenos.2020.47965
Chicago	DUMAN YUCEL,TEKEREKOGLU MEHMET SAIT Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi. Türk Yoğun Bakım Dergisi 19, no.2 (2021): 71 - 75. 10.4274/tybd.galenos.2020.47965
MLA	DUMAN YUCEL,TEKEREKOGLU MEHMET SAIT Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi. Türk Yoğun Bakım Dergisi, vol.19, no.2, 2021, ss.71 - 75. 10.4274/tybd.galenos.2020.47965
AMA	DUMAN Y,TEKEREKOGLU M Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi. Türk Yoğun Bakım Dergisi. 2021; 19(2): 71 - 75. 10.4274/tybd.galenos.2020.47965
Vancouver	DUMAN Y,TEKEREKOGLU M Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi. Türk Yoğun Bakım Dergisi. 2021; 19(2): 71 - 75. 10.4274/tybd.galenos.2020.47965
IEEE	DUMAN Y,TEKEREKOGLU M "Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi." Türk Yoğun Bakım Dergisi, 19, ss.71 - 75, 2021. 10.4274/tybd.galenos.2020.47965
ISNAD	DUMAN, YUCEL - TEKEREKOGLU, MEHMET SAIT. "Yoğun Bakım Ünitelerinde İzole Edilen Acinetobacter Baumannii İzolatlarının Kolistin MİK Değerlerinin ve Direnç Genlerinin İrdelenmesi". Türk Yoğun Bakım Dergisi 19/2 (2021), 71-75. https://doi.org/10.4274/tybd.galenos.2020.47965