Sendromik Tanı Testlerinin
Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı

Yakut, Nurhayat; soyletir, güner; Kepenekli, Eda; Can Sarınoğlu, Rabia

doi:10.5578/ced.20219902

Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı

Nurhayat YAKUT, (Marmara Üniversitesi Pendik Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Çocuk Enfeksiyon Hastalıkları Kliniği, İstanbul, Türkiye)

Eda Kepenekli KADAYIFÇI, (Marmara Üniversitesi Pendik Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Çocuk Enfeksiyon Hastalıkları Kliniği, İstanbul, Türkiye)

Rabia Can SARINOĞLU, (Marmara Üniversitesi Pendik Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Kliniği, İstanbul, Türkiye)

Güner SÖYLETİR (Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Çocuk Enfeksiyon Dergisi

8 3

Yıl: 2021 Cilt: 15 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 7 - 11 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/ced.20219902 İndeks Tarihi: 01-06-2022

Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı

Öz:

Giriş: Boğmaca, aşı ile önlenebilir, bulaşıcı bir solunum yolu enfeksiyonudur. Tüm yaş gruplarını etkilemekle birlikte, özellikle küçük çocuklarda ciddi morbidite ve mortaliteye neden olabilir. Bu çalışmada, boğmaca tanısında sendromik polimeraz zincir reaksiyonunun (PCR) etkisinin ve hastaların klinik özelliklerinin incelenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Nisan-Aralık 2017 tarihleri arasında boğmaca benzeri klinik tablo ile hastanemize başvuran hastaların nazofarenks sürüntü örnekleri Bordetella pertussis’in kültür ve PCR ile araştırılması için Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü Mikrobiyoloji Referans Laboratuvarına gönderildi. Nisan-Aralık 2018 tarihleri arasında boğmaca benzeri klinik tablo ile hastanemize başvuran hastaların nazofarenks sürüntü örneklerinde hastanemiz Mikrobiyoloji Labaratuvarında FilmArray Multipleks PCR (BioFire, Biomerieux Diagnostics, France) ile B. pertussis araştırıldı. Her iki dönemde boğmaca kesin tanısı alan hastaların sayısı karşılaştırıldı, 2018 yılında boğmaca tanısı alan hastaların klinik özellikleri incelendi. Nisan-Aralık 2017 tarihleri arasında nazofarenks sürüntü örneği Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü Mikrobiyoloji Referans Laboratuvarına gönderilen 7 hastanın ikisinde hem B. pertussis üremesi hem de PCR pozitifliği saptandı. Nisan-Aralık 2018 tarihleri arasında 17 hastada nazofarenks sürüntü örneğinde hastanemiz Mikrobiyoloji Labaratuvarında FilmArray Multipleks PCR (BioFire, Biomerieux Diagnostics, France) ile B. pertussis pozitif saptandı. 2017’de 7 şüpheli boğmaca tanısı olan hastanın ikisi kesin boğmaca vakası olarak kayıtlara geçerken; 2018’de sendromik PCR testinin kullanılmaya başlanmasıyla, 17 hastanın tümü kesin boğmaca vakası olarak kayıtlara geçti. Bulgular: Nisan-Aralık 2018 tarihleri arasında boğmaca tanısı ile izlenen hastaların 10’u (%59) kız, 7’si (%41) erkek olarak tespit edilmiştir. En küçük hasta 30 günlük, en büyük hasta 3 aylık (ortalama 1.9 ay) idi. Olguların %59’u (n= 10) aşısızdı, % 41’ine (n= 7) tek doz aşı uygulanmıştı. Hiçbir hastaya koza stratejisi uygulanmamıştı. Nazofarens sürüntü örneklerinin laboratuvara gönderilmesi ve sonuç elde edilmesi arasındaki ortalama süre 2.7 (minimum-maksimum: 1-6) saat idi. Ortalama hastanede yatış süresi 5.6 (minimum-maksimum= 3-11) gündü. Bir olgu non-invaziv mekanik ventilatör desteği aldı. Sonuç: Boğmaca özellikle aşıları tamamlanmamış 6 aydan küçük bebeklerde ağır klinik tablolara neden olabilmektedir. Bu yaş grubunda sendromik PCR ile hızlı tanı konması hastalığın doğru yönetilmesine önemli katkı sağlamaktadır.

Anahtar Kelime:

The Contribution of Syndromic Diagnostic Tests to Pertussis Epidemiology

Öz:

Objective: Pertussis is a vaccine-preventable, contagious respiratory infection. It can cause serious morbidity and mortality especially in young children. In this study, we aimed to investigate the effect of syndromic polymerase chain reaction (PCR) in the diagnosis of pertussis and the clinical features of the patients. Material and Methods: Nasopharyngeal swab specimens of patients who presented with pertussis-like illness between April and December 2017 were sent to Public Health Microbiology Reference Laboratory for Bordetella pertussis culture and PCR. Between April and December 2018, nasopharyngeal swab specimens were tested with the FilmArray Multiplex PCR (BioFire, Biomerieux Diagnostics, France) in Microbiology Laboratory of our hospital The number of patients diagnosed with pertussis was compared between April-December 2017 and April-December 2018. The clinical features of patients were examined. Nasopharyngeal swab specimens of 7 patients between April and December 2017 were sent to Public Health Microbiology Reference Laboratory. B. pertussis culture and PCR positivity were detected in two patients in this period. Between April and December 2018, nasopharyngeal swab specimens of 17 patients were found to be positive for B. pertussis with FilmArray Multiplex PCR (BioFire, Biomerieux Diagnostics, France). In 2017, there were two definite pertussis cases. With the introduction of the syndromic PCR in 2018, all 17 patients were recorded as definite pertussis cases. Results: Between April and December 2018, of all patients with B. pertussis infections, 10 (59%) were female, 7 (41%) were male. The mean age was 1.9 months (range, 1 to 3 months). 59% (n= 10) of cases were unvaccinated and 41% (n= 7) had one dose of pertussis vaccine. The cocoon strategy was implemented to none of the parents. The mean time between sending nasopharyngeal swab samples and obtaining results was 2.7 (range, 1 to 6) hours. The mean length of hospitalization was 5.6 (range, 3 to 11) days. One case (6%) required non-invasive mechanical ventilation. Conclusion: Pertussis may cause severe clinical conditions especially in infants under 6 months. Rapid diagnosis of pertussis with syndromic PCR makes a significant contribution to pertussis epidemiology. It also improves the timely diagnosis, postexposure prophylaxis and management

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Long SS, Pickering LK, Prober CG (Eds). Principles and Practice of Pediatric Infectious Disease. 4th ed. USA, Philadelphia: Elsevier, 2012. [CrossRef]
2. Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Pertussis (Whooping Cough). Atlanta, GA. Available from: https://www.cdc.gov/pertussis/ outbreaks.html Accessed date: August 7, 2017. [CrossRef]
3. Gilley M, Goldman RD. Protecting infants from pertussis. Can Fam Physician 2014;60:138-40. [CrossRef]
4. Versteegh FGA, Schellekens JFP, Fleer A, Roord JJ. Pertussis: a concise historical review including diagnosis, incidence, clinical manifestations and the role of treatment and vaccination in management. Rev Med Microbiol 2005;16:79-89. [CrossRef]
5. Kurugol Z. pertussis epidemiology in Turkey: are booster doses necessary? Cocuk Enf Derg 2009;3:14-8. [CrossRef]
6. Muyldermans G, Soetens O, Antoine M, Bruisten S, Vincart B, Doucet-Populaire F, et al. External quality assessment for molecular detection of Bordetella pertussis in European laboratories. J Clin Microbiol 2005;43:30-5. [CrossRef]
7. Dragsted DM, Dohn B, Madsen J, Jensen JS. Comparison of culture and PCR for detection of Bordetella pertussis and Bordetella parapertussis under routine laboratory conditions. J Med Microbiol 2004;53:749-54. [CrossRef]
8. Guldemir D, Akbas E, Nar Otgun S, Tekin A, Esen B. Development and optimization of an İn-house PCR method for molecular diagnosis of pertussis. Mikrobiyol Bul 2011;45:632-45. [CrossRef]
9. Wood N, McIntyre P. Pertussis: review of epidemiology, diagnosis, management and prevention. Paediatr Resp Rev 2008;9:201-12. [CrossRef]
10. Waters V, Halperin S. Bordetella pertussis. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin RD (eds). Principles and Practice of Infectious Diseases. 7th ed. Churchill Livingstone; Philadelphia, 2010. pp: 2955-64. [CrossRef]
11. Cherry JD. Pertussis: Challenges today and for the future. PLoS Pathog 2013;9:e1003418. [CrossRef]
12. Ozkal A, Sensoy G, Acuner C, Belet N, Güney AK. Seroprevalence of Bordetella pertussis immunoglobulin G antibodies among children in Samsun, Turkey. Turk J Pediatr 2012;54:15-9. [CrossRef]
13. Birinci A. Bordetella. Basustaoglu A (çeviri ed.). Klinik Mikrobiyoloji. 2009, 9. Baskı. Ankara; Atlas Kitapçılık, s: 803-13. [CrossRef]
14. Wendelboe AM, Van Rie A. Diagnosis of pertussis: a historical review and recent developments. Expert Rev Mol Diagn 2006;6:857-64. [CrossRef]
15. Kosters K, Reischl U, Schmetz J, Riffelmann M, Wirsing von König CH. Real time LightCyler PCR for detection and discrimination of Bordetella pertussis and Bordetella parapertussis. J Clin Microbiol 2002;40:1719- 22. [CrossRef]
16. Gursel D, Aslan A, Sonmez C, Koturoğlu G, Cöplü N, Kurugöl Z, et al. Detection of Bordetella pertussis infection by culture, real-time polymerase chain reaction and serologic tests among children with prolonged cough. Mikrobiyol Bul 2012;46:211-24. [CrossRef]
17. Dragsted DM, Dohn B, Madsen J, et al. Comparison of culture and PCR for detection of Bordetella pertussis and Bordetella parapertussis under routine laboratory conditions. J Med Microbiol 2004;53:749-54. [CrossRef]
18. Lee AD, Cassiday PK, Pawloski LC, Tatti KM, Martin MD, Briere EC, et al. Clinical evaluation and validation of laboratory methods for the diagnosis of Bordetella pertussis infection: Culture, polymerase chain reaction (PCR) and anti-pertussis toxin IgG serology (IgG-PT). PLoS One 2018;13(4):e0195979. [CrossRef]
19. El Basha NR, Shaaban HH, El Atroush HA, Sherif MM, El Kholy AA, et al. The use of multiplex PCR for the detection of atypical pathogens in Egyptian children with CAP: a high rate of Bordetella pertussisin early infancy. J Egypt Public Health Assoc 2019;94:5. [CrossRef]
20. World Health Organization (WHO). Pertussis vaccines: WHO position paper-August 2015. Weekly epidemiological record. Vol 90. Switzerland: World Health Organization; 2015. p: 433-60. [CrossRef]
21. Hulscher ME. Intention to accept pertussis vaccination for cocooning: a qualitative study of the determinants. PLoS One 2016;11:e0155861. [CrossRef]
22. TA, Liang JL. Pregnancy dose Tdap and postpartum cocooning to prevent infant pertussis: a decision analysis. Pediatrics 2013;13:e1748-56. [CrossRef]
23. Potin M, Fica A, Véliz L, Moreno G, Wilhelm J, Cerda J, et al. Strategies to protect the newborn and infants under 6 months of age against pertussis: Statement of the Advisory Committee for Immunizations of the Chilean Infectious Diseases Society. Rev Chilena Infectol 2016;33:543-6. [CrossRef]
24. Skoff TH, Kenyon C, Cocoros N, Liko J, Miller L, Kudish K, et al. Sources of infant pertussis infection in the United States. Pediatrics 2015;136:635- 41. [CrossRef]
25. Carcione D, Regan AK, Tracey L, Mak DB, Gibbs R, Dowse GK, et al. The impact of parental postpartum pertussis vaccination on infection in infants: a population-based study of cocooning in Western Australia. Vaccine 2015;33:5654-61. [CrossRef]
26. Del Valle-Mendoza J, Silva-Caso W, Aguilar-Luis MA, Del Valle-Vargas C, Cieza-Mora E, Martins-Luna J, et al. Bordetella pertussis in children hospitalized with a respiratory infection: clinical characteristics and pathogen detection in household contacts. BMC Res Notes 2018;11:318. [CrossRef]
27. Tamburaci Uslu ZD, Ceyhan M, Dinleyici EC, Kurugol Z, Alpman BN, Karadag-Oncel E, et al. Detection of the presence of bordetella pertussis by real-time polymerase chain reaction in children diagnosed with pertussis and among their household contacts. J Vaccines Vaccin 2013;4:199-201. [CrossRef]
28. Li J, Tao Y, Tang M, Du B, Xia Y, Mo X, et al. Rapid detection of respiratory organisms with the FilmArray respiratory panel in a large children’s hospital in China. BMC Infect Dis 2018;18:510. [CrossRef]

APA	Yakut N, Kepenekli E, Can Sarınoğlu R, soyletir g (2021). Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı. , 7 - 11. 10.5578/ced.20219902
Chicago	Yakut Nurhayat,Kepenekli Eda,Can Sarınoğlu Rabia,soyletir güner Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı. (2021): 7 - 11. 10.5578/ced.20219902
MLA	Yakut Nurhayat,Kepenekli Eda,Can Sarınoğlu Rabia,soyletir güner Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı. , 2021, ss.7 - 11. 10.5578/ced.20219902
AMA	Yakut N,Kepenekli E,Can Sarınoğlu R,soyletir g Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı. . 2021; 7 - 11. 10.5578/ced.20219902
Vancouver	Yakut N,Kepenekli E,Can Sarınoğlu R,soyletir g Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı. . 2021; 7 - 11. 10.5578/ced.20219902
IEEE	Yakut N,Kepenekli E,Can Sarınoğlu R,soyletir g "Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı." , ss.7 - 11, 2021. 10.5578/ced.20219902
ISNAD	Yakut, Nurhayat vd. "Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı". (2021), 7-11. https://doi.org/10.5578/ced.20219902

APA	Yakut N, Kepenekli E, Can Sarınoğlu R, soyletir g (2021). Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı. Çocuk Enfeksiyon Dergisi, 15(1), 7 - 11. 10.5578/ced.20219902
Chicago	Yakut Nurhayat,Kepenekli Eda,Can Sarınoğlu Rabia,soyletir güner Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı. Çocuk Enfeksiyon Dergisi 15, no.1 (2021): 7 - 11. 10.5578/ced.20219902
MLA	Yakut Nurhayat,Kepenekli Eda,Can Sarınoğlu Rabia,soyletir güner Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı. Çocuk Enfeksiyon Dergisi, vol.15, no.1, 2021, ss.7 - 11. 10.5578/ced.20219902
AMA	Yakut N,Kepenekli E,Can Sarınoğlu R,soyletir g Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı. Çocuk Enfeksiyon Dergisi. 2021; 15(1): 7 - 11. 10.5578/ced.20219902
Vancouver	Yakut N,Kepenekli E,Can Sarınoğlu R,soyletir g Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı. Çocuk Enfeksiyon Dergisi. 2021; 15(1): 7 - 11. 10.5578/ced.20219902
IEEE	Yakut N,Kepenekli E,Can Sarınoğlu R,soyletir g "Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı." Çocuk Enfeksiyon Dergisi, 15, ss.7 - 11, 2021. 10.5578/ced.20219902
ISNAD	Yakut, Nurhayat vd. "Sendromik Tanı Testlerinin Boğmaca Epidemiyolojisine Katkısı". Çocuk Enfeksiyon Dergisi 15/1 (2021), 7-11. https://doi.org/10.5578/ced.20219902