ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi

Yıl: 2022 Cilt: 14 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 120 - 124 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.14744/iksstd.2021.29494 İndeks Tarihi: 21-06-2022

ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi

Öz:
Amaç: Önemi bilinmeyen monoklonal gammopati asemptomatik, multipl miyeloma ise semptomatik bir plazma hücre diskrazisidir. Daha önce yaptığımız RNA dizileme çalışmasında multipl miyeloma hastalarında endoplazmik retikulum aminopeptidaz 1 (ERAP1) geninin ifadesi sağlıklı kemik iliği kontrollerine göre yüksek bulundu ve aday gen olarak belirlendi. Bu çalışmada, ERAP1’in multipl miyeloma patogenezinde doğrudan ya da dolaylı etkisinin olup olmadığının araştırılması amaçlandı. Yöntem: ERAP1 geninin ifade seviyeleri yeni tanılı, tedavi görmemiş 38 multipl miyeloma hastasından ve 23 önemi bilinmeyen monoklonal gammopati ile 16 kontrol kemik iliği materyallerinde qRT-PCR yöntemi ile incelendi. Elde edilen sonuçlar SPSS 25 istatistik programında analiz edildi. Bulgular: ERAP1 gen ifadesi multipl miyeloma, önemi bilinmeyen monoklonal gammopati ve kontrol grupları arasında karşılaştırıldığında gen ifadesi açısından anlamlı farklılık saptanmadı (p>0,05; p=0,280). Sonuç: RNA dizileme çalışmamız sonucunda ERAP1 geni ifadesi multipl miyeloma hastalarında daha yüksek bulunmasına rağmen, bu çalışmada qRT-PCR ile hasta ve kontrol grupları arasında ERAP1 gen ifadesinde bir farklılık saptanmadı. Ancak bu konuda kesin bir sonuca varabilmek için daha fazla örneklemde bu genin ifadesi araştırılmalıdır. Literatürde farklı kanser türlerinde ERAP1 ifadesi değişkenlik göstermektedir. Ayrıca oldukça polimorfik olan ERAP1 genindeki varyasyonların proteinin fonksiyonuna etkisi olabileceğinden ERAP1’in multipl miyeloma patogenezinde rolünün bu yönüyle de araştırılması gerektiği sonucuna varıldı.
Anahtar Kelime:

Investigation of Expression of the ERAP1 Gene in Plasma Cell Dyscrasia

Öz:
Objective: Monoclonal gammopathy of unknown significance (MGUS) is asymptomatic, and multiple myeloma (MM) is a symptomatic plasma cell dyscrasia. In our RNA sequencing study, the expression of the ERAP1 gene from the cell pools of MM patients and healthy bone marrow controls was found to be high in the patient group and it was investigated in this study whether it has a direct or indirect effect on MM pathogenesis. Method: The expression levels of the ERAP1 gene from the bone marrow materials of 38 newly diagnosed and untreated MM patients, 23 MGUS, and 16 control groups were examined by the qRT-PCR method. The results were analyzed in the SPSS.25 statistics program. Results: Expression levels of the ERAP1 gene were not statistically significant between the MM group, the MGUS group, and the control group (p>0.05) (p=0.280). Conclusion: The ERAP1 candidate gene with high RPKM value in our RNA sequencing study did not find a significant relationship between the validated patient and control groups. This issue should be investigated in more samples to reach a definite conclusion. In addition, it was concluded that the polymorphisms of the ERAP1 gene, highly polymorphic, should be studied in this aspect, and its effect on gene expression in myeloma.
Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Diğer Erişim Türü: Erişime Açık
  • 1. Lum EL, Bunnapradist S. Current opinions in nephrology and hypertension: Kidney transplantation in patients with plasma cell dyscrasias. Curr Opin Nephrol Hypertens 2019;28:573–80.
  • 2. Rossi A, Voigtlaender M, Janjetovic S, Thiele B, Alawi M, März M, et al. Mutational landscape reflects the biological continuum of plasma cell dyscrasias. Blood Cancer J 2017;7:e537.
  • 3. Soh KT, Tario JD Jr, Wallace PK. Diagnosis of plasma cell dyscrasias and monitoring of minimal residual disease by multiparametric flow cytometry. Clin Lab Med 2017;37:821–53.
  • 4. Gavriatopoulou M, Fotiou D, Ntanasis-Stathopoulos I, Kastritis E, Terpos E, Dimopoulos MA. How I treat elderly patients with plasma cell dyscrasias. Aging (Albany NY) 2018;10:4248–68.
  • 5. Leone P, Shin EC, Perosa F, Vacca A, Dammacco F, Racanelli V. MHC class I antigen processing and presenting machinery: Organization, function, and defects in tumor cells. J Natl Cancer Inst 2013;105:1172– 87.
  • 6. Sarıman M, Abacı N, Sırma Ekmekçi S, Çakiris A, Perçin Paçal F, Üstek D, et al. Investigation of gene expressions of myeloma cells in the bone marrow of multiple myeloma patients by transcriptome analysis. Balkan Med J 2019;36:23–31.
  • 7. Ri M. Mechanism of action and determinants of sensitivity to the proteasome inhibitor bortezomib in multiple myeloma therapy. Rinsho Ketsueki 2016;57:537–45. [Article in Japanese]
  • 8. Moore HE, Davenport EL, Smith EM, Muralikrishnan S, Dunlop AS, Walker BA, et al. Aminopeptidase inhibition as a targeted treatment strategy in myeloma. Mol Cancer Ther 2009;8:762–70.
  • 9. Stratikos E, Stamogiannos A, Zervoudi E, Fruci D. A role for naturally occurring alleles of endoplasmic reticulum aminopeptidases in tumor immunity and cancer pre-disposition. Front Oncol 2014;4:363.
  • 10. Koumantou D, Barnea E, Martin-Esteban A, Maben Z, Papakyriakou A, Mpakali A, et al. Editing the immunopeptidome of melanoma cells using a potent inhibitor of endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 (ERAP1). Cancer Immu nol Immunother 2019;68:1245–61.
  • 11. Compagnone M, Cifaldi L, Fruci D. Regulation of ERAP1 and ERAP2 genes and their disfunction in human cancer. Hum Immunol 2019;80:318–24.
  • 12. Mehta AM, Jordanova ES, Kenter GG, Ferrone S, Fleuren GJ. Association of antigen processing machinery and HLA class I defects with clinicopathological outcome in cervical carcinoma. Cancer Immunol Immunother 2008;57:197–206.
  • 13. Steinbach A, Winter J, Reuschenbach M, Blatnik R, Klevenz A, Bertrand M, et al. ERAP1 overexpression in HPV-induced malignancies: A possible novel immune evasion mechanism. Oncoimmunology 2017;6:e1336594.
APA Sariman M, Ayer M, Karaçam B, EKMEKÇİ S, SUER İ, ÇEFLE K, Palanduz S, ÖZTÜRK Ş, Nalcaci M, ABACI N (2022). ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi. , 120 - 124. 10.14744/iksstd.2021.29494
Chicago Sariman Melda,Ayer Mesut,Karaçam Büşra,EKMEKÇİ Sema Sırma,SUER İlknur,ÇEFLE Kıvanç,Palanduz Sukru,ÖZTÜRK ŞÜKRÜ,Nalcaci Meliha,ABACI Neslihan ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi. (2022): 120 - 124. 10.14744/iksstd.2021.29494
MLA Sariman Melda,Ayer Mesut,Karaçam Büşra,EKMEKÇİ Sema Sırma,SUER İlknur,ÇEFLE Kıvanç,Palanduz Sukru,ÖZTÜRK ŞÜKRÜ,Nalcaci Meliha,ABACI Neslihan ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi. , 2022, ss.120 - 124. 10.14744/iksstd.2021.29494
AMA Sariman M,Ayer M,Karaçam B,EKMEKÇİ S,SUER İ,ÇEFLE K,Palanduz S,ÖZTÜRK Ş,Nalcaci M,ABACI N ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi. . 2022; 120 - 124. 10.14744/iksstd.2021.29494
Vancouver Sariman M,Ayer M,Karaçam B,EKMEKÇİ S,SUER İ,ÇEFLE K,Palanduz S,ÖZTÜRK Ş,Nalcaci M,ABACI N ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi. . 2022; 120 - 124. 10.14744/iksstd.2021.29494
IEEE Sariman M,Ayer M,Karaçam B,EKMEKÇİ S,SUER İ,ÇEFLE K,Palanduz S,ÖZTÜRK Ş,Nalcaci M,ABACI N "ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi." , ss.120 - 124, 2022. 10.14744/iksstd.2021.29494
ISNAD Sariman, Melda vd. "ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi". (2022), 120-124. https://doi.org/10.14744/iksstd.2021.29494
APA Sariman M, Ayer M, Karaçam B, EKMEKÇİ S, SUER İ, ÇEFLE K, Palanduz S, ÖZTÜRK Ş, Nalcaci M, ABACI N (2022). ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi. İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi, 14(2), 120 - 124. 10.14744/iksstd.2021.29494
Chicago Sariman Melda,Ayer Mesut,Karaçam Büşra,EKMEKÇİ Sema Sırma,SUER İlknur,ÇEFLE Kıvanç,Palanduz Sukru,ÖZTÜRK ŞÜKRÜ,Nalcaci Meliha,ABACI Neslihan ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi. İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi 14, no.2 (2022): 120 - 124. 10.14744/iksstd.2021.29494
MLA Sariman Melda,Ayer Mesut,Karaçam Büşra,EKMEKÇİ Sema Sırma,SUER İlknur,ÇEFLE Kıvanç,Palanduz Sukru,ÖZTÜRK ŞÜKRÜ,Nalcaci Meliha,ABACI Neslihan ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi. İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi, vol.14, no.2, 2022, ss.120 - 124. 10.14744/iksstd.2021.29494
AMA Sariman M,Ayer M,Karaçam B,EKMEKÇİ S,SUER İ,ÇEFLE K,Palanduz S,ÖZTÜRK Ş,Nalcaci M,ABACI N ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi. İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi. 2022; 14(2): 120 - 124. 10.14744/iksstd.2021.29494
Vancouver Sariman M,Ayer M,Karaçam B,EKMEKÇİ S,SUER İ,ÇEFLE K,Palanduz S,ÖZTÜRK Ş,Nalcaci M,ABACI N ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi. İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi. 2022; 14(2): 120 - 124. 10.14744/iksstd.2021.29494
IEEE Sariman M,Ayer M,Karaçam B,EKMEKÇİ S,SUER İ,ÇEFLE K,Palanduz S,ÖZTÜRK Ş,Nalcaci M,ABACI N "ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi." İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi, 14, ss.120 - 124, 2022. 10.14744/iksstd.2021.29494
ISNAD Sariman, Melda vd. "ERAP1 Gen İfadesinin Plazma Hücre Diskrazilerinde İncelenmesi". İstanbul Kanuni Sultan Süleyman Tıp Dergisi 14/2 (2022), 120-124. https://doi.org/10.14744/iksstd.2021.29494