Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı
Yıl: 2022 Cilt: 56 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 349 - 356 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5578/mb.20229813 İndeks Tarihi: 22-06-2022
Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı
Öz: Çok ilaca dirençli gram-negatif basiller ile gelişen enfeksiyonlarda son seçenek olarak kolistin kullanılmaktadır. Bu nedenle kolistin duyarlılığının doğru belirlenmesi kritik önem kazanmıştır. Ne yazık ki, klinik
laboratuvarda yaygın olarak kullanılmakta ve uygulaması pratik olan pek çok yöntem kolistin duyarlılığının
belirlenmesi açısından çeşitli kısıtlılıklara sahiptir. Bu durum araştırmacıları kolistin duyarlılığının belirlenmesi
için yeni yöntemler araştırmaya yönlendirmiştir. Bu çalışmada, Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumannii izolatlarında kolistin duyarlılığının hızlı tanımlanması amacıyla geliştirilmiş olan ResaPolymyxin NP
testinin çeşitli gram-negatif bakteriler için kolistin duyarlılığının belirlenmesindeki performansının değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla çalışmaya dahil edilen 105 Escherichia coli ve 196 Klebsiella pneumoniae
izolatının kolistin MİK değeri, katyonlu Mueller-Hinton sıvı besiyeri kullanılarak sıvı mikrodilüsyon (BMD) ile
saptanmış ve sonrasında her bir izolat için ResaPolymyxin NP deneyi uygulanmıştır. Çalışmaya dahil edilen
izolatların BMD ile 242 (%80.4)’si kolistine duyarlı bulunurken, ResaPolymyxin NP testi ile izolatların 214
(%71.1)’ü kolistine duyarlı bulunmuştur. ResaPolymyxin NP testinde kategorik uyum oranı E.coli izolatları
için %85.7 iken, K.pneumoniae izolatları için %92.3 olarak belirlenmiştir. Büyük hata oranı E.coli için %14.7
ve K.pneumoniae için %10.8 iken çok büyük hata oranı K.pneumoniae için %1.8 olarak tespit edilmiştir.
ResaPolymyxin NP testinin sırasıyla duyarlılık, özgüllük, pozitif ve negatif prediktif değerleri %98.3; %88.0;
%66.7 ve %99.5 olarak belirlenmiştir. ResaPolymyxin NP testi ile ilgili mevcut verilerin aksine BMD ile gerek
kategorik uyum oranı gerekse çok büyük hata ve büyük hata oranları izolat türüne göre değişkenlik göstermiş olup, testin E.coli ve K.pneumoniae izolatlarında nispeten daha iyi performans gösterdiği saptanmıştır.
Bu çalışmada elde edilen veriler daha önce yayımlanmış verilerden oldukça farklı olması sebebiyle, ResaPolymyxin NP testinin klinik mikrobiyoloji laboratuvarlarında kullanımını önerebilmek için test etkinliğini
değerlendirmek üzere daha kapsamlı ve çok merkezli çalışmalara gereksinim vardır.
Anahtar Kelime: The Use of Resapolymyxin NP Test in Determining theSensitivity of Colistin in Escherichia coli, and Klebsiellapneumoniae Isolates
Öz: Colistin is used as the last choice of drug in multidrug resistant gram-negative bacilli infections; therefore, accurate detection of colistin susceptibility has gained critical importance. Unfortunately, many of the
widely used and practical methods in the clinical laboratory have various limitations for the determination
of colistin susceptibility. This situation has led researchers to search for new methods to determine colistin
susceptibility. In this study, the performance of the ResaPolymyxin NP test, which was developed for the
rapid detection of colistin susceptibility of Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii isolates,
was evaluated for various Gram-negative bacteria for the determination of colistin susceptibility. For this
purpose, the colistin MIC values of 105 Escherichia coli, and 196 Klebsiella pneumoniae isolates were determined by broth microdilution (BMD) using cation-adjusted Mueller-Hinton broth and then ResaPolymyxin
NP test was applied for each isolate. While 242 (%80.4) of the isolates included in the study were found
to be susceptible to colistin with BMD, 214 (71.1%) of the isolates were found as sensitive to colistin with
the ResaPolymyxin NP test. The categorical agreement rate for the ResaPolymyxin NP test was 85.7% for
E.coli isolates, and 92.3% for K.pneumoniae isolates. The major error rate was 14.7% for E.coli, 10.8% for
K.pneumoniae, whereas the very major error rate was 1.8% for K.pneumoniae. For ResaPolymyxin NP test,
sensitivity, specificity, positive and negative predictive values were %98,3; %88.0; %66.7; and %99.5. In
contrast to the available data about the ResaPolymyxin NP test, both the categorical agreement rate with
BMD, and the very major and major error rates varied according to the isolate type, and it was concluded
that the test performed relatively better in E.coli and K.pneumoniae isolates. Since the data obtained in this
study are quite different from the previously published data, more comprehensive and multicenter studies
are needed to evaluate the test effectiveness in order to recommend the use of the ResaPolymyxin NP test
in clinical microbiology laboratories.
Anahtar Kelime: Belge Türü: Makale Makale Türü: Kısa Bildiri Erişim Türü: Bibliyografik
- 1. Bialvaei AZ, Kafil HS. Colistin, mechanisms and prevalence of resistance. Curr Med Res Opin 2015; 31(4): 707-21. https://doi.org/10.1185/03007995.2015.1018989
- 2. Humphries RM. Susceptibility testing of the polymyxins: where are we now? Pharmacotherapy 2015; 35: 22-7. https://doi.org/10.1002/phar.1505
- 3. Turlej-Rogacka A, Xavier BB, Janssens L, Lammens C, Zarkotou O, Pournaras S et al. Evaluation of colistin stability in agar and comparison of four methods for MIC testing of colistin. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2018; 37(2):345-53. https://doi.org/10.1007/s10096-017-3140-3
- 4. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing Recommendations for MIC determination of colistin (polymyxin E) As recommended by the joint CLSI-EUCAST Polymyxin Breakpoints Working Group.). EUCAST 2016.
- 5. Lescat M, Poirel L, Tinguely C, Nordmann P. A Resazurin Reduction-Based Assay for Rapid Detection of Polymyxin Resistance in Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa. J Clin Microbiol 2019; 57(3): e01563-18. https://doi.org/10.1128/JCM.01563-18
- 6. Nordmann P, Jayol A, Poirel L. Rapid detection of polymyxin resistance in Enterobacteriaceae. Emerg Infect Dis 2016; 6: 1038-43. https://doi.org/10.3201/eid2206.151840
- 7. McGaw LJ, Elgorashi EE, Jacobus NE, pp 181-233. In: Kuete V (ed), Toxicological Survey of African Medicinal Plants. 2014, 1st ed. Elsevier Inc. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-800018-2.00008-X
- 8. ISO 20776-1 (2006). Clinical laboratory testing and in vitro diagnostic test systems -Susceptibility testing of infectious agents and evaluation of performance of antimicrobial susceptibility test devices- Part 1: Reference method for testing the in vitro activity of antimicrobial agents against rapidly growing aerobic bacteria involved in infectious diseases.
- 9. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing, EUCAST. EUCAST disk difüzyon testi ve sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile MİK değerlerinin belirlenmesi için besiyeri hazırlanması. Sürüm 4.0, 2014.
- 10. European Committee for Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Dieases (ESCMID). EUCAST Definitive Document E.Def 1.2, May 2000: Terminology relating to methods for the determination of susceptibility of bacteria to antimicrobial agents. Clin Microbiol Infect 2000; 6(9): 503-8.
- 11. ISO 20776-2 (2007). Clinical laboratory testing and in vitro diagnostic test systems -Susceptibility testing of infectious agents and evaluation of performance of antimicrobial susceptibility test devices- Part 2: Evaluation of performance of antimicrobial susceptibility test devices.
- 12. Germ J, Poirel L, Kisek TC, Spik VC, Seme K, Premru MM, et al. Evaluation of resazurin-based rapid test to detect colistin resistance in Acinetobacter baumannii isolates. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2019; 38(11):2159-62. https://doi.org/10.1007/s10096-019-03657-1
- 13. Jia H, Fang R, Lin J, Tian X, Zhao Y, Chen L, et al. Evaluation of resazurin-based assay for rapid detection of polymyxin-resistant gram-negative bacteria. BMC Microbiol 2020; 20(1): 7. https://doi.org/10.1186/ s12866-019-1692-3
- 14. Ezadi F, Ardebili A, Mirnejad R. Antimicrobial susceptibility testing for polymyxins: challenges, issues, and recommendations. J Clin Microbiol 2019; 57(4): e01390-18. https://doi.org/10.1128/JCM.01390-18
| APA | BEŞLİ Y, Liste Ü, kırbaş e, SANCAK B (2022). Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı. , 349 - 356. 10.5578/mb.20229813 |
| Chicago | BEŞLİ YEŞİM,Liste Ümran,kırbaş ekin,SANCAK BANU Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı. (2022): 349 - 356. 10.5578/mb.20229813 |
| MLA | BEŞLİ YEŞİM,Liste Ümran,kırbaş ekin,SANCAK BANU Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı. , 2022, ss.349 - 356. 10.5578/mb.20229813 |
| AMA | BEŞLİ Y,Liste Ü,kırbaş e,SANCAK B Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı. . 2022; 349 - 356. 10.5578/mb.20229813 |
| Vancouver | BEŞLİ Y,Liste Ü,kırbaş e,SANCAK B Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı. . 2022; 349 - 356. 10.5578/mb.20229813 |
| IEEE | BEŞLİ Y,Liste Ü,kırbaş e,SANCAK B "Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı." , ss.349 - 356, 2022. 10.5578/mb.20229813 |
| ISNAD | BEŞLİ, YEŞİM vd. "Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı". (2022), 349-356. https://doi.org/10.5578/mb.20229813 |
| APA | BEŞLİ Y, Liste Ü, kırbaş e, SANCAK B (2022). Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı. Mikrobiyoloji Bülteni, 56(2), 349 - 356. 10.5578/mb.20229813 |
| Chicago | BEŞLİ YEŞİM,Liste Ümran,kırbaş ekin,SANCAK BANU Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı. Mikrobiyoloji Bülteni 56, no.2 (2022): 349 - 356. 10.5578/mb.20229813 |
| MLA | BEŞLİ YEŞİM,Liste Ümran,kırbaş ekin,SANCAK BANU Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.56, no.2, 2022, ss.349 - 356. 10.5578/mb.20229813 |
| AMA | BEŞLİ Y,Liste Ü,kırbaş e,SANCAK B Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı. Mikrobiyoloji Bülteni. 2022; 56(2): 349 - 356. 10.5578/mb.20229813 |
| Vancouver | BEŞLİ Y,Liste Ü,kırbaş e,SANCAK B Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı. Mikrobiyoloji Bülteni. 2022; 56(2): 349 - 356. 10.5578/mb.20229813 |
| IEEE | BEŞLİ Y,Liste Ü,kırbaş e,SANCAK B "Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı." Mikrobiyoloji Bülteni, 56, ss.349 - 356, 2022. 10.5578/mb.20229813 |
| ISNAD | BEŞLİ, YEŞİM vd. "Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae İzolatlarında Kolistin Duyarlılığının Belirlenmesinde ResaPolymyxin NP Testinin Kullanımı". Mikrobiyoloji Bülteni 56/2 (2022), 349-356. https://doi.org/10.5578/mb.20229813 |
