5 2

Proje Grubu: SBAG Sayfa Sayısı: 29 Proje No: 117S960 Proje Bitiş Tarihi: 15.01.2019 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 10-03-2020

Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü

Öz:
Otozomal dominant bir hastalık olan Nörofibromatozis tip 1 (NF1), NF1 genindeki mutasyonlar nedeni ile çeşitli dokulardaki gelişme ve büyüme kontrolu hataları ile ortaya çıkar. NF1 gen mutasyonları malin periferal sinir kılıfı tümörü (MPNST), optik gliyoma, ve Lösemi gibi kötü huylu tümörlerin gelişmesinde başlıca risk faktörüdür. NF1 geni genomik DNA üzerinde 350 kb uzunluğunda 61 ekzondan oluşan tahminen 11-13 kb büyüklüğünde bir transkript kodlar. NF1 genin 27b intronu içinde EVI2A, EVI2B, ve OMGP adlı 3 gen yer almaktadır. NF1 genin ters yönünde transkibe olan bu üç gen hakkında çok az bilgi mevcuttur. EVI2A ve EVI2B genlerin bir transmembran proteinini kodladığı varsayılmaktadır. Bu genlerin faredeki homoloğu (Evi-2a ve Evi-2b; ekotropik viral entegrasyon bölgesi) fare Lösemi modellerinde virüslerin insersiyonu ile bağlantılı bulunmuştur ancak NF1 hastalığının bulguları ile ilişkisi bilinmemektedir. Önceki çalışmalarda Evi2b genin, myeloid farklılaşmasında kritik bir rolü olan C/EBPa transkripsiyon faktörünün direkt hedefi olduğu tanımlanmıştır. Her ne kadar bu bilgi teyit edilmediyse de bu genlerin NF1 hastalarında görülen Lösemi ile ilişkili olması olasıdır. Bu genlerin ifadeleri viral entegrasyon ile değişir ve bu değişen gen ifadesi myeloid hastalıkların patogenezinde rol oynayabilir. Bu nedenle EVI2A ve EVI2B gen değişimlerini NF1 tümörlerinde ve Lösemi hastalarında incelemeye karar verildi ve çalışıldı. Bu amaç için 10 NF1 tümörü, 20 Lösemi ve 3 NF1-Lösemi hastanın DNA?sı analiz edildi. Deneyde kullanılan genomik DNA?lar periferal kan örneklerinden izole edilmiştir. Tümörlerin patolojik durumları rutin patolojik tetkikler ile sağlanmıştır. Akım sitometri ve Kantitatif gerçek zamanlı PCR yöntemlerini kullanarak EVI2B proteinin miktarına ve gen ifadesine bakıldı. Akım sitometri ve RT-PCR deneylerinde elde edilen sonuçlar bir birini destekler nitelikte bulunmuştur ve DNA dizi analizi çalışmalarında EVI2B 2. ekzondaki insersiyon dizisi retroviral genom veri tabanına ?Blast?landığı zaman bir Retro virus olan HIV-1 virusu envelope (env) genine % 87 eşleşme göstermiştir. Bu bulgu hipotezimizin doğru olduğuna önemli bir kanıttır. Viral genom entegrasyonları tümör süpressör genlerin inaktivasyonunda önemli bir mekanizmadır. Sonuç olarak, NF1 geni intron 27 de karşı zincirden ifade olan EVI2B geni viral entegrasyon bölgesi olduğundan olası viral katılımlar NF1 geninde de değişiliklere neden olabilmektedir. Bu değişiklikler de NF1 tümörlerinin patogenezinde modifiye edici bir etki olarak değerlendirilebilir. Kapsam olarak bu çalışma tamamen orijinaldir ve literatürde benzer bir çalışma yoktur.
Anahtar Kelime: modifiye edici genler Nörofibromatosiz tip 1 (NF1) hastalığı; Lösemi; EVI2A/EVI2B genleri

Konular: Onkoloji
Erişim Türü: Erişime Açık
  • Abramowicz A, Gos M. 2015. "Neurofibromin - protein structure and cellular functions in the context of neurofibromatosis type I pathogenesis", Postepy Hig Med Dosw, 69,1331-1348.
  • Bizzarri C, Bottaro G. 2015. "Endocrine implications of neurofibromatosis 1 in childhood", Horm Res Paediatr, 83, 232-241.
  • Cawthon RM, O'Connell P, Buchberg AM, Viskochil D, Weiss RB, Culver M, Stevens J, Jenkins NA, Copeland NG, White R. 1990. "Identification and characterization of transcripts from the neurofibromatosis 1 region: the sequence and genomic structure of EVI2 and mapping of other transcripts", Genomics, 7, 555-565.
  • Cawthon RM, Andersen LB, Buchberg AM, Xu G, O'Connell P, Viskochil D, Weiss RB, Wallace MR, Marchuk DA, Culver M, Stevens J, Jenkins NA, Copeland NG, Collins FS, White R. 1991."cDNA sequence and genomic structure of EVI2B, a gene lying within an intron of the neurofibromatosis type 1 gene", Genomics, 9, 446-460.
  • Kaufmann D, Gruener S, Braun F, Stark M, Griesser J, Hoffmeyer S, Bartelt B. 1999. "EVI2B, a gene lying in an intron of the neurofibromatosis type 1 (NF1) gene, is as the NF1 gene involved in differentiation of melanocytes and keratinocytes and is overexpressed in cells derived from NF1 neurofibromas", DNA Cell Biol, 18, 345-356.
  • Liss A, Ooi CH, Zjablovskaja P, Benoukraf T, Radomska HS, Ju C, Wu M, Balastik M, Delwel R, Brdicka T, Tan P, Tenen DG, Alberich-Jorda M. 2014. "The gene signature in CCAAT- enhancer-binding protein alpha dysfunctional acute myeloid leukemia predicts responsiveness to histone deacetylase inhibitors", Haematologica, 99, 697-705.
  • Maertens O, Cichowski K. 2014. "An expanding role for RAS GTPase activating proteins (RAS GAPs) in cancer", Adv Biol Regul, 55, 1-14.
  • Pasmant E, Masliah-Planchon J, Levy P, Laurendeau I, Ortonne N, Parfait B, Valeyrie- Allanore L, Leroy K, Wolkenstein P, Vidaud M, Vidaud D, Bieche I. 2011. "Identification of genes potentially involved in the increased risk of malignancy in NF1-microdeleted patients", Mol Med, 17, 79-87.
  • Rypacek F, Banks WR, Noskova D, Digenis GA. 1994. "Synthetic macromolecular inhibitors of human leukocyte elastase. 1. Synthesis of peptidyl carbamates bound to water-soluble polymers: poly-alpha, beta-[N-(2-hydroxyethyl)-D, L-aspartamide] and poly-alpha-[N5-(2- hydroxyethyl)-L-glutamine]", J Med Chem, 37, 1850-1856.
  • Shen MH, Harper PS, Upadhyaya M. 1996. "Molecular genetics of neurofibromatosis type 1 (NF1)", J Med Genet, 33, 2-17.
  • Oguzkan S, Terzi YK, Cinbis M, Anlar B, Aysun S, Ayter S. 2006. "Molecular genetic analyses in neurofibromatosis type 1 patients with tumors", Cancer Genet Cytogenet, 165(2), 167-71.
  • Terzi YK, Sirin B, Hosgor G, Serdaroglu E, Anlar B, Aysun S, Ayter S. 2012. "Two pathogenic NF1 gene mutations identified in DNA from a child with mild phenotype", Childs Nerv Syst, 28, 943-946.
  • The Human Protein atlas. http://www.proteinatlas.org/search/EVI2.
  • Trovo-Marqui AB, Tajara EH. 2006. "Neurofibromin: a general outlook", Clin Genet, 70, 1-13.
  • von Deimling A, Krone W, Menon AG. 1995. "Neurofibromatosis type 1: pathology, clinical features and molecular genetics", Brain Pathol, 5, 153-162.
  • Zjablovskaja P, Kardosova M, Danek P, Angelisova P, Benoukraf T, Wurm AA, Kalina T, Sian S, Balastik M, Delwel R, Brdicka T, Tenen DG, Behre G, Fiore F, Malissen B, Horejsi V, Alberich-Jorda M. 2017. “EVI2B is a C/EBPα target gene required for granulocytic differentiation and functionality of hematopoietic progenitors”, Cell Death Differ, 24(4), 705- 716.
APA AYTER Ş, SHARAFİ P, Anlar B, Varan A, ÇETIN M (2019). Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü. , 1 - 29.
Chicago AYTER Şükriye,SHARAFİ Parisa,Anlar Banu,Varan Ali,ÇETIN MUALLA Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü. (2019): 1 - 29.
MLA AYTER Şükriye,SHARAFİ Parisa,Anlar Banu,Varan Ali,ÇETIN MUALLA Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü. , 2019, ss.1 - 29.
AMA AYTER Ş,SHARAFİ P,Anlar B,Varan A,ÇETIN M Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü. . 2019; 1 - 29.
Vancouver AYTER Ş,SHARAFİ P,Anlar B,Varan A,ÇETIN M Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü. . 2019; 1 - 29.
IEEE AYTER Ş,SHARAFİ P,Anlar B,Varan A,ÇETIN M "Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü." , ss.1 - 29, 2019.
ISNAD AYTER, Şükriye vd. "Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü". (2019), 1-29.
APA AYTER Ş, SHARAFİ P, Anlar B, Varan A, ÇETIN M (2019). Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü. , 1 - 29.
Chicago AYTER Şükriye,SHARAFİ Parisa,Anlar Banu,Varan Ali,ÇETIN MUALLA Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü. (2019): 1 - 29.
MLA AYTER Şükriye,SHARAFİ Parisa,Anlar Banu,Varan Ali,ÇETIN MUALLA Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü. , 2019, ss.1 - 29.
AMA AYTER Ş,SHARAFİ P,Anlar B,Varan A,ÇETIN M Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü. . 2019; 1 - 29.
Vancouver AYTER Ş,SHARAFİ P,Anlar B,Varan A,ÇETIN M Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü. . 2019; 1 - 29.
IEEE AYTER Ş,SHARAFİ P,Anlar B,Varan A,ÇETIN M "Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü." , ss.1 - 29, 2019.
ISNAD AYTER, Şükriye vd. "Lösemiler ve NF1 ile İlişkili Tümörlerde EVI2A ve EVI2B Genlerinin Rolü". (2019), 1-29.