Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler

GÜLEŞ, ÖZAY; EREN, Ülker

Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler

Özay GÜLEŞ, (Adnan Menderes Üniversitesi, Aydın, Türkiye)

Ülker EREN (Adnan Menderes Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Histoloji Embriyoloji Anabilim Dalı, Aydın, Türkiye)

Yüzüncü Yıl Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi

119 13

Yıl: 2008 Cilt: 19 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 73 - 78 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler

Öz:

Apoptoz (fizyolojik hücre ölümü), hücre intiharı olarak da bilinen fizyolojik bir olaydır. Apoptoz için sinyal alındıktan sonra hücrede birçok biyokimyasal (DNA parçalanması, fosfotidilserin moleküllerinin hücre membranın dış yüzeyine çıkması) ve morfolojik değişim (hücre küçülmesi, kromatin yoğunlaşması, apoptotik cisimcikler) gözlenir. Bu değişimleri saptamak için çok çeşitli yöntemler geliştirilmiştir. DNA fragmentasyonu histokimyasal olarak (TUNEL) gösterilebileceği gibi, biyokimyasal (agoroz jel elektroforezi) olarak da gösterilebilir. Hatta, ELISA ile de gösterilebilir. Transmisyon elektron mikroskopisi, apoptozun morfolojik olarak tanınması için iyi bir yöntemdir. Apoptoz ayrıca Caspase-3 (Kaspaz-3) metodu kullanılarak da belirlenebilir

Anahtar Kelime: mikroskopla inceleme elektroforez Western Blot teknikleri DNA yıkılma programlanmış hücre ölümü ELISA

Konular: Biyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Biyokimya ve Moleküler Biyoloji

Methods for detection of apoptosis

Öz:

Apoptosis (physiological cell death) also known as suicide of cells is physiological event. When cells are determined to die by apoptosis, they indicate some biochemical (DNA fragmentation, phosphatidylserine translocated to the outer leaflet of apoptotic cell membranes) and morphological changes (cell shrinkage, chromatin condensation, apoptotic bodies) after indicate for apoptosis. These changes can be determined by means of various methods. DNA fragmentation can be determined by histochemical (TUNEL) and biochemical (agarose gel elecrophoresis) methods and ELISA. Transmition electron microscopy is suitable method for morphological changes. In addition, apoptosis also can be determined by using caspase-3 method.

Anahtar Kelime: apoptosis ELISA microscopy electrophoresis Western Blot techniques DNA degradation

Konular: Biyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Biyokimya ve Moleküler Biyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Derleme Erişim Türü: Erişime Açık

1. Aral H (1996): Apoptotik hücrelerin tanınma yöntemleri. Sendrom, 38-42.
2. Bardakçı F, Yenidünya A F (2007): Moleküler biyoloji teknikleri 1:Nükleik asit analiz teknikleri (in) Moleküler Biyoloji. A Yıldırım, F Bardakçı, M Karataş, B Tanyolaç (Editör), 519-553, Nobel Yayın, Ankara.
3. Bellamy C O, Malcomson, R D, Harrison, D J, Wyllie A H (1995): Cell death in health and disease: the biology and regulation of apoptosis. Cancer Biology, 6: 3-16.
4. Bortner C D, Oldenburg N B, Cidlowski J A (1995): The role of DNA fragmentation in apoptosis. Trends Cell Biol., 5: 21–6.
5. Bossù P (2007): Qualitative analysis of dna fragmentation by agarose gel electrophoresis. Erişim: [http://www.cyto.purdue.edu/flowcyt/research/cytotech/apopto/data/chap4.htm] Erişim Tarihi: 05.11.2007.
6. Bratton D L, Fadok V A, Richter D A, Kailey J M, Guthrie L A, Henson P M (1997): Appearance of phosphatidylserine on apoptotic cells requires calcium-mediated nonspecific flip-flop and is enhanced by loss of the aminophospholipid translocase. J. Biol. Chem., 272: 26159–26165.
7. Carson D A, Rbiero J M (1993): Apoptosis and disease. The Lancet, 341: 1251-1254.
8. Caulin C, Salvesen G S, Oshima R G (1997): Caspase cleavage of keratin 18 and reorganization of ıntermediate filaments during epithelial cell apoptosis. The Journal of Cell Biology, 138(6): 1379-1394.
9. Cohen J J (1993): Programmed cell death and apoptosis in lymphocyte development and function. American College of Physicians, CHEST, 103: 99-101.
10. Cummings M C, Winterfold C M, Walker N I (1997): Apoptosis. Am. J. Surg. Pathol., 21: 88-101.
11. Elmore S (2007) Apoptosis: A review of programmed cell death. Toxicol. Pathol., 35(4): 495–516.
12. Gatti R, Belletti S, Orlandini G, Bussolati O, Dall’asta V, Gazzola G C (1998): Comparison of Annexin V and calcein-AM as early vital markers of apoptosis in adherent cells by confocal laser microscopy. J. Histochem. Cytochem., 46: 895–900.
13. Gavrieli Y, Sherman Y, Ben-Sasson S A (1992): Identification of programmed cell death in situ via specific labeling of nuclear DNA fragmentation. J. Cell Biol., 119: 493-501.
14. Grieken N C T, Meijer G A, Hausen A, Meuwissen S G M, Baak J P A, Kuipers E J (2003): Increased apoptosis in gastric mucosa adjacent to intestinal metaplasia. J. Clin. Pathol., 56: 358–362.
15. Kockx M M, Muhring J, Knaapen M W M, de Meyer G R Y (1998): RNA synthesis and splicing interferes with DNA in situ end labeling techniques used to detect apoptosis. Am. J. Pathol., 152: 885.
16. Kopman G, Reutelingsperger C P, Kuijten G A, Keehnen R M, Pals S T, van Oers N H (1994): Annexin V for flow cytometric detection of phosphatidylserine expression on B cells undergoing apoptosis. Blood., 84: 1415–1420.
17. Kressel M, Groscurth P (1994): Distinction of apoptotic and necrotic cell death by in situ labelling of fragmented DNA. Cell Tissue Res., 278: 549–56.
18. Leers M P, Kolgen W, Bjorklund V, Bergman T, Tribbick G, Persson B, Bjorklund P, Ramaekers F C, Bjorklund B, Nap M, Jornvall H, Schutte B (1999): Immunocytochemical detection and mapping of a cytokeratin 18 neo-epitope exposed during early apoptosis. J. Pathol., 187: 567–572.
19. Majno G, Joris I (1995): Apoptosis, oncosis, and necrosis: An overview of cell death. Am. J. Pathol., 146: 3-15.
20. Mak T (2003): The E. Donnall Thomas Lecture-apoptosis: "tis death that makes life live". Biol. Blood Marrow Transplant, 9: 483-8.
21. Morrone S (2007): Annexın V. Purdue Cytometry CD-ROM Series, volume 4 Erişim: [http://www.cyto.purdue.edu/ flowcyt/research/cytotech/apopto/data/chap16.htm] Erişim Tarihi: 02.12.2007.
22. Mountz J D, Zhou T (2001): Apoptosis and autoimmunity (in) A Textbook of Rheumatology: Artritis and allied conditions. WJ Kopman (Editör), Lippincott-Williams&Wilkins.
23. Overbeeke R, Steffens-Nakken H, Vermes I, Reutelingsperger C, Hanen C. (1998): Early features of apoptosis detected by four different flow cytometry assays. Apoptosis, 3: 115.
24. Öniz H (2004): Apoptoz: Ölmeye yatmak. SSK Tepecik Eğitim Hastanesi Dergisi, 14(1).
25. Palazzo I G, Lega A, Farinha G S, Berrotarán N, Ortiz S (2005): Infrecuente neoplasia de utero:linfoma primario, presentacion de un caso. Congreso Virtual Hispanoamericano de Anatomia Patologica.
26. Pınarbaşı E (2007): Apoptozis (Programlı Hücre Ölümü) (in) Moleküler Biyoloji. A Yıldırım, F Bardakçı, M Karataş, B Tanyolaç (Editör), 423-468, Nobel Yayın, Ankara.
27. Sakahira H, Enari M, Nagata S (1998): Cleavage of CAD inhibitor in CAD activation and DNA degradation during apoptosis. Nature., 391: 96–9.
28. Salgame P, Varadhachary A S, Primiano L L, Fincke J E, Muller S, Monestier M (1997): An ELISA for detection of apoptosis. Nucleic Acids Research, 25(3): 680–681.
29. Schwartzman R A, Cidloski J A (1993): Apoptosis; the biochemistry and molecular biology of programmed cell death. Endocrine Reviews, 14: 133-144.
30. Sereno D, Holzmuller P, Mangot I, Cuny G, Ouaissi A, Lemesre J L (2001): Antimonial-mediated dna fragmentation in leishmania infantum amastigotes. Antimicrob Agents Chemother, 45(7): 2064–2069.
31. Spector D L, Goldman R D, Leinwand L A (1998): Culture and Biochemical Analysis of Cells (in) Cells: A Laboratory Manual. DL Spector (Editör), 15.1-15.24, Cold Spring Harbor Laboratory Press, USA.
32. Squier M K, Miller A C, Malkinson A M, Cohen J J (1994): Calpain activation in apoptosis. J. Cell Physiol., 159(2): 229-237.
33. Tesarik J, Greco E, Cohen-Bacrie P, Mendoza C (1998): Germ cell apoptosis in men with complete and incomplete spermiogenesis failure. Mol. Hum. Reprod., 4: 757.
34. Thompson C B (1995): Apoptosis in the pathogenesis and treatment of disease. Science, 267: 1456–1462.
35. Trump B F, Berezesky I K, Chang S H, Phelps P C (1997): The pathways of cell death: oncosis, apoptosis, and necrosis. Toxicol. Pathol., 25: 82–8.
36. Ulukaya E (2003): Apoptozis Ders Notları. Erişim: [http://biyokimya.uludag.edu.tr/ apoptozisdersnotu.pdf] Erişim tarihi: 04.05.2007.
37. Vaux D L, Flavell R A (2000): Apoptosis genes and autoimmunity. Curr. Opin. Immunol., 12: 719–724.
38. Vitale M, Zauli G, Falcieri E (2007): Apoptosis and necrosis. Purdue Cytometry CD-ROM Series, volume 4, Erişim: [http://www. cyto. purdue. edu/ flowcyt / research / cytotech / apopto / data/chap10.htm] Erişim Tarihi: 02.11.2007.
39. Yılmaz İ (2005): Erişkin ratlarda deneysel varikosel oluşturulması sonrası testislerde germ hücrelerinde apoptozis düzeylerinin yükselmesi ve yükselmiş olan apoptozisin varikoselektomi sonrası gerileme düzeyi ve süresinin tunel yöntemi ile değerlendirilmesi, Uzmanlık Tezi, Taksim Eğitim ve Araştırma Hastanesi Üroloji Kliniği, İstanbul.
40. Zhang G, Gurtu V, Kain S R, Yan G (1997): Early detection of apoptosis using a fluorescent conjugate of Annexin V. Biotechniques, 23: 525–531.

APA	GÜLEŞ Ö, EREN Ü (2008). Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler. , 73 - 78.
Chicago	GÜLEŞ ÖZAY,EREN Ülker Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler. (2008): 73 - 78.
MLA	GÜLEŞ ÖZAY,EREN Ülker Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler. , 2008, ss.73 - 78.
AMA	GÜLEŞ Ö,EREN Ü Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler. . 2008; 73 - 78.
Vancouver	GÜLEŞ Ö,EREN Ü Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler. . 2008; 73 - 78.
IEEE	GÜLEŞ Ö,EREN Ü "Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler." , ss.73 - 78, 2008.
ISNAD	GÜLEŞ, ÖZAY - EREN, Ülker. "Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler". (2008), 73-78.

APA	GÜLEŞ Ö, EREN Ü (2008). Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 19(2), 73 - 78.
Chicago	GÜLEŞ ÖZAY,EREN Ülker Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 19, no.2 (2008): 73 - 78.
MLA	GÜLEŞ ÖZAY,EREN Ülker Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, vol.19, no.2, 2008, ss.73 - 78.
AMA	GÜLEŞ Ö,EREN Ü Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi. 2008; 19(2): 73 - 78.
Vancouver	GÜLEŞ Ö,EREN Ü Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi. 2008; 19(2): 73 - 78.
IEEE	GÜLEŞ Ö,EREN Ü "Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler." Yüzüncü Yıl Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 19, ss.73 - 78, 2008.
ISNAD	GÜLEŞ, ÖZAY - EREN, Ülker. "Apoptozun belirlenmesinde kullanılan yöntemler". Yüzüncü Yıl Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 19/2 (2008), 73-78.