Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları

KURŞUN, Şenol; Karahan, Zeynep Ceren; TEKELI, ALPER; KANYILMAZ, Dilek; COŞKUN, Feride Alaca; US, EBRU; AKSU, Neriman; Baran, Irmak; MUMCUOGLU, IPEK

Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları

Feride Alaca COŞKUN, (Sağlık Bakanlığı, Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Bölümü, Ankara, Türkiye)

İpek MUMCUOĞLU, (Sağlık Bakanlığı, Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Bölümü, Ankara, Türkiye)

Neriman AKSU, (Sağlık Bakanlığı, Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Bölümü, Ankara, Türkiye)

Zeynep Ceren KARAHAN, (Ankara Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Ebru US, (Ankara Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Fazıl Alper TEKELİ, (Ankara Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Irmak BARAN, (Sağlık Bakanlığı, Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Bölümü, Ankara, Türkiye)

Dilek KANYILMAZ, (Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Enfeksiyon Kontrol Komitesi, Ankara, Türkiye)

Şenol KURŞUN (Ankara Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara, Türkiye)

Mikrobiyoloji Bülteni

0 0

Yıl: 2012 Cilt: 46 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 276 - 282 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları

Öz:

Hastanemizde, enfeksiyon kontrol programı çerçevesinde yürütülen sürveyans çalışmaları sırasında, bir yıllık dönemde 38 vankomisine dirençli enterokok (VRE) suşu izole edilmiştir. Tüm suşlar VITEK2 (bi-oMerieux/Fransa) sistemi kullanılarak Enterococcus faecium olarak tanımlanmıştır. Antimikrobiyal duyarlı- lık testi sonucunda hem vankomisin hem de teikoplanine dirençli 30 suş vanA fenotipi olarak tanımlanırken, vankomisine dirençli, teikoplanine duyarlı sekiz suş vanB fenotipi olarak değerlendirilmiştir. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi kullanılarak 30 suşun vanA geni taşıdığı tespit edilirken, beş suşun vanB geni taşıdığı belirlenmiştir. Bu beş suş ülkemizde bildirilen ilk vanB pozitif E.faecium izolatlarıdır. Pul-sed field jel elektroferezi (PFGE) ile yapılan değerlendirmede altı farklı bant paterni izlenmiş, altı suş ise sınıflandırılamamıştır. VanB tip direnç gösteren tüm suşların aynı grupta yer aldığı tespit edilmiştir. Bu suşların kaynağı hemodiyaliz ünitesi olarak belirlenmiştir. Daha önce yapılan çalışmalara bakıldığında bu çalışmada, ülkemizde vanB geninin E.faecium suşlarında ilk defa gösteriliyor olması, VRE izolasyon oranı kadar direnç çeşitliliğinin de artmakta olduğunu düşündürmektedir. Hastanelerde VRE yayılımının engellenebilmesi için etkili sürveyans çalışmalarının yapılması ve koruyucu önlemlerin alınması gereklidir

Anahtar Kelime: İlaç direnci, bakteriyel Elektroforez, jel, pulzasyonlu alan Genotiplendirme teknikleri Polimeraz zincir reaksiyonu Vankomisin direnci Vankomisin Enterococcus faecium Enterococcus

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Phenotypic and genotypic traits of vancomycin-resistant Enterococci in a public hospital: The first vanB-positive enterococcus faecium isolates

Öz:

Thirty eight vancomycin resistant enterococci (VRE) were isolated in one year surveillance study for hospital infection control programme in a state hospital in Ankara, Turkey. All isolates were identified as Enterococcus faecium by VITEK2 system (bioMerieux, France). Vancomycin and teicoplanin resistant 30 strains were defined as vanA phenotype while vancomycin-resistant teicoplanin-susceptible eight strains were defined as vanB phenotype. vanA genes were found in 30 strains while vanB genes were found infive strains by using PCR method. Those five strains were the first vanB positive E.faecium strains in our country. VRE strains revealed six different band patterns by PFGE, while six isolates could not be classified. All isolates with vanB type resistance were found in the same cluster. Source of vanB positive strains was considered as the hemodialysis unit. When the previous national reports related to vancomycin-resistant enterococci were considered, this was the first report of vanB positive E.faecium isolates in our country. This emphasized that both the diversity of VRE and the isolation rate was increasing. In order to eliminate the spread of VRE, effective surveillance studies should be performed and protective measures should be established promptly.

Anahtar Kelime: Vancomycin Enterococcus faecium Enterococcus Drug Resistance, Bacterial Electrophoresis, Gel, Pulsed-Field Genotyping Techniques Polymerase Chain Reaction Vancomycin Resistance

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik

1. Winn WC Jr, Allen S, Janda W, et al. (eds). Streptococci, enterococci, and the streptococcus-like bacteria, pp: 673-764. In: Konemans Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. 2006, 6 th ed. Lippincott Williams and Wilkins, Philadelphia.
2. Murray BE. The life and times of the enterococcus. Clin Microbiol Rev 1990; 3(1): 46-65.
3. Uttley AH, Collins CH, Naidoo J, George RC. Vancomycin-resistant enterococci. Lancet 1988; 1(8575-6):57- 8.
4. Aktas Z, Diyarbakirli P, Bal C, et al. Investigation of phenotypic and genotypic characteristics of vancomy- cin-resistant Enterococcus faecium isolates. Mikrobiyol Bul 2007; 41(3): 347-56.
5. Malathum K, Murray BE. Vancomycin-resistant enterococci: recent advances in genetics, epidemiology and therapeutic options. Drug Resist Updat 1999; 2(4): 224-43.
6. Teixeira LM, Siqueira-Carvalho MG, Facklam RR. Enterococcus, pp: 430-42. In: Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Landry ML, Pfaller MA (eds), Manual of Clinical Microbiology. 2007, ASM Press, Washington DC.
7. Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. 20th Informational Supplement, 2010. CLSI, Wayne, PA.
8. Mulvey MR, Chui L, Ismail J, et al; Canadian Committee for the Standardization of Molecular Methods. De- velopment of a Canadian standardized protocol for subtyping methicillin-resistant Staphylococcus aureus using pulsed-field gel electrophoresis. J Clin Microbiol 2001; 39(10): 3481-5.
9. Tenover FC, Arbeit RD, Goering RV, Mickelsen PA, Murray BE, Persing DH. Interpreting chromosomal DNA restriction patterns produced by pulsed-field gel electrophoresis: criteria for bacterial strain typing. J Clin Microbiol 1995; 33(9): 2233-9.
10. Karahan ZC, Tekeli A, Adaleti R, Koyuncu E, Dolapci I, Akan OA. Investigation of Panton-Valentine leukoci- din genes and SCCmec types in clinical Staphylococcus aureus isolates from Turkey. Microb Drug Resist 2008; 14(3): 203-10.
11. Dutka-Malen S, Evers S, Courvalin P. Detection of glycopeptide resistance genotypes and identification to the species level of clinically relevant enterococci by PCR. J Clin Microbiol 1995; 33(1): 24-7.
12. Comert FB, Kulah C, Aktas E, Ozlu N, Celebi G. First isolation of vancomycin-resistant enterococci and spre-ad of a single clone in a university hospital in Northwestern Turkey. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2007; 26(1): 57-61.
13. Altun B, Cengiz AB, Kara A, Ceyhan M, Unal S, Seçmeer G. First vancomycin-resistant blood isolate of Enterococcus faecium in a childrens hospital and molecular analysis of the mechanism of resistance. Turk J Pediatr 2008; 50(6): 554-8.
14. Kilic A, Baysallar M, Bahar G, Kucukkaraaslan A, Cilli F, Doganci L. Evaluation of the EVIGENE VRE detection kit for detection of vanA and vanB genes in vancomycin-resistant enterococci. J Med Microbiol 2005; 54(Pt 4): 347-50.
15. Moellering RC Jr. Vancomycin-resistant enterococci. Clin Infect Dis 1998; 26(5): 1196-9.

APA	COŞKUN F, MUMCUOGLU I, AKSU N, Karahan Z, US E, TEKELI A, Baran I, KANYILMAZ D, KURŞUN Ş (2012). Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları. , 276 - 282.
Chicago	COŞKUN Feride Alaca,MUMCUOGLU IPEK,AKSU Neriman,Karahan Zeynep Ceren,US EBRU,TEKELI ALPER,Baran Irmak,KANYILMAZ Dilek,KURŞUN Şenol Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları. (2012): 276 - 282.
MLA	COŞKUN Feride Alaca,MUMCUOGLU IPEK,AKSU Neriman,Karahan Zeynep Ceren,US EBRU,TEKELI ALPER,Baran Irmak,KANYILMAZ Dilek,KURŞUN Şenol Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları. , 2012, ss.276 - 282.
AMA	COŞKUN F,MUMCUOGLU I,AKSU N,Karahan Z,US E,TEKELI A,Baran I,KANYILMAZ D,KURŞUN Ş Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları. . 2012; 276 - 282.
Vancouver	COŞKUN F,MUMCUOGLU I,AKSU N,Karahan Z,US E,TEKELI A,Baran I,KANYILMAZ D,KURŞUN Ş Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları. . 2012; 276 - 282.
IEEE	COŞKUN F,MUMCUOGLU I,AKSU N,Karahan Z,US E,TEKELI A,Baran I,KANYILMAZ D,KURŞUN Ş "Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları." , ss.276 - 282, 2012.
ISNAD	COŞKUN, Feride Alaca vd. "Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları". (2012), 276-282.

APA	COŞKUN F, MUMCUOGLU I, AKSU N, Karahan Z, US E, TEKELI A, Baran I, KANYILMAZ D, KURŞUN Ş (2012). Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları. Mikrobiyoloji Bülteni, 46(2), 276 - 282.
Chicago	COŞKUN Feride Alaca,MUMCUOGLU IPEK,AKSU Neriman,Karahan Zeynep Ceren,US EBRU,TEKELI ALPER,Baran Irmak,KANYILMAZ Dilek,KURŞUN Şenol Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları. Mikrobiyoloji Bülteni 46, no.2 (2012): 276 - 282.
MLA	COŞKUN Feride Alaca,MUMCUOGLU IPEK,AKSU Neriman,Karahan Zeynep Ceren,US EBRU,TEKELI ALPER,Baran Irmak,KANYILMAZ Dilek,KURŞUN Şenol Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.46, no.2, 2012, ss.276 - 282.
AMA	COŞKUN F,MUMCUOGLU I,AKSU N,Karahan Z,US E,TEKELI A,Baran I,KANYILMAZ D,KURŞUN Ş Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları. Mikrobiyoloji Bülteni. 2012; 46(2): 276 - 282.
Vancouver	COŞKUN F,MUMCUOGLU I,AKSU N,Karahan Z,US E,TEKELI A,Baran I,KANYILMAZ D,KURŞUN Ş Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları. Mikrobiyoloji Bülteni. 2012; 46(2): 276 - 282.
IEEE	COŞKUN F,MUMCUOGLU I,AKSU N,Karahan Z,US E,TEKELI A,Baran I,KANYILMAZ D,KURŞUN Ş "Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları." Mikrobiyoloji Bülteni, 46, ss.276 - 282, 2012.
ISNAD	COŞKUN, Feride Alaca vd. "Bir devlet hastanesinde vankomisine dirençli enterokok suşlarının fenotipik ve genotipik olarak değerlendirilmesi: İlk vanB-Pozitif Enterococcus faecium izolatları". Mikrobiyoloji Bülteni 46/2 (2012), 276-282.