Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi

KESER, Melike; SALMAN, Nuran; SOMER, AYPER; BAL, Çiğdem; Aktas, Zerrin; Gürler, Nezahat; DİYARBAKIRLI, Pınar

Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi

Zerrin AKTAŞ, (İstanbul Üniversitesi, İstanbul Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Pınar DİYARBAKIRLI, (İstanbul Üniversitesi, İstanbul Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Çiğdem BAL, (İstanbul Üniversitesi, İstanbul Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Nezahat GÜRLER, (İstanbul Üniversitesi, İstanbul Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Melike KESER, (İstanbul Üniversitesi, İstanbul Tıp Fakültesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Ayper SOMER, (İstanbul Üniversitesi, İstanbul Tıp Fakültesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Nuran SALMAN (İstanbul Üniversitesi, İstanbul Tıp Fakültesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı, İstanbul, Türkiye)

Mikrobiyoloji Bülteni

1 0

Yıl: 2007 Cilt: 41 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 347 - 356 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi

Öz:

Bu çalışmada, İstanbul Tıp Fakültesi Hastanesi'nde Şubat-Ağustos 2006 tarihleri arasında 11 hastadan izole edilen toplam 13 vankomisine dirençli enterokok (VRE) susunun fenotipik ve genotipik özelliklerinin ve klonal yayılım olasılığının incelenmesi amaçlanmıştır. Antibiyotiklerin in vitro aktiviteleri CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) önerilerine göre disk difüzyon yöntemi ile araştırılmış ve minimum inhibisyon konsantrasyon (MİK) değerleri E-test yöntemiyle belirlenmiştir. vanA, vanB ve vanC genlerinin saptanması için multipleks polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi uygulanmış, VRE suşları arasındaki klonal ilişki RAPD-PCR (Randomly amplified polymorphic DNA-PCR) yöntemi ile araştırılmıştır. Bütün izolatlar vankomisin, teikoplanin ve ampisiline dirençli, streptomisine yüksek düzey dirençli olarak saptanmıştır. Tüm suşların hem vankomisine hem teikoplanine direnç ile karakterize olan VanA fenotipine ve vanA genine sahip E.faecium izolatları olduğu gösterilmiştir. RAPD-PCR yöntemi ile, her bir gruptaki suş sayısının 1-5 arasında değiştiği dört farklı patern saptanmıştır. Bu sonuçlara göre hastanemizde bulunan VRE suşlarının birden fazla klondan köken aldığı düşünülmektedir.

Anahtar Kelime: Bakteriyel proteinler Karbon-oksijen ligazları Anti-bakteriyel ajanlar VanA ligaz, bakteri Genotip Mikrobiyal duyarlılık testleri Polimeraz zincir reaksiyonu Vankomisin direnci VanB proteini, Enterokok Gram-pozitif bakteriyel enfeksiyonlar Peptit sentezi Enterococcus faecium VanC proteini, Enterokok İlaç direnci, çoklu, bakteriyel Teikoplanin Streptomisin Ampisilin

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Investigation of phenotypic and genotypic characteristics of vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolates

Öz:

The purpose of the present study was to investigate the phenotypic and genotypic characteristics and the probable clonal dissemination of 13 vancomycin- resistant enterococcus (VRE) strains isolated between February-August 2006- from 11 patients at the Hospital of Istanbul Faculty of Medicine. The in vitro activities of antibiotics were determined by disk diffusion method in accordance with the CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) guidelines and the minimum inhibitory concentration (MIC) values by E-test. Multiplex polymerase chain reaction (PCR) was performed for detection of vanA, vanB and yanC genes and RAPD-PCR (Randomly amplified polymorphic DNA-PCR) for investigating a clonal relationship among the isolates. All isolates exhibited resistance to vancomycin, teicoplanin, ampicillin, and high-level resistance to streptomycin. VanA phenotype and the relevant vanA gene, characterised by resistance to both vancomycin and teicoplanin, were detected in allisolates which were all E.faecium. Molecular investigation by RAPD-PCR showed these strains to belong to four different patterns, each containing 1 to 5 isolates. According to these results, the spread of VRE within our hospital was considered as a polyclonal dissemination.

Anahtar Kelime: Gram-Positive Bacterial Infections Peptide Synthases Enterococcus faecium VanC protein, Enterococcus Drug Resistance, Multiple, Bacterial Teicoplanin Streptomycin Ampicillin Bacterial Proteins Carbon-Oxygen Ligases Anti-Bacterial Agents VanA ligase, Bacteria Genotype Microbial Sensitivity Tests Polymerase Chain Reaction Vancomycin Resistance VanB protein, Enterococcus

Konular: Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Bibliyografik

1. Moellering JC. Enterococcus species, pp: 2147-56. In: Mandell GL, Bennett JE, Dolin R (eds), Principles and Practice of Infectious Diseases. 2000, 5 th ed. Churcill Livingstone, New York.
2. Murray B. The life and times of the Enterococcus, Clin Microbiol Rev 1990; 3: 46-65.
3. Schouten MA, Hoogkamp-Korstanje JA, Meis JF, Voss A & the European VRE Study Group. Prevalence of vancomycin-resistant enterococci in Europe. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2000; 19: 816-22.
4. Kawalec M, Gniadkowski M, Hryniewicz W. Outbreak of vancomycin-resistant enterococci in a hospital in Gdansk, Poland, due to horizontal transfer of different Tn7546-like transposon variants and clonal spread of several strains. J Clin Microbiol 2000; 38: 3317-22.
5. Nichol KA, Sill M, Laing NM, Johnson JL, Hoban DJ, Zhanel GG. Molecular epidemiology of urinary tract isolates of vancomycin-resistant Enterococcus faecium from North America. Int J Antimicrob Agents 2006; 27: 392-6.
6. Büyükçelik Ö, Kibar F, Biçer AT, Öksün E, Yaman A. Vankomisine dirençli enterokok suşlarının linezolid ve diğer antibiyotiklere duyarlılıkları. XXXIl.Turk Mikrobiyoloji Kongresi, 12-16 Eylül 2006, Antalya. Program ve Özet Kitabı, s: 424.
7. İnan D, Gunseren F, Ce4ak D, Saba R, Kazan S, Mamikoglu L. First confirmed case of vancomycin-resistant Enterococcus faecium meningitis in Turkey: case report and literature review. J Chemother 2004; 16: 608-11.
8. Malathum K, Murray BE. Vancomycin-resistant enterococci: recent advances in genetics, epidemiology and therapeutic options. Drug Resist Updat 1999; 2: 224-43.
9. Fines M, Perichon B, Reynolds P, Sahm DF, Courvalin P. VanE, a new type of acquired glycopeptide resistance in Enterococcus faecalis BM4405. Antimicrob Agents Chemother 1999; 43: 2161-4.
10. Cetinkaya Y, Falk P, Mayhall CG. Vancomycin-resistant enterococci. Clin Microbiol Rev 2000; 13: 686-707.
11. Gold H. Vancomycin-resistant enterococci: mechanisms and clinical observations. Clin Infect Dis 2001; 33: 210-9.
12. Kilic A, Baysallar M, Bahar G, Kucukkaraaslan A, Cilli F, Doganci L. Evaluation of the EVIGENE VRE detection kit for detection of vanA and vanB genes in vancomycin-resistant enterococci. J Med Microbiol 2005; 54: 347-50.
13. Gür D, Bal Ç, Gülay Z. Antimikrobik Duyarlılık Testleri için Uygulama Standartları. Onbeşinci Bilgi Eki (CLSI), M100-S15, 2005. Bilimsel Tıp Yayınevi, Ankara.
14. Clark NC, Cooksey RC, Hill BC, Swenson JM, Tenover FC. Characterization of glycopeptideresistant enterococci from U.S. hospitals. Antimicrob Agents Chemother 1993; 37: 2311-7.
15. Van Belkum A, Kluytmans AJ, Van Leeuwen W, et al. Multicenter evaluation of arbitrarily primed PCR for typing of Staphylococcus aureus strains J Clin Microbiol 1995; 33: 1537-47.
16. Sahm DF, Marsilio MK, Piazza G. Antimicrobial resistance in key bloodstream bacterial isolates: electronic surveillance with The Surveillance Network DatabaseUSA. Clin Infect Dis 1999; 29: 259-63.
17. Fisgin NT, Darka O, Sunbul M, et al. Case report: a nosocomial infection caused by vancomycin resistant enterococcus. Mikrobiyol Bui 2005; 39: 351-5.
18. Brown AR, Amyes SGB, Paton R, et al. Epidemiology and control of vancomycin-resistant enterococci (VRE) in a renal unit. J Hosp Infect 1998; 40: 115-24.
19. Kolar M, Pantucek R, Vagnerova I, et al. Genotypic characterisation of vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolates from haemato-oncological patients at Olomouc University Hospital, Czech Republic. Clin Microbiol Infect 2006; 12: 353-60.
20. Peta M, Carretto E, BarbarinrD, et al. Outbreak of vancomycin-resistant Enterococcus spp. in an Italian general intensive care unit. Clin Microbiol Infect 2006; 12: 163-9.
21. Freitas MC, Pacheco-Silva A, Barbosa D, et al. Prevalence of vancomycin-resistant Enterococcus fecal colonization among kidney transplant patients. BMC Infect Dis 2006; 22: 133.
22. Kolar M, Urbanek K, Vagnerova I, Koukalova D. The influence of antibiotic use on the occurrence of vancomycin-resistant enterococci. J Clin Pharm Ther 2006; 31: 67-72.
23. Feldman RJ, Paul SM and Silber JL, et al: An analysis of treatment of patients with vancomycin- resistant enterococcal bacteremia, Infect Dis Clin Prac 1996, 5: 440-445.
24. Reacher MH, Shah A, Livermore DM, et al: Bacteraemia and antibiotic resistance of its pathogens reported in England and Wales between 1990 and 1998: trend analysis. BMJ 2000; 320: 213-6.
25. Biedenbach DJ, Moet GJ, Jones RN. Occurrence and antimicrobial resistance pattern comparisons among bloodstream infection isolates from the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program (1997-2002). Diagn Microbiol Infect Dis 2004; 50: 59-69.
26. Basustaoglu A, Aydogan H, Beyan C, Yalcin A, Unal S: First glycopeptide-resistant Enterococcus faecium isolate from blood culture in Ankara, Turkey. Emerg Infect Dis 2001; 7: 160-1.
27. Çolak D, Naaş T, Gunseren F, et al. First outbreak of vancomycin-resistant enterococci in a tertiary hospital in Turkey. J Antimicrob Chemother 2002; 50: 397-401.
28. Korten V, Mülazîmoğlu L, Atalay H, et al. Outbreak of vancomycin-resistant enterococci after the Marmara earthquake in back-up university hospital in Istanbul, Turkey. 11th ESCMID, 1-4 April 2001. Istanbul, Turkey. Abstract Book, p543.
29. Gür D, Hasçelik G, Erciş S, et al. Antimicrobial resistance surveillance of major invasive pathogens in Turkey: Preliminary results from The Armed Project. 6th Congress of the International Federation of Infection Control, 13-16 Oct 2005, Istanbul, Turkey. Programme and Abstract Book, p. 79.
30. Ongen B, Gürler N, Akova M, et al. First report of the clinical isolation of vancomycin resistant Enterococcus faecalis in Turkey. 11th ESCMID, 1-4 April 2001. Istanbul, Turkey. Abstract Book, p544.
31.Aktaş Z, Bal Ç. Enterokoklarda glikopeptid direncinin PCR yöntemiyle araştırılması. Doktora tezi, 2002, İstanbul.
32. Vergis EN, Hayden MK, Chow JW, et al. Determinants of vancomycin resistance and mortality rates in enterococcal bacteremia: a prospective multicenter study. Ann Intern Med 2001; 135: 484-92.
33. Wells CL, Juni BA, Cameron SB, et al. Stool carriage, clinical isolation, and mortality during an outbreak of vancomycin-resistant enterococci in hospitalized medical and/or surgical patients. Clin Infect Dis 1995; 21: 45-50.
34. Lodise TP, McKinnon PS, Tarn VH, Rybak MJ. Clinical outcomes for patients with bacteremia caused by vancomycin-resistant enterococcus in a level 1 trauma center. Clin Infect Dis 2002; 34: 922-9.
35. Marshall SH, Donskey CJ, Hutton-Thomas R, Salata RA, Rice LB. Gene dosage and linezolid resistance in Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis. Antimicrob Agents Chemother 2002; 46: 333-46.
36. Jones RN, Della-Latta P, Lee LV, Biedenbach DJ. Linezolid-resistant Enterococcus faecium isolated from a patient without prior exposure to an oxazolidinone: report from the SENJRYAntimicrobial Surveillance Program. Diagn Microbiol Infect Dis 2002; 42: 137-9.
37. Yazgı H, Mustafa E, Ahmet A, Özkurt Z, Tayaran MA. Vankomisine dirençli enterokoklara in vitro linezolid etkinliği. Ankem Derg 2004, 18: 113-6.

APA	Aktas Z, DİYARBAKIRLI P, BAL Ç, Gürler N, KESER M, SOMER A, SALMAN N (2007). Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi. , 347 - 356.
Chicago	Aktas Zerrin,DİYARBAKIRLI Pınar,BAL Çiğdem,Gürler Nezahat,KESER Melike,SOMER AYPER,SALMAN Nuran Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi. (2007): 347 - 356.
MLA	Aktas Zerrin,DİYARBAKIRLI Pınar,BAL Çiğdem,Gürler Nezahat,KESER Melike,SOMER AYPER,SALMAN Nuran Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi. , 2007, ss.347 - 356.
AMA	Aktas Z,DİYARBAKIRLI P,BAL Ç,Gürler N,KESER M,SOMER A,SALMAN N Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi. . 2007; 347 - 356.
Vancouver	Aktas Z,DİYARBAKIRLI P,BAL Ç,Gürler N,KESER M,SOMER A,SALMAN N Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi. . 2007; 347 - 356.
IEEE	Aktas Z,DİYARBAKIRLI P,BAL Ç,Gürler N,KESER M,SOMER A,SALMAN N "Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi." , ss.347 - 356, 2007.
ISNAD	Aktas, Zerrin vd. "Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi". (2007), 347-356.

APA	Aktas Z, DİYARBAKIRLI P, BAL Ç, Gürler N, KESER M, SOMER A, SALMAN N (2007). Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni, 41(3), 347 - 356.
Chicago	Aktas Zerrin,DİYARBAKIRLI Pınar,BAL Çiğdem,Gürler Nezahat,KESER Melike,SOMER AYPER,SALMAN Nuran Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni 41, no.3 (2007): 347 - 356.
MLA	Aktas Zerrin,DİYARBAKIRLI Pınar,BAL Çiğdem,Gürler Nezahat,KESER Melike,SOMER AYPER,SALMAN Nuran Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni, vol.41, no.3, 2007, ss.347 - 356.
AMA	Aktas Z,DİYARBAKIRLI P,BAL Ç,Gürler N,KESER M,SOMER A,SALMAN N Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2007; 41(3): 347 - 356.
Vancouver	Aktas Z,DİYARBAKIRLI P,BAL Ç,Gürler N,KESER M,SOMER A,SALMAN N Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi. Mikrobiyoloji Bülteni. 2007; 41(3): 347 - 356.
IEEE	Aktas Z,DİYARBAKIRLI P,BAL Ç,Gürler N,KESER M,SOMER A,SALMAN N "Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi." Mikrobiyoloji Bülteni, 41, ss.347 - 356, 2007.
ISNAD	Aktas, Zerrin vd. "Vankomisine dirençli Enterococcus faecium suşlarının fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi". Mikrobiyoloji Bülteni 41/3 (2007), 347-356.