Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi

kılıçoğlu, yunus; DURMAZ, Yüksel

Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi

Yüksel DURMAZ, (Veteriner Kontrol ve Araştırma Enstitüsü, Samsun, Türkiye)

Yunus KILIÇOĞLU (Veteriner Kontrol ve Araştırma Enstitüsü, Samsun, Türkiye)

Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi

3 0

Yıl: 2015 Cilt: 10 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 109 - 115 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi

Öz:

Bu olgu sunumunda, Karadeniz Bölgesinde enfeksiyon çıkan bir ticari gökkuşağı alabalığı çiftliğinden toplanan 8 adet balık örneği incelendi. Hastalık etkeni saptandı ve etkenin antibiyotik duyarlılık profili araştırıldı. Salgın 21oC su sıcaklığında ve 2014 yılı Ağustos ayı içerisinde görüldü. Enfeksiyon bir aylık süre içerisinde % 70-75 oranında mortaliteye neden oldu. Bakteriyolojik incelemeler sonucunda 4 balığın karaciğer, dalak ve böbreklerinden Tryptic Soy Agar, McConkey Agar ve Shotts-Waltman Agarda Lactococcus garvieaeizole edildi. Suşların identifikasyonu kültür tekniği ile konfirmasyonu ise moleküler yöntemlerle yapıldı. Çalışmada elde edilen izolatların fenotipik özelliklerinin birbirleriyle uyumlu olduğu saptandı. Suşların tamamı florfenikol, eritromisin, oksitetrasiklin, amoksisilin ve ampisiline duyarlı, trimetoprim, sulfametoksazol/trimetoprim ve okzolinik asite dirençli bulundu. Enrofloksasin, sefoperazon, kanamisin, neomisin, ve gentamisine karşı değişen oranlarda duyarlılık belirlenirken suşların tamamında çoklu antibiyotik direnci tespit edildi.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji

Detection of Naturally Infected Rainbow Trouts (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) by Lactococcus garvieae with Molecular Methods and Culture Techniques and Determination of Antibiotic Susceptibility Profiles of Agent in a Trout Farm

Öz:

In this case report, 8 fish samples taken from a commercial Rainbow trout farm during outbreak in the Black Sea Region were investigated. Causal agent of the outbreak was detected and its antibiotic susceptibility profile was investigated. The outbreak was observed at 21oC temperature in August, 2014. The 70-75 % mortality rate was caused by the agent in a month. Lactococcus garvieae were isolated from liver, spleen and kidney of 4 fish on the Tryptic Soy Agar, McConkey Agar and Shotts-Waltman Agar as the result of bacteriological examinations. Isolated strains were identified by biochemical tests and were confirmed by molecular methods. Similar phenotypic properties were shared by outbreak isolates. All the strains were sensitive to florfenicol, erythromycin, oxytetracycline, amoxicillin, ampicillin while all strains were resistant to trimethoprim, sulfamethoxazole/trimethoprim and oxolinic acid.The sensitivity of enrofloxacin, cefoperazone, kanamycin, neomycin, and gentamicin were determined at varying rates. Multidrug resistance was also detected in all the strains.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Olgu Sunumu Erişim Türü: Erişime Açık

1.Cai Y., Yang J., Pang H., Kitahara M., 2011. Lactococcus fujiensis sp. nov, a lactic acid bacterium isolated from vegetable matter. International Journal ofSystematic andEvolutionaryMicrobiology, 61, 1590-1594.
2.Raissy M., Ansari M., 2011. Antibiotic susceptibility of Lactococcus garvieaeisolated from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) in Iran fish farms. African Journal ofBiotechnology,10, 1473-1476.
3.Alrabadi IN., 2012. The effect of several antibiotics on Lactococcus garvieaeisolated from Jordanian dairy products. American Journal ofAgricultural and BiologicalSciences, 4, 468-472.
4.Kav K., Erganiş O., 2007. Konya Bölgesinde bulunan gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss) çiftliklerinden Lactococcus garvieaeizolasyonu, identifikasyonu ve fenotipik özelliklerinin belirlenmesi. Veteriner BilimleriDergisi,23, 7-17.
5.Timur G., Yardımcı ER., Ürkü Ç., Çanak Ö., 2011. Marmara Bölgesi kültür gökkuşağı alabalıklarında (Oncorhynchus mykiss, L.) Lactococcosisin bakteriyolojik ve histopatolojik metodlarla teşhisi. İstanbul Üniversitesi Su Ürünleri Dergisi, 26, 63-81.
6.Chan JFW., Woo PCY., Teng JLL., Lau SKP., Leung SSM., Tam FCC., Yuen KY., 2011. Primary infective spondylodiscitis caused by Lactococcus garvieaeand a review of human L. garvieaeinfections. Infection, 39, 259-264.
7.Ferrario C., 2012. Lactococcus garvieaeand Morganella morganii: two bacterial models to study quality and safety of fish products. Scientific field AGR/16. PhD programme in Food Science. Technology and Biotechnology, Universita degli studi di Milano.
8.Türe M., Haliloğlu HI., Altuntaş C., Boran H., Kutlu I., 2014. Comparison of experimental susceptibility of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), turbot (Psetta maxima), black sea trout (Salmo trutta labrax)and sea bass (Dicentrarchus labrax) to Lactococcus garviea. Turkish Journal ofFisheries andAquaticSciences, 14, 1-2.
9.Kia ER., Mehrabi Y., 2013. Detection and identification of different streptococcosis strains in farmed rainbow trout in Boyerahmad and Dena Regions (North South of Iran). World Journal ofFish and Marine Sciences, 5, 315-321.
10.DidinenBI., Yardımcı B., Onuk EE., Metin S., Yıldırım P.,2014. Naturally Lactococcus garvieae infection in rainbow trout (Oncorhyncus mykiss Walbaum, 1792): new histopathological observations, phenotypic and molecular identification. Revue de MedecineVeterinaire,165, 12-19.
11.Evans JJ., Klesius PH., Shoemaker CA.,2009. First isolation and characterization of Lactococcus garvieae from Brazilian nile tilapia, Oreochromis niloticus (L.) and pintado, Pseudoplathystoma corruscans (Spix & Agassiz). Journal ofFish Diseases,32, 943-951.
12.Kav K., Erganiş O., 2008. Antibiotic susceptibility of Lactococcus garvieae in rainbowtrout (Oncorhyncus myiıss) farms. Bulleteinof the Veterinary Institue inPulawy,52, 223-226.
13.Avcı H., Aydoğan A., Tanrıkul TT., Birincioğlu SS.,2010. Pathological and microbiological investigations in rainbow trout (Oncorhynchus mykissWalbaum, 1792) naturally infected with Lactococcus garvieae. KafkasÜniversitesi Veteriner FakültesiDergisi,16, 313-318.
14.Çağırgan H., 2007. Gökkuşağı alabalığı hastalıkları, Doğu Anadolu kalkınma programı ve kırsal kalkınma bileşeni. Van. S, 29-32.
15.Altun S., Onuk EE., Çiftçi A., Büyükekiz AG., Duman M.,2013. Phenotypic, genotypic characterisation and antimicrobial susceptibility determination of Lactococcus garvieae strains. Kafkas Üniversitesi Veteriner FakültesiDergisi,19, 375-381.
16.Englen MN., Kelley LC., 2000. A rapid DNA isolation procedure for the identification of Campylobacter jejuniby the polymerase chain reaction. Letters in AppliedMicrobiology,31, 421-426.
17.Altınok I., 2011. Multiplex PCR assay for detection of four major bacterial pathogens causing rainbow trout. Diseases ofAquaticorganisms, 93, 199-206.
18.Türe M., 2012. PFGE Metodu kullanılarakLactococcus garvieaenin genetik çeşitliliğinin ve yayılımının belirlenmesi. Su Ürünleri Merkez Araştırma Enstitüsü-Trabzon. (TAGEM/HS/10/09/02/179) Proje Sonuç Raporu. 68pp.
19.Bauer AW., Kirby WMM., Sherris JC., Turck M., 1966. Antibiotic susceptibility testing by a standardized single disk method. American Journal of ClinicalPathology,45, 493-496.
20.Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI)., 2004. Methods for antimicrobial disk susceptibility testing of bacteria isolated from aquatic animals; proposed guideline. M42-P, CLSI, Wayne, PA.
21.Ruangpan L., Tendencia AE., 2004. Laboratory manual of standardized methods for antimicrobial sensitivity tests for bacteria isolated from aquatic animals and environment. Aquaculture. Extension Manual No 37. Southeast Asian Fisheries Development Center, Tigbauan. 5021, Iloilo, Philippines.
22.BectonDickinsonandCompany(BD)., 2011.Antimicrobial susceptibility test discs.7 Loveton Circle Sparks, USA.
23.Avsever ML., Tanrıkul TT., Güroy D., Metin S., Hasan AH., Tunalıgil S.,2014. Investigation of certain blood parameters in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss walbaum, 1792) naturally infected with Lactococcus garvieae. Journal ofFisheriesSciences.com,8, 114-120.
24.Miyauchi E., Toh H., Nakano A., Tanabe S., Morita M., 2012. Comparative genomic analysis of Lactococcus garvieaestrains isolated from different sources reveals candidate virulence genes, InternationalJournal ofMicrobiology, 1-7.
25.Suneel D., Basappa K., 2013. Identification and characterization of Lactococcus garvieaeand antimicrobial activity of its bacteriocin isolated from cows milk. Asian Journal of Pharmaceutical and ClinicalResearch, 6, 104-108.
26.Halkman AK., Sağdaş EÖ., 2014. Mikrobiyoloji el kitabı. 3. Baskı, 7-211, Prosigma Tasarım, Ankara.

APA	DURMAZ Y, kılıçoğlu y (2015). Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi. , 109 - 115.
Chicago	DURMAZ Yüksel,kılıçoğlu yunus Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi. (2015): 109 - 115.
MLA	DURMAZ Yüksel,kılıçoğlu yunus Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi. , 2015, ss.109 - 115.
AMA	DURMAZ Y,kılıçoğlu y Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi. . 2015; 109 - 115.
Vancouver	DURMAZ Y,kılıçoğlu y Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi. . 2015; 109 - 115.
IEEE	DURMAZ Y,kılıçoğlu y "Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi." , ss.109 - 115, 2015.
ISNAD	DURMAZ, Yüksel - kılıçoğlu, yunus. "Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi". (2015), 109-115.

APA	DURMAZ Y, kılıçoğlu y (2015). Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi, 10(2), 109 - 115.
Chicago	DURMAZ Yüksel,kılıçoğlu yunus Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi 10, no.2 (2015): 109 - 115.
MLA	DURMAZ Yüksel,kılıçoğlu yunus Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi, vol.10, no.2, 2015, ss.109 - 115.
AMA	DURMAZ Y,kılıçoğlu y Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi. 2015; 10(2): 109 - 115.
Vancouver	DURMAZ Y,kılıçoğlu y Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi. Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi. 2015; 10(2): 109 - 115.
IEEE	DURMAZ Y,kılıçoğlu y "Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi." Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi, 10, ss.109 - 115, 2015.
ISNAD	DURMAZ, Yüksel - kılıçoğlu, yunus. "Bir Alabalık Çiftliğinde Doğal Enfekte Gökkuşağı Alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) Lactococcus garvieae'ninKültür ve PCR ile Saptanması ve Etkenin Antibiyotik Duyarlılık Profillerinin Belirlenmesi". Atatürk Üniversitesi Veteriner Bilimleri Dergisi 10/2 (2015), 109-115.