Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları

KARASARTOVA, DJURSUN; BOYACIOĞLU, Z İlkay; Taylan Ozkan, Aysegul; GÜRESER, A. Semra; TAŞÇI, Leyla

Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları

Leyla TAŞÇI, (Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Çorum, Türkiye)

A. Semra GÜRESER, (Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Çorum, Türkiye)

Z İlkay BOYACIOĞLU, (Hitit Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Çorum, Türkiye)

Djursun KARASARTOVA, (Hitit Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Çorum, Türkiye)

HİKMET AYŞEGÜL TAYLAN ÖZKAN (Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Çorum, Türkiye)

Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi

6 0

Yıl: 2016 Cilt: 21 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 27 - 32 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları

Öz:

Giriş: Bakteremi ve sepsis tanısında altın standart kan kültürüdür. Kan kültürlerinde üreyen mikroorganizmaların dağılımı ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi mortalite ve morbiditenin azaltılmasında çok önemlidir. Bu çalışmada laboratuvarımıza, hastanemizin yoğun bakım ünitesi ve diğer servislerinden gönderilen kan kültürlerinde üreyen mikroorganizmaların dağılımı, genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) pozitifliği ve çeşitli antibiyotiklere duyarlılıklarının araştırılması amaçlanmıştır. Materyal ve Metod: Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında, 01 Ocak 2014-31 Mart 2015 tarihleri arasında 3100 hastadan alınan kan kültürleri BACT/ALERT 3D (bioMerieux, Fransa) otomatize kan kültür sisteminde inkübe edilmiştir. Sinyal alınan şişelerden kanlı agar, eozin metilen blue (EMB) ve çikolatamsı agar besiyerlerine ekim yapılmıştır. Plaklar 37°C'de 18-24 saat süre ile inkübe edilerek üreyen mikroorganizmaların (Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Enterococcus spp.) VITEK 2 (bioMerieux, Fransa) tam otomatik bakteri tanımlama cihazı ile tür tayinleri ve antibiyotik duyarlılıkları belirlenmiştir.Bulgular: Kan kültüründe üreyen 224 suştan 80 (%35.7)'inde gram-pozitif, 144 (%64.3)'ünde gram-negatif bakteri saptanmıştır. GSBL pozitifliği E. coli suşlarında %37.2, K. pneumoniae suşlarında ise %29.4 oranında belirlenmiştir. Üreyen S. aureus suşlarının %25'inin metisiline dirençli olduğu görülmüştür. S. aureus ve Enterococcus spp. suşları tigesiklin, vankomisin ve teikoplanine yüksek oranda, Enterobacteriacealar ise karbapenem, kolistin ve aminoglikozidlere yüksek oranda duyarlı bulunmuştur.Sonuç: Kan kültürlerinde üreyen mikroorganizmaların izolasyonu, doğru tanımlanması ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi ampirik tedavi uygulama sırasında yol göstericidir. GSBL üreten bakteriler pek çok antibiyotiğe dirençli oldukları için geniş spektrumlu antibiyotiklerin kullanılması gerekmektedir.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Farmakoloji ve Eczacılık

Microorganisms Isolated from Blood Cultures and Their Antimicrobial Susceptibility in Hitit University Corum Training and Research Hospital

Öz:

Introduction: In the diagnosis of bacteremia and sepsis, blood culture is the gold standard. Determining the distribution and antibioticsensitivity of the microorganisms isolated from blood cultures is very important in reducing mortality and morbidity. In this study, itwas aimed to investigate the blood cultures sent to our laboratory from our hospital's intensive care unit and other services and thedistribution of isolated microorganisms, extended spectrum beta-lactamase (ESBL) positivity and the susceptibility to various antibiotics.Materials and Methods: Between 01.01.2014 and 31.03.2015, 3100 blood cultures taken from patients were incubated in automatedblood culture system (BACT/ALERT 3D, bioMerieux, France) in the Microbiology Laboratory of Hitit University Corum Training andResearch Hospital. From signal received bottles, inoculations were made on to blood agar, eosin methylene blue (EMB) and chocolateagar. Plates were incubated at 37°C for 18-24 hours and microorganisms such as Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacterbaumannii, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Enterococcus spp.) and antibiotic susceptibilities were determined inVITEK 2 (bioMerieux, France) fully automated bacterial identification device.Results: Among the 224 strains isolated from blood cultures, 80 (35.7%) of them were gram-positive and 144 (64.3%) of them weregram negative bacteria. ESBL-positive strains of E. coli and K. pneumoniae strains were found as 37.2%, 29.4%, respectively. 25% ofS. aureus strains was found to be resistant to methicillin. S. aureus and Enterococcus spp. strains were highly sensitive to tigecycline,vancomycin and teicoplanin, while Enterobacteriaceae to carbapenem, colistin and aminoglycosides.Conclusion: Isolation, identification and determination of antibiotic sensitivity of the microorganisms cultivated in blood cultures give a leadin terms of empiric treatment. Since ESBL producing bacteria are multi drug resistant, broad spectrum antibiotics are needed to be used.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Farmakoloji ve Eczacılık

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Başustaoğlu A, Gün H. Kan kültürleri hakkında bilmemiz gerekenler. Hastane İnfeksiyonları Dergisi 1998;2:9-15.
2. Yüce P, Demirdağ K, Kalkan A, Özden M, Denk A, Kılıç SS. Kan kültürlerinde izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. ANKEM Dergisi 2005;19:17-21.
3. Başustaoğlu A. Klinik Mikrobiyoloji. In: Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Landry ML, Pfaller MA (eds). 9. baskı. Ankara: Atlas Kitapçılık, 2009.
4. Baron EJ, Peterson LR, Finegold SM. Baileyand Scott's Diagnostic Microbiology. 9th ed. London: Mosby Co, 1994:193-209.
5. Tunçbilek S, Baykam N, Eren N, Öztürk S. Pozitif kan kültürlerinin değerlendirilmesi ve klinik önemi. Turk Hij Den Biol Derg 1999;56:1-4.
6. Balıkçı A, Belas Z, Topkaya AE. Kan kültürü pozitifliği: Etken ya da kontaminasyon mu? Mikrobiyol Bul 2003;47:135-140.
7. Çetin F, Mumcuoğlu İ, Aksoy A, Gürkan Y, Aksu N. Kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Turk Hij Den Biol Derg 2014;71:67-74.
8. Ulusan Gündoğdu DZ, Çiçek AÇ, Şahin K, Mutlu MA, Koçyiğit S. Kan kültürlerinden izole edilen Gram-negatif çomaklar ve antibiyotik duyarlılıkları. Eur J Health Sci, 2015;1:58-62.
9. Köksal F, Samastı M. Kan kültürlerinde izole edilen enterik bakterilerin antibiyotiklere direnç durumu. Klimik Derg 2002;15:25-8.
10. Köksal F, Samastı M. Kan kültürlerinde izole edilen stafilokoklarda antibiyotik direnci. ANKEM Derg 2002;16:10-3.
11. Öksüz Ş, Yavuz T, Şahin İ, Yıldırım M, Akgünoğlu M, Kaya D. Kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2008;38:117-21.
12. Gülmez D, Gür D. Hacettepe Üniversitesi İhsan Doğramacı Çocuk Hastanesi'nde 2000-2011 yılları arasında kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar: 12 yıllık değerlendirme. J Pediatr Inf 2012;6:679-83.
13. Güngör S, Karaayak Uzun B, Gül Yurtsever S, Baran N. Kan kültürlerinden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında antibiyotiklere direnç. ANKEM Derg 2012;26:171-5.
14. Kurutepe S, Sürücüoğlu S, Gazi H, Teker A, Özbakkaloğlu B. Metisiline-dirençli ve duyarlı Staphylococcus aureus suşları- nın antibiyotiklere direnç oranları. İnfeksiyon Derg 2007;21: 187-91.
15. Şimşek H, Aktaş D, Çöplü N, Esen B. Ulusal Antimikrobiyal Direnç Surveyans Sistemi (UAMDSS) için seçilmiş olan gram negatif bakterilerde 2011 yılı verilerine göre antimikrobiyal ajanlara karşı direnç yüzdeleri. XXXV. Türk Mikrobiyoloji Kongresi. Kasım 3-7, Aydın-Türkiye. 2012.
16. Türk Dağı H, Arslan U, Tuncer Eİ. Kan kültürlerinden izole edilen enterokoklarda antibiyotik direnci. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2011;4:103-6.
17. Sader HS, Jones RN, Andrade-Baiocchi S; The SENTRY ParticipantsGroup (Latin America). Four-year evaluation of frequency of occurrence and antimicrobial susceptibility patterns of bacteria from blood stream infections in Latin American medical centers. Diagn Microbiol Infect Dis 2003;44:273- 80.
18. Özdemir M, Erayman İ, Gündem NS, Baykan M, Baysal B. Hastane infeksiyonu etkeni Acinetobacter suşlarının çeşitli antibiyotiklere duyarlılıklarının araştırılması. ANKEM Derg 2009; 23:127-32.
19. Balcı M, Bitirgen M, Kandemir B, Türk Arıbaş E, Erayman İ. Nozokomiyal Acinetobacter baumannii suşlarının antibiyotik duyarlılığı. ANKEM Derg 2010;24:28-33.
20. Türk Dağı H, Arslan U, Fındık D, Tuncer İ. Kan kültürlerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının antibiyotiklere direnç oranları. ANKEM Derg 2011;25:107-10.
21. Uzun B, Güngör S, Yurtsever S, Afşar İ, Demirci M. Yoğun bakım hastalarının kan kültürlerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumannii suşlarının çeşitli antibiyotiklere direnç durumları. ANKEM Derg 2012;26:55-60.

APA	TAŞÇI L, GÜRESER A, BOYACIOĞLU Z, KARASARTOVA D, Taylan Ozkan A (2016). Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları. , 27 - 32.
Chicago	TAŞÇI Leyla,GÜRESER A. Semra,BOYACIOĞLU Z İlkay,KARASARTOVA DJURSUN,Taylan Ozkan Aysegul Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları. (2016): 27 - 32.
MLA	TAŞÇI Leyla,GÜRESER A. Semra,BOYACIOĞLU Z İlkay,KARASARTOVA DJURSUN,Taylan Ozkan Aysegul Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları. , 2016, ss.27 - 32.
AMA	TAŞÇI L,GÜRESER A,BOYACIOĞLU Z,KARASARTOVA D,Taylan Ozkan A Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları. . 2016; 27 - 32.
Vancouver	TAŞÇI L,GÜRESER A,BOYACIOĞLU Z,KARASARTOVA D,Taylan Ozkan A Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları. . 2016; 27 - 32.
IEEE	TAŞÇI L,GÜRESER A,BOYACIOĞLU Z,KARASARTOVA D,Taylan Ozkan A "Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları." , ss.27 - 32, 2016.
ISNAD	TAŞÇI, Leyla vd. "Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları". (2016), 27-32.

APA	TAŞÇI L, GÜRESER A, BOYACIOĞLU Z, KARASARTOVA D, Taylan Ozkan A (2016). Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 21(1), 27 - 32.
Chicago	TAŞÇI Leyla,GÜRESER A. Semra,BOYACIOĞLU Z İlkay,KARASARTOVA DJURSUN,Taylan Ozkan Aysegul Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 21, no.1 (2016): 27 - 32.
MLA	TAŞÇI Leyla,GÜRESER A. Semra,BOYACIOĞLU Z İlkay,KARASARTOVA DJURSUN,Taylan Ozkan Aysegul Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, vol.21, no.1, 2016, ss.27 - 32.
AMA	TAŞÇI L,GÜRESER A,BOYACIOĞLU Z,KARASARTOVA D,Taylan Ozkan A Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2016; 21(1): 27 - 32.
Vancouver	TAŞÇI L,GÜRESER A,BOYACIOĞLU Z,KARASARTOVA D,Taylan Ozkan A Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2016; 21(1): 27 - 32.
IEEE	TAŞÇI L,GÜRESER A,BOYACIOĞLU Z,KARASARTOVA D,Taylan Ozkan A "Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları." Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 21, ss.27 - 32, 2016.
ISNAD	TAŞÇI, Leyla vd. "Hitit Üniversitesi Çorum Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kan Kültürlerinden Üreyen Mikroorganizmalar ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları". Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 21/1 (2016), 27-32.