Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi

DEMİRBİLEK, Müge; ÇOLAKOĞLU, Şule; BOZKIRLI, Emine Duygu; ALISKAN, HIKMET EDA

Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi

Hikmet Eda ALIŞKAN, (Başkent Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji ABD, ANKARA)

Emine Duygu BOZKIRLI, (Başkent Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji ABD, ANKARA)

Şule ÇOLAKOĞLU, (Başkent Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji ABD, ANKARA)

Müge DEMİRBİLEK (Başkent Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji ABD, ANKARA)

Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi

3 0

Yıl: 2016 Cilt: 73 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 15 - 24 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi

Öz:

Amaç: Candida türlerinin etken olduğu kan dolaşım enfeksiyonları, hastanede yatan hastalarda morbidite ve mortaliteyi artıran en önemli nedenlerden biridir. Fungusların etken olduğu kan dolaşım enfeksiyonları içerisinde en sık Candida türleri izole edilmektedir. Candida türlerinden C. albicans (CA)'ların yanı sıra non-albicans Candida (NAC) türlerinin prevelansı giderek artmaktadır. Çalışmamızda; üç yıllık süreçte, pediatrik ve erişkin yaş grubundaki hastaların kan kültüründe CA ve NAC türlerinin etken olarak izole edildiği kandidemilerdeki risk faktörlerini belirlemek ve iki türün etken olduğu hastaları karşılaştırmak amaçlanmıştır.Yöntem: Kandidemi şüpheli hastalardan kan kültürü için alınan örnekler BACTEC Aerobik/F şişesine inoküle edilmiş ve BACTEC 9240 (Becton Dickinson, Maryland, USA) cihazına yerleştirilmiştir. Pozitif üreme alarmı veren kan kültürü şişeleri çıkarılarak %5 koyun kanlı ve çikolata agar içeren besiyerlerine ekimleri yapılmıştır. Üreyen maya kolonilerine Germ tüp testi yapılmıştır. Germ tüp testi negatif olan kolonilerin, API 20C AUX (bioMérieux, Fransa) kitleri ile tür düzeyinde tanımlamaları yapılmıştır. Germ tüp testi pozitif olan izolatlar CA olarak tanımlanmıştır.Bulgular: Kan kültüründe Candida üremesi olan 163 hastanın 100 (%61,3)'ü 0-17 yaş aralığında, 63 (%38,4)'ü >17 yaş, 86 (%52,7)'sının erkek ve 77 (%47,2)'sinin kadın olduğu görülmüştür. Toplam 163 hastanın 150'sinin enfeksiyon kaynağının hastane kökenli olduğu, 13'ünün ise toplumdan edinilmiş olduğu tespit edilmiştir. Hastaların 79 (%48,5)'unda CA, 84 (%51,5)'ünde NAC izole edilmiştir. C. parapsilosis 54 adet (%32,9), C. tropicalis 10 adet (%6,1), C. famata 10 adet (%6,1), C. glabrata beş adet (%3,0) ve diğerleri (C. pelliculosa, C. crusei ve C. norvogensis) beş adet (%3,0) olduğu görülmüştür.türlerinin dağılımına baktığımızda, Sonuç: Kan kültüründe Candida türlerinin üremesi olarak tanımlanan kandidemi gelişimi için total parenteral nütrisyon (TPN) kullanımı, santral venöz kateter varlığı, altta yatan hastalıklardan özellikle malignite ve yanıklı hastaların yanı sıra öncesinde kullanılan antibiyotik tedavisi risk faktörleri olarak bulunmuştur. Bunlara ek olarak kandidemi öncesinde ampirik kullanılan antifungal ilaç tedavisi (p<0,05) ve uygulanan yanık cerrahileri, örneğin; yanık dokusunun erken dönemde çıkarılması, nekrotik dokunun debritmanı ve cilde uygulanan greftleme, NAC türlerin etken olduğu kandidemilerde artmış risk faktörleri olarak değerlendirilmiştir

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mantar Bilimi Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Enfeksiyon Hastalıkları Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Evaluation of risk factors in candidemias caused by Candida albicans and non-albicans Candida species, isolated from the blood cultures for three years period in our hospital

Öz:

Objective: Bloodstream infections caused byCandida species are one of the most important causethat increase morbidity and mortality in hospitalizedpatients. Among the bloodstream infections caused byfungi, Candida species are the most frequently isolatedones. In addition to C. albicans (CA) from Candidaspecies the prevalence of non-albicans Candida (NAC)species is gradually increasing. In our study, it was aimedto determine risk factors in candidemias caused by CAand NAC species isolated from the blood culture of thepediatric and adult patients for 3 years period and tocompare patients having candidemias caused by the twospecies.Method: Samples taken from the candidemiasuspected patients for blood culture were inoculatedinto BACTEC Aerobik/F bottles and placed into theautomated system BACTEC 9240 (Becton Dickinson,Maryland, USA). The blood culture that signalized apositive growth alarm were subcultured on the 5%sheep blood and chocolate agars. Germ tube test wasperformed on isolated yeast colonies. The identificationof germ tube test negative colonies were done accordingto the level of species with the use of API 20C AUX bioMérieux, France) kit. Germ tube test positiveisolates were identified as albicans Candida albicans.Results: It was observed that, from the total of163 patients having Candida isolated from their bloodculture 100 (61.3%) of them were between 0-17 years ofage range, 63 (38.4%) were > 17 years of age, 86 (52.7%)male and 77 (47.2%) were female. It was determinedthat out of 163 patients, 150 episodes were nosocomialinfections and 13 episodes were community aqcuiredinfections. CA was isolated from 79 (48.5%) of thepatients, whereas NAC were isolated from 84 (51.5%).When we look through the distribution of non-albicansCandida species, it was observed that C. parapsilosiswere 54 (32.9%), C. tropicalis were 10 (6.1%),C. famata were 10 (6.1%),C. glabrata were 5 (3.0%)and others (C. pelliculosa, C. crusei and C. norvogensis)were 5 (3.0%).Conclusion: For candidemia which was diagnosedwith the growth of Candida species in blood culture,total parenteral nutrition (TPN) usage, presence ofcentral venous catheter, underlying diseseases especiallymalignancy and burns and previous antibiotics treatmentwere determined as the risk factors for candidemia.Additionally before candidemia empiric antifungaltreatment (p<0.05) and burn surgery, for example:early surgical excision of burned tissue, withdebridement of necrotic tissue and grafting of skin, wereevaluated as the increased risk factors of candidemiascaused by NAC species.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mantar Bilimi Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji Enfeksiyon Hastalıkları Tıbbi Laboratuar Teknolojisi

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Wisplinghoff H, Ebbers J, Geurtz L, Stefanik D, Major Y, Edmond MB, et al. Nosocomial bloodstream infections due to Candida spp. in the USA: species distribution, clinical features and antifungal susceptibilities. Int J Antimicrob Agents, 2014; 43(1): 78-81.
2. Wisplinghoff H, Bischoff T, Tallent SM, Seifert H, Wenzel RP, Edmond MB. Nosocomial bloodstream infections in US hospitals: analysis of 24,179 cases from a prospective nationwide surveillance study. Clin Infect Dis, 2004; 39(3): 309-17.
3. Diekema D, Arbefeville S, Boyken L, Kroeger J, Pfaller M. The changing epidemiology of healthcare-associated candidemia over three decades. Diagn Microbiol Infect Dis, 2012; 73(1): 45-8.
4. Morgan J, Meltzer MI, Plikaytis BD, Sofair AN, Huie-White S, Wilcox S, et al. Excess mortality, hospital stay and cost due to candidemia: a casecontrol study using data from population-based candidemia surveillance. Infect Control Hosp Epidemiol, 2005; 26(6): 540-7.
5. Montagna MT, Lovero G, Borghi E, Amato G, Andreoni S, Campion L, et al. Candidemia in intensive care unit: a nationwide prospective observational survey (GISIA-3 study) and review of the European literature from 2000 through 2013. Eur Rev Med Pharmacol Sci, 2014; 18(5): 661-74.
6. Conde-Rosa A, Amador R, Pérez-Torres D, Colón E, Sánchez-Rivera C, Nieves-Plaza M, et al. Candidemia distribution, associated risk factors, and attributed mortality at a university-based medical center. P R Health Sci J, 2010; 29(1): 26-9.
7. Labbé AC, Pépin J, Patiño C, Castonguay S, Restieri C, Laverdiere M. A single-centre 10-year experience with Candida bloodstream infections. Can J Infect Dis Med Microbiol, 2009; 20(2): 45-50.
8. Horasan ES, Ersöz G, Göksu M, Otag F, Kurt AO, Karaçorlu S, et al. Increase in Candida parapsilosis fungemia in critical care units: a 6-years study. Mycopathologia, 2010; 170(4): 263-8.
9. Poikonen E, Lyytikäinen O, Anttila VJ, Koivula I, Lumio J, Kotilainen P, et al. Secular trend in candidemia and the use of fluconazole in Finland, 2004-2007. BMC Infect Dis, 2010; 10: 312.
10. Lyytikäinen O, Lumio J, Sarkkinen H, Kolho E, Kostiala A, Ruutu P. Hospital Infection Surveillance Team. Nosocomial bloodstream infections in Finnish hospitals during 1999-2000. Clin Infect Dis, 2002; 35(2): e14-9.
11. Voss A, Kluytmans JA, Koeleman JG, Spanjaard L, Vandenbroucke-Grauls CM, Verbrugh HA, et al. Occurrence of yeast bloodstream infections between 1987 and 1995 in five Dutch university hospitals. Eur J Clin Microbiol Infect Dis, 1996; 15(12): 909-12.
12. Krcmery V, Barnes AJ. Non-albicans Candida spp. causing fungaemia: pathogenicity and antifungal resistance. J Hosp Infect, 2002; 50(4): 243-60.
13. Erdem F, Tuncer Ertem G, Oral B, Karakoç E, Demiröz AP, Tülek N. Epidemiological and microbiological evaluation of nosocomial infections caused by Candida species. Mikrobiyol Bul, 2012; 46(4): 637-48.
14. Shepard JR, Addison RM, Alexander BD, Della-Latta P, Ghena M, Haase G, et al. Multicenter evaluation of the Candida albicans/Candida glabrata peptide nucleic acid fluorescent in situ hybridization method for simultaneous dual-color identification of C. albicans and C. glabrata directly from blood culture bottles. J Clin Microbiol, 2008; 46: 50-5.
15. Foongladda S, Mongkol N, Petlum P, Chayakulkeeree M. Multi-probe real-time PCR identification of four common Candida species in blood culture broth. Mycopathologia, 2014; 17.
16. Fernández-Cruz A, Marín M, Kestler M, Alcalá L, Rodriguez-Créixems M, Bouza E. The value of combining blood culture and SeptiFast data for predicting complicated bloodstream infections caused by Gram positive bacteria or Candida species. J Clin Microbiol, 2013; 51(4): 1130-6.
17. Jonathan A. Abelson, Theodore Moore, Trofa D, Gacser A, Nosanchuk JD. Candida parapsilosis an emerging fungal pathogen. Clin Microbiol Rev, 2008; 21(4): 606-25.
18. Tortorano AM, Kibbler C, Peman J, Bernhardt H, Klingspor L, Grillot R. et al; ECMM Working Group on Candidaemia. Epidemiology of Candidaemia in Europe: results of 28-month European Confederation of Medical Mycology (ECMM) hospital-based surveillance study. Eur J Clin Microbiol Infect Dis, 2004; 23(4): 317-22.
19. Tortorano AM, Kibbler C, Peman J, Bernhardt H, Klingspor L, Grillot R. Candidaemia in Europe: epidemiology and resistance. Int J Antimicrob Agents, 2006; 27(5): 359-66.
20. Yenigün Koçak B, Kuloğlu F, Doğan Çelik A, Akata F. Evaluation of epidemiological characteristics and risk factors of candidemia in adult patients in a tertiary-care hospital. Mikrobiyol Bul, 2011; 45(3): 489-503.
21. Dizbay M, Fidan I, Kalkanci A, Sari N, Yalcin B, Kustimur S, et al. High incidence of Candida parapsilosis Candidaemia in non-neutropenic critically ill patients: epidemiology and antifungal susceptibility. Scand J Infect Dis, 2010; 42(2): 114-20.
22. Horasan ES, Ersöz G, Göksu M, Otag F, Kurt AO, Karaçorlu S, et al. Increase in Candida parapsilosis fungemia in critical care units: a 6-years study. Mycopathologia, 2010; 170 (4): 263-8.
23. Yapar N, Pullukcu H, Avkan-Oguz V, Sayin-Kutlu S, Ertugrul B, Sacar S, et al. Evaluation of species distribution and risk factors of candidemia: a multicenter case-control study. Med Mycol, 2011; 49(1): 26-31.
24. Apisarnthanarak A, Naknarongkij N, Kiratisin P, Mundy LM. Risk factors and outcomes of Candida albicans and non-albicans Candida species at a Thai tertiary care center. Am J Infect Control, 2009; 37(9): 781-2.
25. Playford EG, Marriott D, Nguyen Q, Chen S, Ellis D, Slavin M, et al. Candidemia in nonneutropenic critically ill patients: risk factors for nonalbicans Candida spp. Crit Care Med, 2008; 36(7): 2034-9.
26. Ha JF, Italiano CM, Heath CH, Shih S, Rea S, Wood FM. Candidemia and invasive candidiasis: a review of the literature for the burns surgeon. Burns, 2011; 37(2):181-95.
27. Chow JK, Golan Y, Ruthazer R, Karchmer AW, Carmeli Y, Lichtenberg D, et al. Factors associated with candidemia caused by non-albicans Candida species versus Candida albicans in the intensive care unit. Clin Infect Dis, 2008; 46(8): 1206-13.
28. Bassetti M, Righi E, Costa A, Fasce R, Molinari MP, Rosso R, et al. Epidemiological trends in nosocomial candidemia in intensive care. BMC Infect Dis, 2006; 10; 6: 21.
29. Magill SS, Swoboda SM, Shields CE, Colantuoni EA, Fothergill AW, Merz WG, et al. The epidemiology of Candida colonization and invasive candidiasis in a surgical intensive care unit where fluconazole prophylaxis is utilized: follow-up to a randomized clinical trial. Ann Surg, 2009; 249(4): 657-65.
30. Viscoli C, Girmenia C, Marinus A, Collette L, Martino P, Vandercam B, et al. Candidemia in cancer patients: a prospective, multicenter surveillance study by the Invasive Fungal Infection Group (IFIG) of the European Organization for Research and Treatment of Cancer (EORTC). Clin Infect Dis, 1999; 28(5): 1071-9.
31. Luzzati R, Amalfitano G, Lazzarini L, Soldani F, Bellino S, Solbiati M, et al. Nosocomial candidemia in non-neutropenic patients at an Italian tertiary care hospital. Eur J Clin Microbiol Infect Dis, 2000;19(8): 602-7.
32. Paganini H, Rodriguez Brieshcke T, Santos P, Seú S, Rosanova MT. Risk factors for nosocomial Candidaemia: a case-control study in children. J Hosp Infect, 2002; 50(4): 304-8.

APA	ALISKAN H, BOZKIRLI E, ÇOLAKOĞLU Ş, DEMİRBİLEK M (2016). Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi. , 15 - 24.
Chicago	ALISKAN HIKMET EDA,BOZKIRLI Emine Duygu,ÇOLAKOĞLU Şule,DEMİRBİLEK Müge Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi. (2016): 15 - 24.
MLA	ALISKAN HIKMET EDA,BOZKIRLI Emine Duygu,ÇOLAKOĞLU Şule,DEMİRBİLEK Müge Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi. , 2016, ss.15 - 24.
AMA	ALISKAN H,BOZKIRLI E,ÇOLAKOĞLU Ş,DEMİRBİLEK M Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi. . 2016; 15 - 24.
Vancouver	ALISKAN H,BOZKIRLI E,ÇOLAKOĞLU Ş,DEMİRBİLEK M Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi. . 2016; 15 - 24.
IEEE	ALISKAN H,BOZKIRLI E,ÇOLAKOĞLU Ş,DEMİRBİLEK M "Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi." , ss.15 - 24, 2016.
ISNAD	ALISKAN, HIKMET EDA vd. "Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi". (2016), 15-24.

APA	ALISKAN H, BOZKIRLI E, ÇOLAKOĞLU Ş, DEMİRBİLEK M (2016). Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 73(1), 15 - 24.
Chicago	ALISKAN HIKMET EDA,BOZKIRLI Emine Duygu,ÇOLAKOĞLU Şule,DEMİRBİLEK Müge Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 73, no.1 (2016): 15 - 24.
MLA	ALISKAN HIKMET EDA,BOZKIRLI Emine Duygu,ÇOLAKOĞLU Şule,DEMİRBİLEK Müge Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, vol.73, no.1, 2016, ss.15 - 24.
AMA	ALISKAN H,BOZKIRLI E,ÇOLAKOĞLU Ş,DEMİRBİLEK M Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi. 2016; 73(1): 15 - 24.
Vancouver	ALISKAN H,BOZKIRLI E,ÇOLAKOĞLU Ş,DEMİRBİLEK M Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi. 2016; 73(1): 15 - 24.
IEEE	ALISKAN H,BOZKIRLI E,ÇOLAKOĞLU Ş,DEMİRBİLEK M "Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi." Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 73, ss.15 - 24, 2016.
ISNAD	ALISKAN, HIKMET EDA vd. "Hastanemizde üç yıllık süreçte kan kültürlerinden izole edilen Candida albicans ve non-albicans Candida türlerinin etken olduğu kandidemilerdeki risk faktörlerinin irdelenmesi". Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 73/1 (2016), 15-24.