İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması

ÖRMEN, Murat; Akşit, Murat; Bozkaya, Giray; bilgili, sibel

İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması

Giray BOZKAYA, (Bozyaka Eğitim ve Araştırma Hastanesi)

Murat ÖRMEN, (Bozyaka Eğitim ve Araştırma Hastanesi)

Sibel BİLGİLİ, (Bozyaka Eğitim ve Araştırma Hastanesi)

Murat AKŞİT (Dokuz Eylül Üniversitesi)

Türk Klinik Biyokimya Dergisi

9 2

Yıl: 2016 Cilt: 14 Sayı: 2 Sayfa Aralığı: 94 - 99 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması

Öz:

Amaç: Ailesel Akdeniz Ateşi (FMF) otozomal resesif geçişli, tekrarlayan ateş, karın ağrısı ve serozit atakları ile kendini gösteren bir hastalıktır. FMF'in sebebi, Mediterranean Fever (MEFV) geninde meydana gelen mutasyonlardır. Çalışmamızın amacı, laboratuvarımızda yapılan FMF dizi analiz sonuçlarını değerlendirerek İzmir'deki FMF mutasyon sıklığı hakkında fikir sahibi olmamıza yardımcı olacak bir çalışma yapmaktı.Gereç ve Yöntem: Ocak 2013 ve Ağustos 2015 tarihleri arasında FMF ön tanısı alan 126 kişide MEFV gen mutasyonları retrospektif olarak araştırıldı. MEFV genindeki mutasyonları belirlemek için Polimeraz Zincir Reaksiyonu ve 21 mutasyon araştırılabilen pyrosekans yöntemi ile DNA dizi analizi yapıldı.Bulgular: Sekans analizi ile 126 kişinin 66'sında MEFV gen mutasyonları saptandı (% 52,4). Mutasyon görülen 18 hastanın homozigot, 20 hastanın birleşik heterozigot ve 28 hastanın heterozigot olduğu belirlendi. En sık görülen mutasyonların; homozigot olanlarda M694V, birleşik heterozigotlarda M694V/M680I, heterozigot olanlarda ise E148Q olduğu görüldü. Allel frekansları yüzdeleri açısından incelendiğinde; M694V (%37,4), E148Q (%11,45), M680I (%11,45), V726A (%6,11), P369S (%5,35), R761H (%3,05), R744S (%2,29), K695R (%1,52), wt (%21,38) bulundu. Sonuç: Birçok çalışmada olduğu gibi bizim çalışmamızda da M694V mutasyonu ilk sırada yer almaktaydı. En sık rastlanan ilk dört mutasyon türü yapılmış diğer çalışmalarla uyumlu iken; sıklık sırası açısından farklılık gösterdi. Çalışmamızdaki M694V toplam allel sayısı oranı diğer bazı çalışmalardan daha düşük bulundu (%37,4). Düşük M694V oranı, hasta sayımızın az olmasına bağlı olabileceği gibi, yöntem farklılığından veya araştırılan mutasyon sayısından da kaynaklanabilir. Ülkemizde 21 mutasyon araştırılan az sayıda çalışma mevcuttur. Organ nakli bölümünce istenen mutasyon analizlerinde M694V mutasyonunun çoğunluğu oluşturduğu tespit edildi. Mutasyon tipinin hastalık şiddeti ile ilişkili olabileceği düşünüldü. Bu sebeple FMF hastalarında mutasyon analizinin mümkün olduğu kadar erken gerçekleştirilerek olası komplikasyonların önüne geçilebileceği kanısına varıldı.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyokimya ve Moleküler Biyoloji

The Investigation of the Prevelance of MEFV Gene Mutations in Izmir

Öz:

Objective: Familial Mediterranean fever (FMF) is an autosomal recessive hereditary disease characterised by recurrent attacks of serositis and fever accompanied by pain in the abdomen. FMF is caused by mutations in Mediterranean Fever (MEFV) gene. The aim of this study was to evaluate the results of FMF genetic mutation analysis made in our laboratory and to get some information about the frequency of FMF genetic mutations in Izmir. Materials and Methods: MEFV gene mutations were retrospectively investigated in 126 patients which were prediagnosed as FMF between January-August 2015. Polymerase Chain Reaction and DNA pyrosequence methods were used to search 21 different mutations in MEFV gene. Results: MEFV gene mutations were found in 66 of 126 patients with sequence analysis (52.4%). There were 18 homozygous, 20 compound heterozygous and 28 heterozygous patients. The most common mutations were; M694V in homozygotes, M694V/M680I in compound heterozigotes and E148Q in heterozigotes. Allele frequencies were as follows: M694V (37.4%), E148Q (11.45%), M680I (11:45%), V726A (6.11%), P369S (5.35%), R761H (3.05%), R744S (2.29%), K695R (1.52%), wt (21.38%). Conclusion: In our study M694V was found to be the most common mutation as in many studies results. The most common four mutation types that we found were in accordance with the other studies, but their frequency rate varies. In this study, total number of M694V allels was lower than the other studies (37.4%). This may be due to small number of the study group, difference of methods or it can be caused by the number of mutations investigated. In our country there are few studies examining 21 mutations. It was determined that most of the mutations from the department of organ transplantation was M694V. It was thought that the mutation type is associated with the severity of the disease. Earlier mutation analysis in patients who are prediagnosed as FMF, will prevent future possible complications. In this respect, we believe that our results may provide guidence to future studies.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyokimya ve Moleküler Biyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Onen F. Familial Mediterranean fever. Rheumatol Int 2006;26:489-496.
2. Ancient missense mutations in a new member of the RoRet gene family are likely to cause familial Mediterranean fever. The international FMF consortium. Cell 1997;90:797-807.
3. A candidate gene for familial Mediterranean fever. The French FMF consortium. Nat Genet 1997; 17:25-31.
4. Touitou I. The spectrum of familial Mediterranean fever (FMF) mutations. Eur J Hum Genet 2001;9:473-483.
5. Tunca M, Akar S, Onen F, Ozdogan H, Kasapcopur O, Yalcinkaya F, Tutar E, Ozen S, Topaloglu R, Yilmaz E, Arici M, Bakkaloglu A, Besbas N, Akpolat T, Dinc A, Erken E. Familial Mediterranean fever (FMF) in Turkey: results of a nationwide multicenter study. Medicine (Baltimore) 2005;84:1-11.
6. Dinc A, Pay S, Turan M, Simsek I. Prevalance of familial Mediterranean fever in young Turkish men [abstract]. Clin Exp Rheumatol 2000;18:292.
7. Onen F, Sumer H, Turkay S, Akyurek O, Tunca M, Ozdogan H. Increased frequency of familial Mediterranean fever in Central Anatolia, Turkey. Clin Exp Rheumatol 2004;22(4 Suppl 34):S31-S33.
8. Anonymous. Ancient missense mutations in a new member of the RoRet gene family are likely to cause familial Mediterranean fever. The International FMF Consortium. Cell 1997;90:797- 807.
9. Anonymous. A candidate gene for familial Mediterranean fever. Nat Genet 1997;17:25-31.
10. Shohat M, Magal N, Shohat T, Chen X, Dagan T, Mimouni A, Danon Y, Lotan R, Ogur G, Sirin A, Schlezinger M, Halpern GJ, Schwabe A, Kastner D, Rotter JI, Fischel-Ghodsian N. Phenotype-genotype correlation in familial Mediterranean fever: evidence for an association between Met694Val and amyloidosis. Eur J Hum Genet 1999;7:287- 292.
11. Livneh A, Langevitz P, Shinar Y, Zaks N, Kastner DL, Pras M, Pras E. MEFV mutation analysis in patients suffering from amyloidosis of familial Mediterranean fever. Amyloid 1999;6:1-6.
12. Cazeneuve C, Ajrapetyan H, Papin S, RoudotThoraval F, Genevieve D, Mndjoyan E, Papazian M, Sarkisian A, Babloyan A, Boissier B, Duquesnoy P, Kouyoumdjian JC, Girodon-Boulandet E, Grateau G, Sarkisian T, Amselem S. Identification of MEFVindependent modifying genetic factors for familial Mediterranean fever. Am J Hum Genet 2000;67:1136-1143.
13. Tekin M, Yalcinkaya F, Cakar N, Akar N, Misirlioglu M, Tastan H, Tumer N. MEFV mutations in multiplex families with familial Mediterranean fever: is a particular genotype necessary for amyloidosis? Clin Genet 2000;57:430-434.
14. Yilmaz E, Balci B, Kutlay S, Ozen S, Erturk S, Oner A, Besbas N, Bakkaloglu A. Analysis of the modifying effects of SAA1, SAA2 and TNF-alpha gene polymorphisms on development of amyloidosis in FMF patients. Turk J Pediatr 2003;45:198-202.
15. Caglayan AO, Demiryilmaz F, Ozyazgan I, Gumus H. MEFV gene compound heterozygous mutations in familial Mediterranean fever phenotype: a retrospective clinical and molecular study. Nephrol Dial Transplant 2010;25:2520-2523.
16. Yilmaz E, Ozen S, Balci B et al. Mutation frequency of familial Mediterranean fever and evidence for a high carrier rate in the Turkish population. Eur J Hum Genet 2001;9:553-555.
17. Yalcinkaya F, Cakar N, Misirlioglu N et al. Genotype-phenotype correlation in a large group of Turkish patients with familial Mediterranean fever: evidence for mutation-independent amyloidosis. Rheumatology 2000;39:67-72.
18. Olgun A, Akman S, Kurt I, Tuzun A, Kutluay T. MEFV mutations in familial Mediterranean fever: association of M694V homozygosity with arthritis. Rheumatol Int 2005;25(4):255-9.
19. Erden G, Bal C ,Güngör Torun O, Uğuz N ,Yıldırımkaya MM. Ailesel Akdeniz Ateşi (FMF) Düşünülen Olgularda MEFV Gen Mutasyonları Sıklığının İncelenmesi. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 2008;65(1):1-5.
20. Yalcinkaya E, Guran S, Nas BG, Dursun A, Imirzalioglu N. The Importance of Results of MEFV Gene Analysis in Cases Prediagnosed as 'Familial Mediterranean Fever'. Erciyes Medical J 2006;28(1):19-24.
21. Yeşilada E, Savacı S, Yüksel Ş, Gülbay G, Otlu G, Kaygusuzoğlu E. Ailesel Akdeniz Ateşi (FMF) Düşünülen Olgularda MEFV Gen Mutasyonları. İnönü Üniversitesi TF Dergisi 2005;12(4):235-38.
22. Soylu A, Turkmen MA, Kavukcu S. The Rate of Awareness for Familial Mediterranean Fever for Urban Dwellers in Turkey. Turk J Rheumatol 2012;27(4):275-277.

APA	Bozkaya G, ÖRMEN M, bilgili s, Akşit M (2016). İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması. , 94 - 99.
Chicago	Bozkaya Giray,ÖRMEN Murat,bilgili sibel,Akşit Murat İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması. (2016): 94 - 99.
MLA	Bozkaya Giray,ÖRMEN Murat,bilgili sibel,Akşit Murat İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması. , 2016, ss.94 - 99.
AMA	Bozkaya G,ÖRMEN M,bilgili s,Akşit M İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması. . 2016; 94 - 99.
Vancouver	Bozkaya G,ÖRMEN M,bilgili s,Akşit M İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması. . 2016; 94 - 99.
IEEE	Bozkaya G,ÖRMEN M,bilgili s,Akşit M "İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması." , ss.94 - 99, 2016.
ISNAD	Bozkaya, Giray vd. "İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması". (2016), 94-99.

APA	Bozkaya G, ÖRMEN M, bilgili s, Akşit M (2016). İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması. Türk Klinik Biyokimya Dergisi, 14(2), 94 - 99.
Chicago	Bozkaya Giray,ÖRMEN Murat,bilgili sibel,Akşit Murat İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması. Türk Klinik Biyokimya Dergisi 14, no.2 (2016): 94 - 99.
MLA	Bozkaya Giray,ÖRMEN Murat,bilgili sibel,Akşit Murat İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması. Türk Klinik Biyokimya Dergisi, vol.14, no.2, 2016, ss.94 - 99.
AMA	Bozkaya G,ÖRMEN M,bilgili s,Akşit M İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması. Türk Klinik Biyokimya Dergisi. 2016; 14(2): 94 - 99.
Vancouver	Bozkaya G,ÖRMEN M,bilgili s,Akşit M İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması. Türk Klinik Biyokimya Dergisi. 2016; 14(2): 94 - 99.
IEEE	Bozkaya G,ÖRMEN M,bilgili s,Akşit M "İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması." Türk Klinik Biyokimya Dergisi, 14, ss.94 - 99, 2016.
ISNAD	Bozkaya, Giray vd. "İzmir'de MEFV Gen Mutasyonlarının Sıklığının Araştırılması". Türk Klinik Biyokimya Dergisi 14/2 (2016), 94-99.