Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi

Arif PARMAKSIZ, (Harran Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü)
Özlem ŞEKER, (Harran Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü)
Nevin ASLAN, (Harran Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü)
Ahmet OYMAK (Harran Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü)
Yunus Araştırma Bülteni
18 1
Yıl: 2017 Cilt: 17 Sayı: 1 Sayfa Aralığı: 103 - 107 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi

Öz:
Barbus grypus (Heckel, 1843) Fırat ve Dicle nehir sistemlerinde yaşayan ve ekonomik önemi olan endemik balık türlerinden biridir. Bu çalışmada, B. gr)/pus populasyonların danıita kondriyal DNA sitokrom oksidazalt ünite (mtDNA COI) gen bölgesinin dizi analizlerine dayalı genetik çeşitlilik belirlenmiştir. İki popülasyondan toplam 36 örnek alınıp iki değişken bölge ve üç haplotip tespit edilmiştir. Ortalama haplotip (h) ve nükleotit çeşitliliği (1t) sırasıyla 0,246 ve 0,00045 olarak hesaplanmıştır. Nötralite testleri sonucunda tüm değerler istatistiksel olarak önemsiz bulunmuştur (p>0. 10). Yapılan bu çalışmadaki sonuçlar B. gr)/pus türü için ilk kez elde edilmiş verilerdir. mtDNA COI gen bölgesi için belirlenen haplotipler literatür açısından yeni sonuçlar olup, bu türün genetik çeşitliliği açısından önemli bir veri seti oluşturmuştur.
Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Ekoloji

Determination of Genetic Diversity in Barbus grypus (Heckel, 1843) Populations by mtDNA COI Gene Sequences

Öz:
Barbus gr)/pus (Heckel,1843) living in the Euphrates and Tigris river system, is one of the endemic fish species and haseconomic importance. In this study, genetic diversity of B. g1ypus populations was detected based on mitochondrial DNAcytochrome oxidase subunit (mtDNA COI) gene sequences. Three haplotypes and two polymorphic sites were detected intotally 36 individuals sampled from two populations. The average haplotype diversity (h) and nucleotide diversity (ıt) werecalculated 0,246 and 0,00045 respectively. The result ofNeutrality tests as statistically was insignificant (p>0.10). The resultsobtained by this study performed firstly for Barbus gr)/pus species. Determined haplotypes for mtDNA COI gene region arenew results for literature, in terms ofgenetic diversity ofthis species is an important data set.
Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Ekoloji
Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık
  • Avise, J.C., Arnold, J., Ball, R.M., Bermingham, E., Lamb, T., Neigel, .E., Reeb, C.A. ve Saunders, N. 1987. Intraspecific phylogeography: the mitochondrial DNA bridge between population genetics and systematics. Annu Rev Ecol Syst., 18: 489522.
  • Avise, .C. 2000. Phylogeography. London: Harvard University Press.
  • Croos, D. M. ve Palsson, S. 2010. Mitochondrial DNA variation and population genetic structure of white Shrimp Fenneropenaeus indicus along the coastalbelt of Sri Lanka. Aquat Living Resour., 23:31532.
  • Darabi, A. R.,Kashan, N., Fayazi, ., Aminafshar, M. Ve Chamani, M. 2014. Phylogenetic relationships of sub-populations of Barbus sharpeyi fish in southwest of Iran using mitochondrial DNA with PCR—sequencing method. International Journal of Biosciences, 5(2): 41-46.
  • Darabi, A. R., Kashan, N., Fayazi, J., Aminafshar, M. Ve Chamani, M. 2015.1nvestigation of Phylogenetic Relationship Among two Barbus species (Cyprinidae) Populations with Mitochondrial DNA Using Pcr—Sequencing. IJBPAS, (2): 302- 311.
  • Doğu, Z., Aral, F. ve Şahinöz, E. 2014. Atatürk Baraj Gölü'ndeki (Şanlıurfa) Şabut Balığının Bazı Spermatolojik ve Hematolojik Özelliklerinin Belirlenmesi. Journal of Fisheries Sciences.com., (4) 265 277
  • Düşükcan, M.,Çalta, M. ve Eroğlu, M. 2015. Keban Baraj Gölü'nde yaşayan B. Grypus Heckel, 1843'de otolit Biyometıisi-Balık Boyu İlişkisi (Elazığ, Türkiye). Yunus Araştırma Bülteni, 201 (3): 21-29.
  • Fu, Y. X. 1997.Statistical tests of neutrality against populatio ngrowth, hitchiking and background selection. Genetics, 147: 915-925.
  • Gökçınar, N. C. 2010. Şabot (Bıyıklı Balık) (Tor grypus H. 1843) Balığı Yavru Yemlerine Balık Unu Yerine Farklı Oranlarda Azolla (Azolla Sp.) İlavesiııin büyüme Parametrelerine Etkisi, Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Yüksek Lisans Tezi.
  • Keskin, E. ve Atar, H. H. 2012. Türkiye'nin Akdeniz Kıyısındaki Mavi Yengeç (Callinectes sapidus) Populasyonları Arasındaki Genetik Farklılığın COI Gen Dizleri Kullanılarak Değerlendirilmesi. Journal of Fisheries Sciences.com., 6(2): 125- 131.
  • Nei, M. veLi, W. H. 1979.Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases. Proc Natl Acad Sci., 76: 52695273.
  • Nei, M. 1987.Molecularevolutionarygenetics. New York: Columbia University Press.,
  • Oymak, S. A., Doğan, N.ve Uysal, E.2008. Age, growth and reproduction of the Shabut Barbus grypus (Cyprinidae) in Atatürk Dam Lake (Euphrates River), Turkey. Cybium, 32(2): 145-152.
  • Olgunoğlu,İ. A.,Olgunoglu, M. P. ve Artar, E.2010. Seasonal changes in biochemical composition and meatyield of Shabut (Barbusgrypus, Heckel 1843). Iranian Journal of Fisheries Sciences, 10 (1) 181-187.
  • Olgunoğlu, M. P. Ve Olgunoğlu,İ. A. 2011. Seasonal variation oftraceelements in muscletissues oftwo comınercially valuable fresh water fish species (Silurus triostegus and Barbus grypus Heckel, 1843) from Atatürk Dam Lake (Turkey) African Journal ofBiotechnology, 10(34), pp. 6628-6632.
  • Ortega-VillaizanRomo, M., Suzuki, S., Nakajima, M. Ve Taniguchi, N. 2006. Genetice volution of inter Individual relatedness for brood stock management of the rare species barfin flounder Verasper moseri using microsatellite DNA markers. Fisheries Sci., 72:3339.
  • Rozas, J.,Sanchez—Del Barrio, J.C., Messeguer, X. Ve Rozas, R. 2003. DnaSP DNA polymorphism analyses by the coalescent and other methods. Bioinformatics, 19 pp. 24962497.
  • Tajirna, F. 1996. The amount of DNA polymorphism maintained in finite populatio 11 when the neutral mutation rate varies amongsites. Genetics, 143:1457-1465.
  • Ward, RD. 2000. Genetics in fisheries management. Hydrobiologia, 420: 191201
APA PARMAKSIZ A, seker o, ASLAN N, OYMAK A (2017). Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi. , 103 - 107.
Chicago PARMAKSIZ ARİF,seker ozlem,ASLAN Nevin,OYMAK Ahmet Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi. (2017): 103 - 107.
MLA PARMAKSIZ ARİF,seker ozlem,ASLAN Nevin,OYMAK Ahmet Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi. , 2017, ss.103 - 107.
AMA PARMAKSIZ A,seker o,ASLAN N,OYMAK A Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi. . 2017; 103 - 107.
Vancouver PARMAKSIZ A,seker o,ASLAN N,OYMAK A Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi. . 2017; 103 - 107.
IEEE PARMAKSIZ A,seker o,ASLAN N,OYMAK A "Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi." , ss.103 - 107, 2017.
ISNAD PARMAKSIZ, ARİF vd. "Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi". (2017), 103-107.
APA PARMAKSIZ A, seker o, ASLAN N, OYMAK A (2017). Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi. Yunus Araştırma Bülteni, 17(1), 103 - 107.
Chicago PARMAKSIZ ARİF,seker ozlem,ASLAN Nevin,OYMAK Ahmet Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi. Yunus Araştırma Bülteni 17, no.1 (2017): 103 - 107.
MLA PARMAKSIZ ARİF,seker ozlem,ASLAN Nevin,OYMAK Ahmet Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi. Yunus Araştırma Bülteni, vol.17, no.1, 2017, ss.103 - 107.
AMA PARMAKSIZ A,seker o,ASLAN N,OYMAK A Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi. Yunus Araştırma Bülteni. 2017; 17(1): 103 - 107.
Vancouver PARMAKSIZ A,seker o,ASLAN N,OYMAK A Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi. Yunus Araştırma Bülteni. 2017; 17(1): 103 - 107.
IEEE PARMAKSIZ A,seker o,ASLAN N,OYMAK A "Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi." Yunus Araştırma Bülteni, 17, ss.103 - 107, 2017.
ISNAD PARMAKSIZ, ARİF vd. "Fırat ve Dicle Nehri'nde Yaşayan Barbus grypus (Heckel, 1843) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin mtDNA COI Gen Dizileri Kullanılarak Belirlenmesi". Yunus Araştırma Bülteni 17/1 (2017), 103-107.
Sayfa Oluşturulma Tarihi
23-04-2024 4:50

İLETİŞİM

TÜBİTAK ULAKBİM TR Dizin

Yüzüncüyıl, İşçi Blokları Mahallesi

Muhsin Yazıcıoğlu Caddesi No:51/C

06530 Çankaya / ANKARA +90 (312) 298 92 00

trdizin@tubitak.gov.tr

TÜBİTAK ULAKBİM Ulusal Akademik Ağ ve Bilgi Merkezi Cahit Arf Bilgi Merkezi © Tüm Hakları Saklıdır. Gizlilik Politikası Kullanım Şartları