Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı

GÖREN SAĞLAM, NİHAL

Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı

Nihal GÖREN SAĞLAM (İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Botanik Anabilimdalı, Süleymaniye, İstanbul)

Marmara Fen Bilimleri Dergisi

0 0

Yıl: 2017 Cilt: 29 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 131 - 133 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı

Öz:

Gen aktivitesinin hücreye özgü çözümü özel gelişimsel olayların anlaşılmasında kritik bir rol oynamaktadır. Bunun yanında, genomik seviyede böyle yüksek çözünürlüklü verilerin elde edilmesi spesifik hücrelerin izole edilmesini gerektirdiği için oldukça zordur. Aynı organ ya da dokunun komşu hücrelerinden spesifik hücrelerin izole edilebilmesi için en etkili yöntem FACS (Fluorescence-activated cell sorting=Floresans tarafından aktive edilmiş hücrelerin ayrılması) yöntemidir. İzole edilen hücreler genomik analizler için kullanılabilmektedir. Bu derlemede GFP (Green flourescent protein=Yeşil floresans protein) ile işaretlenmiş transgenik Arabidopsis thaliana bitkilerinin yapraklarında FACS uygulaması hakkında bilgi verilmiş olacaktır

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Hücre ve Doku Mühendisliği Biyokimya ve Moleküler Biyoloji

Cell-type specific analysis: The use of fluorescence-activated cell sorting (FACS) in Arabidopsis thaliana leaves

Öz:

Cell-specific resolution of gene activity is critical to understand specific developmental events. However, such high resolution data have been difficult to obtain at a genomic level because specific types of cell need to be isolated. One of the most efficient method to isolate specific cells from neighboring cells in the same organ or tissue is FACS. The isolated cells can be used for genomic analysis. In this review, it will be given information about FACS in transgenic Arabidopsis thaliana leaves which are labelled with GFP

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Hücre ve Doku Mühendisliği Biyokimya ve Moleküler Biyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

[1] Hertzberg, M., Sievertzon, M., Aspeborg, H., Nilsson, P., Sandberg, G., & Lundeberg, J. (2001). cDNA microarray analysis of small plant tissue samples using a cDNA tag target amplification protocol. The Plant Journal, 25(5), 585-591.
[2] Lee, J. Y., Levesque, M., & Benfey, P. N. (2005). High-throughput RNA isolation technologies. New tools for high-resolution gene expression profiling in plant systems. Plant physiology, 138(2), 585-590.
[3] Wang, Y., & Jiao, Y. (2011). Advances in plant cell type-specific genome-wide studies of gene expression. Frontiers in Biology, 6(5), 384-389.
[4] Carter, A. D., Bonyadi, R., & Gifford, M. L. (2013). The use of fluorescence-activated cell sorting in studying plant development and environmental responses. The International journal of developmental biology, 57, 545-552.
[5] Birnbaum, K., Shasha, D. E., Wang, J. Y., Jung, J. W., Lambert, G. M., Galbraith, D. W., & Benfey, P. N. (2003). A gene expression map of the Arabidopsis root. Science, 302(5652), 1956-1960.
[6] Birnbaum, K., Jung, J. W., Wang, J. Y., Lambert, G. M., Hirst, J. A., Galbraith, D. W., & Benfey, P. N. (2005). Cell type–specific expression profiling in plants via cell sorting of protoplasts from fluorescent reporter lines. Nature methods, 2(8), 615-619.
[7] Grønlund, J. T., Eyres, A., Kumar, S., Buchanan-Wollaston, V., & Gifford, M. L. (2012). Cell specific analysis of Arabidopsis leaves using fluorescence activated cell sorting. Journal of visualized experiments: JoVE, (68).
[8] Gören Sağlam, N. (2017). Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. yapraklarında GUS ve GFP raportör genleri kullanılarak senesens ile ilişkili genlerin analizi. Trakya University Journal of Natural Sciences, 18(2), 175-183

APA	GÖREN SAĞLAM N (2017). Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı. , 131 - 133.
Chicago	GÖREN SAĞLAM NİHAL Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı. (2017): 131 - 133.
MLA	GÖREN SAĞLAM NİHAL Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı. , 2017, ss.131 - 133.
AMA	GÖREN SAĞLAM N Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı. . 2017; 131 - 133.
Vancouver	GÖREN SAĞLAM N Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı. . 2017; 131 - 133.
IEEE	GÖREN SAĞLAM N "Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı." , ss.131 - 133, 2017.
ISNAD	GÖREN SAĞLAM, NİHAL. "Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı". (2017), 131-133.

APA	GÖREN SAĞLAM N (2017). Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı. Marmara Fen Bilimleri Dergisi, 29(4), 131 - 133.
Chicago	GÖREN SAĞLAM NİHAL Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı. Marmara Fen Bilimleri Dergisi 29, no.4 (2017): 131 - 133.
MLA	GÖREN SAĞLAM NİHAL Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı. Marmara Fen Bilimleri Dergisi, vol.29, no.4, 2017, ss.131 - 133.
AMA	GÖREN SAĞLAM N Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı. Marmara Fen Bilimleri Dergisi. 2017; 29(4): 131 - 133.
Vancouver	GÖREN SAĞLAM N Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı. Marmara Fen Bilimleri Dergisi. 2017; 29(4): 131 - 133.
IEEE	GÖREN SAĞLAM N "Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı." Marmara Fen Bilimleri Dergisi, 29, ss.131 - 133, 2017.
ISNAD	GÖREN SAĞLAM, NİHAL. "Hücre Tipine Özgü Analiz : Arabidopsis thaliana Yapraklarında Floresans ile Aktive Edilmiş Hücrelerin Toplanması Yönteminin Kullanımı". Marmara Fen Bilimleri Dergisi 29/4 (2017), 131-133.