Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi

Orhan, Zerife; KAYIŞ, ARZU; Aral, Murat; Akyol, Ismail; Kaya, Esra

Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi

Zerife ORHAN, (Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Sağlık Hizmetleri Meslek yüksekokulu, Sağlık Bakım Hizmetleri Bölümü, Kahramanmaraş, Türkiye)

Arzu KAYIŞ, (Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Sağlık Hizmetleri Meslek yüksekokulu, Sağlık Bakım Hizmetleri Bölümü, Kahramanmaraş, Türkiye)

İsmail AKYOL, (Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Ziraat Fakültesi, Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü, Kahramanmaraş, Türkiye)

Esra KAYA, (Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Kahramanmaraş, Türkiye)

Murat ARAL (Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Kahramanmaraş, Türkiye)

Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi

1 1

Yıl: 2017 Cilt: 22 Sayı: 3 Sayfa Aralığı: 102 - 109 Metin Dili: Türkçe İndeks Tarihi: 29-07-2022

Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi

Öz:

Giriş: Staphylococcus aureus, ciddi hastalıklara yol açabilen tehlikeli bir patojendir. Antibiyotik direncinin ortaya çıkması büyük oranda etkili tedaviler bulma sorununa neden olmuştur. Bu çalışma, hastaların çeşitli klinik örneklerinden elde edilen S. aureus izolatlarında bazı antibiyotiklerin antibiyotik duyarlılık paternleri ile antibiyotik direnç genleri arasındaki ilişkiyi değerlendirmek amacıyla yapılmıştır. Materyal ve Metod: Toplam 100 S. aureus klinik izolatı, antimikrobik duyarlılık testine tabi tutulmuştur. Oksasilin (mecA), trimetoprim-sülfametoksazol (TMP-SMZ) (dfrA), eritromisin, klindamisin (ermA, ermB, ermC ve msrA), kinupristin-dalfopristin (vatA, vatB, vatC) ve siprofloksasin (gyrA, gyrB) direnci ile ilişkili genler konvansiyonel polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi ile amplifiye edilmiştir.Bulgular: Yüz S. aureus izolatı arasındaki metisiline direnç oranı %19 idi ve bu izolatların hepsi de mecA genini taşıyordu. Fenotipik olarak izolatların %1'i TMP-SMZ'ye dirençli iken, yine aynı izolat dfrA genini de taşıyordu. Fenotipik olarak eritromisin direnci %26 olarak tespit edilirken, izolatların %6'sının hem ermA, hem de ermC genini birlikte taşıdığı, %22'sinin ise sadece ermC genini taşımakta olduğu tespit edilmiştir. İzolatların hiçbiri de ermB ve msrA genlerini taşımıyordu. İzolatların hiçbiri fenotipik olarak kinupristin-dalfopristine dirençli değildi ve vatA, vatB, vatC direnç genlerini taşımıyordu. Fenotipik olarak izolatların %6'sı siprofloksasine dirençli iken, genotipik olarak 100 izolatın hepsi de gyrA ve gyrB direnç genlerini taşıyordu.Sonuç: Elde ettiğimiz bulgulara göre, fenotipik antibiyotik duyarlılık testi sonuçları moleküler sonuçlara kısmen benzerlik göstermektedir. Antibiyotik duyarlılığını belirlemede hızlı ve güvenilir yöntemler uygun tedavi kararlarını belirlemek için önemlidir. Bu yüzden klasik yöntemler ve PCR gibi moleküler yaklaşımlar birlikte kullanıldığında daha doğru ve güvenilir bilgiler sağlayabilir

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Phenotypic and Genotypic Determination of Antibiotic Resistances of Some Clinical Staphylococcus aureus Isolates

Öz:

Introduction: Staphylococcus aureus is a dangerous pathogen causing serious illnesses. The acquisitions of antibiotic resistance genes has largely led to the problem of finding effective treatments. This study was carried out to evaluate the relationship between the antibiotic susceptibility patterns of some antibiotics and antibiotic resistance genes in S. aureus isolates obtained from various clinical samples of patients. Materials and Methods: A total of 100 clinical S. aureus isolates were subjected to the antimicrobial susceptibility test. The genes associated with resistance to oxacilline (mecA), trimethoprim-sulfamethoxazole (TMP-SMX) (dfrA), erythromycin, clindamycin (ermA, ermB, ermC and msrA), quinupristin-dalfopristin (vatA, vatB, vatC) and ciprofloxacin (gyrA, gyrB) were investigated by PCR amplification. Results: Methicillin resistance ratio of one hundred S. aureus isolates was found 19%, and all of these isolates were carrying the mecA gene. Only 1% of the isolates were phenotypically resistant to TMP-SMX and carrying the dfrA gene. Erythromycin resistance ratio was found 26% phenotypically and 6% of the isolates were carrying both the ermA and the ermC genes, and 22% of them were carrying only the ermC gene. None of the isolates carried the ermB and msrA genes. None of the isolates was phenotypically resistant to quinupristin-dalfopristin and carried vatA, vatB, vatC resistance genes. All isolates were carrying the gyrA and gyrB resistance genes, but 6% of the isolates were phenotypically resistant to ciprofloxacin. Conclusion: According to the acquired results, phenotypic antibiotic susceptibility test results were partially similar to molecular observation. In pathogenic organisms, the use of rapid and reliable methods for determining antibiotic susceptibility is important in determining appropriate treatment outcomes. When biochemical methods and molecular approaches were combined, more accurate and reliable results were observed in a short time.

Anahtar Kelime:

Konular: Biyoloji Mikrobiyoloji Biyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Kong C, Neoh H, Nathan S. Targeting Staphylococcus aureus toxins: a potential form of anti-virulence therapy. Toxins (Basel) 2016;8:72.
2. Raeisi J, Saifi M, Pourshafie MR, Karam MRA, Mohajerani HR. Rapid detection of methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates by turanose fermentation method. Jundishapur J Microbiol 2015;8:e21198.
3. Vickers AA, Potter NJ, Fishwick CWG, Chopra I, O’Neill, AJ. Analysis of mutational resistance to trimethoprim in Staphylococcus aureus by genetic and structural modelling techniques. J Antimicrob Chemother 2009;63:1112-7.
4. Otsuka T, Zaraket H, Takano T, Saito K, Dohmae S, Higuchi W, et al. Macrolide–lincosamide–streptogramin B resistance phenotypes and genotypes among Staphylococcus aureus clinical isolates in Japan. Clin Microbiol Infect 2007;13:325-7.
5. Jensen SO, Lyon BR. Genetics of antimicrobial resistance in Staphylococcus aureus. Future Microbiol 2009;4:565-82.
6. Lowy FD. Antimicrobial resistance: the example of Staphylococcus aureus. J Clin Invest 2003;111:1265-73.
7. Campion JJ, McNamara PJ, Evans ME. Evolution of ciprofloxacin-resistant Staphylococcus aureus in in vitro pharmacokinetic environments. Antimicrob Agents Chemother 2004;48:4733-44.
8. Barski P, Piechowicz L, Galiski J, Kur J. Rapid assay for detection of methicillin-resistant Staphylococcus aureus using multiplex PCR. Mol Cell Probes 1996;10:471-5.
9. CLSI. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing; twenty-fifth informational supplement. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) 2015;35:M100-S25.
10. Strommenger B, Kettlitz C, Werner G, Witte W. Multiplex PCR assay for simultaneous detection of nine clinically relevant antibiotic resistance genes in Staphylococcus aureus. J Clin Microbiol 2003;41:4089-94.
11. McDougal LK, Fosheim GE, Nicholson A, Bulens SN, Limbago BM, Shearer JE, et al. Emergence of resistance among USA300 methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates causing invasive disease in the United States. Antimicrob Agents Chemother 2010;54:3804-11.
12. Martineau F, Picard FJ, Lansac N, Ménard C, Roy PH, Ouellette M, et al. Correlation between the resistance genotype determined by multiplex PCR assays and the antibiotic susceptibility patterns of Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis. Antimicrob Agents Chemother 2000;44:231-8.
13. Schmitz FJ, Jones ME, Hofmann B, Hansen B, Scheuring S, Lückefahr M, et al. Characterization of grlA, grlB, gyrA, and gyrB mutations in 116 unrelated isolates of Staphylococcus aureus and effects of mutations on ciprofloxacin MIC. Antimicrob Agents Chemother 1998;42:1249-52.
14. Choi SM, Kim SH, Kim HJ, Lee DG, Choi JH, Yoo JH, et al. Multiplex PCR for the detection of genes encoding aminoglycoside modifying enzymes and methicillin resistance among Staphylococcus species. J Korean Med Sci 2003;18:631-6.
15. Ekrami A, Samarbafzadeh A, Alavi M, Kalantar E, Hamzeloi F. Prevalence of methicillin resistant Staphylococcus species isolated from burn patients in a burn center, Ahvaz, Iran. Undishapur J Microbiol 2010;3:84-91.
16. Pillai MM, Latha R, Sarkar G. Detection of methicillin resistance in Staphylococcus aureus by polymerase chain reaction and conventional methods: a comparative study. J Lab Physicians 2012;4:83-8.
17. Zmantar T, Bekir K, Elgarsadi SI, Hadad O, Bakhrouf A. Molecular investigation of antibiotic resistance genes in methicillin resistant Staphylococcus aureus isolated from nasal cavity in pediatric service. Afr J Microbiol Res 2013;7:4414-21.
18. Nurjadi D, Schäfer J, Friedrich-Jänicke B, Mueller A, Neumayr A, Calvo-Cano A, et al. Predominance of dfrG as determinant of trimethoprim resistance in imported Staphylococcus aureus. Clin Microbiol Infect 2015;21:1095.e5-9.
19. Masoud-Landgraf L, Johler S, Badura A, Feierl G, Luxner J, Wagner-Eibel U. Genetic and phenotypic characteristics of Staphylococcus aureus isolates from cystic fibrosis patients in Austria. Respiration 2015;89:390-5.
20. Sun DD, Ma XX, Hu J, Tian Y, Pang L, Shang H, et al. Epidemiological and molecular characterization of community and hospital acquired Staphylococcus aureus strains prevailing in Shenyang, Northeastern China. Braz J Infect Dis 2013;17:682-90.
21. Sekiguchi J, Hama T, Fujino T, Araake M, Irie A, Saruta K. Detection of the antiseptic-and disinfectant-resistance genes qacA, qacB, and qacC in methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated in a Tokyo hospital. Jpn J Infect Dis 2004;57:288-91.
22.Duran N, Ozer B, Duran GG, Onlen Y, Demir C. Antibiotic resistance genes&susceptibility patterns in staphylococci. Indian J Med Res 2012;135:389-96.
23. Spiliopoulou I, Petinaki E, Papandreou P, Dimitracopoulos G. erm(C) is the predominant genetic determinant for the expression of resistance to macrolides among methicillin-resistant Staphylococcus aureus clinical isolates in Greece. J Antimicrob Chemother 2004;53;814-7.
24. Adwan G, Adwan K, Jarrar N, Amleh A. Molecular detection of nine antibiotic resistance genes in methicillin resistant Staphylococcus aureus isolates. Roum Arch Microbiol Immunol 2014;73:9-18.
25. Momtaz H, Hafezi L. Meticillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from Iranian hospitals: virulence factors and antibiotic resistance properties. Bosn J Basic Med Sci 2014;14:219-26.
26. Blumberg HM, Rimland D, Carroll DJ, Terry P, Wachsmuth IK. Rapid development of ciprofloxacin resistance in methicillin-susceptible and resistant Staphylococcus aureus. J Infect Dis 1991;163:1279-85.
27. Goldstein FW, Acar JF. Epidemiology of quinolone resistance: Europe and North and South America. Drugs 1995;49:36- 42.
28. Kresken M, Hafner D, Mittermayer H, Verbist L, Bergogne-Bérézin E, Giamarellou H, et al. Prevalence of fluoroquinolone resistance in Europe. Study Group ‘Bacterial Resistance’ of the Paul-Ehrlich-Society for Chemotherapy e. V. Infection 1994;(Suppl 2):S90-8.
29. Gade ND, Qazi MS. Fluoroquinolone therapy in Staphylococcus aureus infections: Where do we stand? J Lab Physicians 2013;5:109-12.
30. Takahata, M, Yonezawa M, Kurose S, Futakuchi N, Matsubara N, Watanabe Y, et al. Mutations in the gyrA and grlA genes of quinolone-resistant clinical isolates of methicillin-resistant Staphylococcus aureus. J Antimicrob Chemother 1996;38:543-6.
31 Coskun-Ari FF, Bosgelmez-Tinaz G. grlA and gyrA mutations and antimicrobial susceptibility in clinical isolates of ciprofloxacin-methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Eur J Med Res 2008;13:366-70.

APA	Orhan Z, KAYIŞ A, Akyol I, Kaya E, Aral M (2017). Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi. , 102 - 109.
Chicago	Orhan Zerife,KAYIŞ ARZU,Akyol Ismail,Kaya Esra,Aral Murat Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi. (2017): 102 - 109.
MLA	Orhan Zerife,KAYIŞ ARZU,Akyol Ismail,Kaya Esra,Aral Murat Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi. , 2017, ss.102 - 109.
AMA	Orhan Z,KAYIŞ A,Akyol I,Kaya E,Aral M Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi. . 2017; 102 - 109.
Vancouver	Orhan Z,KAYIŞ A,Akyol I,Kaya E,Aral M Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi. . 2017; 102 - 109.
IEEE	Orhan Z,KAYIŞ A,Akyol I,Kaya E,Aral M "Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi." , ss.102 - 109, 2017.
ISNAD	Orhan, Zerife vd. "Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi". (2017), 102-109.

APA	Orhan Z, KAYIŞ A, Akyol I, Kaya E, Aral M (2017). Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 22(3), 102 - 109.
Chicago	Orhan Zerife,KAYIŞ ARZU,Akyol Ismail,Kaya Esra,Aral Murat Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 22, no.3 (2017): 102 - 109.
MLA	Orhan Zerife,KAYIŞ ARZU,Akyol Ismail,Kaya Esra,Aral Murat Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, vol.22, no.3, 2017, ss.102 - 109.
AMA	Orhan Z,KAYIŞ A,Akyol I,Kaya E,Aral M Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2017; 22(3): 102 - 109.
Vancouver	Orhan Z,KAYIŞ A,Akyol I,Kaya E,Aral M Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi. Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 2017; 22(3): 102 - 109.
IEEE	Orhan Z,KAYIŞ A,Akyol I,Kaya E,Aral M "Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi." Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi, 22, ss.102 - 109, 2017.
ISNAD	Orhan, Zerife vd. "Klinik Staphylococcus aureus İzolatlarının Bazı Antibiyotiklere Dirençlerinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Belirlenmesi". Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 22/3 (2017), 102-109.