Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi

köse, şükran; akbulut, ilkay; Çelik, Didem; ödemiş, ilker; Ersan, Gursel

doi:10.5505/TurkHijyen.2018.70456

Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi

İlker ÖDEMİŞ, (Ömer Halisdemir Üniversitesi, Eğitim ve Araştırma Hastanesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Niğde, Türkiye)

Şükran KÖSE, (Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği, İzmir, Türkiye)

Gürsel ERSAN, (Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği, İzmir, Türkiye)

Didem ÇELİK, (Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği, İzmir, Türkiye)

İlkay AKBULUT (Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği, İzmir, Türkiye)

Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi

4 1

Yıl: 2018 Cilt: 75 Sayı: 4 Sayfa Aralığı: 345 - 352 Metin Dili: Türkçe DOI: 10.5505/TurkHijyen.2018.70456 İndeks Tarihi: 20-07-2020

Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi

Öz:

Amaç: Enterokoklar idrar yolu yara yeri enfeksiyonlarıile bakteriyemiye neden olabilmektedir. Hastane kökenlienfeksiyonlarda en sık saptanan etkenlerden birisidir.Enterokoklarda son yıllarda antibiyotiklere karşı artanoranda direnç gözlenmektedir. Kültürlerden izoleedilen enterokokların dağılımı ve antibiyotik direncininsağlık bakım merkezleri arasında değişebildiği, bunedenle de merkezin kendi sonuçlarını belli aralıklarladeğerlendirmesinin faydalı olacağı düşünülmüştür.Bu çalışmanın amacı hastanemizde yatan hastalarınidrar, kan, yara, balgam ve beyin omurilik sıvısı (BOS)örneklerinden izole edilen Enterococcus faecalis veEnterococcus faecium suşlarının ampisilin, gentamisin,streptomisin, siprofloksasin, vankomisin, teikoplaninve linezolid gibi antibiyotiklere direnç oranlarınıbelirlemektir.Yöntem: Ocak 2010 - Ocak 2015 arasında İzmirTepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesinde yatanhastaların çeşitli klinik örneklerinden izole edilen 390enterokok suşu retrospektif olarak değerlendirilmiştir.Suşların identifikasyonu ve antibiyotik duyarlılıkları;tam otomatize bakteri tanımlama sistemi VITEK-2(bioMerieux, Fransa) ile çalışılmıştır. Vankomisin,teikoplanin ve linezolid duyarlılıkları E-test (bioMerieux,Fransa) ile de test edilmiştir. Duyarlılık sonuçları iseClinical and Laboratory Standarts Institute (CLSI)kriterleri esas alınarak belirlenmiştir.Bulgular: İdentifiye edilen toplam 390 suşun 154(%40)’ü E. faecalis, 236 (%60)’sı E. faecium olaraktanımlandı. E. faecium suşlarının izole edildikleri klinikörnekler sırasıyla; 126 (%53)’sı idrar, 65 (%27)’i kan, 39(%17)’u yara yeri, 4 (%2)’ü balgam ve 2 (%1)’si BOS’dur.E. faecalis suşlarının izole edildikleri klinik örnekler ise77 (%50)’si idrar, 50 (%33)’si kan, 22 (%14)’si yara yeri,3 (%2)’ü balgam ve 2 (%1)’si ise BOS’dur. E. faecalis veE. faecium suşlarının her ikisi için en duyarlı bulunanantibiyotik linezolid’dir. Hem E. faecalis hem de E.faecium için en dirençli antibiyotiğin ampisilin olduğusaptandı.Sonuç: Çalışmamızda hem E. faecalis hem de E.faecium suşlarında ampisilin, vankomisin ve teikoplanindirencinin yüksek saptanması, bu suşlara yönelikampirik antibiyotik seçiminde dikkate alınması gerekenbir veri olduğu düşünülmektedir.

Anahtar Kelime:

Evaluation of antibiotic susceptibilities of enterococcus strains isolated from clinical samples of hospitalized patients

Öz:

Objective: Enterococci can cause urinary tract infection, wound infection and bacteremia. It is one of the most commonly detected agents in hospitalacquired infections. Increasing resistance to antibiotics has been observed in enterococci in recent years. The distribution of enterococci isolated from cultures and antibiotic resistance may vary between health care centers, so it would be beneficial for each center to evaluate its own results at certain intervals. The aim of this study is to determine the antibiotic resistance rates of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium strains isolated from urine, blood, wound, sputum and cerebrospinal fluid (CSF) specimens of patients hospitalized in our hospital, such as ampicillin, gentamicin, streptomycin, ciprofloxacin, vancomycin, teicoplanin and linezolid. Methods: Between January 2010 and January 2015, 390 Enterococcus strains isolated from various clinical specimens of patients in İzmir Tepecik Training and Research Hospital were evaluated retrospectively. Identification and antibiotic susceptibility testing of the enterococci strains were performed by fully automated bacterial identification system VITEK-2 (bioMerieux, France). Vancomycin, teicoplanin and linezolid resistance was also tested by the E-test method (bioMerieux, Fransa). Susceptibility results were evaluated according to the guidelines of Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Results: A total of 390 strains were identified as follows; 154 (%40) were E. faecalis, 236 (%60) were E. faecium. Clinical specimens from which E. faecium strains were isolated were; 126 (53%) urine, 65 (27%) blood, 39 (17%) wound, 4 (2%) sputum and 2 (1%) CSF. Clinical specimens from which E. faecalis strains were isolated were; 77 (50%) urine, 50 (33%) blood, 22 (14%) wound, 3 (2%) sputum and 2 (1%) CSF. Linezolid was the most sensitive antibiotic against both E. faecalis and E. faecium strains, Ampicillin was the most resistant antibiotic for both E. faecalis and E. faecium strains. Conclusion: In our study; the detection of high ampicillin, vancomycin and teicoplanin resistance in both E. faecalis and E. faecium strains is considered to be a data that should be taken into consideration in the selection of empirical antibiotics for these strains.

Anahtar Kelime:

Belge Türü: Makale Makale Türü: Araştırma Makalesi Erişim Türü: Erişime Açık

1. Cömert F, Külah C, Eroğlu Ö, Aktaş E. Zonguldak Karaelmas Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesinde izole edilen enterokok izolatlarının üç yıllık değerlendirmesi. Flora Derg, 2007; 12: 98-102.
2. Atalay S, Ece G, Şamlioğlu P, Maraş G, Köse I, Köse Ş. İzmir’de üçüncü basamak bir hastanede görülen vankomisine dirençli enterokok olgularının değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul, 2012; 46(4): 553- 9.
3. Aktepe OC, Aşık G, Çiftçi İH, Çetinkaya Z. Klinik örneklerden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik direnç oranları. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2011; 41(2): 86-90.
4. Ulusal Antimikrobiyal Direnç Surveyans Sistemi Bakteri Tanımlama ve ADT Standart Uygulama Prosedürleri. 2014 p23-24. Türkiye Halk Sağlığı Kurumu: Ankara. (http://mikrobiyoloji. thsk.saglik.gov.tr/uamdss.html) (Erişim Tarihi:10.10.2017).
5. Watts JL, Clinical and LS Institute. Performance standards for antimicrobial disk and dilution susceptibility tests for bacteria isolated from animals: approved standard. 2008: National Committee for Clinical Laboratory Standards.
6. Özseven AG, Çetin E, Arıdoğan B, Çiftçi E, Özseven L. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. ANKEM Derg, 2011; 25(4): 256-62.
7. Aral M, Paköz NİP, Aral İ, Doğan S. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarının antibiyotik direnci. Turk Hij Den Biyol Derg: 2011; 68 (2): 85- 92.
8. Dinç BM, Arca EA, Yağci S, Karabiber N. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarında in-vitro antibiyotik duyarlılığı. Turk Hij Den Biyol Derg: 2009; 66 (3): 117-22.
9. Etiz P, Kibar F, Ekenoğlu Y, Yaman A. İdrar kültüründen izole edilen enterokok türlerinin antibiyotik direnç profillerinin değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2014; 44(3): 107-13.
10. Jia W, Li G, Wang W. Prevalence and antimicrobial resistance of Enterococcus species: a hospitalbased study in China. Int J Environ Res Public Health 2014, 11(3): 3424-42.
11. Gür D, Antibiyotik Duyarlılık Testleri, EUCAST: Uygulama, Yorum ve Uzman Kurallar. Cilt 46, Ek sayı 2016. Basım yeri: Logos Yayıncılık Tic. A.Ş, Basım yılı:2016. (http://tmc.dergisi.org/pdf/tmc_ supplement_2016.pdf).
12. Iraz M, Ceylan A, Akkoyunlu Y. Klinik örneklerden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıkları. ANKEM Derg, 2012; 26(4): 176-80.
13. Lee DS, Choe HS, Lee SJ, Bae WJ, Cho HJ, Han CH et al. Antimicrobial susceptibility pattern and epidemiology of female urinary tract infections in South Korea, 2010-2011. Antimicrob, Agents and Chemother, 2013; 57: 5384-93.
14. Schouten MA, Hoogkamp-Korstance JAA, Meis JFG, Voss A and European VRE Study Group. Prevelance of vancomycin-resistant enterococci in Europe. Eur J Clin Microbiol Infect Dis ,2001; 19: 816-22.
15. World Health Organization: Central Asian and Eastern European Surveillance of Antimicrobial Resistance. Annual report 2016 p80. Available from: http://www.euro.who.int/en/health-topics/ disease-prevention/antimicrobial-resistance/ publications/2016/central-asian-and-easterneuropean-surveillance-of-antimicrobialresistance.-annual-report-2016. (Erişim Tarihi: 15.10.2018).
16. Butcu M, Akcay SS, Inan AS, Aksaray S, Engin DO, Calisici G. In vitro susceptibility of enterococci strains isolated from urine samples to fosfomycin and other antibiotics. J Infect Chemother, 2011; 17(4): 575-8.
17. T.C.Sağlık Bakanlığı, Sağlık Hizmetleri Genel Müdürlüğü, Sağlık Hizmet Standartları Dairesi Başkanlığı Ulusal Hastane Enfeksiyonları Sürveyans Ağı (UHESA) Raporu, Özet Veri 2015; 42.
18. Medell M, Hart M, Batista ML. Sensibilidad antimicrobiana in vitro en aislamientos de Enterococcus faecalis y Enterococcus faecium obtenidos de pacientes hospitalizados. Biomédica 2014; 34(Supl.1): 50-7.
19. Şamlıoğlu P, Ece G, Atalay S, Köse Ş. Yoğun bakım birimlerinden izole edilen Gram pozitif koklarda daptomisin duyarlılığı, ANKEM Derg, 2011; 25(3): 173-7.
20. Deshpande VR, Karmarkar MG, Mehta PR. Prevalence of multidrug-resistant enterococci in a tertiary care hospital in Mumbai, India. J Infect Dev Ctries, 2013; 7(2): 155-8.

APA	ödemiş i, köse ş, Ersan G, Çelik D, akbulut i (2018). Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. , 345 - 352. 10.5505/TurkHijyen.2018.70456
Chicago	ödemiş ilker,köse şükran,Ersan Gursel,Çelik Didem,akbulut ilkay Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. (2018): 345 - 352. 10.5505/TurkHijyen.2018.70456
MLA	ödemiş ilker,köse şükran,Ersan Gursel,Çelik Didem,akbulut ilkay Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. , 2018, ss.345 - 352. 10.5505/TurkHijyen.2018.70456
AMA	ödemiş i,köse ş,Ersan G,Çelik D,akbulut i Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. . 2018; 345 - 352. 10.5505/TurkHijyen.2018.70456
Vancouver	ödemiş i,köse ş,Ersan G,Çelik D,akbulut i Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. . 2018; 345 - 352. 10.5505/TurkHijyen.2018.70456
IEEE	ödemiş i,köse ş,Ersan G,Çelik D,akbulut i "Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi." , ss.345 - 352, 2018. 10.5505/TurkHijyen.2018.70456
ISNAD	ödemiş, ilker vd. "Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi". (2018), 345-352. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2018.70456

APA	ödemiş i, köse ş, Ersan G, Çelik D, akbulut i (2018). Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 75(4), 345 - 352. 10.5505/TurkHijyen.2018.70456
Chicago	ödemiş ilker,köse şükran,Ersan Gursel,Çelik Didem,akbulut ilkay Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 75, no.4 (2018): 345 - 352. 10.5505/TurkHijyen.2018.70456
MLA	ödemiş ilker,köse şükran,Ersan Gursel,Çelik Didem,akbulut ilkay Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, vol.75, no.4, 2018, ss.345 - 352. 10.5505/TurkHijyen.2018.70456
AMA	ödemiş i,köse ş,Ersan G,Çelik D,akbulut i Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi. 2018; 75(4): 345 - 352. 10.5505/TurkHijyen.2018.70456
Vancouver	ödemiş i,köse ş,Ersan G,Çelik D,akbulut i Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi. 2018; 75(4): 345 - 352. 10.5505/TurkHijyen.2018.70456
IEEE	ödemiş i,köse ş,Ersan G,Çelik D,akbulut i "Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi." Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 75, ss.345 - 352, 2018. 10.5505/TurkHijyen.2018.70456
ISNAD	ödemiş, ilker vd. "Hastanede yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi". Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 75/4 (2018), 345-352. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2018.70456